; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg27659 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg27659
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionDNA-binding protein BIN4
Genome locationCarg_Chr03:2626072..2631830
RNA-Seq ExpressionCarg27659
SyntenyCarg27659
Gene Ontology termsGO:0042023 - DNA endoreduplication (biological process)
GO:0009330 - DNA topoisomerase complex (ATP-hydrolyzing) (cellular component)
GO:0003690 - double-stranded DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR033246 - DNA-binding protein BIN4


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6603412.1 DNA-binding protein BIN4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.1e-15299.66Show/hide
Query:  MLSSDSELSPVNSFIKEDYGHHEELSELTTSHFQGRGKDENAGGKSKSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNGGDVEI
        MLSSDSELSPVNSFIKEDYGHHEELSELTTSHFQGRGKDENAGGKSKSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNGGDVEI
Subjt:  MLSSDSELSPVNSFIKEDYGHHEELSELTTSHFQGRGKDENAGGKSKSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNGGDVEI

Query:  IEKDALDDCNERPVSSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLSGDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIESIM
        IEKDALDDCNERPVSSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLSGDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIESIM
Subjt:  IEKDALDDCNERPVSSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLSGDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIESIM

Query:  NDFIQLKALCNVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKVPTDQNEPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKSTKSKK
        NDFIQLKAL NVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKVPTDQNEPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKSTKSKK
Subjt:  NDFIQLKALCNVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKVPTDQNEPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKSTKSKK

KAG7033609.1 DNA-binding protein BIN4 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.4e-153100Show/hide
Query:  MLSSDSELSPVNSFIKEDYGHHEELSELTTSHFQGRGKDENAGGKSKSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNGGDVEI
        MLSSDSELSPVNSFIKEDYGHHEELSELTTSHFQGRGKDENAGGKSKSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNGGDVEI
Subjt:  MLSSDSELSPVNSFIKEDYGHHEELSELTTSHFQGRGKDENAGGKSKSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNGGDVEI

Query:  IEKDALDDCNERPVSSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLSGDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIESIM
        IEKDALDDCNERPVSSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLSGDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIESIM
Subjt:  IEKDALDDCNERPVSSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLSGDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIESIM

Query:  NDFIQLKALCNVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKVPTDQNEPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKSTKSKK
        NDFIQLKALCNVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKVPTDQNEPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKSTKSKK
Subjt:  NDFIQLKALCNVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKVPTDQNEPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKSTKSKK

XP_022932993.1 DNA-binding protein BIN4 [Cucurbita moschata]3.0e-15199.32Show/hide
Query:  MLSSDSELSPVNSFIKEDYGHHEELSELTTSHFQGRGKDENAGGKSKSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNGGDVEI
        MLSSDSELSPVNSFIKEDYGHHEELSELTTSHFQGRGKDENAGGKSKSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNGGDVEI
Subjt:  MLSSDSELSPVNSFIKEDYGHHEELSELTTSHFQGRGKDENAGGKSKSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNGGDVEI

Query:  IEKDALDDCNERPVSSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLSGDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIESIM
        IEKDALDDCNERPVSSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLSGDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIESIM
Subjt:  IEKDALDDCNERPVSSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLSGDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIESIM

Query:  NDFIQLKALCNVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKVPTDQNEPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKSTKSKK
        NDFIQLKAL NVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKVPTDQNE AEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKSTKSKK
Subjt:  NDFIQLKALCNVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKVPTDQNEPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKSTKSKK

XP_022967815.1 DNA-binding protein BIN4 [Cucurbita maxima]5.6e-15098.31Show/hide
Query:  MLSSDSELSPVNSFIKEDYGHHEELSELTTSHFQGRGKDENAGGKSKSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNGGDVEI
        ML+SDSELSPVNSFIKEDYGHHEELSELTTSHFQGRGKDENAGGKSKSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNGGDVEI
Subjt:  MLSSDSELSPVNSFIKEDYGHHEELSELTTSHFQGRGKDENAGGKSKSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNGGDVEI

Query:  IEKDALDDCNERPVSSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLSGDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIESIM
        IEKDALDDCNERPVSSSRLPLVLS+KVQRLKALVECEGNSIDLSGDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIESIM
Subjt:  IEKDALDDCNERPVSSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLSGDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIESIM

Query:  NDFIQLKALCNVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKVPTDQNEPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKSTKSKK
        NDFIQLKAL NVDEAETMVEGTLDGF FDSEDEGEKISKV TDQNEPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKSTKSKK
Subjt:  NDFIQLKALCNVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKVPTDQNEPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKSTKSKK

XP_023515821.1 DNA-binding protein BIN4 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.0e-15198.99Show/hide
Query:  MLSSDSELSPVNSFIKEDYGHHEELSELTTSHFQGRGKDENAGGKSKSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNGGDVEI
        MLSSDSELSPVNSFIKEDYGHHEELSELTTSHFQGRGKDENAGGKSKSRKISDKKLSKKQVKS+VCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNGGDVEI
Subjt:  MLSSDSELSPVNSFIKEDYGHHEELSELTTSHFQGRGKDENAGGKSKSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNGGDVEI

Query:  IEKDALDDCNERPVSSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLSGDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIESIM
        IEKDALDDCNERPVSSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLSGDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIESIM
Subjt:  IEKDALDDCNERPVSSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLSGDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIESIM

Query:  NDFIQLKALCNVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKVPTDQNEPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKSTKSKK
        NDFIQLKAL NVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKVPTDQNEPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGK QAPKKARKKVQGSKTKSTKSKK
Subjt:  NDFIQLKALCNVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKVPTDQNEPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKSTKSKK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5D3BS94 DNA-binding protein BIN4 isoform X23.5e-11377.96Show/hide
Query:  MLSSDSELSPVNSFIKEDYGHHEELSELTTSHFQGRGKDENAG-----GKSKSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNG
        MLSSDSE    N+FIKED  HHEELSEL TS  QGR KDENAG     GKSKSRK+S +   KK++KSQVCTS +EKI+ SDTNK  LTLEGSE +V N 
Subjt:  MLSSDSELSPVNSFIKEDYGHHEELSELTTSHFQGRGKDENAG-----GKSKSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNG

Query:  GDVEIIEKDALDDCNERPVSSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLSGDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAK
        G+ EI+EKDALDDC   PVSSSRLPLVLSDKV RLKALVECEG SIDLSGDMGAVGR+VVSDSS AKNELCLDLKGT+YRA +VPSRTFC+VSFGQSEAK
Subjt:  GDVEIIEKDALDDCNERPVSSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLSGDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAK

Query:  IESIMNDFIQLKALCNVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKV---PTDQNEPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKST
        IESIMNDFIQLKAL  VDEAETMVEGTLDGF FDSEDE EKI+KV   P DQNEP E LN KSKNK EKSSGRKRVK+GG++QAPKK RKKVQGSKTK+ 
Subjt:  IESIMNDFIQLKALCNVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKV---PTDQNEPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKST

Query:  KSKK
        KSKK
Subjt:  KSKK

A0A6J1CGV6 DNA-binding protein BIN4 isoform X22.4e-11478.62Show/hide
Query:  MLSSDSELSPVNSFIKEDYGHHEELSELTTSHFQGRGKDEN-----AGGKSKSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNG
        MLSSDSEL   NS IKEDY HHEEL E  TS F GR KDEN       GKSKSRK+SDKK  KK+VKSQV T  +EKI+   TNKE   LEGSEC V NG
Subjt:  MLSSDSELSPVNSFIKEDYGHHEELSELTTSHFQGRGKDEN-----AGGKSKSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNG

Query:  GDVEIIEKDALDDCNERPVSSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLSGDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAK
        GDVEII KDALDDCN  PVSSSRLPLVLSDKV RLKALVECEG SIDLSGD+GAVGR+VVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAA+VPSRTFC+VSFGQSEAK
Subjt:  GDVEIIEKDALDDCNERPVSSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLSGDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAK

Query:  IESIMNDFIQLKALCNVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKV---PTDQNEPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKST
        +E IMNDFIQLKA  N+DEAETMVEGTLDGF FDSEDE EKI+KV   PTDQNE  E L+KKSKNK EKSSGRKRV+TGGK+QAPKKARKKVQG KTK+ 
Subjt:  IESIMNDFIQLKALCNVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKV---PTDQNEPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKST

Query:  KSKK
        KSKK
Subjt:  KSKK

A0A6J1CI66 DNA-binding protein BIN4 isoform X12.4e-11478.62Show/hide
Query:  MLSSDSELSPVNSFIKEDYGHHEELSELTTSHFQGRGKDEN-----AGGKSKSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNG
        MLSSDSEL   NS IKEDY HHEEL E  TS F GR KDEN       GKSKSRK+SDKK  KK+VKSQV T  +EKI+   TNKE   LEGSEC V NG
Subjt:  MLSSDSELSPVNSFIKEDYGHHEELSELTTSHFQGRGKDEN-----AGGKSKSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNG

Query:  GDVEIIEKDALDDCNERPVSSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLSGDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAK
        GDVEII KDALDDCN  PVSSSRLPLVLSDKV RLKALVECEG SIDLSGD+GAVGR+VVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAA+VPSRTFC+VSFGQSEAK
Subjt:  GDVEIIEKDALDDCNERPVSSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLSGDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAK

Query:  IESIMNDFIQLKALCNVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKV---PTDQNEPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKST
        +E IMNDFIQLKA  N+DEAETMVEGTLDGF FDSEDE EKI+KV   PTDQNE  E L+KKSKNK EKSSGRKRV+TGGK+QAPKKARKKVQG KTK+ 
Subjt:  IESIMNDFIQLKALCNVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKV---PTDQNEPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKST

Query:  KSKK
        KSKK
Subjt:  KSKK

A0A6J1F3E0 DNA-binding protein BIN41.4e-15199.32Show/hide
Query:  MLSSDSELSPVNSFIKEDYGHHEELSELTTSHFQGRGKDENAGGKSKSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNGGDVEI
        MLSSDSELSPVNSFIKEDYGHHEELSELTTSHFQGRGKDENAGGKSKSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNGGDVEI
Subjt:  MLSSDSELSPVNSFIKEDYGHHEELSELTTSHFQGRGKDENAGGKSKSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNGGDVEI

Query:  IEKDALDDCNERPVSSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLSGDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIESIM
        IEKDALDDCNERPVSSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLSGDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIESIM
Subjt:  IEKDALDDCNERPVSSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLSGDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIESIM

Query:  NDFIQLKALCNVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKVPTDQNEPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKSTKSKK
        NDFIQLKAL NVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKVPTDQNE AEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKSTKSKK
Subjt:  NDFIQLKALCNVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKVPTDQNEPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKSTKSKK

A0A6J1HVH1 DNA-binding protein BIN42.7e-15098.31Show/hide
Query:  MLSSDSELSPVNSFIKEDYGHHEELSELTTSHFQGRGKDENAGGKSKSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNGGDVEI
        ML+SDSELSPVNSFIKEDYGHHEELSELTTSHFQGRGKDENAGGKSKSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNGGDVEI
Subjt:  MLSSDSELSPVNSFIKEDYGHHEELSELTTSHFQGRGKDENAGGKSKSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNGGDVEI

Query:  IEKDALDDCNERPVSSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLSGDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIESIM
        IEKDALDDCNERPVSSSRLPLVLS+KVQRLKALVECEGNSIDLSGDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIESIM
Subjt:  IEKDALDDCNERPVSSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLSGDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIESIM

Query:  NDFIQLKALCNVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKVPTDQNEPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKSTKSKK
        NDFIQLKAL NVDEAETMVEGTLDGF FDSEDEGEKISKV TDQNEPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKSTKSKK
Subjt:  NDFIQLKALCNVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKVPTDQNEPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKSTKSKK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9FLU1 DNA-binding protein BIN43.4e-4146.54Show/hide
Query:  KSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNGGDVEIIEKDALDDCNERPV--SSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLS
        K++  S +K  K++  +Q     E+K   +DT+                    II ++   D   +P   SSSRLPLVLS+KV R K LVECEG+SIDLS
Subjt:  KSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNGGDVEIIEKDALDDCNERPV--SSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLS

Query:  GDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALCNVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKV---P
        GDMGAVGR+VVSD++    ++ LDLKGTIY++ ++PSRTFCVV+ GQ+EAKIE+IMNDFIQL    NV EAETMVEGTL+GF F+S+DE  K +K    P
Subjt:  GDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALCNVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKV---P

Query:  TDQN-----EPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKSTKSKK
         DQ+     E       K+K K E   G+KR +   + Q P    KK + S  K  K+KK
Subjt:  TDQN-----EPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKSTKSKK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G24630.1 double-stranded DNA binding2.4e-4246.54Show/hide
Query:  KSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNGGDVEIIEKDALDDCNERPV--SSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLS
        K++  S +K  K++  +Q     E+K   +DT+                    II ++   D   +P   SSSRLPLVLS+KV R K LVECEG+SIDLS
Subjt:  KSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNGGDVEIIEKDALDDCNERPV--SSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLS

Query:  GDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALCNVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKV---P
        GDMGAVGR+VVSD++    ++ LDLKGTIY++ ++PSRTFCVV+ GQ+EAKIE+IMNDFIQL    NV EAETMVEGTL+GF F+S+DE  K +K    P
Subjt:  GDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALCNVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKV---P

Query:  TDQN-----EPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKSTKSKK
         DQ+     E       K+K K E   G+KR +   + Q P    KK + S  K  K+KK
Subjt:  TDQN-----EPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKSTKSKK

AT5G24630.3 double-stranded DNA binding2.4e-4246.54Show/hide
Query:  KSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNGGDVEIIEKDALDDCNERPV--SSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLS
        K++  S +K  K++  +Q     E+K   +DT+                    II ++   D   +P   SSSRLPLVLS+KV R K LVECEG+SIDLS
Subjt:  KSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNGGDVEIIEKDALDDCNERPV--SSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLS

Query:  GDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALCNVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKV---P
        GDMGAVGR+VVSD++    ++ LDLKGTIY++ ++PSRTFCVV+ GQ+EAKIE+IMNDFIQL    NV EAETMVEGTL+GF F+S+DE  K +K    P
Subjt:  GDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALCNVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKV---P

Query:  TDQN-----EPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKSTKSKK
         DQ+     E       K+K K E   G+KR +   + Q P    KK + S  K  K+KK
Subjt:  TDQN-----EPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKSTKSKK

AT5G24630.4 double-stranded DNA binding2.4e-4246.54Show/hide
Query:  KSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNGGDVEIIEKDALDDCNERPV--SSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLS
        K++  S +K  K++  +Q     E+K   +DT+                    II ++   D   +P   SSSRLPLVLS+KV R K LVECEG+SIDLS
Subjt:  KSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNGGDVEIIEKDALDDCNERPV--SSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLS

Query:  GDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALCNVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKV---P
        GDMGAVGR+VVSD++    ++ LDLKGTIY++ ++PSRTFCVV+ GQ+EAKIE+IMNDFIQL    NV EAETMVEGTL+GF F+S+DE  K +K    P
Subjt:  GDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALCNVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKV---P

Query:  TDQN-----EPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKSTKSKK
         DQ+     E       K+K K E   G+KR +   + Q P    KK + S  K  K+KK
Subjt:  TDQN-----EPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKSTKSKK

AT5G24630.5 double-stranded DNA binding1.7e-4354.11Show/hide
Query:  IIEKDALDDCNERPV--SSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLSGDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIE
        II ++   D   +P   SSSRLPLVLS+KV R K LVECEG+SIDLSGDMGAVGR+VVSD++    ++ LDLKGTIY++ ++PSRTFCVV+ GQ+EAKIE
Subjt:  IIEKDALDDCNERPV--SSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLSGDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIE

Query:  SIMNDFIQLKALCNVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKV---PTDQN-----EPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKT
        +IMNDFIQL    NV EAETMVEGTL+GF F+S+DE  K +K    P DQ+     E       K+K K E   G+KR +   + Q P    KK + S  
Subjt:  SIMNDFIQLKALCNVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKV---PTDQN-----EPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKT

Query:  KSTKSKK
        K  K+KK
Subjt:  KSTKSKK

AT5G24630.6 double-stranded DNA binding2.4e-4246.54Show/hide
Query:  KSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNGGDVEIIEKDALDDCNERPV--SSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLS
        K++  S +K  K++  +Q     E+K   +DT+                    II ++   D   +P   SSSRLPLVLS+KV R K LVECEG+SIDLS
Subjt:  KSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNGGDVEIIEKDALDDCNERPV--SSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLS

Query:  GDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALCNVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKV---P
        GDMGAVGR+VVSD++    ++ LDLKGTIY++ ++PSRTFCVV+ GQ+EAKIE+IMNDFIQL    NV EAETMVEGTL+GF F+S+DE  K +K    P
Subjt:  GDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALCNVDEAETMVEGTLDGFLFDSEDEGEKISKV---P

Query:  TDQN-----EPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKSTKSKK
         DQ+     E       K+K K E   G+KR +   + Q P    KK + S  K  K+KK
Subjt:  TDQN-----EPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKSTKSKK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTATCATCGGATTCTGAGTTATCGCCTGTTAATAGTTTTATAAAGGAGGATTATGGTCATCATGAAGAATTATCTGAACTTACGACATCTCACTTCCAAGGGAGAGG
GAAGGATGAAAATGCAGGTGGAAAATCTAAGTCAAGGAAAATATCAGATAAAAAGTTGTCAAAAAAACAGGTCAAATCACAAGTTTGCACTTCGCCCGAAGAGAAGATAG
TCATTTCTGATACAAATAAAGAACGACTTACGTTGGAAGGATCTGAATGCTATGTAAGCAATGGTGGAGATGTGGAGATCATAGAAAAAGATGCATTGGATGACTGCAAC
GAACGTCCTGTTTCCTCCTCAAGGTTGCCACTGGTGCTGTCTGACAAAGTTCAAAGATTGAAGGCACTTGTTGAGTGTGAAGGAAATTCAATAGATTTGAGTGGTGACAT
GGGTGCTGTTGGACGAATTGTAGTTTCTGATTCCTCATTTGCAAAAAATGAACTTTGCCTCGATTTGAAAGGTACAATTTATAGAGCGGCAGTAGTTCCTTCAAGGACAT
TTTGCGTTGTTAGCTTCGGTCAGTCGGAGGCGAAGATAGAATCTATCATGAATGACTTCATACAGCTGAAGGCACTCTGCAACGTTGATGAGGCTGAAACCATGGTTGAA
GGAACATTGGATGGCTTCTTATTTGATTCTGAAGATGAGGGCGAGAAAATAAGTAAAGTTCCAACAGACCAAAACGAGCCTGCCGAAGCGCTCAACAAGAAATCTAAAAA
TAAAGACGAAAAATCATCGGGGCGGAAGCGTGTTAAAACAGGAGGAAAGGTGCAGGCACCCAAGAAAGCGAGGAAGAAAGTTCAAGGTTCTAAGACTAAAAGTACAAAGA
GCAAGAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAAAAGTGGATCAAGCGGGCGCTGATTGAAATTTTGCCCCGTCCTACATTCTGGCGTTCCATTACATTTTCTGCTTCCGAAGGAGGAGGAAGAGAGCGAGGAGGAGGG
AGACAGCGCGCCGTCGTTTGTTCATTGTTGTTTTTCCATTACTCTGGTGCTGTCGTGCGGCCTCTCGAGATCAAATTTGAGGAGAGTGCTGGGGAAGAGCTTGGCAGTGG
ATCTCCAATCCAAGGATATTATTTGGCAGTGGCATGCTACTGTGGAAAGACCAGAAGACTTCTGAATTCGCTTGAAGGCCAAAATGAGCAGCTCGAGAGAGCAGTCTCCG
GATTGGATGCGTTCTTTCCAAGCACCAACTAGTGCTGCGCTATCCTCTAATTCTGAATCTTCAACGAATGGTAGCTTATCAATGGATGATTCAATTGATCAAAAGGGTCC
ATCTTCACTTAAAACCACACAAGATTCAGATGGAGATCAGATTCAAGGGGACAGTGACAACCATAATCTGGCAAAGGAAGTGAAACTTGAGGAACGTACAGGGAATGAAG
TGAGAGAATTTACTTCTGGATTTTTACTTTTATCTCAAAGCAGTCAGTTTTGATGTTATCATCGGATTCTGAGTTATCGCCTGTTAATAGTTTTATAAAGGAGGATTATG
GTCATCATGAAGAATTATCTGAACTTACGACATCTCACTTCCAAGGGAGAGGGAAGGATGAAAATGCAGGTGGAAAATCTAAGTCAAGGAAAATATCAGATAAAAAGTTG
TCAAAAAAACAGGTCAAATCACAAGTTTGCACTTCGCCCGAAGAGAAGATAGTCATTTCTGATACAAATAAAGAACGACTTACGTTGGAAGGATCTGAATGCTATGTAAG
CAATGGTGGAGATGTGGAGATCATAGAAAAAGATGCATTGGATGACTGCAACGAACGTCCTGTTTCCTCCTCAAGGTTGCCACTGGTGCTGTCTGACAAAGTTCAAAGAT
TGAAGGCACTTGTTGAGTGTGAAGGAAATTCAATAGATTTGAGTGGTGACATGGGTGCTGTTGGACGAATTGTAGTTTCTGATTCCTCATTTGCAAAAAATGAACTTTGC
CTCGATTTGAAAGGTACAATTTATAGAGCGGCAGTAGTTCCTTCAAGGACATTTTGCGTTGTTAGCTTCGGTCAGTCGGAGGCGAAGATAGAATCTATCATGAATGACTT
CATACAGCTGAAGGCACTCTGCAACGTTGATGAGGCTGAAACCATGGTTGAAGGAACATTGGATGGCTTCTTATTTGATTCTGAAGATGAGGGCGAGAAAATAAGTAAAG
TTCCAACAGACCAAAACGAGCCTGCCGAAGCGCTCAACAAGAAATCTAAAAATAAAGACGAAAAATCATCGGGGCGGAAGCGTGTTAAAACAGGAGGAAAGGTGCAGGCA
CCCAAGAAAGCGAGGAAGAAAGTTCAAGGTTCTAAGACTAAAAGTACAAAGAGCAAGAAATGAGGTTTGAATTTTTGTTGTATGCTTATGAACCGAGGTGGTCAAATAGT
TGTTTCTTATTGTATCCATGAGGCAAAATGGATGAGATTTGTACCTTAGTTCTCGAGAACCCAACCCAACACGAGATTGAATTAATAACTCTTCGTCTCTCTCTCTGCTC
TACACGAGATTGAATTAATAATTGTAATGATGAAGTATGCTATCGTTCTCATCTTTCTCATTGTCTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLSSDSELSPVNSFIKEDYGHHEELSELTTSHFQGRGKDENAGGKSKSRKISDKKLSKKQVKSQVCTSPEEKIVISDTNKERLTLEGSECYVSNGGDVEIIEKDALDDCN
ERPVSSSRLPLVLSDKVQRLKALVECEGNSIDLSGDMGAVGRIVVSDSSFAKNELCLDLKGTIYRAAVVPSRTFCVVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALCNVDEAETMVE
GTLDGFLFDSEDEGEKISKVPTDQNEPAEALNKKSKNKDEKSSGRKRVKTGGKVQAPKKARKKVQGSKTKSTKSKK