; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg27748 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg27748
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionespin-like
Genome locationCarg_Chr18:4263155..4263649
RNA-Seq ExpressionCarg27748
SyntenyCarg27748
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002110 - Ankyrin repeat
IPR036770 - Ankyrin repeat-containing domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6573477.1 Espin, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.3e-7582.46Show/hide
Query:  MGLYEEKKQLYKLVLRGEWRRLLEVCKGARQLVFPITSNRDTAFHLAVYSGKKEPLKTILEQVM-------EMDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAF
        M +YEEKKQLYKL LRGEWR L EVCK ARQL+ PI ++ +TA HLAV+SGK+EPLKTILEQ++       EMDY EHWKS  ENTPLHEAAT GNLDAF
Subjt:  MGLYEEKKQLYKLVLRGEWRRLLEVCKGARQLVFPITSNRDTAFHLAVYSGKKEPLKTILEQVM-------EMDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAF

Query:  KLLVEFRKEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRSPLNWMADGTTPIIHEAIQSENFG
        KLLVEFRKEDLL LNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRSPLNWMADGTTPIIHEAIQSENFG
Subjt:  KLLVEFRKEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRSPLNWMADGTTPIIHEAIQSENFG

KAG7012618.1 Espin, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.1e-90100Show/hide
Query:  MGLYEEKKQLYKLVLRGEWRRLLEVCKGARQLVFPITSNRDTAFHLAVYSGKKEPLKTILEQVMEMDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFR
        MGLYEEKKQLYKLVLRGEWRRLLEVCKGARQLVFPITSNRDTAFHLAVYSGKKEPLKTILEQVMEMDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFR
Subjt:  MGLYEEKKQLYKLVLRGEWRRLLEVCKGARQLVFPITSNRDTAFHLAVYSGKKEPLKTILEQVMEMDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFR

Query:  KEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRSPLNWMADGTTPIIHEAIQSENFG
        KEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRSPLNWMADGTTPIIHEAIQSENFG
Subjt:  KEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRSPLNWMADGTTPIIHEAIQSENFG

XP_022954414.1 espin-like [Cucurbita moschata]3.0e-7687.73Show/hide
Query:  MGLYEEKKQLYKLVLRGEWRRLLEVCKGARQLVFPITSNRDTAFHLAVYSGKKEPLKTILEQVMEMDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFR
        M +YEEKKQLYKL LRGEWR L EVCK A QLV PI ++ +TA HLAVYSGK EPLKTILEQVMEMDYIE+WKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFR
Subjt:  MGLYEEKKQLYKLVLRGEWRRLLEVCKGARQLVFPITSNRDTAFHLAVYSGKKEPLKTILEQVMEMDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFR

Query:  KEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRSPLNWMADGTTPIIHEAIQSENF
        KEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYY+RSPLNWM DG TPIIHEAIQSE+F
Subjt:  KEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRSPLNWMADGTTPIIHEAIQSENF

XP_022954460.1 espin-like [Cucurbita moschata]1.9e-8696.93Show/hide
Query:  MGLYEEKKQLYKLVLRGEWRRLLEVCKGARQLVFPITSNRDTAFHLAVYSGKKEPLKTILEQVMEMDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFR
        MGLYEEKKQLYKLVLRGEWRRLLEVCKGARQLVFPITSNRDTAFHLAVYSGKKEPLKTILEQVMEMDY EHWKS  ENTPLHEAAT GNLDAFKLLVEFR
Subjt:  MGLYEEKKQLYKLVLRGEWRRLLEVCKGARQLVFPITSNRDTAFHLAVYSGKKEPLKTILEQVMEMDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFR

Query:  KEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRSPLNWMADGTTPIIHEAIQSENF
        KEDLL LNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRSPLNWMADGTTPIIHEAIQSENF
Subjt:  KEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRSPLNWMADGTTPIIHEAIQSENF

XP_023523820.1 uncharacterized protein LOC111787944 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.1e-7382.82Show/hide
Query:  MGLYEEKKQLYKLVLRGEWRRLLEVCKGARQLVFPITSNRDTAFHLAVYSGKKEPLKTILEQVMEMDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFR
        M LY+E+KQL+KL LRGEW+ L +VCKGARQLV PI ++ +TA HLAVYSGK+EPLKTILEQVME +Y EHWKS  ENTPLHEAAT GNLDAFKLLVEFR
Subjt:  MGLYEEKKQLYKLVLRGEWRRLLEVCKGARQLVFPITSNRDTAFHLAVYSGKKEPLKTILEQVMEMDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFR

Query:  KEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRSPLNWMADGTTPIIHEAIQSENF
        KEDLLELN RGETPLYRAA+YGQLQIVEYILNECEDYY+RSP NWM DGTTPIIHEAIQSENF
Subjt:  KEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRSPLNWMADGTTPIIHEAIQSENF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1GQZ1 ankyrin repeat-containing protein ITN1-like1.7e-6173.01Show/hide
Query:  MGLYEEKKQLYKLVLRGEWRRLLEVCKGARQLVFPITSNRDTAFHLAVYSGKKEPLKTILEQVMEMDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFR
        M L ++ K+ Y L +RGEW  L +VCK A +LV PIT + DT+ HLAV+SGK+EPLKT L QVME++Y  +WKS+ ENTPLHEAATVGNL A KLLVE R
Subjt:  MGLYEEKKQLYKLVLRGEWRRLLEVCKGARQLVFPITSNRDTAFHLAVYSGKKEPLKTILEQVMEMDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFR

Query:  KEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRSPLNWMADGTTPIIHEAIQSENF
        KEDLLE+N RGETPLYRAARYG+L+IVEYILNECEDYYTRSPLNWMA G TPIIH AIQSENF
Subjt:  KEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRSPLNWMADGTTPIIHEAIQSENF

A0A6J1GR15 espin-like isoform X21.7e-6173.01Show/hide
Query:  MGLYEEKKQLYKLVLRGEWRRLLEVCKGARQLVFPITSNRDTAFHLAVYSGKKEPLKTILEQVMEMDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFR
        M L ++ K+ Y L +RGEW  L +VCK A +LV PIT + DT+ HLAV+SGK+EPLKT L QVME++Y  +WKS+ ENTPLHEAATVGNL A KLLVE R
Subjt:  MGLYEEKKQLYKLVLRGEWRRLLEVCKGARQLVFPITSNRDTAFHLAVYSGKKEPLKTILEQVMEMDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFR

Query:  KEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRSPLNWMADGTTPIIHEAIQSENF
        KEDLLE+N RGETPLYRAARYG+L+IVEYILNECEDYYTRSPLNWMA G TPIIH AIQSENF
Subjt:  KEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRSPLNWMADGTTPIIHEAIQSENF

A0A6J1GSG9 espin-like9.0e-8796.93Show/hide
Query:  MGLYEEKKQLYKLVLRGEWRRLLEVCKGARQLVFPITSNRDTAFHLAVYSGKKEPLKTILEQVMEMDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFR
        MGLYEEKKQLYKLVLRGEWRRLLEVCKGARQLVFPITSNRDTAFHLAVYSGKKEPLKTILEQVMEMDY EHWKS  ENTPLHEAAT GNLDAFKLLVEFR
Subjt:  MGLYEEKKQLYKLVLRGEWRRLLEVCKGARQLVFPITSNRDTAFHLAVYSGKKEPLKTILEQVMEMDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFR

Query:  KEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRSPLNWMADGTTPIIHEAIQSENF
        KEDLL LNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRSPLNWMADGTTPIIHEAIQSENF
Subjt:  KEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRSPLNWMADGTTPIIHEAIQSENF

A0A6J1GSX9 espin-like1.4e-7687.73Show/hide
Query:  MGLYEEKKQLYKLVLRGEWRRLLEVCKGARQLVFPITSNRDTAFHLAVYSGKKEPLKTILEQVMEMDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFR
        M +YEEKKQLYKL LRGEWR L EVCK A QLV PI ++ +TA HLAVYSGK EPLKTILEQVMEMDYIE+WKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFR
Subjt:  MGLYEEKKQLYKLVLRGEWRRLLEVCKGARQLVFPITSNRDTAFHLAVYSGKKEPLKTILEQVMEMDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFR

Query:  KEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRSPLNWMADGTTPIIHEAIQSENF
        KEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYY+RSPLNWM DG TPIIHEAIQSE+F
Subjt:  KEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRSPLNWMADGTTPIIHEAIQSENF

A0A6J1K0P4 espin-like isoform X25.9e-6273.62Show/hide
Query:  MGLYEEKKQLYKLVLRGEWRRLLEVCKGARQLVFPITSNRDTAFHLAVYSGKKEPLKTILEQVMEMDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFR
        M LY+EKK LYK  LR +W  + EVCK ARQ V PI +  DTA HLAV+SGK+EPLKT L QVMEM+Y EHWKSYVENTPLHEAA+VGNL A KLLVE R
Subjt:  MGLYEEKKQLYKLVLRGEWRRLLEVCKGARQLVFPITSNRDTAFHLAVYSGKKEPLKTILEQVMEMDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFR

Query:  KEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRSPLNWMADGTTPIIHEAIQSENF
        KEDLLE+N  GETPLYRAARYG+L IV+YILN+CED+Y RS LNW A G TPIIH AIQSENF
Subjt:  KEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRSPLNWMADGTTPIIHEAIQSENF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B1AK53 Espin5.2e-0738.27Show/hide
Query:  PLHEAATVGNLDAFKLLVEFRKEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNEC-EDYYTRSPLNWMADGTTPIIHEAIQ
        P+H AA  G+  + +LLVE   E +    K G TPLY A + G L++ +Y++ EC  D + R+      DG TP +H A Q
Subjt:  PLHEAATVGNLDAFKLLVEFRKEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNEC-EDYYTRSPLNWMADGTTPIIHEAIQ

Q5ZLC8 Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit C5.7e-0634.44Show/hide
Query:  TAFHLAVYSGKKEPLKTILEQVMEMDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFRKEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYIL
        TA H AV+SG  E +  +L +   +   +      +  P+H AA +G+L+  KLLV  R  D++  +K+G T L+ AA  GQ+++V ++L
Subjt:  TAFHLAVYSGKKEPLKTILEQVMEMDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFRKEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYIL

Q63618 Espin1.5e-0637.5Show/hide
Query:  PLHEAATVGNLDAFKLLVEFRKEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRSPLNWMADGTTPIIHEAIQ
        P+H AA  G+L + KLLV    E +      G TPLY A + G L++ +Y++ EC    +  P     DG TP +H A Q
Subjt:  PLHEAATVGNLDAFKLLVEFRKEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRSPLNWMADGTTPIIHEAIQ

Q99NH0 Ankyrin repeat domain-containing protein 173.4e-0631.53Show/hide
Query:  KGARQLVFPITSNRDTAFHLAVYSGKKEPLKTILEQVMEMDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFRKEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQI
        KGA     P+ S+RDTA  +A   G  +  + ++ +   +D     ++   NTPL  AA  G+LD  +LLV+    D+   + R  TPL  A R G +++
Subjt:  KGARQLVFPITSNRDTAFHLAVYSGKKEPLKTILEQVMEMDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFRKEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQI

Query:  VEYILNECEDY
        V Y++ E   +
Subjt:  VEYILNECEDY

Q9ET47 Espin2.3e-0733.05Show/hide
Query:  TAFHLAVYSGKKEPLKTILEQVMEMDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFRKEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRS
        T  HLA   G  + +K +L Q      I    +     P+H AA  G+L + KLLV    E +      G TPLY A + G L++ +Y++ EC    +  
Subjt:  TAFHLAVYSGKKEPLKTILEQVMEMDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFRKEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRS

Query:  PLNWMADGTTPIIHEAIQ
        P     DG TP +H A Q
Subjt:  PLNWMADGTTPIIHEAIQ

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G04710.1 ankyrin repeat family protein3.4e-0631.3Show/hide
Query:  AVYSGKKEPLKTILEQVME----MDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFRKEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRSP
        A  +G  E LK + +Q+ E       +E  K   +   LH AA  G  +  + L+E  K +    ++ G+TPL  AAR GQ++ V+Y+L +  D    S 
Subjt:  AVYSGKKEPLKTILEQVME----MDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFRKEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRSP

Query:  LNWMADGTTPIIHEA
        L     G T + H A
Subjt:  LNWMADGTTPIIHEA

AT3G04710.2 ankyrin repeat family protein3.4e-0631.3Show/hide
Query:  AVYSGKKEPLKTILEQVME----MDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFRKEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRSP
        A  +G  E LK + +Q+ E       +E  K   +   LH AA  G  +  + L+E  K +    ++ G+TPL  AAR GQ++ V+Y+L +  D    S 
Subjt:  AVYSGKKEPLKTILEQVME----MDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFRKEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRSP

Query:  LNWMADGTTPIIHEA
        L     G T + H A
Subjt:  LNWMADGTTPIIHEA

AT3G04710.3 ankyrin repeat family protein3.4e-0631.3Show/hide
Query:  AVYSGKKEPLKTILEQVME----MDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFRKEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRSP
        A  +G  E LK + +Q+ E       +E  K   +   LH AA  G  +  + L+E  K +    ++ G+TPL  AAR GQ++ V+Y+L +  D    S 
Subjt:  AVYSGKKEPLKTILEQVME----MDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFRKEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRSP

Query:  LNWMADGTTPIIHEA
        L     G T + H A
Subjt:  LNWMADGTTPIIHEA

AT3G54070.1 Ankyrin repeat family protein1.1e-0929.37Show/hide
Query:  LYKLVLRGEWRRLLE-VCKGARQLVFPITSNRDTAFHLAVYSGKKEPLKTILEQVMEMDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFRKEDLLEL-
        +YK VL G+W+     + +    +V  IT N + A H+AV +  K+ ++ +L ++   D     K+   NTPL  AA +G+++  ++L+   + DL ++ 
Subjt:  LYKLVLRGEWRRLLE-VCKGARQLVFPITSNRDTAFHLAVYSGKKEPLKTILEQVMEMDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFRKEDLLEL-

Query:  NKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNE
        N++  TP++ AA YG  ++V+Y+ ++
Subjt:  NKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNE

AT5G20350.1 Ankyrin repeat family protein with DHHC zinc finger domain2.6e-0630.97Show/hide
Query:  HLAVYSGKKEPLKTILEQVMEMDYIEHWKSYVEN---TPLHEAATVGNLDAFKLLVEF-RKEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTR
        H A Y G  + ++ +L       +++ ++   +    TPLH AA  GNL+A  +LV+  +KEDL+  +K G TP   AA     Q+  ++ N       R
Subjt:  HLAVYSGKKEPLKTILEQVMEMDYIEHWKSYVEN---TPLHEAATVGNLDAFKLLVEF-RKEDLLELNKRGETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTR

Query:  SPLNWMADGTTPI
        S L    DG++P+
Subjt:  SPLNWMADGTTPI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTCTGTACGAGGAGAAAAAACAGTTATACAAGCTAGTGTTGAGGGGAGAATGGAGGCGTCTGCTGGAGGTATGTAAGGGTGCGAGGCAGTTAGTGTTTCCGATCAC
TAGCAATCGAGACACGGCGTTTCATTTGGCAGTGTACAGTGGAAAAAAAGAACCTTTAAAAACAATTCTTGAGCAGGTGATGGAGATGGATTACATAGAGCATTGGAAGA
GCTACGTTGAAAACACACCTCTACATGAAGCTGCCACTGTGGGGAATTTGGATGCTTTCAAGCTTTTGGTTGAGTTCAGGAAGGAGGATTTGTTGGAGTTGAACAAGCGG
GGTGAAACGCCTTTGTATAGGGCAGCCAGATATGGGCAACTTCAGATCGTTGAATATATTTTGAATGAATGTGAAGATTATTACACTCGATCTCCCCTAAATTGGATGGC
AGATGGTACTACTCCAATCATTCATGAAGCCATTCAAAGCGAGAACTTTGGTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGTCTGTACGAGGAGAAAAAACAGTTATACAAGCTAGTGTTGAGGGGAGAATGGAGGCGTCTGCTGGAGGTATGTAAGGGTGCGAGGCAGTTAGTGTTTCCGATCAC
TAGCAATCGAGACACGGCGTTTCATTTGGCAGTGTACAGTGGAAAAAAAGAACCTTTAAAAACAATTCTTGAGCAGGTGATGGAGATGGATTACATAGAGCATTGGAAGA
GCTACGTTGAAAACACACCTCTACATGAAGCTGCCACTGTGGGGAATTTGGATGCTTTCAAGCTTTTGGTTGAGTTCAGGAAGGAGGATTTGTTGGAGTTGAACAAGCGG
GGTGAAACGCCTTTGTATAGGGCAGCCAGATATGGGCAACTTCAGATCGTTGAATATATTTTGAATGAATGTGAAGATTATTACACTCGATCTCCCCTAAATTGGATGGC
AGATGGTACTACTCCAATCATTCATGAAGCCATTCAAAGCGAGAACTTTGGTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGLYEEKKQLYKLVLRGEWRRLLEVCKGARQLVFPITSNRDTAFHLAVYSGKKEPLKTILEQVMEMDYIEHWKSYVENTPLHEAATVGNLDAFKLLVEFRKEDLLELNKR
GETPLYRAARYGQLQIVEYILNECEDYYTRSPLNWMADGTTPIIHEAIQSENFG