; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg27812 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg27812
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionGlucan endo-1,3-beta-D-glucosidase
Genome locationCarg_Chr10:10530294..10532801
RNA-Seq ExpressionCarg27812
SyntenyCarg27812
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
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InterPro domainsIPR012946 - X8 domain
IPR044965 - Glycoside hydrolase family 17, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7024045.1 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 3 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.5e-211100Show/hide
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A0A1S3BQE9 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 46.7e-15285.92Show/hide
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A0A5A7U6N8 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 46.7e-15285.92Show/hide
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O65399 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 11.0e-1954.44Show/hide
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Q93V72 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 41.3e-2244.77Show/hide
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Q9FNQ2 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 11.3e-1941.71Show/hide
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Q9FZ86 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 31.4e-2144.16Show/hide
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Q9M069 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 75.8e-2047Show/hide
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        S  + T +  +    WCV + GA+   LQ++LD+ACG G DC  IQ GG+C+ PN + +HA++A N YFQK+P  PT CDF  +A VT+ NPS  +C+YP
Subjt:  SPPAMTNAPVIPGQSWCVARSGASEMALQSALDYACGTGADCSQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNP-SPTSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCLYP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09460.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein1.3e-5450.51Show/hide
Query:  TTMHDATDSPTTNFPTTPDTSTPTIITVPATNPITVTPSSPASTPVSIPLTTPITVPANSPVPLTNPVAPPVTVPGAQPITNPVTTYP--APSGGSPVVT
        TT HD  + PT  FPT P T+TPT  T P   P+T+TP++PA+T   +P  T I  P  +P P+     P +T P   P+TNPVT YP   PSG  PV  
Subjt:  TTMHDATDSPTTNFPTTPDTSTPTIITVPATNPITVTPSSPASTPVSIPLTTPITVPANSPVPLTNPVAPPVTVPGAQPITNPVTTYP--APSGGSPVVT

Query:  PVTNPVPVSPPAMTNAPVIPGQSWCVARSGASEMALQSALDYACGTGADCSQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNPS
        PV     V+PP ++N+P + GQSWCVA+ GAS+++LQ ALDYACG  ADCSQ+QQGG+CY+P +L++HASFAFNSY+QKNPSP SCDFGG+A + N+NPS
Subjt:  PVTNPVPVSPPAMTNAPVIPGQSWCVARSGASEMALQSALDYACGTGADCSQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNPS

Query:  TGSCLYPSSSSSATPASMTPSVPTPTPTTTAPITVAPTIVTNPTSSPVGTGMPENGTPPAVFNPDNPA-------SSIGSSTGFGTEIPPSSSTSIS
        TGSC+Y + SS++TP  MT    TPTP+T    TV    VT+    P G G+   GTPPA+FNP NP        SS G + G+G +  P+ +   S
Subjt:  TGSCLYPSSSSSATPASMTPSVPTPTPTTTAPITVAPTIVTNPTSSPVGTGMPENGTPPAVFNPDNPA-------SSIGSSTGFGTEIPPSSSTSIS

AT1G29380.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein1.1e-1838.11Show/hide
Query:  VPATNPI-----TVTPSSPASTPVSIPLTTPITVPANSPVPL--TNPVA--PPV---TVPGAQPITNPVTTY----PAPSGGSPVVTPV---TNPVPVSP
        +P  NP      T TP+    +P S+    P T P     PL  T P    PP+   T PG   +      Y    P   GG    T             
Subjt:  VPATNPI-----TVTPSSPASTPVSIPLTTPITVPANSPVPL--TNPVA--PPV---TVPGAQPITNPVTTY----PAPSGGSPVVTPV---TNPVPVSP

Query:  PAMTNAPVIPGQSWCVARSGASEMALQSALDYACG-TGADCSQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCLYPSS
               V  GQ WC+A++ AS  +LQ ALDYACG  GADC QIQQG +CY PNT+ +HASFAFNSY+QK+P   SC+FGG+A +T+++PS GSC +  S
Subjt:  PAMTNAPVIPGQSWCVARSGASEMALQSALDYACG-TGADCSQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCLYPSS

Query:  SSSATPASMTPSVPTPTPTTTAPITVAPTIVTNPTSSPVGTGMPENGTPPAVFNPDNPASSIGSS
        SSS T ++  PS  +P   ++ P +  P  +T PT+   G+G P     P      N A+S+  S
Subjt:  SSSATPASMTPSVPTPTPTTTAPITVAPTIVTNPTSSPVGTGMPENGTPPAVFNPDNPASSIGSS

AT1G69295.1 plasmodesmata callose-binding protein 48.9e-2444.77Show/hide
Query:  SWCVARSGASEMALQSALDYACGTGADCSQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSP-TSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCLYPSSSSSATPASMTPS
        ++C+ + G +E  LQ A+DYACG GADC+QIQ  G+CY PNT++NH   A NSY+QK  S   +CDF G+A  + + PST S     SSSS TP + TP+
Subjt:  SWCVARSGASEMALQSALDYACGTGADCSQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSP-TSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCLYPSSSSSATPASMTPS

Query:  VPTP---TPTTTAPITVAPTIVT----NPTSSPVGTGMPENGTPPAVFNPDNPASSIGSSTGFGTEIPPSSS
          TP   TPTT  P T  PT  T     PTS    TG P  GT   + N +   +S  SS   GT + P+ S
Subjt:  VPTP---TPTTTAPITVAPTIVT----NPTSSPVGTGMPENGTPPAVFNPDNPASSIGSSTGFGTEIPPSSS

AT2G30933.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein1.1e-2946.56Show/hide
Query:  TTPITVPANSPVPLTNPVAPPVTVPGAQPITNPVTTYP-APSGGSPVVTPVTNPVPVSPPAMTNAPVIPG-QSWCVARSGASEMALQSALDYACGT-GAD
        T  IT P      +T P+A         P T P T  P + S  S V T      P++ P+  +    PG QSWCVAR   ++MALQ+ALDYACG  GAD
Subjt:  TTPITVPANSPVPLTNPVAPPVTVPGAQPITNPVTTYP-APSGGSPVVTPVTNPVPVSPPAMTNAPVIPG-QSWCVARSGASEMALQSALDYACGT-GAD

Query:  CSQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCLYPSSSSSATPASMT-----------PSVPTPTP
        CS+IQ+GG+CYNPN+L  HASFAFNSY+QKNP P+SC+F G+A+  +++PS GSC +PS+S+S +  ++T           PS PTP P
Subjt:  CSQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCLYPSSSSSATPASMT-----------PSVPTPTP

AT2G30933.2 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein1.9e-2649.01Show/hide
Query:  TTPITVPANSPVPLTNPVAPPVTVPGAQPITNPVTTYP-APSGGSPVVTPVTNPVPVSPPAMTNAPVIPG-QSWCVARSGASEMALQSALDYACGT-GAD
        T  IT P      +T P+A         P T P T  P + S  S V T      P++ P+  +    PG QSWCVAR   ++MALQ+ALDYACG  GAD
Subjt:  TTPITVPANSPVPLTNPVAPPVTVPGAQPITNPVTTYP-APSGGSPVVTPVTNPVPVSPPAMTNAPVIPG-QSWCVARSGASEMALQSALDYACGT-GAD

Query:  CSQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNPS
        CS+IQ+GG+CYNPN+L  HASFAFNSY+QKNP P+SC+F G+A+  +++PS
Subjt:  CSQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNPS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATTCCGTCCGGGTTCCTGCGAGTTTCAGCTTCTGAATCGAAAGTTTGCATTTTGTCCACTAATGGCGTTTCATGTTTTCGCAAAAGATTTAAGGGGTTTTGTTGTTT
AGTGTCGGGTGAATCTTTTTTCTTCGTTTCCGTTCTGAATGTATCTGCTTCTGCCGTTATCTCAGGTAGATTTGGTGGATCGCATTTGGATGTGCAAGAAAATGCTTCGG
CAGAGTTGGAATGGAAGTTCAGTGAACTTGTTCGGACAACAATGCACGACGCGACCGACTCGCCGACAACGAATTTTCCGACAACTCCAGACACCTCCACGCCGACAATC
ATCACCGTTCCGGCGACCAACCCTATCACTGTCACTCCGTCGAGTCCTGCTTCCACGCCGGTGTCCATTCCCTTAACGACACCCATCACAGTTCCTGCTAACTCGCCGGT
GCCGCTCACCAATCCGGTTGCGCCGCCAGTTACAGTACCCGGAGCCCAGCCCATAACGAACCCGGTGACCACTTATCCAGCTCCGTCAGGTGGTTCGCCGGTAGTAACAC
CCGTCACAAACCCAGTTCCGGTGTCCCCTCCGGCGATGACGAACGCACCGGTAATTCCAGGACAGAGCTGGTGTGTGGCCAGGTCCGGCGCTTCTGAGATGGCTCTTCAG
TCGGCGTTGGACTACGCCTGTGGCACTGGGGCTGACTGTTCTCAAATCCAGCAAGGTGGAAGCTGCTACAACCCAAATACACTTGAAAACCACGCTTCTTTTGCATTCAA
TAGCTATTTTCAGAAGAATCCTTCTCCTACAAGCTGCGATTTTGGAGGATCTGCCATGGTTACCAACTCCAATCCAAGCACTGGCTCTTGCCTTTACCCATCATCATCTT
CCTCTGCGACGCCGGCATCCATGACGCCGTCGGTTCCAACGCCAACACCGACAACAACAGCGCCGATCACTGTCGCACCAACTATAGTTACGAACCCAACGTCTTCACCT
GTAGGGACCGGCATGCCAGAAAATGGAACTCCTCCTGCAGTCTTTAACCCAGACAATCCAGCTTCAAGTATTGGCAGCTCAACAGGGTTTGGAACTGAGATCCCTCCAAG
CTCAAGCACCTCAATATCCATGGCAGCTGGATTGAGACCCTTTACTTGGTGCATCATTATGACGATGTCCTTGATCACTCGCAGAATCACTCTGGAGTTATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTTCTTCCTTTCCCCCGTTTCTCTCTTTGAACTTTGGACGCGAGCCCCTTTACACCATTTTTCCTGTCTGGTTTCGTTGTTTTTAAAAGCAACGCCTCAATTAAACCGAT
CCCATTAAGAATCCAGTTGGGTCTATTCATTTGTCCCCAGAACTATAACCTCTCACCATTAAAATGGCCCAAACAGCTTCCAAATGCTTCTTCTTTTCCGTTCTGTCTCT
CCTCGCCATCTGCTCTTCTGGTAAGCAACTTCTTATTCTCGAACTAGAACAGGTTATAGATCTATCTAGCTCAGTTCTTCGTTTTCTGCTATGATTCCGTCCGGGTTCCT
GCGAGTTTCAGCTTCTGAATCGAAAGTTTGCATTTTGTCCACTAATGGCGTTTCATGTTTTCGCAAAAGATTTAAGGGGTTTTGTTGTTTAGTGTCGGGTGAATCTTTTT
TCTTCGTTTCCGTTCTGAATGTATCTGCTTCTGCCGTTATCTCAGGTAGATTTGGTGGATCGCATTTGGATGTGCAAGAAAATGCTTCGGCAGAGTTGGAATGGAAGTTC
AGTGAACTTGTTCGGACAACAATGCACGACGCGACCGACTCGCCGACAACGAATTTTCCGACAACTCCAGACACCTCCACGCCGACAATCATCACCGTTCCGGCGACCAA
CCCTATCACTGTCACTCCGTCGAGTCCTGCTTCCACGCCGGTGTCCATTCCCTTAACGACACCCATCACAGTTCCTGCTAACTCGCCGGTGCCGCTCACCAATCCGGTTG
CGCCGCCAGTTACAGTACCCGGAGCCCAGCCCATAACGAACCCGGTGACCACTTATCCAGCTCCGTCAGGTGGTTCGCCGGTAGTAACACCCGTCACAAACCCAGTTCCG
GTGTCCCCTCCGGCGATGACGAACGCACCGGTAATTCCAGGACAGAGCTGGTGTGTGGCCAGGTCCGGCGCTTCTGAGATGGCTCTTCAGTCGGCGTTGGACTACGCCTG
TGGCACTGGGGCTGACTGTTCTCAAATCCAGCAAGGTGGAAGCTGCTACAACCCAAATACACTTGAAAACCACGCTTCTTTTGCATTCAATAGCTATTTTCAGAAGAATC
CTTCTCCTACAAGCTGCGATTTTGGAGGATCTGCCATGGTTACCAACTCCAATCCAAGCACTGGCTCTTGCCTTTACCCATCATCATCTTCCTCTGCGACGCCGGCATCC
ATGACGCCGTCGGTTCCAACGCCAACACCGACAACAACAGCGCCGATCACTGTCGCACCAACTATAGTTACGAACCCAACGTCTTCACCTGTAGGGACCGGCATGCCAGA
AAATGGAACTCCTCCTGCAGTCTTTAACCCAGACAATCCAGCTTCAAGTATTGGCAGCTCAACAGGGTTTGGAACTGAGATCCCTCCAAGCTCAAGCACCTCAATATCCA
TGGCAGCTGGATTGAGACCCTTTACTTGGTGCATCATTATGACGATGTCCTTGATCACTCGCAGAATCACTCTGGAGTTATGAAATCACTGAGTTCTTCTCCTTGTACTG
TACATGAAAGGCACTCGTAATTCACAGCTTCAGAATCGCCACCCAGTTCCACCATGAGTGCAATTTTTGGAGGAGAAAAGGGACCAGAGGTGAGTTTGAGAGATAGACAA
GATGGTTTAGAGAATGCACTGCCACTGCCACTGCCTTGCTTGAGCTTTTGCTTGTGTAAAGATCAAATATATGTTAGTGATAGAGACGGATGTATTAGCTATTGGAACTT
TGAGACTGTAATATAATATTTTTATAAATATATCTATATGTTAGATTTTGGGAGTATTGTTGGAATTTGTATCGCTGGTTATTTACTTCAACGTGGTCGGTGCTTGAGAA
TTAGAACTAGAACTTTGGTTCCAGAAAACAGGGAGACATAGCTGTGGACTGGAAATGTTTCTATAACTATGTTTAAGTCGGAGTGTTTTGTACTTAAAAAGGAAAAGAAT
GGTTGTCGCTCAATTTGAAATTTGTTGAGTTACTCGTTGGTTGAAGTTAGAATCCTTGAATCAAAACATAAGATTTCATATTATCTCGTATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MIPSGFLRVSASESKVCILSTNGVSCFRKRFKGFCCLVSGESFFFVSVLNVSASAVISGRFGGSHLDVQENASAELEWKFSELVRTTMHDATDSPTTNFPTTPDTSTPTI
ITVPATNPITVTPSSPASTPVSIPLTTPITVPANSPVPLTNPVAPPVTVPGAQPITNPVTTYPAPSGGSPVVTPVTNPVPVSPPAMTNAPVIPGQSWCVARSGASEMALQ
SALDYACGTGADCSQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCLYPSSSSSATPASMTPSVPTPTPTTTAPITVAPTIVTNPTSSP
VGTGMPENGTPPAVFNPDNPASSIGSSTGFGTEIPPSSSTSISMAAGLRPFTWCIIMTMSLITRRITLEL