CuGenDBv2

Gene ID	Carg27878
Organism	Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Description	transcription factor Pur-alpha 1-like
Genome location	Carg_Chr11:3599460..3602621
RNA-Seq Expression	Carg27878
Synteny	Carg27878
Gene Ontology terms	GO:0110165 - cellular anatomical structure (cellular component) GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function) GO:0032422 - purine-rich negative regulatory element binding (molecular function)
InterPro domains	IPR006628 - Purine-rich element binding protein family

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG7022000.1 Transcription factor Pur-alpha 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

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KAG7022011.1 Transcription factor Pur-alpha 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

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100

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XP_022967890.1 transcription factor Pur-alpha 1-like [Cucurbita maxima]

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A0A1S4DZ49 transcription factor Pur-alpha 1 isoform X1

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A0A5A7UN79 Transcription factor Pur-alpha 1 isoform X2

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A0A5D3CEN1 Transcription factor Pur-alpha 1 isoform X2

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A0A6J1EUL9 transcription factor Pur-alpha 1-like

4.5e-55

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SwissProt top hits

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Q9SKZ1 Transcription factor Pur-alpha 1

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Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G32080.1 purin-rich alpha 1

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59.75

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AT2G32080.2 purin-rich alpha 1

3.4e-39

60.13

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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGTTCCCTCTCGTGGGATCCATGTTCTTAATCTCTTCAAATTACTATATCAATTCTGATGATTTCCGGAAGTTTTTGCAAGGAATTGCCAGCTTCGACACCAAGGCGCC
TTTGTTCCTCTATCTCTTCTCTGTTCATCGTCTCCTCCACTTATTACTAGTTCATCTCTGTGAATCTCCTGTTCAACTTTTGCTAATTTACTCATCCTGCCTTCAGGTTT
TACTTGGACATTGGCTGAAATCGGGGTCGATTTTGAAGGTATCTGAAGCTTCTGTCAGTAGAAACCGCAGCACCATTATCGTTCCTGCTGGAAGCAATCGGGACGAGGGA
TGGACTGCGTTCAGAAACATTTTGGCAGAGATCAATGAAGCGTCTAGGCTTTTCATACTGCCCAATCAGGAAAATTCCGAACATTCAGAACGTCTAGTCGGACTTTCGGA
TGATGTAGGTGCTGGCTTCATATCAGGTCATAGTAGTCAACCTGGTCCAACCTCTGACTTGAATGTAGACAGACAAGTAGACTTATCATCAGCTCAAGATGAAATGGGCC
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mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

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VQVAGADRSSIILPLSG

Carg27878 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome