CuGenDBv2

Gene ID	Carg28077
Organism	Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Description	Heat shock protein 90
Genome location	Carg_Chr06:3629435..3630167
RNA-Seq Expression	Carg28077
Synteny	Carg28077
Gene Ontology terms	GO:0006457 - protein folding (biological process) GO:0034605 - cellular response to heat (biological process) GO:0050821 - protein stabilization (biological process) GO:0005829 - cytosol (cellular component) GO:0005886 - plasma membrane (cellular component) GO:0032991 - protein-containing complex (cellular component) GO:0048471 - perinuclear region of cytoplasm (cellular component) GO:0005524 - ATP binding (molecular function) GO:0016887 - ATPase activity (molecular function) GO:0051082 - unfolded protein binding (molecular function)
InterPro domains	IPR001404 - Heat shock protein Hsp90 family IPR003594 - Histidine kinase/HSP90-like ATPase IPR019805 - Heat shock protein Hsp90, conserved site IPR020575 - Heat shock protein Hsp90, N-terminal IPR036890 - Histidine kinase/HSP90-like ATPase superfamily

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG7028312.1 Heat shock cognate protein 80, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

7.1e-40

100

Show/hide

Query:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKAGE
        MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKAGE
Subjt:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKAGE

KZM93821.1 hypothetical protein DCAR_017066 [Daucus carota subsp. sativus]

2.3e-38

95.56

Show/hide

Query:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKAGE
        MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDK+KLDAQPELFIHIIPDKA+N+LT+IDSGIGMTKAGE
Subjt:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKAGE

XP_022949808.1 heat shock cognate protein 80 [Cucurbita moschata]

1.3e-38

100

Show/hide

Query:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA
        MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA
Subjt:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA

XP_023005321.1 heat shock protein 90-2 [Cucurbita maxima]

3.9e-38

98.86

Show/hide

Query:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA
        MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDK NNSLTIIDSGIGMTKA
Subjt:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA

XP_023531429.1 heat shock cognate protein 80-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]

6.7e-38

97.73

Show/hide

Query:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA
        MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISN+SDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANN+LTIIDSGIGMTKA
Subjt:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A164Y0R2 HATPase_c domain-containing protein

1.1e-38

95.56

Show/hide

Query:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKAGE
        MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDK+KLDAQPELFIHIIPDKA+N+LT+IDSGIGMTKAGE
Subjt:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKAGE

A0A2Z7BPE2 Heat shock cognate protein 80-like

3.2e-38

97.73

Show/hide

Query:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA
        MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISN+SDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANN+LTIIDSGIGMTKA
Subjt:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA

A0A6J1GD51 heat shock cognate protein 80

6.5e-39

100

Show/hide

Query:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA
        MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA
Subjt:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA

A0A6J1I2J1 heat shock cognate protein 80

3.2e-38

97.73

Show/hide

Query:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA
        MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISN+SDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANN+LTIIDSGIGMTKA
Subjt:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA

A0A6J1KUM6 heat shock protein 90-2

1.9e-38

98.86

Show/hide

Query:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA
        MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDK NNSLTIIDSGIGMTKA
Subjt:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

A2YWQ1 Heat shock protein 81-1

6.9e-38

90.8

Show/hide

Query:  ADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA
        ++TETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISN+SDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHI+PDKA+N+L+IIDSGIGMTK+
Subjt:  ADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA

O03986 Heat shock protein 90-4

2.8e-39

94.32

Show/hide

Query:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA
        MAD ETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISN+SDALDKIRFESLTDKSKLD QPELFIHIIPDK NN+LTIIDSGIGMTKA
Subjt:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA

P36181 Heat shock cognate protein 80

2.2e-39

94.32

Show/hide

Query:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA
        M+D ETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISN+SDALDKIRFESLTDKSKLD QPELFIHIIPDKANN+LTIIDSGIGMTKA
Subjt:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA

P51818 Heat shock protein 90-3

2.8e-39

94.32

Show/hide

Query:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA
        MAD ETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISN+SDALDKIRFESLTDKSKLD QPELFIHIIPDK NN+LTIIDSGIGMTKA
Subjt:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA

P55737 Heat shock protein 90-2

2.8e-39

94.32

Show/hide

Query:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA
        MAD ETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISN+SDALDKIRFESLTDKSKLD QPELFIHIIPDK NN+LTIIDSGIGMTKA
Subjt:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G52640.1 heat shock protein 90.1

4.2e-38

88.64

Show/hide

Query:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA
        MAD ETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISN+SDALDKIRFESLTDKSKLD QPELFI ++PDK+N +L+IIDSGIGMTKA
Subjt:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA

AT5G56000.1 HEAT SHOCK PROTEIN 81.4

2.0e-40

94.32

Show/hide

Query:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA
        MAD ETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISN+SDALDKIRFESLTDKSKLD QPELFIHIIPDK NN+LTIIDSGIGMTKA
Subjt:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA

AT5G56010.1 heat shock protein 81-3

2.0e-40

94.32

Show/hide

Query:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA
        MAD ETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISN+SDALDKIRFESLTDKSKLD QPELFIHIIPDK NN+LTIIDSGIGMTKA
Subjt:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA

AT5G56030.1 heat shock protein 81-2

2.0e-40

94.32

Show/hide

Query:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA
        MAD ETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISN+SDALDKIRFESLTDKSKLD QPELFIHIIPDK NN+LTIIDSGIGMTKA
Subjt:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKA

AT5G56030.2 heat shock protein 81-2

8.7e-36

70.94

Show/hide

Query:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASD-----------------------------ALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDK
        MAD ETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISN+SD                             ALDKIRFESLTDKSKLD QPELFIHIIPDK
Subjt:  MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASD-----------------------------ALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDK

Query:  ANNSLTIIDSGIGMTKA
         NN+LTIIDSGIGMTKA
Subjt:  ANNSLTIIDSGIGMTKA

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCGGATACTGAAACGTTCGCCTTCCAGGCTGAGATTAATCAGCTCCTCAGTCTGATTATCAACACGTTTTACAGTAACAAGGAGATCTTCCTTCGGGAACTTATTAG
CAACGCCTCAGATGCTCTAGATAAAATCAGGTTTGAGAGCTTGACCGACAAGAGCAAGCTTGATGCCCAGCCTGAACTATTCATCCACATCATTCCTGACAAGGCAAACA
ATTCCTTGACGATTATTGACAGTGGTATTGGAATGACCAAGGCTGGTGAGTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MADTETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKANNSLTIIDSGIGMTKAGE

Carg28077 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome