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Carg28121 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg28121
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionpumilio homolog 12-like isoform X1
Genome locationCarg_Chr11:3609722..3611007
RNA-Seq ExpressionCarg28121
SyntenyCarg28121
Gene Ontology termsGO:0006417 - regulation of translation (biological process)
GO:0003723 - RNA binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6588121.1 Pumilio-like 12, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.1e-3290.7Show/hide
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KAG7022012.1 hypothetical protein SDJN02_15741, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]9.0e-40100Show/hide
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XP_022930793.1 pumilio homolog 12-like [Cucurbita moschata]8.2e-3391.86Show/hide
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XP_022966829.1 pumilio homolog 12-like isoform X1 [Cucurbita maxima]6.3e-3391.86Show/hide
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XP_022966836.1 pumilio homolog 12-like isoform X2 [Cucurbita maxima]6.3e-3391.86Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LZQ0 PUM-HD domain-containing protein2.1e-1052.63Show/hide
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A0A5A7UN64 Pumilio-like protein 12-like isoform X11.6e-1052.63Show/hide
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A0A6J1EWD9 pumilio homolog 12-like4.0e-3391.86Show/hide
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A0A6J1HQE5 pumilio homolog 12-like isoform X23.0e-3391.86Show/hide
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A0A6J1HUY8 pumilio homolog 12-like isoform X13.0e-3391.86Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCACATTAAACTGACAACTGATCTTGAGAGGCTTTATGGTGAGAATCCGATAGTTGCTCGTGAGAATGGACGTACTGAGGAATCAGTTCATCCGAGAATGACTTCGAT
GGTTGCAGATTCCTGTAAGGGCTCGTCTTTGGAGAACGGAAAGGTCATGATGAATGAGCTTCAGCAATCAACAGGGTCATATTTCGGACGGGGGGAAAGTAACCGGGCGA
TCAGGGACCACCGGTCATTGACATCTGCAGTCGAAAGAAATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCACATTAAACTGACAACTGATCTTGAGAGGCTTTATGGTGAGAATCCGATAGTTGCTCGTGAGAATGGACGTACTGAGGAATCAGTTCATCCGAGAATGACTTCGAT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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