; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg28292 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg28292
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptiontetrapyrrole-binding protein, chloroplastic-like
Genome locationCarg_Chr17:5300671..5301444
RNA-Seq ExpressionCarg28292
SyntenyCarg28292
Gene Ontology termsGO:0010019 - chloroplast-nucleus signaling pathway (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0046906 - tetrapyrrole binding (molecular function)
InterPro domainsIPR008629 - GUN4-like
IPR037215 - GUN4-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6575363.1 Tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.4e-13399.61Show/hide
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KAG7013908.1 Tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.7e-134100Show/hide
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XP_022953248.1 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic-like [Cucurbita moschata]2.2e-12694.98Show/hide
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XP_022992337.1 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic-like [Cucurbita maxima]1.5e-12795.02Show/hide
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XP_023547651.1 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.3e-13097.28Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KCD2 GUN4 domain-containing protein5.3e-10277.57Show/hide
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A0A1S3BE43 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic6.1e-10680.38Show/hide
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A0A5A7SPC7 Tetrapyrrole-binding protein6.1e-10680.38Show/hide
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A0A6J1GMW2 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic-like1.1e-12694.98Show/hide
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A0A6J1JPI7 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic-like7.4e-12895.02Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O19887 Uncharacterized protein ycf531.1e-2235.21Show/hide
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           +  +P EF+W +    P GHLPL N LRG  ++  I  +
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P51202 Uncharacterized protein ycf532.2e-2034.87Show/hide
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        ++  + + +L+  L   N   AD+ T++ LI LAG   K R ++YF++++ I  ++L+ ID LW  +S GKFG+ VQ++++  + +++ + + K+GW   
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           EI +   R +P EF W  T   P+GHLPL N LRG Q+++ + SH A++
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P72583 Ycf53-like protein1.3e-2034.64Show/hide
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        ++  + +  L+  L +++F  ADE TR  L  LAG  A +R ++YF+EV+   + +L  I+ LW  +S+G FG+SVQ+R++    ++FTKL+ K+GW   
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                 +  +P  F W+L+   P+GHLPL N LRG ++  ++  HP + +
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Q1XDT5 Uncharacterized protein ycf534.4e-2134.87Show/hide
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        ++  +++ +L+  L  ++  +AD+ T++ LI LAG  A+ R ++YF++++ I + +L+ ID LW  +S GKFG  VQ++++  V +D+ K + K+GW   
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           E+++   R +P EF W      P GHLPL N LRG Q+++ + +H A+E
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Q9LX31 Tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic5.5e-5649.43Show/hide
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        HS PS  H     H + +  P   S    +S+++  L+ S S+ +++  A S++ST  AS    ++   +A  FD LE HL  +NFRQADEETRRLLI +
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        +G+AA KRGYV+FSEV+ IS ++L+AID+LW K+SDG+FGYSVQ++++ KV +DFT+ F+K+ WMK LDTE+ QYNYRAFP EF WEL +ETP GHLPLT
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        NALRGTQL+  +LSHPAF       G  E+        A E  G         +R+FK +YSF
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G59400.1 enzyme binding;tetrapyrrole binding3.9e-5749.43Show/hide
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        HS PS  H     H + +  P   S    +S+++  L+ S S+ +++  A S++ST  AS    ++   +A  FD LE HL  +NFRQADEETRRLLI +
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        +G+AA KRGYV+FSEV+ IS ++L+AID+LW K+SDG+FGYSVQ++++ KV +DFT+ F+K+ WMK LDTE+ QYNYRAFP EF WEL +ETP GHLPLT
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        NALRGTQL+  +LSHPAF       G  E+        A E  G         +R+FK +YSF
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GTCTACTTCTCCGAAGTTCAATTCATTTCCTCCGACAATCTGAAAGCCATCGACGATCTCTGGCAGAAATACAGCGATGGAAAATTTGGGTATAGCGTACAGAAACGGGT
TTTCGAGAAAGTGAACAGAGATTTCACAAAATTGTTCATGAAACTTGGATGGATGAAGAAACTGGATACAGAAATTGAGCAGTACAATTACAGAGCATTTCCAACGGAGT
TCATTTGGGAGCTGACGGAGGAGACGCCGGAAGGGCATCTGCCATTGACTAACGCTTTGAGAGGGACGCAGTTGATGACCAACATTCTGAGCCATCCGGCATTCGAGGAG
GACGCCATTGAAGGAGGAGCTCAAGAAAACGTTGCAGCGGACGAAAATGGAGGATTCAAAAAGGGATTGGAAACGATGAGTGAGAGGATTTTCAAAAGGGATTATAGCTT
CTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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TTTCGAGAAAGTGAACAGAGATTTCACAAAATTGTTCATGAAACTTGGATGGATGAAGAAACTGGATACAGAAATTGAGCAGTACAATTACAGAGCATTTCCAACGGAGT
TCATTTGGGAGCTGACGGAGGAGACGCCGGAAGGGCATCTGCCATTGACTAACGCTTTGAGAGGGACGCAGTTGATGACCAACATTCTGAGCCATCCGGCATTCGAGGAG
GACGCCATTGAAGGAGGAGCTCAAGAAAACGTTGCAGCGGACGAAAATGGAGGATTCAAAAAGGGATTGGAAACGATGAGTGAGAGGATTTTCAAAAGGGATTATAGCTT
CTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAASHSLPSLRHTLRRPHRPNLSPNPFSSSSSSSSLLLKSTSTPTAAIAATSSLSTAAASSFSLSSDTSSAVSFDELEGHLAAKNFRQADEETRRLLIALAGDAAKKRGY
VYFSEVQFISSDNLKAIDDLWQKYSDGKFGYSVQKRVFEKVNRDFTKLFMKLGWMKKLDTEIEQYNYRAFPTEFIWELTEETPEGHLPLTNALRGTQLMTNILSHPAFEE
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