; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CcUC01G009140 (gene) of Watermelon (PI 537277) v1 genome

Gene IDCcUC01G009140
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
Descriptiontranscription repressor KAN1-like isoform X2
Genome locationCicolChr01:10336076..10344351
RNA-Seq ExpressionCcUC01G009140
SyntenyCcUC01G009140
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0010158 - abaxial cell fate specification (biological process)
GO:0000976 - transcription regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR006447 - Myb domain, plants
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR044847 - Transcription repressor KANADI


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008463176.1 PREDICTED: probable transcription factor KAN2 [Cucumis melo]2.0e-7072.2Show/hide
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        MPNIQ  IN++   SSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPN   N+STF TNTIE+SN              + NQLFTH  H+ N + NQINNGV LDHH 
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Query:  FFNSINGFPIHPNRSFFSFKDSKQMSTSPTFSSSSSSSSISYSKISTFTSPPPYLHYQLDSGRSSKVARGRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHER
            INGFPIHPN S F     KQ  TSP FS +SSSSS     ISTFT PPPYLHY LDS R S VARGRSMR PRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHER
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        ATPKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHK TDK AASPG
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XP_011655242.2 probable transcription factor KAN2 isoform X1 [Cucumis sativus]3.9e-8269.34Show/hide
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        MPNIQ  IN++      SSSSSTPFLDLSLQISPP   N++STF+TNTIE+S   I             NQLFT  PH+ N + +QINNGV LDHH  + 
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Query:  SINGFPIHPNRSFFSFKDSKQMSTSPTFSSSSSSSSISYSKISTFTSPPPYLHYQLDSGRSSKVARGRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERATP
         IN FPIHPN S F    SKQ  TSP    +SSSSSISYS+ STFT PP YLHY L+S R S +ARGRSMR PRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERATP
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Query:  KSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHKTTDKSAASPGRSEGSSGSLEDDIFSTQRDHMGYASSNNHLCSMNSI
        KSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHKTT+K AASPGRS+GSSGSLEDD+FSTQ D++G +SS   LCSMNSI
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XP_031741144.1 probable transcription factor KAN2 isoform X2 [Cucumis sativus]9.2e-6868.78Show/hide
Query:  MPNIQSFINLQSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPP---NNNSTFTTNTIESSNDRIIIGAPNHNHNHNHNQLFTHFPHHYNDTFNQINNGVWLDHHAFFN
        MPNIQ  IN++      SSSSSTPFLDLSLQISPP   N++STF+TNTIE+S   I             NQLFT  PH+ N + +QINNGV LDHH  + 
Subjt:  MPNIQSFINLQSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPP---NNNSTFTTNTIESSNDRIIIGAPNHNHNHNHNQLFTHFPHHYNDTFNQINNGVWLDHHAFFN

Query:  SINGFPIHPNRSFFSFKDSKQMSTSPTFSSSSSSSSISYSKISTFTSPPPYLHYQLDSGRSSKVARGRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERATP
         IN FPIHPN S F    SKQ  TSP    +SSSSSISYS+ STFT PP YLHY L+S R S +ARGRSMR PRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERATP
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        KSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHKTT+K AASP
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XP_031741145.1 probable transcription factor KAN2 isoform X3 [Cucumis sativus]9.2e-6868.78Show/hide
Query:  MPNIQSFINLQSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPP---NNNSTFTTNTIESSNDRIIIGAPNHNHNHNHNQLFTHFPHHYNDTFNQINNGVWLDHHAFFN
        MPNIQ  IN++      SSSSSTPFLDLSLQISPP   N++STF+TNTIE+S   I             NQLFT  PH+ N + +QINNGV LDHH  + 
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Query:  SINGFPIHPNRSFFSFKDSKQMSTSPTFSSSSSSSSISYSKISTFTSPPPYLHYQLDSGRSSKVARGRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERATP
         IN FPIHPN S F    SKQ  TSP    +SSSSSISYS+ STFT PP YLHY L+S R S +ARGRSMR PRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERATP
Subjt:  SINGFPIHPNRSFFSFKDSKQMSTSPTFSSSSSSSSISYSKISTFTSPPPYLHYQLDSGRSSKVARGRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERATP

Query:  KSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHKTTDKSAASP
        KSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHKTT+K AASP
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XP_038875583.1 transcription repressor KAN1 [Benincasa hispida]1.9e-12986.29Show/hide
Query:  MPNIQSFINLQSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPNNNSTFTTNTIESSNDRIIIGAPNHNHNHNHNQLFTHFPHHYNDTFNQINNGVWLDHHAFFNSIN
        MPNI+  IN++ SSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPNNNSTFT NT ESSN+ IIIG P    NHNHN+LFT   HHYND FNQINNGVWLDHH FFN IN
Subjt:  MPNIQSFINLQSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPNNNSTFTTNTIESSNDRIIIGAPNHNHNHNHNQLFTHFPHHYNDTFNQINNGVWLDHHAFFNSIN

Query:  GFPIHPNRSFFSFKDSKQMSTSPTF-SSSSSSSSISYSKISTFTSPPPYLHYQLDSGRSSKVARGRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERATPKS
        GFPIH NRSFFS KDSKQ+ TSPTF SSSSSSSSISYSKISTFT PPPYL YQLDSGRSS VA+GRSMR PRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERATPKS
Subjt:  GFPIHPNRSFFSFKDSKQMSTSPTF-SSSSSSSSISYSKISTFTSPPPYLHYQLDSGRSSKVARGRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERATPKS

Query:  VLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHKTTDKSAASPGRSEGSSGSLEDDIFSTQRDHMGYASSNNHLCSMNSISVPWRSCADMDGGQSSSLVPPKSSQQN
        VLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHKTTDK AASPGRSEGSSGSLEDD+FSTQ +HMGYASSN  LCSMNSISVPWRSCAD+DGGQSS  VPPKSSQQN
Subjt:  VLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHKTTDKSAASPGRSEGSSGSLEDDIFSTQRDHMGYASSNNHLCSMNSISVPWRSCADMDGGQSSSLVPPKSSQQN

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CJ01 probable transcription factor KAN29.6e-7172.2Show/hide
Query:  MPNIQSFINLQ---SSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPN---NNSTFTTNTIESSNDRIIIGAPNHNHNHNHNQLFTHFPHHYNDTFNQINNGVWLDHHA
        MPNIQ  IN++   SSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPN   N+STF TNTIE+SN              + NQLFTH  H+ N + NQINNGV LDHH 
Subjt:  MPNIQSFINLQ---SSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPN---NNSTFTTNTIESSNDRIIIGAPNHNHNHNHNQLFTHFPHHYNDTFNQINNGVWLDHHA

Query:  FFNSINGFPIHPNRSFFSFKDSKQMSTSPTFSSSSSSSSISYSKISTFTSPPPYLHYQLDSGRSSKVARGRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHER
            INGFPIHPN S F     KQ  TSP FS +SSSSS     ISTFT PPPYLHY LDS R S VARGRSMR PRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHER
Subjt:  FFNSINGFPIHPNRSFFSFKDSKQMSTSPTFSSSSSSSSISYSKISTFTSPPPYLHYQLDSGRSSKVARGRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHER

Query:  ATPKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHKTTDKSAASPG
        ATPKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHK TDK AASPG
Subjt:  ATPKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHKTTDKSAASPG

A0A6J1CIH2 probable transcription factor KAN21.3e-6461.75Show/hide
Query:  MPNIQSFINLQ--SSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPNNNSTFTTNTIESSNDRIIIGAPNHNHNHNHNQLFTHFPHHYNDT--FNQINNGVW-LDHHAF
        MPN+  FIN++  SSSSSSSSSSSTP LDLSLQISPPNNNST     IE S+     GA +H H         H P H+N T  FNQ NNGVW LDHH  
Subjt:  MPNIQSFINLQ--SSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPNNNSTFTTNTIESSNDRIIIGAPNHNHNHNHNQLFTHFPHHYNDT--FNQINNGVW-LDHHAF

Query:  FNSINGFPIHPNRSFFSFKDSKQMSTSPTFSSSSSSSSISYSKISTFTSPPPYLHYQLDSGRSSKVARGRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERA
        F  INGFPIH                 P+FSSSSSS+S    K+  F S PPYL YQLDS R + VARGR  R PRMRWT+SLHAQFVHAVELLGGHERA
Subjt:  FNSINGFPIHPNRSFFSFKDSKQMSTSPTFSSSSSSSSISYSKISTFTSPPPYLHYQLDSGRSSKVARGRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERA

Query:  TPKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHKTTDKSAASPGRSEGSSGSLEDDIFS----------TQRDHMGYASSNNHLCSMNS
        TPKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHKTTDK A SPG SEGSS S EDD+ S          + +    Y SSN+ L SMNS
Subjt:  TPKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHKTTDKSAASPGRSEGSSGSLEDDIFS----------TQRDHMGYASSNNHLCSMNS

A0A6J1E464 transcription repressor KAN1-like isoform X22.2e-5953.54Show/hide
Query:  MPNIQSFINLQSSSSSSSSSSSTPF----LDLSLQISPPNNNSTFTTNTIESSNDRIIIGAPNHNHNHNHNQLFTHFPHHYNDTFNQINNGVWLDHHAFF
        MPNIQSFIN+QSSSSSSSSSSS+      LDLSLQISPPNN                 +GA      H H              FNQI NGVWL     F
Subjt:  MPNIQSFINLQSSSSSSSSSSSTPF----LDLSLQISPPNNNSTFTTNTIESSNDRIIIGAPNHNHNHNHNQLFTHFPHHYNDTFNQINNGVWLDHHAFF

Query:  NSINGFPIHPNRSFFSFKDSKQMSTSPTFSSSSSSSSISYSKISTFTSPPPYLHYQLDSGRSSKVARGRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERAT
        N  N    H                                    F  PPP+L  QLD GR S +ARGR  R PRMRWTS+LHAQFVHAVELLGGHERAT
Subjt:  NSINGFPIHPNRSFFSFKDSKQMSTSPTFSSSSSSSSISYSKISTFTSPPPYLHYQLDSGRSSKVARGRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERAT

Query:  PKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHK-TTDKSAASPGRSEGSSGSLEDD------------------IFSTQRDHMGYASSNNHLCSMNSISV----
        PKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHK TTDK AASP RSE SSG L+D+                  +FSTQRD MGY+SSN  + S+NS SV    
Subjt:  PKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHK-TTDKSAASPGRSEGSSGSLEDD------------------IFSTQRDHMGYASSNNHLCSMNSISV----

Query:  PWRSCADMDGGQSSSL-VPPKSSQQ
        P RSC DMDGGQSS+L VPP+SSQQ
Subjt:  PWRSCADMDGGQSSSL-VPPKSSQQ

A0A6J1E4U1 transcription repressor KAN1-like isoform X12.2e-5953.54Show/hide
Query:  MPNIQSFINLQSSSSSSSSSSSTPF----LDLSLQISPPNNNSTFTTNTIESSNDRIIIGAPNHNHNHNHNQLFTHFPHHYNDTFNQINNGVWLDHHAFF
        MPNIQSFIN+QSSSSSSSSSSS+      LDLSLQISPPNN                 +GA      H H              FNQI NGVWL     F
Subjt:  MPNIQSFINLQSSSSSSSSSSSTPF----LDLSLQISPPNNNSTFTTNTIESSNDRIIIGAPNHNHNHNHNQLFTHFPHHYNDTFNQINNGVWLDHHAFF

Query:  NSINGFPIHPNRSFFSFKDSKQMSTSPTFSSSSSSSSISYSKISTFTSPPPYLHYQLDSGRSSKVARGRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERAT
        N  N    H                                    F  PPP+L  QLD GR S +ARGR  R PRMRWTS+LHAQFVHAVELLGGHERAT
Subjt:  NSINGFPIHPNRSFFSFKDSKQMSTSPTFSSSSSSSSISYSKISTFTSPPPYLHYQLDSGRSSKVARGRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERAT

Query:  PKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHK-TTDKSAASPGRSEGSSGSLEDD------------------IFSTQRDHMGYASSNNHLCSMNSISV----
        PKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHK TTDK AASP RSE SSG L+D+                  +FSTQRD MGY+SSN  + S+NS SV    
Subjt:  PKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHK-TTDKSAASPGRSEGSSGSLEDD------------------IFSTQRDHMGYASSNNHLCSMNSISV----

Query:  PWRSCADMDGGQSSSL-VPPKSSQQ
        P RSC DMDGGQSS+L VPP+SSQQ
Subjt:  PWRSCADMDGGQSSSL-VPPKSSQQ

A0A6J1JNA8 transcription repressor KAN1-like isoform X14.9e-5953.7Show/hide
Query:  MPNIQSFINLQSSSSSSSSSSSTPF---LDLSLQISPPNNNSTFTTNTIESSNDRIIIGAPNHNHNHNHNQLFTHFPHHYNDTFNQINNGVWLDHHAFFN
        MPNIQSFIN+QSSSSSSSSSSS+     LDLSLQISPPNN                 +GA      HNH              FNQI NGVWL +H    
Subjt:  MPNIQSFINLQSSSSSSSSSSSTPF---LDLSLQISPPNNNSTFTTNTIESSNDRIIIGAPNHNHNHNHNQLFTHFPHHYNDTFNQINNGVWLDHHAFFN

Query:  SINGFPIHPNRSFFSFKDSKQMSTSPTFSSSSSSSSISYSKISTFTSPPPYLHYQLDSGRSSKVARGRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERATP
               H +                                  F SP P+L +QLD GR S +ARGR  R PRMRWTS+LHAQFVHAVELLGGHERATP
Subjt:  SINGFPIHPNRSFFSFKDSKQMSTSPTFSSSSSSSSISYSKISTFTSPPPYLHYQLDSGRSSKVARGRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERATP

Query:  KSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHK-TTDKSAASPGRSEGSSGSLEDD------------------IFSTQRDHMGYASSNNHLCSMNSISV----P
        KSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRA K TTDK AASPGRSE SSG L+D+                  +FST+RD MGY+SSN  + SMNS SV    P
Subjt:  KSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHK-TTDKSAASPGRSEGSSGSLEDD------------------IFSTQRDHMGYASSNNHLCSMNSISV----P

Query:  WRSCADMDGGQSSSL-VPPKSSQQ
         RSC DMDGGQSS+L VPPKSSQQ
Subjt:  WRSCADMDGGQSSSL-VPPKSSQQ

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q0J235 Probable transcription factor RL91.5e-2541.09Show/hide
Query:  NHNHNHNQLFTHFPHHYNDTFNQINNGVWLDHHAFFNSINGFPIHPNRSFFSFKDSKQMSTSP-------TFSSSSSSSSISYSKISTFTSPPPYLHYQL
        +H+H+H ++  +  +H+  T+   +           +S    P+ P  +F S    + +S +        + S +  S  +  +          + H+ L
Subjt:  NHNHNHNQLFTHFPHHYNDTFNQINNGVWLDHHAFFNSINGFPIHPNRSFFSFKDSKQMSTSP-------TFSSSSSSSSISYSKISTFTSPPPYLHYQL

Query:  DSGR----------SSKVARGRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERATPKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHKTTDKSAASPGRSEGSSGS
          G+            K+   RSMR PRMRWTS+LHA+FVHAVELLGGHERATPKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQM+R  K+TDK AAS G ++G SG 
Subjt:  DSGR----------SSKVARGRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERATPKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHKTTDKSAASPGRSEGSSGS

Query:  LE
         E
Subjt:  LE

Q93WJ9 Transcription repressor KAN14.2e-2337.01Show/hide
Query:  MPNIQSFINLQSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPNNNSTFTTNTIESSNDRIIIGAPNHNHNHN----------------------------HNQLFTH
        +P+I  + + +SS  SS  SS     + S       ++    T  I    DR  +  P+  H +N                            HN+    
Subjt:  MPNIQSFINLQSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPNNNSTFTTNTIESSNDRIIIGAPNHNHNHN----------------------------HNQLFTH

Query:  FPHHYNDTFNQINNGVWLDHHAFFNSINGFPIHPNRSFFSFKDSKQMSTSPTFSSSSSSSSISYSKISTFTSPPPYLHYQLDSG--RS---SKVARGRSM
        FP H  ++      G  +D  +  NS +G+    N ++ S + S ++   P       +    Y  + +  S  P+ H     G  RS    K+   RSM
Subjt:  FPHHYNDTFNQINNGVWLDHHAFFNSINGFPIHPNRSFFSFKDSKQMSTSPTFSSSSSSSSISYSKISTFTSPPPYLHYQLDSG--RS---SKVARGRSM

Query:  RVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERATPKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHKTTDKSAASPGRSEGSSGSLEDDI
        R PRMRWTSSLHA+FVHAVELLGGHERATPKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQM+R  KTT+K AAS      S GS E+++
Subjt:  RVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERATPKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHKTTDKSAASPGRSEGSSGSLEDDI

Q941I2 Probable transcription factor KAN32.5e-2347.33Show/hide
Query:  INGFPIHPNRSFFSFKDSKQMSTSPTFSSSSSSSSISYSKISTFTSPPPYL-----HYQLDSGRSSKVARGRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHE
        I G P++ N+    +  S   S +P F S  +    S   I   T+P         H +    +  +    R +R PRMRWT++LHA FVHAV+LLGGHE
Subjt:  INGFPIHPNRSFFSFKDSKQMSTSPTFSSSSSSSSISYSKISTFTSPPPYL-----HYQLDSGRSSKVARGRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHE

Query:  RATPKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHKTTDKSAASPGRSEGSSGS
        RATPKSVLELMDV+DLTLAHVKSHLQM+R  K+T+K   S G+S+  +GS
Subjt:  RATPKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHKTTDKSAASPGRSEGSSGS

Q9C616 Probable transcription factor KAN21.8e-2640.48Show/hide
Query:  SSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPNNNSTFTTNTIESSNDRIIIGAPNHNHNHNHNQLFTHFPHHYNDTFNQINNGVWLDHHAFFNSINGFPI--------H
        S+S+S + + PF DLSL             + I     +     P    N N + + T F          +   +  D +     I G P+        H
Subjt:  SSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPNNNSTFTTNTIESSNDRIIIGAPNHNHNHNHNQLFTHFPHHYNDTFNQINNGVWLDHHAFFNSINGFPI--------H

Query:  PNR---SFFSFKDSKQMSTSPTFSSSSSSSSISYSKISTFTSPPPYLHYQLDSGRSSKVAR---GRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERATPKS
        P+R     F F  S  + +S T S + + ++ S++  S+ ++P  + H+     R+  + R    RSMR PRMRWT++LHA+FVHAVELLGGHERATPKS
Subjt:  PNR---SFFSFKDSKQMSTSPTFSSSSSSSSISYSKISTFTSPPPYLHYQLDSGRSSKVAR---GRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERATPKS

Query:  VLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHKTTDKSAASPGRSE----GSSGSLEDD
        VLELMDVKDLTLAHVKSHLQM+R  KTTDK+AAS G+S+    GSSG    D
Subjt:  VLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHKTTDKSAASPGRSE----GSSGSLEDD

Q9FJV5 Probable transcription factor KAN43.1e-2653.6Show/hide
Query:  SSKVARGRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERATPKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHKTTDKSAASPGRSEGSSGS-LEDDIFSTQRDHM
        SS V   RS+R PRMRWTS+LHA FVHAV+LLGGHERATPKSVLELM+VKDLTLAHVKSHLQM+R  K TDK +   G+ E  +   +ED+  + + D  
Subjt:  SSKVARGRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERATPKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHKTTDKSAASPGRSEGSSGS-LEDDIFSTQRDHM

Query:  GYASSNNHLCSMNSISVPWRSCADM
           +S N      +    W S  ++
Subjt:  GYASSNNHLCSMNSISVPWRSCADM

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G32240.1 Homeodomain-like superfamily protein1.3e-2740.48Show/hide
Query:  SSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPNNNSTFTTNTIESSNDRIIIGAPNHNHNHNHNQLFTHFPHHYNDTFNQINNGVWLDHHAFFNSINGFPI--------H
        S+S+S + + PF DLSL             + I     +     P    N N + + T F          +   +  D +     I G P+        H
Subjt:  SSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPNNNSTFTTNTIESSNDRIIIGAPNHNHNHNHNQLFTHFPHHYNDTFNQINNGVWLDHHAFFNSINGFPI--------H

Query:  PNR---SFFSFKDSKQMSTSPTFSSSSSSSSISYSKISTFTSPPPYLHYQLDSGRSSKVAR---GRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERATPKS
        P+R     F F  S  + +S T S + + ++ S++  S+ ++P  + H+     R+  + R    RSMR PRMRWT++LHA+FVHAVELLGGHERATPKS
Subjt:  PNR---SFFSFKDSKQMSTSPTFSSSSSSSSISYSKISTFTSPPPYLHYQLDSGRSSKVAR---GRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERATPKS

Query:  VLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHKTTDKSAASPGRSE----GSSGSLEDD
        VLELMDVKDLTLAHVKSHLQM+R  KTTDK+AAS G+S+    GSSG    D
Subjt:  VLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHKTTDKSAASPGRSE----GSSGSLEDD

AT4G17695.1 Homeodomain-like superfamily protein1.8e-2447.33Show/hide
Query:  INGFPIHPNRSFFSFKDSKQMSTSPTFSSSSSSSSISYSKISTFTSPPPYL-----HYQLDSGRSSKVARGRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHE
        I G P++ N+    +  S   S +P F S  +    S   I   T+P         H +    +  +    R +R PRMRWT++LHA FVHAV+LLGGHE
Subjt:  INGFPIHPNRSFFSFKDSKQMSTSPTFSSSSSSSSISYSKISTFTSPPPYL-----HYQLDSGRSSKVARGRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHE

Query:  RATPKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHKTTDKSAASPGRSEGSSGS
        RATPKSVLELMDV+DLTLAHVKSHLQM+R  K+T+K   S G+S+  +GS
Subjt:  RATPKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHKTTDKSAASPGRSEGSSGS

AT5G16560.1 Homeodomain-like superfamily protein3.0e-2437.01Show/hide
Query:  MPNIQSFINLQSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPNNNSTFTTNTIESSNDRIIIGAPNHNHNHN----------------------------HNQLFTH
        +P+I  + + +SS  SS  SS     + S       ++    T  I    DR  +  P+  H +N                            HN+    
Subjt:  MPNIQSFINLQSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPNNNSTFTTNTIESSNDRIIIGAPNHNHNHN----------------------------HNQLFTH

Query:  FPHHYNDTFNQINNGVWLDHHAFFNSINGFPIHPNRSFFSFKDSKQMSTSPTFSSSSSSSSISYSKISTFTSPPPYLHYQLDSG--RS---SKVARGRSM
        FP H  ++      G  +D  +  NS +G+    N ++ S + S ++   P       +    Y  + +  S  P+ H     G  RS    K+   RSM
Subjt:  FPHHYNDTFNQINNGVWLDHHAFFNSINGFPIHPNRSFFSFKDSKQMSTSPTFSSSSSSSSISYSKISTFTSPPPYLHYQLDSG--RS---SKVARGRSM

Query:  RVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERATPKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHKTTDKSAASPGRSEGSSGSLEDDI
        R PRMRWTSSLHA+FVHAVELLGGHERATPKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQM+R  KTT+K AAS      S GS E+++
Subjt:  RVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERATPKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHKTTDKSAASPGRSEGSSGSLEDDI

AT5G42630.1 Homeodomain-like superfamily protein2.2e-2753.6Show/hide
Query:  SSKVARGRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERATPKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHKTTDKSAASPGRSEGSSGS-LEDDIFSTQRDHM
        SS V   RS+R PRMRWTS+LHA FVHAV+LLGGHERATPKSVLELM+VKDLTLAHVKSHLQM+R  K TDK +   G+ E  +   +ED+  + + D  
Subjt:  SSKVARGRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERATPKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHKTTDKSAASPGRSEGSSGS-LEDDIFSTQRDHM

Query:  GYASSNNHLCSMNSISVPWRSCADM
           +S N      +    W S  ++
Subjt:  GYASSNNHLCSMNSISVPWRSCADM

AT5G42630.2 Homeodomain-like superfamily protein6.4e-2760.75Show/hide
Query:  SSKVARGRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERATPKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHKTTDKSAASPGRSEGSSGS-LEDDIFSTQRDHM
        SS V   RS+R PRMRWTS+LHA FVHAV+LLGGHERATPKSVLELM+VKDLTLAHVKSHLQM+R  K TDK +   G+ E  +   +ED+  + + D  
Subjt:  SSKVARGRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERATPKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMFRAHKTTDKSAASPGRSEGSSGS-LEDDIFSTQRDHM

Query:  GYASSNN
           +S N
Subjt:  GYASSNN


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCTAATATTCAAAGTTTTATAAATCTTCAATCGTCTTCTTCTTCTTCCTCCTCTTCTTCTTCAACCCCATTTCTTGATCTTTCTCTTCAAATTAGTCCACCCAATAA
TAATTCTACCTTCACTACTAATACTATTGAATCCTCTAATGATAGAATTATTATTGGGGCTCCTAATCATAATCATAATCATAATCATAATCAATTATTTACTCATTTTC
CTCATCATTACAATGATACATTCAATCAAATAAATAACGGGGTTTGGCTTGATCATCATGCTTTTTTCAACTCTATTAACGGTTTCCCAATTCATCCCAACCGTTCATTT
TTCTCTTTCAAAGACTCTAAACAAATGTCTACTTCTCCTACTTTCTCCTCCTCCTCCTCCTCGTCTTCAATCTCGTACTCGAAAATCTCTACTTTCACTTCACCACCACC
GTATCTCCATTACCAGTTGGACTCTGGTCGTTCGTCGAAGGTGGCGAGAGGACGATCCATGAGGGTGCCGAGAATGCGGTGGACGAGCAGCCTCCACGCTCAGTTTGTTC
ATGCTGTTGAGCTTCTTGGCGGCCATGAAAGAGCTACGCCTAAATCAGTTCTAGAGCTCATGGATGTGAAGGATCTAACATTGGCTCACGTGAAAAGCCATTTACAGATG
TTTCGGGCTCATAAGACGACCGACAAGTCTGCAGCTTCTCCAGGTCGCTCCGAAGGTAGCTCTGGCTCTCTAGAAGATGATATCTTTTCTACTCAAAGGGATCATATGGG
CTATGCTTCCTCCAATAATCATCTATGCTCTATGAATTCCATAAGCGTCCCTTGGAGGAGTTGCGCTGACATGGATGGCGGCCAATCATCATCTTTAGTTCCACCAAAAT
CCTCCCAACAAAATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTCTGCATGTCTGTGCTGAAGAAGACCAATTAAAACCATTTTTTTTCTTTTACATATCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCCTTTCTTTAACTTTCTACAAA
ATCTGTTCCCAAAGAACAAACCCAAACTGAAATCTCTTTTCTTCTTAATTTGTTGCTCTACCTGTTTTCTAATTTGTTTTTGAATGATTGGTTGTCTTTTCTTTTCTGTT
TCTTTTTTCATAAACCCTTCTTCTGTTTGTGACTCAAGGGTTTTAAAATGCCTAATATTCAAAGTTTTATAAATCTTCAATCGTCTTCTTCTTCTTCCTCCTCTTCTTCT
TCAACCCCATTTCTTGATCTTTCTCTTCAAATTAGTCCACCCAATAATAATTCTACCTTCACTACTAATACTATTGAATCCTCTAATGATAGAATTATTATTGGGGCTCC
TAATCATAATCATAATCATAATCATAATCAATTATTTACTCATTTTCCTCATCATTACAATGATACATTCAATCAAATAAATAACGGGGTTTGGCTTGATCATCATGCTT
TTTTCAACTCTATTAACGGTTTCCCAATTCATCCCAACCGTTCATTTTTCTCTTTCAAAGACTCTAAACAAATGTCTACTTCTCCTACTTTCTCCTCCTCCTCCTCCTCG
TCTTCAATCTCGTACTCGAAAATCTCTACTTTCACTTCACCACCACCGTATCTCCATTACCAGTTGGACTCTGGTCGTTCGTCGAAGGTGGCGAGAGGACGATCCATGAG
GGTGCCGAGAATGCGGTGGACGAGCAGCCTCCACGCTCAGTTTGTTCATGCTGTTGAGCTTCTTGGCGGCCATGAAAGAGCTACGCCTAAATCAGTTCTAGAGCTCATGG
ATGTGAAGGATCTAACATTGGCTCACGTGAAAAGCCATTTACAGATGTTTCGGGCTCATAAGACGACCGACAAGTCTGCAGCTTCTCCAGGTCGCTCCGAAGGTAGCTCT
GGCTCTCTAGAAGATGATATCTTTTCTACTCAAAGGGATCATATGGGCTATGCTTCCTCCAATAATCATCTATGCTCTATGAATTCCATAAGCGTCCCTTGGAGGAGTTG
CGCTGACATGGATGGCGGCCAATCATCATCTTTAGTTCCACCAAAATCCTCCCAACAAAATTAAACGAGATGAGAAGCTATTATGAAGAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPNIQSFINLQSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPNNNSTFTTNTIESSNDRIIIGAPNHNHNHNHNQLFTHFPHHYNDTFNQINNGVWLDHHAFFNSINGFPIHPNRSF
FSFKDSKQMSTSPTFSSSSSSSSISYSKISTFTSPPPYLHYQLDSGRSSKVARGRSMRVPRMRWTSSLHAQFVHAVELLGGHERATPKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQM
FRAHKTTDKSAASPGRSEGSSGSLEDDIFSTQRDHMGYASSNNHLCSMNSISVPWRSCADMDGGQSSSLVPPKSSQQN