CuGenDBv2

Gene ID	CcUC01G012760
Organism	Citrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
Description	Serine/threonine-protein kinase fray2
Genome location	CicolChr01:24761667..24771367
RNA-Seq Expression	CcUC01G012760
Synteny	CcUC01G012760
Gene Ontology terms	GO:0000380 - alternative mRNA splicing, via spliceosome (biological process) GO:0016310 - phosphorylation (biological process) GO:0005634 - nucleus (cellular component) GO:0005737 - cytoplasm (cellular component) GO:0016301 - kinase activity (molecular function)
InterPro domains	IPR010530 - NADH-ubiquinone reductase complex 1 MLRQ subunit IPR034604 - Serine/Arginine-related protein 53

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

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Alignment

KAA0055199.1 serine/threonine-protein kinase fray2 [Cucumis melo var. makuwa]

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XP_038895539.1 serine/threonine-protein kinase fray2 isoform X1 [Benincasa hispida]

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XP_038895540.1 serine/threonine-protein kinase fray2 isoform X2 [Benincasa hispida]

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A0A0A0LTD9 Uncharacterized protein

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A0A1S3AV81 serine/threonine-protein kinase fray2

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A0A5A7UP09 Serine/threonine-protein kinase fray2

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A0A5D3BJE5 Serine/threonine-protein kinase fray2

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A0A6J1E8B9 serine/threonine-protein kinase fray2

2.0e-145

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G29970.1 B12D protein

1.3e-21

50.6

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        + RW+RPEVYPL  A+G    +  FQL RN  +NP+ R+ KE+R  G+L+N  EGEKYA+H  RK++R + P++MPS+N FF+
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AT3G48120.1 unknown protein

1.1e-60

52.99

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        MEE KAAAYYDELTRKGEGAARFK+GLGFS + +N+V    +GSA  SSSSFL+ FVKAS+ +K+++  K +++ +I++KLKKK           PR  E
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        R  R+SS RRR  S+ER+    S RR     R R S RRS     Y D+ R R R R   RR+R     DR+ RRR +RS SL  +R             
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         R  E  K +  DYSRLI+GYD MS AE+VKAKMKLQL ETA  D +KG   GWERFEFDK+AP+DDEE+ E A+DDA LVK +GQS+RFSAIEA++EEQ
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        +KAAHDEAMFG P GQ    +T DD  E+ N K  E   +  A +LLSEK+
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AT3G48140.1 B12D protein

1.3e-35

81.18

Show/hide

Query:  SRWLRPEVYPLFAAVGVAVGICGFQLVRNICINPEVRVTKENRAAGVLDNFAEGEKYAEHFLRKFVRNKSPEIMPSINSFFTDPS
        SRWLRPEVYPLFAA GVAVGIC F L+RNI  NPEVR TKENRAAG+LDN AEGEKY E+FLRKFVRNK PEIMP +N FFTDP+
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

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GGTCTCCGCGTCCAAGGGCTCCGCTCCGCCTTCGTCGTCTTCCTTCCTCAGTTCTTTTGTTAAAGCCTCAAGCCCTTCCAAGGCCTCCGAGTTCGAAAAGCAAGCGCAGC
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CcUC01G012760 (gene) of Watermelon (PI 537277) v1 genome