; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CcUC01G013560 (gene) of Watermelon (PI 537277) v1 genome

Gene IDCcUC01G013560
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
Description50S ribosomal protein L19, chloroplastic-like
Genome locationCicolChr01:25738609..25741807
RNA-Seq ExpressionCcUC01G013560
SyntenyCcUC01G013560
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005840 - ribosome (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR001857 - Ribosomal protein L19
IPR008991 - Translation protein SH3-like domain superfamily
IPR038657 - Ribosomal protein L19 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8652777.1 hypothetical protein Csa_022701 [Cucumis sativus]6.0e-6577.01Show/hide
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XP_023522394.1 uncharacterized protein LOC111786317 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.7e-6475.53Show/hide
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XP_031743848.1 50S ribosomal protein L19-2, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus]6.0e-6577.01Show/hide
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XP_031743853.1 50S ribosomal protein L19-2, chloroplastic isoform X2 [Cucumis sativus]6.0e-6577.01Show/hide
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XP_038896029.1 uncharacterized protein LOC120084206 [Benincasa hispida]1.0e-6779.14Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LV41 Uncharacterized protein2.9e-6577.01Show/hide
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A0A1S3CHC3 50S ribosomal protein L19-2, chloroplastic-like isoform X15.2e-6274.87Show/hide
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A0A1S3CHF9 50S ribosomal protein L19-2, chloroplastic-like isoform X25.2e-6274.87Show/hide
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A0A6J1K1Y5 50S ribosomal protein L19, chloroplastic-like isoform X21.8e-6273.8Show/hide
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A0A6J1K3G4 50S ribosomal protein L19, chloroplastic-like isoform X11.8e-6273.8Show/hide
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        K+  SQMEF+P  K VSS C AFQS   H+FQLAEIAAPFSSRGIATTSSMESA QGSPA+DSDITPRIKFKRLDKTS+HIM                  
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B6IP95 50S ribosomal protein L193.4e-1045.45Show/hide
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P82413 50S ribosomal protein L19, chloroplastic5.8e-1858.11Show/hide
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Q2G8H1 50S ribosomal protein L195.8e-1044.16Show/hide
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        +Q L+ EA+ E KA++EIPD + G  V++ V V E +R RV   +G+ IAR N GL + F +R++  G G+E +FPL
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Q8RXX5 50S ribosomal protein L19-2, chloroplastic3.7e-1751.35Show/hide
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Q8W463 50S ribosomal protein L19-1, chloroplastic2.2e-1752.7Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G24240.1 Ribosomal protein L19 family protein2.0e-3758.78Show/hide
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AT4G11630.1 Ribosomal protein L19 family protein1.1e-3758.11Show/hide
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        ++SR  +TT   +S++QGSP  D  +  RIKFKRLDKT++HIM                              QI+DKEAVEEV++ REIP+IKPGYIVQ
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AT4G17560.1 Ribosomal protein L19 family protein1.6e-1852.7Show/hide
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AT5G11750.1 Ribosomal protein L19 family protein4.4e-3758.39Show/hide
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AT5G47190.1 Ribosomal protein L19 family protein2.7e-1851.35Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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