; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CcUC01G013630 (gene) of Watermelon (PI 537277) v1 genome

Gene IDCcUC01G013630
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionNADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1
Genome locationCicolChr01:26071306..26072664
RNA-Seq ExpressionCcUC01G013630
SyntenyCcUC01G013630
Gene Ontology termsGO:0022900 - electron transport chain (biological process)
GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
GO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0008137 - NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001694 - NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit 1/F420H2 oxidoreductase subunit H
IPR018086 - NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit 1, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG8362761.1 hypothetical protein BUALT_BualtUnG0039900 [Buddleja alternifolia]2.8e-2082.35Show/hide
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QVD39098.1 NADH dehydrogenase subunit 1 [Gleditsia sinensis]2.8e-2082.35Show/hide
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XP_029152592.1 uncharacterized protein LOC114926190 [Arachis hypogaea]1.6e-2082.35Show/hide
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XP_038889269.1 LOW QUALITY PROTEIN: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1-like [Benincasa hispida]1.6e-2083.82Show/hide
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YP_009913626.1 NADH dehydrogenase subunit 1 [Luffa acutangula]1.6e-2083.82Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A290WKZ7 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 11.4e-2082.35Show/hide
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A0A6C0ABA9 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 (Fragment)1.4e-2082.35Show/hide
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A0A7D6C5G1 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 17.9e-2183.82Show/hide
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A0A7G8P4A3 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 11.4e-2082.35Show/hide
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E9KZL0 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 11.4e-2082.35Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P26845 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 12.8e-1561.76Show/hide
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P31839 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 13.1e-2280.88Show/hide
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P92558 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 11.5e-2179.41Show/hide
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Q01148 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 11.5e-2179.41Show/hide
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Q01300 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 13.7e-2382.35Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G07785.1 NADH dehydrogenase family protein6.4e-2379.41Show/hide
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ATMG00516.1 NADH dehydrogenase 1C6.4e-2379.41Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GAAATTGATTCTAAAAGAACCTCTTTCACCAAGTAGTGCAAATTTCTCCCTTTTTAGATTGGCTCTAGTGGCTACATTTATGTTAAGTCTGGTCGCTCGGGCCGTTGTAC
CTTTTGATTATGGTATGAGATGTGTGGGGAACGTGTTGAATACTCCT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCCCTCACAAAAGTGCTTTGCTCGATCTTATGTTAGTGCCAGTGGCAGCGGTTGATGTTAATGTAGCGATTCTCTTTCGACTTCGAGGTCCTAATGTAGTGGGATCGTTC
GGATTGTTACAAACTCTAACAGATGGTTTGAAATTGATTCTAAAAGAACCTCTTTCACCAAGTAGTGCAAATTTCTCCCTTTTTAGATTGGCTCTAGTGGCTACATTTAT
GTTAAGTCTGGTCGCTCGGGCCGTTGTACCTTTTGATTATGGTATGAGATGTGTGGGGAACGTGTTGAATACTCCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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