; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CcUC01G015430 (gene) of Watermelon (PI 537277) v1 genome

Gene IDCcUC01G015430
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationCicolChr01:28246706..28247380
RNA-Seq ExpressionCcUC01G015430
SyntenyCcUC01G015430
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6584364.1 hypothetical protein SDJN03_20296, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.7e-7974.78Show/hide
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KAG7019949.1 hypothetical protein SDJN02_18916, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.9e-7874.35Show/hide
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XP_011660345.1 uncharacterized protein LOC105436376 [Cucumis sativus]1.1e-8982.01Show/hide
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XP_022924029.1 uncharacterized protein LOC111431577 [Cucurbita moschata]7.4e-7873.91Show/hide
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XP_038894861.1 uncharacterized protein LOC120083261 [Benincasa hispida]4.6e-9687.56Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LQD5 Uncharacterized protein5.3e-9082.01Show/hide
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A0A251PC24 Uncharacterized protein2.4e-3447.97Show/hide
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A0A6J1E811 uncharacterized protein LOC1114315773.6e-7873.91Show/hide
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A0A6J1GR95 uncharacterized protein LOC1114568055.2e-7771.49Show/hide
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A0A6J1K097 uncharacterized protein LOC1114899161.6e-7368.86Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G13360.1 unknown protein5.2e-1330.96Show/hide
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        E+E+  +       S      Q +LGYL  ASDDELGLPP   +S       E   ET+  +    S D   ++   GFED +  Y   + G G+G    
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              GG++VA+ GLF++SD  F        R ESL A
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AT1G13360.2 unknown protein6.3e-1130Show/hide
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              GG++VA+ G F Y+
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AT1G13360.3 unknown protein5.4e-1030.09Show/hide
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        E+E+  +       S      Q +LGYL  ASDDELGLPP   +S       E   ET+  +    S D   ++   GFED +  Y   + G G+G    
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              GG++VA+ GL
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AT3G25870.1 unknown protein1.9e-0733.52Show/hide
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        D V ++ ++D L   L+  D    RD+  +  GL     +LDS +KSFE E+    A   +   Q +LGYLF ASDDELGLPP               +P
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Query:  ASCSPDVFEL---------EGKL-GFEDEIPCYDSFELGMGIGSGTAEENGLGGGEFVALGGLFDYSDV-PFRPESLSA
         SC   V EL          G+L GFED +  +   +LG         ++GL    F    G  D  D+  +RPE L A
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAAATTACTCTGAGGATAAGAAGCGAGTTCGCGACGAGTTCGACGACTCGCTAGCCGATTCGGCTGAGTCCAAGCTCCGACGACTCAACTCGTCGGATTCG
AGATTGGTCAAGCCATGCACCAAGGAGAATTTGAATGTTGTCCAACATTCAACCGCTGCTGCCGGTGATTTGAATATTGATGATTTGGTGGAATCTGAGGAGATT
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GAGATTCAAGCTTTACCGGCGGAGGATCAGAATGAAAGCCCTCAGGCGGAACTCGGATATCTTTTTGGAGCGTCGGATGATGAGCTAGGGCTGCCTCCGAGCGGA
GGTTTGAGTACGGAAGGCAAGATGGAGACGATTGATTTCATGCCTGCTTCTTGTTCACCTGATGTGTTTGAGTTGGAAGGGAAGTTGGGGTTTGAAGATGAGATT
CCGTGTTACGACTCGTTCGAGTTGGGAATGGGGATTGGTTCCGGTACAGCGGAGGAGAATGGGTTGGGCGGCGGAGAGTTTGTTGCATTGGGCGGTTTGTTTGAT
TATTCGGACGTGCCATTTCGGCCGGAGTCGTTATCGGCTTTGTAG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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EIQALPAEDQNESPQAELGYLFGASDDELGLPPSGGLSTEGKMETIDFMPASCSPDVFELEGKLGFEDEIPCYDSFELGMGIGSGTAEENGLGGGEFVALGGLFD
YSDVPFRPESLSAL