; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CcUC02G019750 (gene) of Watermelon (PI 537277) v1 genome

Gene IDCcUC02G019750
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
Descriptionglycine-rich protein-like
Genome locationCicolChr02:2450293..2451114
RNA-Seq ExpressionCcUC02G019750
SyntenyCcUC02G019750
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR010800 - Glycine rich protein


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6572253.1 Glycine-rich protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.8e-4384.8Show/hide
Query:  MSSKVFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGG-----
        MSSK F+FLGLL A VLL+SSEVAARDLAETS+KK+NEAT ETNGVEDAKYGGYD GYGGR  YG GGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYG RGGYGG     
Subjt:  MSSKVFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGG-----

Query:  -GCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
         GCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  -GCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP

KAG7011884.1 Glycine-rich protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.2e-4284.68Show/hide
Query:  MSSKVFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGG-----
        MSSK F+FLGLL A VLL+SSEVAARDLAETS+KK+NEAT ETNGVEDAKYGGYD GYGGR  YG GGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYG RGGYGG     
Subjt:  MSSKVFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGG-----

Query:  -GCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
         GCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
Subjt:  -GCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK

XP_022952570.1 cold and drought-regulated protein CORA-like isoform X1 [Cucurbita moschata]1.1e-4387.39Show/hide
Query:  MSSKVFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGGCRYG
        MSSK F+FLGLL A VLL+SSEVAARDLAETS+KK+NEAT ETNGVEDAKYGGYD GYGGR  YG GGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYG  GGYG GCRYG
Subjt:  MSSKVFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGGCRYG

Query:  RCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        RCGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  RCGYRCCSYAGEVVEGAKP

XP_022969295.1 glycine-rich protein-like [Cucurbita maxima]7.0e-4386.67Show/hide
Query:  MSSKVFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRY-GHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGGCRY
        MSSK F+FLGLL AF+LL+SSEVAARDLAETS+ K+ EATVETNGVEDAKYGGYD GYGGR  Y G GGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYG RGGYG GCRY
Subjt:  MSSKVFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRY-GHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGGCRY

Query:  GRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        GRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  GRCGYRCCSYAGEVVEGAKP

XP_023554637.1 cold and drought-regulated protein CORA-like isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.7e-4285Show/hide
Query:  MSSKVFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRY-GHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGGCRY
        MSSK F+FLG L A +L++SSEVAARDLAETS+KK+NEATVETNGVEDAKYGGYD GYGGR  Y G GGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYG  GGYG GCRY
Subjt:  MSSKVFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRY-GHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGGCRY

Query:  GRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        GRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  GRCGYRCCSYAGEVVEGAKP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3C180 cold and drought-regulated protein CORA-like6.6e-3989.26Show/hide
Query:  MSSKVFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKY-GGYDRGYGGRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGY-GDRGGYGGGCR
        MSSK FVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAET SK DNEATVETNGVEDAKY GGYDRGYGG   YG GGY GRGGY GRGGYGGRGGY G RGGYG GCR
Subjt:  MSSKVFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKY-GGYDRGYGGRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGY-GDRGGYGGGCR

Query:  YGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        YGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  YGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP

A0A5D3DE59 Cold and drought-regulated protein CORA-like1.3e-3990.08Show/hide
Query:  MSSKVFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKY-GGYDRGYGGRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGY-GDRGGYGGGCR
        MSSK FVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSK DNEATVETNGVEDAKY GGYDRGYGG   YG GGY GRGGY GRGGYGGRGGY G RGGYG GCR
Subjt:  MSSKVFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKY-GGYDRGYGGRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGY-GDRGGYGGGCR

Query:  YGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        YGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  YGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP

A0A6J1GKL6 glycine-rich protein-like isoform X21.9e-3881.51Show/hide
Query:  MSSKVFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGGCRYG
        MSSK F+FLGLL A VLL+SSEVAARDLAETS+KK+NEAT ETNGVEDAKYGGYD           GGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYG  GGYG GCRYG
Subjt:  MSSKVFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGGCRYG

Query:  RCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        RCGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  RCGYRCCSYAGEVVEGAKP

A0A6J1GM55 cold and drought-regulated protein CORA-like isoform X15.2e-4487.39Show/hide
Query:  MSSKVFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGGCRYG
        MSSK F+FLGLL A VLL+SSEVAARDLAETS+KK+NEAT ETNGVEDAKYGGYD GYGGR  YG GGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYG  GGYG GCRYG
Subjt:  MSSKVFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGGCRYG

Query:  RCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        RCGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  RCGYRCCSYAGEVVEGAKP

A0A6J1HZJ5 glycine-rich protein-like3.4e-4386.67Show/hide
Query:  MSSKVFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRY-GHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGGCRY
        MSSK F+FLGLL AF+LL+SSEVAARDLAETS+ K+ EATVETNGVEDAKYGGYD GYGGR  Y G GGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYG RGGYG GCRY
Subjt:  MSSKVFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRY-GHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGGCRY

Query:  GRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        GRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  GRCGYRCCSYAGEVVEGAKP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P11898 Glycine-rich protein HC12.7e-0545.31Show/hide
Query:  MSSKVFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKD---NEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRD-----RYGHGGYGGRGGY-GGRGGY-------GGR
        M SK+F+ LGL +AF +L+SSEVAAR+LAET++K +   N       G      GGY  G GG +       G GGY   GGY  G GGY        G 
Subjt:  MSSKVFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKD---NEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRD-----RYGHGGYGGRGGY-GGRGGY-------GGR

Query:  GGYGDRGGY--GGGCRYGRCGYRCCSYA
        GGY + GGY  GGG  Y  C  RCCS A
Subjt:  GGYGDRGGY--GGGCRYGRCGYRCCSYA

P23137 Glycine-rich protein1.4e-0647.15Show/hide
Query:  MSSKVFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSS--KKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGGCR
        M SK F+FLGL LAF  L+SSEV A +LAETS+  K D E  V+ +G                 R G+   GG G YGG  G GG GGY  R     GCR
Subjt:  MSSKVFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSS--KKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGGCR

Query:  YGRC--GY----RCCSYAGEVVE
        YG C  GY    RCCSYAGE ++
Subjt:  YGRC--GY----RCCSYAGEVVE

P37703 Glycine-rich protein DC9.11.0e-0444.53Show/hide
Query:  MSSKVFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKD---NEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRD-----RYGHGGYGGRGGY-GGRGGY-------GGR
        M SK+F+ LGL +AF +L+SSEVAAR+LAET++K +   N       G      GGY  G GG +       G GGY   GGY  G GGY        G 
Subjt:  MSSKVFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKD---NEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRD-----RYGHGGYGGRGGY-GGRGGY-------GGR

Query:  GGYGDRGGY--GGGCRYGRCGYRCCSYA
        GGY + GG+  GGG  Y  C  RCCS A
Subjt:  GGYGDRGGY--GGGCRYGRCGYRCCSYA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G05530.1 Glycine-rich protein family1.1e-0445.16Show/hide
Query:  MSSKVFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRY-GHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGY--GDRGGYGGGC
        M+SK  V  GL    VLL+ +EVAA              TV++   E  +   Y+ G+GG   Y G GGY G GG+ G GGY G GGY  G  GG  G C
Subjt:  MSSKVFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRY-GHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGY--GDRGGYGGGC

Query:  RYGRC--GY----RCCSYAGEVVE
        RYG C  GY    RCCSYAGE V+
Subjt:  RYGRC--GY----RCCSYAGEVVE

AT2G05540.1 Glycine-rich protein family3.2e-0948.51Show/hide
Query:  MSSKVFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGY-DRGYGGRDRYGHGGYGGR--GGYGGR--------GGYGGR-GGYG
        M+SK  +FL L++  VLL++SEV ARDLAE S+++ N    E    E  ++GG+   GYGG   +  GGYGG   GGYG R        GGYG R GGYG
Subjt:  MSSKVFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGY-DRGYGGRDRYGHGGYGGR--GGYGGR--------GGYGGR-GGYG

Query:  DRGGYGGGCRYGRC--GY-----RCCSYAGEVVE
        +RG  GG CRYG C  GY     RCC+YAG+ V+
Subjt:  DRGGYGGGCRYGRC--GY-----RCCSYAGEVVE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTTCCAAAGTTTTTGTTTTCCTCGGTCTTCTTCTCGCCTTTGTTCTCCTTCTCTCTTCGGAGGTGGCCGCAAGAGACCTCGCAGAGACTTCCTCCAAGAAG
GATAACGAGGCTACTGTGGAGACCAATGGTGTAGAGGATGCCAAGTATGGAGGGTACGATAGAGGCTATGGTGGTCGTGATCGTTACGGCCATGGTGGCTATGGC
GGTCGTGGTGGTTATGGTGGTCGCGGTGGTTACGGAGGCCGTGGTGGTTACGGTGACCGTGGTGGCTACGGAGGAGGTTGCCGGTATGGTCGATGCGGGTACAGG
TGCTGCAGCTACGCTGGTGAAGTGGTAGAGGGCGCAAAACCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTCTTGCTCTTTAGGCACCTATAAATACATCTACGAGAATGCAAAATTTTCTCATCCCATCTCCAAAAATCAATCTCTTACTTAAACACAAAAAATGAGTTCCAA
AGTTTTTGTTTTCCTCGGTCTTCTTCTCGCCTTTGTTCTCCTTCTCTCTTCGGAGGTGGCCGCAAGAGACCTCGCAGAGACTTCCTCCAAGAAGGATAACGAGGC
TACTGTGGAGACCAATGGTGTAGAGGATGCCAAGTATGGAGGGTACGATAGAGGCTATGGTGGTCGTGATCGTTACGGCCATGGTGGCTATGGCGGTCGTGGTGG
TTATGGTGGTCGCGGTGGTTACGGAGGCCGTGGTGGTTACGGTGACCGTGGTGGCTACGGAGGAGGTTGCCGGTATGGTCGATGCGGGTACAGGTGCTGCAGCTA
CGCTGGTGAAGTGGTAGAGGGCGCAAAACCCTAAGAAAACGTGTGGAATGGGCTGAAATAATAAAATAGTTTAAAGTTAAATGTTTGAACTGTGAAGCTTAAGAA
ATAAATGCATGGGGAATGGAGTGGCTACCTTCTAGTTTTTCTTTTTCCCTATGTTTGGTTTTAGTATGTTGCTACAGATTTGCTTTTGCAAATTTTCATAATATC
AACAAAGATATTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSKVFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGGCRYGRCGYR
CCSYAGEVVEGAKP