; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CcUC02G020630 (gene) of Watermelon (PI 537277) v1 genome

Gene IDCcUC02G020630
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationCicolChr02:3203173..3207423
RNA-Seq ExpressionCcUC02G020630
SyntenyCcUC02G020630
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
ACU16532.1 unknown, partial [Glycine max]3.6e-0538.55Show/hide
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        T +Q  L EN E +    KR V++L  +QE+ W +I +H+S  +A +++  N   Q+    L VM+  DDP+E+LTAA +LH+
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AFK48849.1 unknown [Lotus japonicus]2.1e-0541.25Show/hide
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        L+E+RE +I      +     +QEI   +I M+N KR+ SL+N  N+  Q  S SLT+M  L++PI++LT +TKLH+ M+
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KAB8089687.1 hypothetical protein EE612_014223 [Oryza sativa]4.6e-0559.57Show/hide
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        S +    +T +AIF +LF+AENCL RE TAG+R  SGATP SQ QGW
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KAF7840197.1 hypothetical protein G2W53_008679 [Senna tora]2.7e-0539.47Show/hide
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        R+ +I+  K  ++    +QE+ WF++S+HN KRM    N +N+   L    LTVM  L DPIEQL    +LH+ +N
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OAY81390.1 hypothetical protein ACMD2_01829 [Ananas comosus]3.6e-0528.81Show/hide
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        LTL AIF +LFIAENC +R  TA SR LSGATP ++ QG      K + + +  +A         QI  A   ND+                        
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              N+ K++             +I+MH+ +R+A L++T  +P +     L V+  L D +E+L    +LH+ ++
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0P0VRR0 Os02g0831900 protein2.2e-0559.57Show/hide
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        S +    +T +AIF +LF+AENCL RE TAG+R  SGATP SQ QGW
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C6T4C2 Uncharacterized protein (Fragment)1.7e-0538.55Show/hide
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I3T8K7 Uncharacterized protein1.0e-0541.25Show/hide
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        L+E+RE +I      +     +QEI   +I M+N KR+ SL+N  N+  Q  S SLT+M  L++PI++LT +TKLH+ M+
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Q0DW49 Os02g0831900 protein2.2e-0559.57Show/hide
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T1LZJ3 Uncharacterized protein6.3e-0839.74Show/hide
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        E+ E +IN  +R V+++I++QEI   +I +H+++R+A L++ D++PG+L    L V+ PLDD +EQL A  +LH+ ++
Subjt:  ENREAKINSFKREVIILINQQEIFWFQISMHNSKRMASLNNTDNNPGQLCSFSLTVMSPLDDPIEQLTAATKLHNNMN

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTGAGAAGTTACAAAGAAGTCAAATTTGGGGATGGGAACCCCAGACCAAAAGAACCGACAAGATTCTGTAACATAGAATTCGATATCCCACTCTACTACGCA
GTCTCCACAAGAAGCCAGCAATCTCCTCTTCAGAAAGGCTTTCGGCAATCACCTAATTGTACAAAGAATGCAGATTATAGACATCAGTATTGTTTAAAGCCAACA
GTGTGGATATTCTATGCAAACTTGAAAAATAACATTCAAAAGGGTGTTCAAATTCAGTTCTCCCACCTAAGCGAAAAGCATGTTGATACACTTACTCTTAATGCC
ATCTTCTTTAACTTGTTCATTGCAGAGAATTGTTTGAGTCGAGAAAGTACAGCTGGATCAAGAGCCCTATCAGGAGCAACTCCATTTTCGCAAATCCAAGGGTGG
CCTGTACAGATTACGAAGTCAAACGATCTGATGGTCGGGAACATAGCATCTTTCTTATTAGATCCTTTGCACTGTCAGATATCAGGGGCCAAGGGTCCAAATGAT
CGAACCAAGGATCTAGGTGCCCTTAACACCCAACGCCCTAATTCCTCAACCACTAGGCAACAAAATCTTTTAGAAAACAGAGAGGCCAAAATCAATAGCTTTAAG
AGAGAAGTCATCATCCTTATTAACCAACAAGAAATTTTCTGGTTTCAAATCTCTATGCATAACTCCAAGCGAATGGCAAGTCTCAACAACACCGACAATAATCCT
GGTCAACTCTGCAGCTTTTCGCTCACTGTAATGTCCCCTCTGGATGATCCTATCGAACAACTCACCGCCGCTACAAAGCTCCATAACAATATGAACATATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGTGAGAAGTTACAAAGAAGTCAAATTTGGGGATGGGAACCCCAGACCAAAAGAACCGACAAGATTCTGTAACATAGAATTCGATATCCCACTCTACTACGCA
GTCTCCACAAGAAGCCAGCAATCTCCTCTTCAGAAAGGCTTTCGGCAATCACCTAATTGTACAAAGAATGCAGATTATAGACATCAGTATTGTTTAAAGCCAACA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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REVIILINQQEIFWFQISMHNSKRMASLNNTDNNPGQLCSFSLTVMSPLDDPIEQLTAATKLHNNMNI