; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CcUC02G032580 (gene) of Watermelon (PI 537277) v1 genome

Gene IDCcUC02G032580
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
Descriptionprotein RALF-like 33
Genome locationCicolChr02:28196371..28198758
RNA-Seq ExpressionCcUC02G032580
SyntenyCcUC02G032580
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7021083.1 Protein RALF-like 33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.9e-5794.87Show/hide
Query:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNS TFFLICAAVFVVFSCSSTAVH GLGI HSL WIPNQSTCKG+IAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAIT
        QPGAQANPYSRGCSAIT
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAIT

KGN60987.2 hypothetical protein Csa_021272 [Cucumis sativus]5.8e-5894.87Show/hide
Query:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNSPTFFLICAAVF++FSCSST VHAGLGI HSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRN VPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAIT
        QPGAQANPYSRGC+AIT
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAIT

XP_022937540.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita moschata]4.9e-5794.87Show/hide
Query:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNS TFFLICAAVFVVFSCSSTAVH GLGI HSL WIPNQSTCKG+IAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAIT
        QPGAQANPYSRGCSAIT
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAIT

XP_022966015.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita maxima]5.8e-5895.73Show/hide
Query:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNS TFFLICAAVFVVFSCSSTAVH GLGIHHSL WIPNQSTCKG+IAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAIT
        QPGAQANPYSRGCSAIT
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAIT

XP_038889183.1 protein RALF-like 33 [Benincasa hispida]1.2e-6099.15Show/hide
Query:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNSPTFFLICAAVFV+FSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAIT
        QPGAQANPYSRGCSAIT
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAIT

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LFW9 Uncharacterized protein2.8e-5894.87Show/hide
Query:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNSPTFFLICAAVF++FSCSST VHAGLGI HSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRN VPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAIT
        QPGAQANPYSRGC+AIT
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAIT

A0A5A7TYI2 Rapid ALkalinization Factor1.5e-5693.16Show/hide
Query:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNSPTFFLI AAVF++FSCSSTAVHAG+GI +SLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRN VPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAIT
        QPGAQANPYSRGC+AIT
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAIT

A0A6J1DA82 protein RALF-like 332.9e-5592.31Show/hide
Query:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGF+SPT FLICAAVFVVF+CSSTAVH GLGIHHSLAWIP+QS+CKGSIAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGAL+RNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAIT
        QPGAQANPY RGCSAIT
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAIT

A0A6J1FH12 protein RALF-like 332.4e-5794.87Show/hide
Query:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNS TFFLICAAVFVVFSCSSTAVH GLGI HSL WIPNQSTCKG+IAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAIT
        QPGAQANPYSRGCSAIT
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAIT

A0A6J1HQE4 protein RALF-like 332.8e-5895.73Show/hide
Query:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNS TFFLICAAVFVVFSCSSTAVH GLGIHHSL WIPNQSTCKG+IAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAIT
        QPGAQANPYSRGCSAIT
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAIT

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 331.7e-2859.32Show/hide
Query:  MAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAEC---FGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYN
        M G ++    +I A + V F      + A +    S  ++P +S C G+IAEC      EEFE DSEINRRILAT++YISYGALRRNTVPCSRRGASYYN
Subjt:  MAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAEC---FGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYN

Query:  CQPGAQANPYSRGCSAIT
        C+ GAQANPYSRGCSAIT
Subjt:  CQPGAQANPYSRGCSAIT

Q945T0 Rapid alkalinization factor4.2e-2758.41Show/hide
Query:  PTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWI-PNQS--TCKGSIAECFG-GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGA
        P+  ++C  +   F   + A  +G     +  W+ P +S   CKGSI EC    EEFE DSE NRRILAT +YISYGAL++N+VPCSRRGASYYNC+PGA
Subjt:  PTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWI-PNQS--TCKGSIAECFG-GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGA

Query:  QANPYSRGCSAIT
        QANPYSRGCSAIT
Subjt:  QANPYSRGCSAIT

Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 232.5e-2767.39Show/hide
Query:  PNQSTCKGSIAEC-------------FG----GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAIT
        P ++ C+G+IAEC             +G    GEEFE DSEINRRILAT +YISYGALRRNT+PCSRRGASYYNC+ GAQANPYSRGCSAIT
Subjt:  PNQSTCKGSIAEC-------------FG----GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAIT

Q9MA62 Protein RALF-like 227.9e-2678.08Show/hide
Query:  STCKGSIAECFG-GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAIT
        S C GSIAEC    EE EFDS+I+RRILA  +YISYGA+RRN+VPCSRRGASYYNCQ GAQANPYSRGCS IT
Subjt:  STCKGSIAECFG-GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAIT

Q9SRY3 Protein RALF-like 11.7e-2863.96Show/hide
Query:  TFFLICAAVFVVFSCSSTAVHAGLGIH-HSLAWI---PNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQ
        T FL    + VVF  SS  V AG       +AW     N S C GSIAEC G EE E DSEINRRILAT++YISY +L+RN+VPCSRRGASYYNCQ GAQ
Subjt:  TFFLICAAVFVVFSCSSTAVHAGLGIH-HSLAWI---PNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQ

Query:  ANPYSRGCSAI
        ANPYSRGCS I
Subjt:  ANPYSRGCSAI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 11.2e-2963.96Show/hide
Query:  TFFLICAAVFVVFSCSSTAVHAGLGIH-HSLAWI---PNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQ
        T FL    + VVF  SS  V AG       +AW     N S C GSIAEC G EE E DSEINRRILAT++YISY +L+RN+VPCSRRGASYYNCQ GAQ
Subjt:  TFFLICAAVFVVFSCSSTAVHAGLGIH-HSLAWI---PNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQ

Query:  ANPYSRGCSAI
        ANPYSRGCS I
Subjt:  ANPYSRGCSAI

AT2G33775.1 ralf-like 199.9e-1655.56Show/hide
Query:  WIPNQSTCKGSIAECFG--GE-EFEFDSEINRRILATSQ-YISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAIT
        W   +S   G    C G  GE ++  DSE NRR LA  + YISYGALR+N VPCSRRG SYY+C+   +ANPY RGCS IT
Subjt:  WIPNQSTCKGSIAECFG--GE-EFEFDSEINRRILATSQ-YISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAIT

AT3G05490.1 ralf-like 225.6e-2778.08Show/hide
Query:  STCKGSIAECFG-GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAIT
        S C GSIAEC    EE EFDS+I+RRILA  +YISYGA+RRN+VPCSRRGASYYNCQ GAQANPYSRGCS IT
Subjt:  STCKGSIAECFG-GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAIT

AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 231.7e-2867.39Show/hide
Query:  PNQSTCKGSIAEC-------------FG----GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAIT
        P ++ C+G+IAEC             +G    GEEFE DSEINRRILAT +YISYGALRRNT+PCSRRGASYYNC+ GAQANPYSRGCSAIT
Subjt:  PNQSTCKGSIAEC-------------FG----GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAIT

AT4G15800.1 ralf-like 331.2e-2959.32Show/hide
Query:  MAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAEC---FGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYN
        M G ++    +I A + V F      + A +    S  ++P +S C G+IAEC      EEFE DSEINRRILAT++YISYGALRRNTVPCSRRGASYYN
Subjt:  MAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAEC---FGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYN

Query:  CQPGAQANPYSRGCSAIT
        C+ GAQANPYSRGCSAIT
Subjt:  CQPGAQANPYSRGCSAIT


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
GAACTCCAAAACGAAGAAGAAGCACAACCCACCGACGATTCGCCGGAGCCACTGCCGGAGCTGAGGAAACCGTCAATTCCGAAGACAGAGACAGTACGAGCTTTTTCTTG
CATGGCAATGGCCGGATTCAATTCTCCGACCTTCTTCCTGATCTGCGCCGCCGTGTTTGTTGTCTTCAGCTGCTCCTCAACCGCCGTCCATGCCGGCCTCGGGATCCACC
ACAGTCTTGCATGGATTCCTAACCAATCCACCTGTAAGGGCTCCATAGCGGAGTGTTTCGGTGGAGAGGAGTTCGAATTTGATTCAGAAATCAACCGCCGTATTTTGGCC
ACTAGCCAGTACATCAGCTACGGCGCTCTTCGGAGGAACACGGTACCGTGCTCGAGACGCGGTGCATCCTATTACAATTGCCAGCCCGGAGCTCAGGCCAATCCCTATAG
CCGTGGATGCAGCGCCATTACGAGTAAATTTCTGATGATAATTATGCATAAGTACGGCTACTTCTCCGACCCAAATGTTTTCGGATCTAACTTGTTTCTGCTGGGGTTTG
TTAATTGTTGTATGATGTCGATTTTGAAAAATGAATCTGAGACCGTG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAACTCCAAAACGAAGAAGAAGCACAACCCACCGACGATTCGCCGGAGCCACTGCCGGAGCTGAGGAAACCGTCAATTCCGAAGACAGAGACAGTACGAGCTTTTTCTTG
CATGGCAATGGCCGGATTCAATTCTCCGACCTTCTTCCTGATCTGCGCCGCCGTGTTTGTTGTCTTCAGCTGCTCCTCAACCGCCGTCCATGCCGGCCTCGGGATCCACC
ACAGTCTTGCATGGATTCCTAACCAATCCACCTGTAAGGGCTCCATAGCGGAGTGTTTCGGTGGAGAGGAGTTCGAATTTGATTCAGAAATCAACCGCCGTATTTTGGCC
ACTAGCCAGTACATCAGCTACGGCGCTCTTCGGAGGAACACGGTACCGTGCTCGAGACGCGGTGCATCCTATTACAATTGCCAGCCCGGAGCTCAGGCCAATCCCTATAG
CCGTGGATGCAGCGCCATTACGAGTAAATTTCTGATGATAATTATGCATAAGTACGGCTACTTCTCCGACCCAAATGTTTTCGGATCTAACTTGTTTCTGCTGGGGTTTG
TTAATTGTTGTATGATGTCGATTTTGAAAAATGAATCTGAGACCGTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
ELQNEEEAQPTDDSPEPLPELRKPSIPKTETVRAFSCMAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILA
TSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITSKFLMIIMHKYGYFSDPNVFGSNLFLLGFVNCCMMSILKNESETV