; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CcUC02G034500 (gene) of Watermelon (PI 537277) v1 genome

Gene IDCcUC02G034500
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
Descriptionbasic-leucine zipper transcription factor A
Genome locationCicolChr02:30329020..30329499
RNA-Seq ExpressionCcUC02G034500
SyntenyCcUC02G034500
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0063552.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold329G00590 [Cucumis melo var. makuwa]1.8e-7086.06Show/hide
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XP_011650096.1 NEDD8-specific protease 1 [Cucumis sativus]2.6e-6987.12Show/hide
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XP_023536962.1 uncharacterized protein LOC111798189 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.5e-6181.37Show/hide
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XP_038890730.1 homeobox protein MOX-2 [Benincasa hispida]8.9e-7895Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LL60 Uncharacterized protein1.3e-6987.12Show/hide
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A0A1S3CDF1 uncharacterized protein LOC1034996073.9e-7186.67Show/hide
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A0A5D3BFQ4 Uncharacterized protein8.7e-7186.06Show/hide
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A0A6J1FDP2 uncharacterized protein LOC1114444391.7e-6180.75Show/hide
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A0A6J1HQB7 uncharacterized protein LOC1114657101.1e-6080.75Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G01430.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NHL domain-containing protein (TAIR:AT5G14890.1)1.8e-0751.72Show/hide
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        G    R S    FRYD LSY+LNFD+G   GH DDEFP R++S R   PS P S+  S
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AT5G11070.1 unknown protein7.0e-0444.83Show/hide
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        H   HS S   DF YD LSYALNF+   D    DD+    NF++RLP SP   + S++
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AT5G14890.1 NHL domain-containing protein1.1e-0643.06Show/hide
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        FI R GR+         G        FRYD+ SY+LNFD+G   GH +DEFP R++S R   PS P S+  S
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AT5G35090.1 unknown protein2.2e-1034.69Show/hide
Query:  SLKEMLKSTLCLSCCLRKHRSGHHHHHHHHHHRRMS-TSSDGDSPGPLMRCSSAKDKSRSRESPEIKDRRPHFISRL----------GRHGRRHSASADF
        SL++ LKS  C++ C R   + HHHH +       S  +++  +  P       K    +R   +  ++    I R+          G+H RRH  +ADF
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Query:  RYDALSYALNFDEGYDEGHVDDEFPLRNFSSRLPPSPPKSSPSSSNA
         YD  SYALNFD+G ++ ++ D FPLRNFS+RLP SPP S+ ++ ++
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACGATTCGAACGAACACAAAGGAAATGCCTCGCCGTCGTCTCTGAAGGAGATGCTCAAATCTACTCTGTGTTTATCTTGTTGCCTCCGTAAGCACCGGAGTGGCCA
CCACCACCACCACCACCACCACCACCACCGGCGGATGTCAACTTCCTCCGACGGCGATTCGCCTGGACCGCTTATGAGGTGTTCCTCTGCTAAGGATAAATCCAGATCTC
GCGAGAGTCCTGAGATCAAGGATCGACGTCCGCATTTCATTTCGCGACTCGGCCGCCATGGACGCCGCCACTCTGCTTCAGCCGATTTCCGCTACGATGCGCTTAGTTAC
GCGCTTAATTTCGATGAAGGATACGATGAAGGTCATGTCGATGATGAGTTTCCTCTCAGGAATTTCTCCTCCAGGTTACCGCCTTCTCCGCCGAAATCCTCGCCGTCTTC
ATCTAATGCGTCGAGGGAGATGATCACGGCGTTTAGTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGACGATTCGAACGAACACAAAGGAAATGCCTCGCCGTCGTCTCTGAAGGAGATGCTCAAATCTACTCTGTGTTTATCTTGTTGCCTCCGTAAGCACCGGAGTGGCCA
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ATCTAATGCGTCGAGGGAGATGATCACGGCGTTTAGTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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ALNFDEGYDEGHVDDEFPLRNFSSRLPPSPPKSSPSSSNASREMITAFS