; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CcUC04G061380 (gene) of Watermelon (PI 537277) v1 genome

Gene IDCcUC04G061380
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionNADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5
Genome locationCicolChr04:10601375..10603423
RNA-Seq ExpressionCcUC04G061380
SyntenyCcUC04G061380
Gene Ontology termsGO:0015986 - ATP synthesis coupled proton transport (biological process)
GO:0042773 - ATP synthesis coupled electron transport (biological process)
GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0009579 - thylakoid (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0045263 - proton-transporting ATP synthase complex, coupling factor F(o) (cellular component)
GO:0008137 - NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity (molecular function)
GO:0008289 - lipid binding (molecular function)
GO:0015078 - proton transmembrane transporter activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001750 - NADH:quinone oxidoreductase/Mrp antiporter, membrane subunit
IPR003945 - NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAB8477461.1 hypothetical protein FH972_025327 [Carpinus fangiana]2.1e-23186.76Show/hide
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        VGGTG          L   +   +  + E   G      R    + +  +    QA       ++++LADKAAIKAMPVNRVGDFGLAPGISG FTLFQT
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        VDFSTIFARASAPRNSWISCNMRLNAITLICILLLIGAVGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSASIHAATMVTAGVFMIARCSPLFEYPPTALIVIT AGA
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        FPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFGRDILRCHDAPIPMAIP ILLALGSLFVGYLAK
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KAG7528117.1 NADH:quinone oxidoreductase/Mrp antiporter membrane subunit [Arabidopsis suecica]9.9e-21386.75Show/hide
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        PT  HHSMSG RGDILDVWERS SGKAKTAPRIWVARGRLCPDGGALWGRAQPNRDSTPP SSAPLYRLN S  LVGGTG          + P EDQVGE
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        PCDGKPSRT                              ADKAA KAM VNRVGDFGLA GISGRFTLFQTVDFSTIFARASAPRNSWISCNMRLNAI+L
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        ICILLLIGAVGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSASIHAATMVTAGVFMIARCSPLFEYPPTALIVITSAGATTSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLG
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        YMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAMSDEQDMRKMGGLASSFP TYAMML+GSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAF
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        WLGS+SVLFTSYYSFR LFLTFLVPTNSFGRDI RCHDAPIPMAIPSILLALG
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KJB09767.1 hypothetical protein B456_001G163400 [Gossypium raimondii]2.1e-21576.35Show/hide
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        PDAAVAPRRYGLDPLL T  HHSMSGIRGDILD          VWERS SGKAKTAPRIWVARGRLCPDGGALWGRAQPNRDSTPPTSSAPLYRLN+S S
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        LVGGTG     V    Q  + C                +GK  P     R L    +     F    L  R  R I+   R                   
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Query:  -----------------------------LADKAAIKAMPVNRVGDFGLAPGISGRFTLFQTVDFSTIFARASAPRNSWISCNMRLNAITLICILLLIGA
                                      ADKAAIKAMPVNRVGDFGLAPGISGRFTLFQTVDFSTIFA ASAPRNSWISCNMRLNAITLICILLLIGA
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        VGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSA IHAATMVTAGVFMIARCSPLFEYPPTALIVIT AGATTSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGIS
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        NYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAMSDEQDMRKMGGLASSFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLF
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        TSYYSFR LFLTFLVPTNSFGRDILRCHDAPIPMAIP ILLALGSLFVGYLAKV
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TKS02708.1 putative NADH dehydrogenase [Populus alba]3.8e-22082.45Show/hide
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        MNCRVDRSDPDAAVAPRRYGLDPLLPT  +HSMSG+ G            KAKTAPRIWVARGRLCPDGGA  GRAQPNRD TPPTSSAPLYRLN+S  L
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        VGGT      G  G K P                   AEDQVGEPCDGKPSRT                              ADKAAIKAM VNRVGDF
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        GLAPGISGRFTLFQTVDFSTIFA ASAPRNSWISCNMRLNAITLICILLLIGAVGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSASIHAATMVTAGVFMIARCSPLF
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        EY PTALIVIT AGA TSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAMSDEQDMRKMGGLASSFP
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Query:  FTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFGRDILRCHDAPIPMAIPSILLALGSLF
        FTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFGRDI+RCHDAPIPMAIP ILLALGSLF
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Query:  VGYLAKV
        VGYLAKV
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YP_009526581.1 NADH dehydrogenase subunit 5 [Ammopiptanthus mongolicus]3.6e-23186.69Show/hide
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        VGGTG            L    V +  + G+    K  +  R    E +R   + L  +    IR  ++++LADKAA KAMPVNRVGDFGLAPGISGRFT
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        LFQTVDFSTIFARASAPRNSWISCNMRLNAITLICILLLIGAVGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSA IHAATMVTAGVFMIARCSPLFEYPPTALIVIT
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        SAGATTSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAMSDEQDMRKMGGLASSFPFTYAMMLMGSL
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        SLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFGRDILRCHDAPIPMAIP ILLALGSLFVGYLAKV
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0D2LZE3 Proton_antipo_M domain-containing protein1.0e-21576.35Show/hide
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        LVGGTG     V    Q  + C                +GK  P     R L    +     F    L  R  R I+   R                   
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                                      ADKAAIKAMPVNRVGDFGLAPGISGRFTLFQTVDFSTIFA ASAPRNSWISCNMRLNAITLICILLLIGA
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        VGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSA IHAATMVTAGVFMIARCSPLFEYPPTALIVIT AGATTSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGIS
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        NYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAMSDEQDMRKMGGLASSFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLF
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        TSYYSFR LFLTFLVPTNSFGRDILRCHDAPIPMAIP ILLALGSLFVGYLAKV
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A0A2N9G584 Proton_antipo_M domain-containing protein6.2e-22987.55Show/hide
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        MNCRVDRSDPDAA+APRRYGLDPLLPT  HHSMSGIR DILDVWERS SGKAKTAPRIWVARGRLCPDGGALWGRAQPNRDSTPPTSSAPLYRLN+S SL
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        VGGT             GEP +                                   LADKAAIKAMPVNRVGDFGLAPGISG FTLFQTVDFSTIFARA
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        SAPRNSWISCNMRLNAITLICILLLIGAVGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSASIHAATMVTAGVFMIARCSPLFEYPPTALIVIT AGATTSFLAATTG
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Query:  ILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAMSDEQDMRKMGGLASSFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSK
        ILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAMSDEQDMRKMGGLASSFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSK
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Query:  DVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFGRDILRCHDAPIPMAIPSILLALGSLFVGYLAKV
        DVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFGRDILRCHDAPIPMAIP ILLALGSLFVGYLAKV
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A0A385G2B9 NADH dehydrogenase subunit 51.8e-23186.69Show/hide
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        MNCRVDRSDPDAAVAPRRYGLDPLLPT  +HSMSG RGDILDVWERS SGKAKTAPRIWVARGRLCPDGGALWGRAQPNRDSTPPTSSAPLYRLN+S SL
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Query:  VGGTG------------LFGHKVPAEDQVGEPCDGKPSRTVRRALNENERFTTTSLQARGARSIR--KRVRLADKAAIKAMPVNRVGDFGLAPGISGRFT
        VGGTG            L    V +  + G+    K  +  R    E +R   + L  +    IR  ++++LADKAA KAMPVNRVGDFGLAPGISGRFT
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Query:  LFQTVDFSTIFARASAPRNSWISCNMRLNAITLICILLLIGAVGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSASIHAATMVTAGVFMIARCSPLFEYPPTALIVIT
        LFQTVDFSTIFARASAPRNSWISCNMRLNAITLICILLLIGAVGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSA IHAATMVTAGVFMIARCSPLFEYPPTALIVIT
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Query:  SAGATTSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAMSDEQDMRKMGGLASSFPFTYAMMLMGSL
        SAGATTSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAMSDEQDMRKMGGLASSFPFTYAMMLMGSL
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Query:  SLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFGRDILRCHDAPIPMAIPSILLALGSLFVGYLAKV
        SLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFGRDILRCHDAPIPMAIP ILLALGSLFVGYLAKV
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A0A4U5PYK3 Putative NADH dehydrogenase1.8e-22082.45Show/hide
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        MNCRVDRSDPDAAVAPRRYGLDPLLPT  +HSMSG+ G            KAKTAPRIWVARGRLCPDGGA  GRAQPNRD TPPTSSAPLYRLN+S  L
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Query:  VGGT------GLFGHKVP-------------------AEDQVGEPCDGKPSRTVRRALNENERFTTTSLQARGARSIRKRVRLADKAAIKAMPVNRVGDF
        VGGT      G  G K P                   AEDQVGEPCDGKPSRT                              ADKAAIKAM VNRVGDF
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Query:  GLAPGISGRFTLFQTVDFSTIFARASAPRNSWISCNMRLNAITLICILLLIGAVGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSASIHAATMVTAGVFMIARCSPLF
        GLAPGISGRFTLFQTVDFSTIFA ASAPRNSWISCNMRLNAITLICILLLIGAVGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSASIHAATMVTAGVFMIARCSPLF
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Query:  EYPPTALIVITSAGATTSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAMSDEQDMRKMGGLASSFP
        EY PTALIVIT AGA TSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAMSDEQDMRKMGGLASSFP
Subjt:  EYPPTALIVITSAGATTSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAMSDEQDMRKMGGLASSFP

Query:  FTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFGRDILRCHDAPIPMAIPSILLALGSLF
        FTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFGRDI+RCHDAPIPMAIP ILLALGSLF
Subjt:  FTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFGRDILRCHDAPIPMAIPSILLALGSLF

Query:  VGYLAKV
        VGYLAKV
Subjt:  VGYLAKV

A0A5N6L1B2 Uncharacterized protein1.0e-23186.76Show/hide
Query:  MNCRVDRSDPDAAVAPRRYGLDPLLPTSRHHSMSGIRGDILDVWERSRSGKAKTAPRIWVARGRLCPDGGALWGRAQPNRDSTPPTSSAPLYRLNYSLSL
        MNCRVDRSDPDAA+APRRYGLDPLLPT  HHSMSGIR DILDVWERSRSGKAKTAPRIWVARGRLCPDGGALWGRAQPNRDSTPPTSSAPLYRLN+S SL
Subjt:  MNCRVDRSDPDAAVAPRRYGLDPLLPTSRHHSMSGIRGDILDVWERSRSGKAKTAPRIWVARGRLCPDGGALWGRAQPNRDSTPPTSSAPLYRLNYSLSL

Query:  VGGTG----------LFGHKVPAEDQVGEPCDGKPSRTVRRALNENERFTTTSLQARGARSIRKRVRLADKAAIKAMPVNRVGDFGLAPGISGRFTLFQT
        VGGTG          L   +   +  + E   G      R    + +  +    QA       ++++LADKAAIKAMPVNRVGDFGLAPGISG FTLFQT
Subjt:  VGGTG----------LFGHKVPAEDQVGEPCDGKPSRTVRRALNENERFTTTSLQARGARSIRKRVRLADKAAIKAMPVNRVGDFGLAPGISGRFTLFQT

Query:  VDFSTIFARASAPRNSWISCNMRLNAITLICILLLIGAVGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSASIHAATMVTAGVFMIARCSPLFEYPPTALIVITSAGA
        VDFSTIFARASAPRNSWISCNMRLNAITLICILLLIGAVGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSASIHAATMVTAGVFMIARCSPLFEYPPTALIVIT AGA
Subjt:  VDFSTIFARASAPRNSWISCNMRLNAITLICILLLIGAVGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSASIHAATMVTAGVFMIARCSPLFEYPPTALIVITSAGA

Query:  TTSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAMSDEQDMRKMGGLASSFPFTYAMMLMGSLSLIG
        TTSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAMSDEQDMRKMGGLASSFPFTYAMMLMGSLSLIG
Subjt:  TTSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAMSDEQDMRKMGGLASSFPFTYAMMLMGSLSLIG

Query:  FPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFGRDILRCHDAPIPMAIPSILLALGSLFVGYLAK
        FPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFGRDILRCHDAPIPMAIP ILLALGSLFVGYLAK
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P10330 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 51.0e-16795.98Show/hide
Query:  ADKAAIKAMPVNRVGDFGLAPGISGRFTLFQTVDFSTIFARASAPRNSWISCNMRLNAITLICILLLIGAVGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSASIHAA
        ADKAAIKAM VNRVGDFGLA GI G FTLFQTVDFSTIFA ASAPRNSWISCNMRLNAITLICILLLIGAVGKSAQIG HTW PDAMEGPTPVSA IHAA
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Query:  TMVTAGVFMIARCSPLFEYPPTALIVITSAGATTSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAM
        TMVTAGVFMIARCSPLFEY PTALIVIT AGA TSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAM
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Query:  SDEQDMRKMGGLASSFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFGRDILRCHDA
        SDEQDMRKMGGLASSFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFR LFLTFLVPTNSFGRDILRCHDA
Subjt:  SDEQDMRKMGGLASSFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFGRDILRCHDA

Query:  PIPMAIPSILLALGSLFVGYLAK
        PIPMAIP ILLALGSLFVGYLAK
Subjt:  PIPMAIPSILLALGSLFVGYLAK

P26849 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 52.1e-14985.89Show/hide
Query:  ADKAAIKAMPVNRVGDFGLAPGISGRFTLFQTVDFSTIFARASA---PRNSWISCNMRLNAITLICILLLIGAVGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSASI
        A+KAAIKAM +NRVGDFGLA GI G FT+FQTVDFSTIFA ASA   P + ++ CNM  +AIT+ICIL+ IGAVGKSAQIG HTW PDAMEGPTPVSA I
Subjt:  ADKAAIKAMPVNRVGDFGLAPGISGRFTLFQTVDFSTIFARASA---PRNSWISCNMRLNAITLICILLLIGAVGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSASI

Query:  HAATMVTAGVFMIARCSPLFEYPPTALIVITSAGATTSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVI
        HAATMVTAGVFMIARCSPLFEY P ALIVIT  GA TSF AATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHA FKALLFLSAGSVI
Subjt:  HAATMVTAGVFMIARCSPLFEYPPTALIVITSAGATTSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVI

Query:  HAMSDEQDMRKMGGLASSFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFGRDILRC
        HAMSDEQDMRKMGGLAS  PFTYAMML+GSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSV FTSYYSFR LFLTFL PTNSF RD+ RC
Subjt:  HAMSDEQDMRKMGGLASSFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFGRDILRC

Query:  HDAPIPMAIPSILLALGSLFVGYLAK
        HDAPI MAIP ILLA GS+FVGYLAK
Subjt:  HDAPIPMAIPSILLALGSLFVGYLAK

P29388 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 51.8e-16494.12Show/hide
Query:  ADKAAIKAMPVNRVGDFGLAPGISGRFTLFQTVDFSTIFARASAPRNSWISCNMRLNAITLICILLLIGAVGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSASIHAA
        ADKAAIKAM VNRVGDFGLA GI G FTLFQTVDFSTIFA AS PRNSWI CNMRLNAI+LICILL IGAVGKSAQIG HTW PDAMEGPTPVSA IHAA
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Query:  TMVTAGVFMIARCSPLFEYPPTALIVITSAGATTSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAM
        TMVTAGVFMIARCSPLFEY PTALIVITSAGA TSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAM
Subjt:  TMVTAGVFMIARCSPLFEYPPTALIVITSAGATTSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAM

Query:  SDEQDMRKMGGLASSFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFGRDILRCHDA
        SDEQDMRKMGGLASSFP TYAMML+GSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFR LFLTFLVPTNSFGRDI RCHDA
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Query:  PIPMAIPSILLALGSLFVGYLAK
        PIPMAIP ILLALGSLFVGYLAK
Subjt:  PIPMAIPSILLALGSLFVGYLAK

Q35099 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 51.5e-10261.73Show/hide
Query:  ADKAAIKAMPVNRVGDFGLAPGISGRFTLFQTVDFSTIF-ARASAPRNSWISCNMRLNAITLICILLLIGAVGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSASIHA
        A+KAAIKAM VNRVGD G    +   +  F  +DF+++F   A AP ++           TLIC+ L IGAVGKSAQ+G HTW PDAMEGPTPVSA IHA
Subjt:  ADKAAIKAMPVNRVGDFGLAPGISGRFTLFQTVDFSTIF-ARASAPRNSWISCNMRLNAITLICILLLIGAVGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSASIHA

Query:  ATMVTAGVFMIARCSPLFEYPPTALIVITSAGATTSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHA
        ATMVTAGVF++ R SPL E  P AL+V+T  G+ T+F+AAT G++QNDLK+VIAYSTCSQLGYM+ ACG+S YS+S+FHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHA
Subjt:  ATMVTAGVFMIARCSPLFEYPPTALIVITSAGATTSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHA

Query:  MSDEQDMRKMGGLASSFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFGRDILRCHD
        ++DEQDMRKMGGL  S PFTY M+++GSLSL+GFP+LTGFYSKD+ILELAY +Y ++  FA WLG  S L T+ YS R ++LTF+  TN+      + H+
Subjt:  MSDEQDMRKMGGLASSFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFGRDILRCHD

Query:  APIPMAIPSILLALGSLFVGYLAK
            + +P ILLALGS+FVGYL K
Subjt:  APIPMAIPSILLALGSLFVGYLAK

Q37680 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 51.4e-16494.43Show/hide
Query:  ADKAAIKAMPVNRVGDFGLAPGISGRFTLFQTVDFSTIFARASAPRNSWISCNMRLNAITLICILLLIGAVGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSASIHAA
        ADKAAIKAM VNRVGDFGLA GI G FTLFQTVDFSTIFA ASAPRN WI CNMRLNAITLICILL IGAVGKSAQIG HTW PDAMEGPTPVSA IHAA
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Query:  TMVTAGVFMIARCSPLFEYPPTALIVITSAGATTSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAM
        TMVTAGVFMIARCSPLFEY PTALIVIT AGA TSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAM
Subjt:  TMVTAGVFMIARCSPLFEYPPTALIVITSAGATTSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAM

Query:  SDEQDMRKMGGLASSFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFGRDILRCHDA
        SDEQDMRKMGGLASSFP TYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFR LFLTFLVPTNSFGRD LRCHDA
Subjt:  SDEQDMRKMGGLASSFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFGRDILRCHDA

Query:  PIPMAIPSILLALGSLFVGYLAK
        PIPMAIP ILLALGSLFVGYLAK
Subjt:  PIPMAIPSILLALGSLFVGYLAK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
ATCG01010.1 NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 protein7.7e-5443.81Show/hide
Query:  LADKAAIKAMPVNRVGDFGLAPGISGRFTLFQTVDFSTIFARASAPRNSWISCNMRLNAITLICILLLIGAVGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSASIHA
        +A  A  KA   NRVGDFGL  GI G + +  + +F  +F       N  ++  + L  +TL   LL +G + KSAQ   H W PDAMEGPTP+SA IHA
Subjt:  LADKAAIKAMPVNRVGDFGLAPGISGRFTLFQTVDFSTIFARASAPRNSWISCNMRLNAITLICILLLIGAVGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSASIHA

Query:  ATMVTAGVFMIARCSPLFEYPPTALIVITSAGATTSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHA
        ATMV AG+F++AR  PLF   P+ + +I+  G  T  L AT  + Q D+KR +AYST SQLGYM+ A G+ +Y  ++FHL+ HA+ KALLFL +GS+IH+
Subjt:  ATMVTAGVFMIARCSPLFEYPPTALIVITSAGATTSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHA

Query:  M--------SDEQDMRKMGGLASSFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFRSLFLTFLVPTNSF
        M           Q+M  MGGL    P T    L+G+LSL G P L  F+SKD IL         S  FA    S + L T++Y FR   LTF    N++
Subjt:  M--------SDEQDMRKMGGLASSFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFRSLFLTFLVPTNSF

ATCG01050.1 NADH-Ubiquinone/plastoquinone (complex I) protein7.0e-0726.11Show/hide
Query:  LICILLLIGAVGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSASIHAATMVTAGVFMIARCSPLFEYPPTALIVITS----AGATTSFLAATTGILQNDLKRVIAYST
        L  I  LI    KS  I  HTW PD        +  + A  ++  G + + R +   E  P A  + +      G      AA+T   Q +LK+ IAYS+
Subjt:  LICILLLIGAVGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSASIHAATMVTAGVFMIARCSPLFEYPPTALIVITS----AGATTSFLAATTGILQNDLKRVIAYST

Query:  CSQLGYMIFACGISN-----YSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAMSDEQDMRKMGGLASSFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYT
         S +G++I   GIS+      + ++  +++H F  A LF  AG+    +     + +MGG+A S P  + M  + S++ +  P ++GF ++ ++     T
Subjt:  CSQLGYMIFACGISN-----YSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAMSDEQDMRKMGGLASSFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYT

Query:  K---YTISGNFAFWLGSVSVLFTSYY
            + IS  F  ++ ++ ++ T  Y
Subjt:  K---YTISGNFAFWLGSVSVLFTSYY

ATMG00060.1 NADH dehydrogenase subunit 5C6.3e-17397.21Show/hide
Query:  ADKAAIKAMPVNRVGDFGLAPGISGRFTLFQTVDFSTIFARASAPRNSWISCNMRLNAITLICILLLIGAVGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSASIHAA
        ADKAA KAM VNRVGDFGLA GISGRFTLFQTVDFSTIFARASAPRNSWISCNMRLNAI+LICILLLIGAVGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSASIHAA
Subjt:  ADKAAIKAMPVNRVGDFGLAPGISGRFTLFQTVDFSTIFARASAPRNSWISCNMRLNAITLICILLLIGAVGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSASIHAA

Query:  TMVTAGVFMIARCSPLFEYPPTALIVITSAGATTSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAM
        TMVTAGVFMIARCSPLFEYPPTALIVITSAGATTSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAM
Subjt:  TMVTAGVFMIARCSPLFEYPPTALIVITSAGATTSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAM

Query:  SDEQDMRKMGGLASSFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFGRDILRCHDA
        SDEQDMRKMGGLASSFP TYAMML+GSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFR LFLTFLVPTNSFGRDI RCHDA
Subjt:  SDEQDMRKMGGLASSFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFGRDILRCHDA

Query:  PIPMAIPSILLALGSLFVGYLAK
        PIPMAIP ILLALGSLFVGYLAK
Subjt:  PIPMAIPSILLALGSLFVGYLAK

ATMG00513.1 NADH dehydrogenase 5A6.3e-17397.21Show/hide
Query:  ADKAAIKAMPVNRVGDFGLAPGISGRFTLFQTVDFSTIFARASAPRNSWISCNMRLNAITLICILLLIGAVGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSASIHAA
        ADKAA KAM VNRVGDFGLA GISGRFTLFQTVDFSTIFARASAPRNSWISCNMRLNAI+LICILLLIGAVGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSASIHAA
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Query:  TMVTAGVFMIARCSPLFEYPPTALIVITSAGATTSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAM
        TMVTAGVFMIARCSPLFEYPPTALIVITSAGATTSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAM
Subjt:  TMVTAGVFMIARCSPLFEYPPTALIVITSAGATTSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAM

Query:  SDEQDMRKMGGLASSFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFGRDILRCHDA
        SDEQDMRKMGGLASSFP TYAMML+GSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFR LFLTFLVPTNSFGRDI RCHDA
Subjt:  SDEQDMRKMGGLASSFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFGRDILRCHDA

Query:  PIPMAIPSILLALGSLFVGYLAK
        PIPMAIP ILLALGSLFVGYLAK
Subjt:  PIPMAIPSILLALGSLFVGYLAK

ATMG00665.1 NADH dehydrogenase 5B6.3e-17397.21Show/hide
Query:  ADKAAIKAMPVNRVGDFGLAPGISGRFTLFQTVDFSTIFARASAPRNSWISCNMRLNAITLICILLLIGAVGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSASIHAA
        ADKAA KAM VNRVGDFGLA GISGRFTLFQTVDFSTIFARASAPRNSWISCNMRLNAI+LICILLLIGAVGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSASIHAA
Subjt:  ADKAAIKAMPVNRVGDFGLAPGISGRFTLFQTVDFSTIFARASAPRNSWISCNMRLNAITLICILLLIGAVGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSASIHAA

Query:  TMVTAGVFMIARCSPLFEYPPTALIVITSAGATTSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAM
        TMVTAGVFMIARCSPLFEYPPTALIVITSAGATTSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAM
Subjt:  TMVTAGVFMIARCSPLFEYPPTALIVITSAGATTSFLAATTGILQNDLKRVIAYSTCSQLGYMIFACGISNYSVSVFHLMNHAFFKALLFLSAGSVIHAM

Query:  SDEQDMRKMGGLASSFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFGRDILRCHDA
        SDEQDMRKMGGLASSFP TYAMML+GSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYTKYTISGNFAFWLGSVSVLFTSYYSFR LFLTFLVPTNSFGRDI RCHDA
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Query:  PIPMAIPSILLALGSLFVGYLAK
        PIPMAIP ILLALGSLFVGYLAK
Subjt:  PIPMAIPSILLALGSLFVGYLAK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAATTGTCGAGTAGATAGATCAGATCCGGACGCGGCTGTTGCTCCCCGGCGATACGGACTCGACCCACTCCTACCCACCTCGAGGCACCATAGCATGTCGGGAATAAG
GGGGGACATACTAGACGTGTGGGAGCGATCCAGGTCAGGGAAGGCTAAGACGGCGCCTCGCATATGGGTAGCAAGAGGGCGCTTATGCCCCGATGGTGGGGCCTTATGGG
GAAGGGCCCAGCCCAATAGGGACAGCACACCCCCCACTTCAAGCGCACCTCTGTATCGACTGAATTACTCTTTAAGTCTAGTCGGTGGAACCGGCCTGTTCGGACATAAG
GTTCCCGCGGAAGATCAAGTTGGTGAGCCGTGTGATGGGAAACCTTCCCGCACGGTTCGGAGAGCACTGAATGAGAATGAAAGGTTCACCACCACATCATTGCAGGCAAG
GGGAGCTCGCTCGATTCGCAAAAGGGTCCGACTCGCAGATAAAGCAGCTATAAAAGCTATGCCTGTCAATCGAGTAGGTGATTTTGGATTAGCTCCTGGGATTTCGGGTC
GTTTTACTCTCTTTCAAACAGTAGACTTTTCCACCATTTTTGCTCGTGCTAGTGCCCCCAGAAATTCTTGGATTTCTTGCAATATGAGATTGAATGCCATAACTCTGATT
TGTATTTTACTTCTTATTGGTGCTGTTGGGAAATCCGCACAGATAGGATCGCATACTTGGTCACCCGATGCTATGGAGGGTCCCACTCCAGTATCCGCTTCGATTCATGC
AGCTACTATGGTAACAGCTGGCGTTTTCATGATAGCAAGGTGCTCCCCTTTATTTGAATACCCACCTACGGCTTTGATTGTTATTACTTCTGCAGGAGCTACGACGTCAT
TCCTTGCGGCAACCACGGGAATATTACAGAACGATCTAAAGAGGGTCATAGCTTATTCAACTTGCAGTCAATTAGGCTATATGATCTTTGCTTGCGGCATCTCTAACTAT
TCGGTTAGCGTCTTTCACTTAATGAATCACGCGTTTTTCAAAGCATTACTATTCCTGAGTGCAGGTTCGGTGATTCATGCCATGTCGGATGAGCAAGATATGCGGAAGAT
GGGGGGGCTTGCCTCCTCGTTCCCTTTTACCTATGCCATGATGCTCATGGGCAGCTTATCTCTAATTGGATTTCCTTTTCTAACTGGATTTTATTCCAAAGATGTGATCT
TAGAGCTCGCTTACACTAAGTATACCATCAGTGGGAACTTTGCTTTCTGGTTGGGAAGTGTCTCTGTCCTTTTCACTTCTTATTACTCTTTTCGTTCACTTTTTCTAACA
TTTCTAGTACCAACTAATTCATTCGGGCGAGACATCTTACGATGTCATGATGCGCCCATTCCTATGGCCATTCCTTCAATACTTCTGGCTCTCGGGAGTCTCTTTGTAGG
ATACTTGGCCAAAGTGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAATTGTCGAGTAGATAGATCAGATCCGGACGCGGCTGTTGCTCCCCGGCGATACGGACTCGACCCACTCCTACCCACCTCGAGGCACCATAGCATGTCGGGAATAAG
GGGGGACATACTAGACGTGTGGGAGCGATCCAGGTCAGGGAAGGCTAAGACGGCGCCTCGCATATGGGTAGCAAGAGGGCGCTTATGCCCCGATGGTGGGGCCTTATGGG
GAAGGGCCCAGCCCAATAGGGACAGCACACCCCCCACTTCAAGCGCACCTCTGTATCGACTGAATTACTCTTTAAGTCTAGTCGGTGGAACCGGCCTGTTCGGACATAAG
GTTCCCGCGGAAGATCAAGTTGGTGAGCCGTGTGATGGGAAACCTTCCCGCACGGTTCGGAGAGCACTGAATGAGAATGAAAGGTTCACCACCACATCATTGCAGGCAAG
GGGAGCTCGCTCGATTCGCAAAAGGGTCCGACTCGCAGATAAAGCAGCTATAAAAGCTATGCCTGTCAATCGAGTAGGTGATTTTGGATTAGCTCCTGGGATTTCGGGTC
GTTTTACTCTCTTTCAAACAGTAGACTTTTCCACCATTTTTGCTCGTGCTAGTGCCCCCAGAAATTCTTGGATTTCTTGCAATATGAGATTGAATGCCATAACTCTGATT
TGTATTTTACTTCTTATTGGTGCTGTTGGGAAATCCGCACAGATAGGATCGCATACTTGGTCACCCGATGCTATGGAGGGTCCCACTCCAGTATCCGCTTCGATTCATGC
AGCTACTATGGTAACAGCTGGCGTTTTCATGATAGCAAGGTGCTCCCCTTTATTTGAATACCCACCTACGGCTTTGATTGTTATTACTTCTGCAGGAGCTACGACGTCAT
TCCTTGCGGCAACCACGGGAATATTACAGAACGATCTAAAGAGGGTCATAGCTTATTCAACTTGCAGTCAATTAGGCTATATGATCTTTGCTTGCGGCATCTCTAACTAT
TCGGTTAGCGTCTTTCACTTAATGAATCACGCGTTTTTCAAAGCATTACTATTCCTGAGTGCAGGTTCGGTGATTCATGCCATGTCGGATGAGCAAGATATGCGGAAGAT
GGGGGGGCTTGCCTCCTCGTTCCCTTTTACCTATGCCATGATGCTCATGGGCAGCTTATCTCTAATTGGATTTCCTTTTCTAACTGGATTTTATTCCAAAGATGTGATCT
TAGAGCTCGCTTACACTAAGTATACCATCAGTGGGAACTTTGCTTTCTGGTTGGGAAGTGTCTCTGTCCTTTTCACTTCTTATTACTCTTTTCGTTCACTTTTTCTAACA
TTTCTAGTACCAACTAATTCATTCGGGCGAGACATCTTACGATGTCATGATGCGCCCATTCCTATGGCCATTCCTTCAATACTTCTGGCTCTCGGGAGTCTCTTTGTAGG
ATACTTGGCCAAAGTGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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