; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CcUC04G065980 (gene) of Watermelon (PI 537277) v1 genome

Gene IDCcUC04G065980
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionExtensin
Genome locationCicolChr04:22964496..22965005
RNA-Seq ExpressionCcUC04G065980
SyntenyCcUC04G065980
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
CAG7903382.1 unnamed protein product [Brassica rapa]1.7e-2658.11Show/hide
Query:  LLHHLPTMFIISSSSFLSNSPPPKVKYEYKSPPPPVLLFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPVYHSTY
        L+ H P   +  S       PPPK +YEYKSPPPPV  +S             S PT        P K  EYKSPPPPVY SPPP VYHSPPPP  H  Y
Subjt:  LLHHLPTMFIISSSSFLSNSPPPKVKYEYKSPPPPVLLFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPVYHSTY

Query:  ----PPIYHSPPPPVYHSPPPPKKQ-EYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPP
            PP+Y SPPPPVYHSPPPPKK  EYKSPPPP+Y SPPPPVYHSPP
Subjt:  ----PPIYHSPPPPVYHSPPPPKKQ-EYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPP

KAA0048790.1 extensin-3-like [Cucumis melo var. makuwa]1.0e-2663.2Show/hide
Query:  PPPKVKYEYKSPPPPVLLFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPVYHSTYPPIYHSPPPPVYHSPPPPKK
        PPPKVKYEYKSPPPP+           S    +       +  S P     Y SPPPPVY+SPPP VYHSPPPPVYHS  PP+Y SPPPP+Y+SPPPPKK
Subjt:  PPPKVKYEYKSPPPPVLLFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPVYHSTYPPIYHSPPPPVYHSPPPPKK

Query:  QEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPPLQ
         EYKSPPPPIYYS PPP+YHSPP Q
Subjt:  QEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPPLQ

TYK31543.1 extensin-3-like [Cucumis melo var. makuwa]1.0e-2663.2Show/hide
Query:  PPPKVKYEYKSPPPPVLLFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPVYHSTYPPIYHSPPPPVYHSPPPPKK
        PPPKVKYEYKSPPPP+           S    +       +  S P     Y SPPPPVY+SPPP VYHSPPPPVYHS  PP+Y SPPPP+Y+SPPPPKK
Subjt:  PPPKVKYEYKSPPPPVLLFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPVYHSTYPPIYHSPPPPVYHSPPPPKK

Query:  QEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPPLQ
         EYKSPPPPIYYS PPP+YHSPP Q
Subjt:  QEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPPLQ

XP_022976067.1 extensin-3-like [Cucurbita maxima]5.8e-2762.02Show/hide
Query:  PPPKVKYEYKSPPPPVL------LFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPVYHSTYPPIYHSPPPPVYHS
        PPPKVKYEYKSPPPPV       ++ S     + S       ++   +  +P  ++EYKSPPPPVYYSPPP VY SPPPPVYHS  PP+YHSPPPPVYHS
Subjt:  PPPKVKYEYKSPPPPVL------LFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPVYHSTYPPIYHSPPPPVYHS

Query:  PPPPKKQEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPP
        PPPP    YKSPPP +Y+SPPPPVYHSPP
Subjt:  PPPPKKQEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPP

XP_038899768.1 extensin-3-like [Benincasa hispida]3.5e-3255.56Show/hide
Query:  PTMFIISSSSFLSNSPPPKVKYEYKSPP----------------------PPVLLFSSVSYLPFSS--TTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPVYY
        P  + +  S    + PPPKVKYEYKSPP                      PP  ++ S S   + S        P         P K+QEYKSPPPPVYY
Subjt:  PTMFIISSSSFLSNSPPPKVKYEYKSPP----------------------PPVLLFSSVSYLPFSS--TTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPVYY

Query:  SPPPLVYHSPPPPVYHSTYPPIYHSPPPPVYHSPPPPKKQEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPP
        SPPP VYHSPPPPVYHS  PP+YHSPPPPVY+SPPPPKKQEYKSPPPP+YYSPPPP+YHSPP
Subjt:  SPPPLVYHSPPPPVYHSTYPPIYHSPPPPVYHSPPPPKKQEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K484 Uncharacterized protein2.2e-2760.32Show/hide
Query:  SNSPPPKVKYEYKSPPPPVLLFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPVYHSTYPPIYHSPPPPVYHSPPP
        S+ PPPKVKYEYKSPPPPV                                   Y SPPPP+Y+SPPP VYHSPPPPVYHS  PP+Y SPPPPVY+SPPP
Subjt:  SNSPPPKVKYEYKSPPPPVLLFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPVYHSTYPPIYHSPPPPVYHSPPP

Query:  PKKQEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPP
        PKK EYKSPPPP+YYS PPP+YHSPP
Subjt:  PKKQEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPP

A0A5A7U062 Extensin-3-like4.8e-2763.2Show/hide
Query:  PPPKVKYEYKSPPPPVLLFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPVYHSTYPPIYHSPPPPVYHSPPPPKK
        PPPKVKYEYKSPPPP+           S    +       +  S P     Y SPPPPVY+SPPP VYHSPPPPVYHS  PP+Y SPPPP+Y+SPPPPKK
Subjt:  PPPKVKYEYKSPPPPVLLFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPVYHSTYPPIYHSPPPPVYHSPPPPKK

Query:  QEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPPLQ
         EYKSPPPPIYYS PPP+YHSPP Q
Subjt:  QEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPPLQ

A0A5D3E640 Extensin-3-like4.8e-2763.2Show/hide
Query:  PPPKVKYEYKSPPPPVLLFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPVYHSTYPPIYHSPPPPVYHSPPPPKK
        PPPKVKYEYKSPPPP+           S    +       +  S P     Y SPPPPVY+SPPP VYHSPPPPVYHS  PP+Y SPPPP+Y+SPPPPKK
Subjt:  PPPKVKYEYKSPPPPVLLFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPVYHSTYPPIYHSPPPPVYHSPPPPKK

Query:  QEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPPLQ
         EYKSPPPPIYYS PPP+YHSPP Q
Subjt:  QEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPPLQ

A0A6J1IER1 extensin-3-like2.8e-2762.02Show/hide
Query:  PPPKVKYEYKSPPPPVL------LFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPVYHSTYPPIYHSPPPPVYHS
        PPPKVKYEYKSPPPPV       ++ S     + S       ++   +  +P  ++EYKSPPPPVYYSPPP VY SPPPPVYHS  PP+YHSPPPPVYHS
Subjt:  PPPKVKYEYKSPPPPVL------LFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPVYHSTYPPIYHSPPPPVYHS

Query:  PPPPKKQEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPP
        PPPP    YKSPPP +Y+SPPPPVYHSPP
Subjt:  PPPPKKQEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPP

V4KJG4 Uncharacterized protein (Fragment)1.4e-2657.53Show/hide
Query:  NSPPPKVKYEYKSPPPPVLLFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPVYYSPPPLVYH--------------------SPPPPVYHS
        +SPPPK  YEYKSPPPPV                 S P         P K  EYKSPPPPVY SPPPLVYH                    SPPPPVYHS
Subjt:  NSPPPKVKYEYKSPPPPVLLFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPVYYSPPPLVYH--------------------SPPPPVYHS

Query:  TYPPIYHSPPPPVYHSPPPPKKQ-EYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPP
          PP+Y SPPPPVYHSPPPPKK  EYKSPPPP+Y SPPPPVYHSPP
Subjt:  TYPPIYHSPPPPVYHSPPPPKKQ-EYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q38913 Extensin-15.9e-2255.81Show/hide
Query:  SPPPKVKY-----EYKSPPPPVLLFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPVYHSTYPPIYHSPPPPVYHS
        SPPP VKY      YKSPPPPV          +S       P       S P     YKSPPPPV+YSPPP+VYHSPPPPV++S  P +YHSPPPPV++S
Subjt:  SPPPKVKY-----EYKSPPPPVLLFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPVYHSTYPPIYHSPPPPVYHS

Query:  PPPPKKQEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPP
        PPP     Y SPPPP++YSPPP VYHSPP
Subjt:  PPPPKKQEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPP

Q9FS16 Extensin-31.0e-2152.38Show/hide
Query:  HHLPTMFIISSSSFLSNSPPPKVKYEYKSPPPPVLLFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPV-YYSPPPLVYHSPPPP----VYH
        H+ P +   S      + PPPK  YEYKSPPPPV  +S               P         P K   YKSPPPPV +YSPPP VYHSPPPP    VY 
Subjt:  HHLPTMFIISSSSFLSNSPPPKVKYEYKSPPPPVLLFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPV-YYSPPPLVYHSPPPP----VYH

Query:  STYPPIYHSPPPPVYHSPPPPKKQ-EYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPP
        S  PP+ H  PPPVYHSPPPPKK   YKSPPPP+ +  PPPVYHSPP
Subjt:  STYPPIYHSPPPPVYHSPPPPKKQ-EYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPP

Q9LJ64 Pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 15.7e-0945.07Show/hide
Query:  NSPPPKVKYEYKSPPPPVLLFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTS---SLLLSTPTKEQEYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPVYHSTYPPIYHSPPPPVYHSP
        +SPPP V     SPPPPV       + P         P  S     + S P     Y  PPPPV+  PPP+  HSPPPP  HS  PP+ HSPPPPV HSP
Subjt:  NSPPPKVKYEYKSPPPPVLLFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTS---SLLLSTPTKEQEYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPVYHSTYPPIYHSPPPPVYHSP

Query:  PPPKKQEYKSPPPPIY--------YSPPPPVYHSPPLQFTIL
        PPP      SPPPP++        YSPPPPV+  PP   T L
Subjt:  PPPKKQEYKSPPPPIY--------YSPPPPVYHSPPLQFTIL

Q9M1G9 Extensin-22.5e-1246.21Show/hide
Query:  PTMFIISSSSFLSNSPPPKVKYEYKSPPPPVLLFSSVS--YLPFSSTTCLSLP-----TTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPV-YH
        P  ++ SS      SP PKV  EYKSPPPP +  S     Y P       S P     ++      +P+ + EYKSPPPP  YS PP  Y+SP P V Y 
Subjt:  PTMFIISSSSFLSNSPPPKVKYEYKSPPPPVLLFSSVS--YLPFSSTTCLSLP-----TTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPV-YH

Query:  STYPPIYHSPPPPVYHSPPPPKKQEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSP
        S  PP  +S PPP Y+SP P  K +YKSPPPP  YS PPP Y+SP
Subjt:  STYPPIYHSPPPPVYHSPPPPKKQEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSP

Q9XIL9 Pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 33.0e-1049.24Show/hide
Query:  SSSSFLSNSPPPKVKYEYKSPPPPVLLFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPVYHSTYPPIYHSPPPPV
        S   F  + PPP V     SPPPP  + S      +S       P     + S P     Y  PPPP  +SPPP V HSPPPPV HS  PP+ HSPPPPV
Subjt:  SSSSFLSNSPPPKVKYEYKSPPPPVLLFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPVYHSTYPPIYHSPPPPV

Query:  YHSPPPPKKQEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPP
         HSPPPP      SPPPP+ YSPPPP  HSPP
Subjt:  YHSPPPPKKQEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G21310.1 extensin 37.1e-2352.38Show/hide
Query:  HHLPTMFIISSSSFLSNSPPPKVKYEYKSPPPPVLLFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPV-YYSPPPLVYHSPPPP----VYH
        H+ P +   S      + PPPK  YEYKSPPPPV  +S               P         P K   YKSPPPPV +YSPPP VYHSPPPP    VY 
Subjt:  HHLPTMFIISSSSFLSNSPPPKVKYEYKSPPPPVLLFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPV-YYSPPPLVYHSPPPP----VYH

Query:  STYPPIYHSPPPPVYHSPPPPKKQ-EYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPP
        S  PP+ H  PPPVYHSPPPPKK   YKSPPPP+ +  PPPVYHSPP
Subjt:  STYPPIYHSPPPPVYHSPPPPKKQ-EYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPP

AT1G26240.1 Proline-rich extensin-like family protein6.5e-1652.48Show/hide
Query:  FLSNSPPPKVKYEYKSPPPPVLLFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPVY-YS---PPPLVYHSPPPP--VYHSTYPP--IYHSP
        ++ NSPPP   Y YKSPPPP  ++SS    P+      S P    +  S P     YKSPPPP Y YS   PPP VY SPPPP  VY S  PP  +Y SP
Subjt:  FLSNSPPPKVKYEYKSPPPPVLLFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPVY-YS---PPPLVYHSPPPP--VYHSTYPP--IYHSP

Query:  PPPVY-HSPPPPKKQEYKSPPPP--IYYSPPPP--VYHSPP
        PPP Y +S PPP    YKSPPPP  +Y SPPPP  VY SPP
Subjt:  PPPVY-HSPPPPKKQEYKSPPPP--IYYSPPPP--VYHSPP

AT1G76930.1 extensin 42.6e-1747.85Show/hide
Query:  SSSSFLSNSPPPKVKY-----EYKSPPPPVLLFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPV-YYSPPPLVYHSPPPPVYHSTYPPIYH
        +++++  +SPPP VK+      YKSPPPPV          +S       P       S P     YKSPPPPV YYSPPP VY SPPPPVY S  PP+ H
Subjt:  SSSSFLSNSPPPKVKY-----EYKSPPPPVLLFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPV-YYSPPPLVYHSPPPPVYHSTYPPIYH

Query:  SPPPPVYHSPPPPKKQ-----EYKSP--------PPPIYYSPPPPVYH-SPPLQFTILLLHPF
          PPPVY SPPPP K       YKSP        PPP+Y SPPPPV H SPP  +T L  H F
Subjt:  SPPPPVYHSPPPPKKQ-----EYKSP--------PPPIYYSPPPPVYH-SPPLQFTILLLHPF

AT1G76930.2 extensin 42.6e-1747.85Show/hide
Query:  SSSSFLSNSPPPKVKY-----EYKSPPPPVLLFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPV-YYSPPPLVYHSPPPPVYHSTYPPIYH
        +++++  +SPPP VK+      YKSPPPPV          +S       P       S P     YKSPPPPV YYSPPP VY SPPPPVY S  PP+ H
Subjt:  SSSSFLSNSPPPKVKY-----EYKSPPPPVLLFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPV-YYSPPPLVYHSPPPPVYHSTYPPIYH

Query:  SPPPPVYHSPPPPKKQ-----EYKSP--------PPPIYYSPPPPVYH-SPPLQFTILLLHPF
          PPPVY SPPPP K       YKSP        PPP+Y SPPPPV H SPP  +T L  H F
Subjt:  SPPPPVYHSPPPPKKQ-----EYKSP--------PPPIYYSPPPPVYH-SPPLQFTILLLHPF

AT2G43150.1 Proline-rich extensin-like family protein8.4e-1648.59Show/hide
Query:  SPPPKVK-----YEYKSPPPPVLLFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPVYHSTYPPIYHSPPPPV---
        SPPP VK     YEYKSPPPPV       Y         S P      + +P     Y SPPPPV   PPP  YHSPPPPV     P  YHSPPPPV   
Subjt:  SPPPKVK-----YEYKSPPPPVLLFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPVYHSTYPPIYHSPPPPV---

Query:  -----YHSPPPPKKQE-----YKSPPPPIYYSPPPPVYHSPP
             YHSPPPP K       Y SPPPP+   PPP  YHSPP
Subjt:  -----YHSPPPPKKQE-----YKSPPPPIYYSPPPPVYHSPP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTTATTCTTCTCCACCACCTCCCTACTATGTTTATAATCTCCTCCTCCTCTTTTCTATCAAACTCCCCACCACCAAAAGTAAAGTATGAGTACAAATCACCGCCACC
TCCAGTTTTATTATTCTCCTCCGTCTCCTATTTACCATTCTCCTCCACCACCTGTTTATCACTTCCCACCACCTCCAGTTTATTACTATCCACCCCCACCAAAGAGCAGG
AGTATAAATCACCACCACCTCCTGTTTATTACTCTCCTCCTCCCCTTGTATATCACTCTCCTCCACCTCCAGTTTACCATTCTACTTACCCACCTATTTATCACTCCCCA
CCACCTCCGGTTTATCACTCTCCACCCCCACCAAAGAAGCAGGAGTATAAATCACCACCACCTCCTATTTATTACTCTCCTCCTCCACCTGTATATCACTCTCCTCCACT
CCAGTTTACCATTCTGCTCCTCCACCCATTTATCAATAACAGTAGAAACATTTGGTTATATCATATATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTTTATTCTTCTCCACCACCTCCCTACTATGTTTATAATCTCCTCCTCCTCTTTTCTATCAAACTCCCCACCACCAAAAGTAAAGTATGAGTACAAATCACCGCCACC
TCCAGTTTTATTATTCTCCTCCGTCTCCTATTTACCATTCTCCTCCACCACCTGTTTATCACTTCCCACCACCTCCAGTTTATTACTATCCACCCCCACCAAAGAGCAGG
AGTATAAATCACCACCACCTCCTGTTTATTACTCTCCTCCTCCCCTTGTATATCACTCTCCTCCACCTCCAGTTTACCATTCTACTTACCCACCTATTTATCACTCCCCA
CCACCTCCGGTTTATCACTCTCCACCCCCACCAAAGAAGCAGGAGTATAAATCACCACCACCTCCTATTTATTACTCTCCTCCTCCACCTGTATATCACTCTCCTCCACT
CCAGTTTACCATTCTGCTCCTCCACCCATTTATCAATAACAGTAGAAACATTTGGTTATATCATATATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MFILLHHLPTMFIISSSSFLSNSPPPKVKYEYKSPPPPVLLFSSVSYLPFSSTTCLSLPTTSSLLLSTPTKEQEYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPVYHSTYPPIYHSP
PPPVYHSPPPPKKQEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPPLQFTILLLHPFINNSRNIWLYHI