; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CcUC04G066040 (gene) of Watermelon (PI 537277) v1 genome

Gene IDCcUC04G066040
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionLegume-specific protein
Genome locationCicolChr04:23020509..23020799
RNA-Seq ExpressionCcUC04G066040
SyntenyCcUC04G066040
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6595338.1 hypothetical protein SDJN03_11891, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.8e-1257.3Show/hide
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KAG6603637.1 hypothetical protein SDJN03_04246, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.9e-1257.58Show/hide
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KAG7027348.1 hypothetical protein SDJN02_11360, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.7e-1256.38Show/hide
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KAG7033819.1 hypothetical protein SDJN02_03544, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.0e-1257.58Show/hide
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KGN54276.1 hypothetical protein Csa_018169 [Cucumis sativus]1.9e-2268.42Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L2A8 Uncharacterized protein9.1e-2368.42Show/hide
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        QSPLC LLSNRV A
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A0A1R3H7T7 Uncharacterized protein4.1e-0744.33Show/hide
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A0A2C9VAK2 Uncharacterized protein6.3e-0843.14Show/hide
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        MEGLIPF+Y+AI+QY+NGN     SW  D  SSS      Y+RL GD       + ++    +  S+++S+SS  ++ +++ST   G QSPLCRL S R+
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        AA
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A0A2N9ENY4 Uncharacterized protein1.6e-0644.23Show/hide
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        MEGLIPF+Y+AI+QY+NGN     S  C+  S+S      Y+RL GD       D     ++  F+++SS SS +  S++ II   +SG+QSPLCRL   
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        RVAA
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A0A6M2ER07 Uncharacterized protein3.5e-0646.15Show/hide
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        MEGLIPF+Y+AI+QY+NG       SW       S S  A Y+RL GD       D  I    +  S+SS+SSSN +SS      ++G QSPL CRL S 
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        RVAA
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G37750.1 unknown protein1.4e-0439.33Show/hide
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        MEGLIP +YKA++Q R GN         ES   SSS   YVRL GD   ++ ++   S   S+SS+ ++ S+S       +G+QSP+ R
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AT5G02090.1 unknown protein7.2e-0447.83Show/hide
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        MEGLIPFLYKAI+ Y+   + +S    D  S S++    Y+RL GD
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGGGTCTGATTCCATTCCTTTACAAAGCCATTTTACAGTATAGAAATGGCAATAATGAAACTTCTTCATGGTGTTGTGATGAGTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCAGA
AGCTTTATATGTAAGACTTGCAGGTGATGATCAAGACTACATTATTAATAATCCTCCATTTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTTCTTCTTCAAATGGCAGCAGCAGTGTCA
TCATATCAACTGATAATTCTGGGATTCAATCTCCTCTCTGTCGTTTGCTTTCCAATCGAGTTGCTGCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGGGTCTGATTCCATTCCTTTACAAAGCCATTTTACAGTATAGAAATGGCAATAATGAAACTTCTTCATGGTGTTGTGATGAGTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCAGA
AGCTTTATATGTAAGACTTGCAGGTGATGATCAAGACTACATTATTAATAATCCTCCATTTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTTCTTCTTCAAATGGCAGCAGCAGTGTCA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEGLIPFLYKAILQYRNGNNETSSWCCDESSSSSSSEALYVRLAGDDQDYIINNPPFSSSSSSSSSSNGSSSVIISTDNSGIQSPLCRLLSNRVAA