; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CcUC04G070270 (gene) of Watermelon (PI 537277) v1 genome

Gene IDCcUC04G070270
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionNuclear ribonuclease Z
Genome locationCicolChr04:27069581..27072731
RNA-Seq ExpressionCcUC04G070270
SyntenyCcUC04G070270
Gene Ontology termsGO:0034414 - tRNA 3'-trailer cleavage, endonucleolytic (biological process)
GO:0042781 - 3'-tRNA processing endoribonuclease activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001279 - Metallo-beta-lactamase
IPR036866 - Ribonuclease Z/Hydroxyacylglutathione hydrolase-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0063843.1 nuclear ribonuclease Z [Cucumis melo var. makuwa]2.3e-14481.08Show/hide
Query:  MAAETV--CSRSLDLDPMETRKGMQIEGYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFLFISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKMEPPTIIVP
        MAA T    S++LD +PME  KG+QI GYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQ+FLFISHGHMDHIGGLP YVATRGLYKM PPTI+VP
Subjt:  MAAETV--CSRSLDLDPMETRKGMQIEGYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFLFISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKMEPPTIIVP

Query:  KSIKNDVENLLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYSVKQKLKKEYLGLSGNEIKKLRSSGVEVTNTITEPEVAFT
        KSIKNDVENLLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDL+VRVF+TYHVIDSQGY+LYSVKQKLKK+YLGLSGNEIKKLR SGVE+T TITEPEVAFT
Subjt:  KSIKNDVENLLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYSVKQKLKKEYLGLSGNEIKKLRSSGVEVTNTITEPEVAFT

Query:  GDTTSDFIVDENNIDVLRAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFEVRSLNIVAPAIPVFIQQLISYNFTSFCASCVAAPSQIINHAEKFKNKAILLI
        GDTTSDFIVDENNIDVLRAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFE                                    IINHA+KFKNKAILLI
Subjt:  GDTTSDFIVDENNIDVLRAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFEVRSLNIVAPAIPVFIQQLISYNFTSFCASCVAAPSQIINHAEKFKNKAILLI

Query:  HFSARYTTEEIQQAIATLPPPLAGRVSALTEGF
        HFSARYTTEEIQ+AI+TLPPPLAGRVSALTEGF
Subjt:  HFSARYTTEEIQQAIATLPPPLAGRVSALTEGF

TYK28208.1 nuclear ribonuclease Z [Cucumis melo var. makuwa]1.9e-16288.59Show/hide
Query:  MAAETV--CSRSLDLDPMETRKGMQIEGYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFLFISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKMEPPTIIVP
        MAA T    S++LD +PME  KG+QI GYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQ+FLFISHGHMDHIGGLP YVATRGLYKM PPTI+VP
Subjt:  MAAETV--CSRSLDLDPMETRKGMQIEGYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFLFISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKMEPPTIIVP

Query:  KSIKNDVENLLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYSVKQKLKKEYLGLSGNEIKKLRSSGVEVTNTITEPEVAFT
        KSIKNDVENLLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDL+VRVF+TYHVIDSQGY+LYSVKQKLKK+YLGLSGNEIKKLR SGVE+T TITEPEVAFT
Subjt:  KSIKNDVENLLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYSVKQKLKKEYLGLSGNEIKKLRSSGVEVTNTITEPEVAFT

Query:  GDTTSDFIVDENNIDVLRAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFEVRSLNIVAPAIPVFIQQLISYNFTSFCASCVAAPSQIINHAEKFKNKAILLI
        GDTTSDFIVDENNIDVLRAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFEV  LNIV P IPVFIQQLISYNFTS  A  V  P+QIINHA+KFKNKAILLI
Subjt:  GDTTSDFIVDENNIDVLRAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFEVRSLNIVAPAIPVFIQQLISYNFTSFCASCVAAPSQIINHAEKFKNKAILLI

Query:  HFSARYTTEEIQQAIATLPPPLAGRVSALTEGF
        HFSARYTTEEIQ+AI+TLPPPLAGRVSALTEGF
Subjt:  HFSARYTTEEIQQAIATLPPPLAGRVSALTEGF

XP_022950835.1 tRNase Z TRZ1 [Cucurbita moschata]1.4e-14483.02Show/hide
Query:  SRSLDLDPMETRKGMQIEGYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFLFISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKMEPPTIIVPKSIKNDVEN
        S+SLD D  E  KGMQIEGYPIKGLSIGGHETC+IFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFL ISHGHMDHIGGLP YVATRGLYKMEPPTIIVPKSIKNDVEN
Subjt:  SRSLDLDPMETRKGMQIEGYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFLFISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKMEPPTIIVPKSIKNDVEN

Query:  LLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYSVKQKLKKEYLGLSGNEIKKLRSSGVEVTNTITEPEVAFTGDTTSDFIV
        LLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEE SLRRDL+VR FKTYHVIDSQGY+LYSVKQKLKKEYLGL GNEIKKLR SGVEVT TIT+PEVAFTGDTTSDFIV
Subjt:  LLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYSVKQKLKKEYLGLSGNEIKKLRSSGVEVTNTITEPEVAFTGDTTSDFIV

Query:  DENNIDVLRAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFEVRSLNIVAPAIPVFIQQLISYNFTSFCASCVAAPSQIINHAEKFKNKAILLIHFSARYTTE
        DENNIDVLRAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFE                                    IINHAEKFKNKAIL+IHFSARYTTE
Subjt:  DENNIDVLRAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFEVRSLNIVAPAIPVFIQQLISYNFTSFCASCVAAPSQIINHAEKFKNKAILLIHFSARYTTE

Query:  EIQQAIATLPPPLAGRVSALTEGF
        EIQQA+ATLPPPLAGRVSALTEGF
Subjt:  EIQQAIATLPPPLAGRVSALTEGF

XP_038882012.1 tRNase Z TRZ1 isoform X1 [Benincasa hispida]6.5e-14782.83Show/hide
Query:  MAAETVC-SRSLDLDPMETRKGMQIEGYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFLFISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKMEPPTIIVPK
        MAA T C S+SLD DPME+ KGMQIEGYPIKGLSIGGHETCVIFPTL+LAFDIGRCPQKAISQ+FLFISHGHMDHIGGLP YVATRGLYKM+PPTIIVPK
Subjt:  MAAETVC-SRSLDLDPMETRKGMQIEGYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFLFISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKMEPPTIIVPK

Query:  SIKNDVENLLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYSVKQKLKKEYLGLSGNEIKKLRSSGVEVTNTITEPEVAFTG
        SIKNDVENLLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDL+VR FKTYHVIDSQGY+LYSVKQKLKKEYLGLSGNEIKKLR SG E+T TITEPEVAFTG
Subjt:  SIKNDVENLLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYSVKQKLKKEYLGLSGNEIKKLRSSGVEVTNTITEPEVAFTG

Query:  DTTSDFIVDENNIDVLRAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFEVRSLNIVAPAIPVFIQQLISYNFTSFCASCVAAPSQIINHAEKFKNKAILLIH
        DTTSDFIVDENNID+LRAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFE                                    IINHAEKFKNKAILLIH
Subjt:  DTTSDFIVDENNIDVLRAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFEVRSLNIVAPAIPVFIQQLISYNFTSFCASCVAAPSQIINHAEKFKNKAILLIH

Query:  FSARYTTEEIQQAIATLPPPLAGRVSALTEGF
        FSARYTTEEIQQAIAT+PPPLAGRVSAL EGF
Subjt:  FSARYTTEEIQQAIATLPPPLAGRVSALTEGF

XP_038882013.1 tRNase Z TRZ1 isoform X2 [Benincasa hispida]6.5e-14782.83Show/hide
Query:  MAAETVC-SRSLDLDPMETRKGMQIEGYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFLFISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKMEPPTIIVPK
        MAA T C S+SLD DPME+ KGMQIEGYPIKGLSIGGHETCVIFPTL+LAFDIGRCPQKAISQ+FLFISHGHMDHIGGLP YVATRGLYKM+PPTIIVPK
Subjt:  MAAETVC-SRSLDLDPMETRKGMQIEGYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFLFISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKMEPPTIIVPK

Query:  SIKNDVENLLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYSVKQKLKKEYLGLSGNEIKKLRSSGVEVTNTITEPEVAFTG
        SIKNDVENLLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDL+VR FKTYHVIDSQGY+LYSVKQKLKKEYLGLSGNEIKKLR SG E+T TITEPEVAFTG
Subjt:  SIKNDVENLLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYSVKQKLKKEYLGLSGNEIKKLRSSGVEVTNTITEPEVAFTG

Query:  DTTSDFIVDENNIDVLRAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFEVRSLNIVAPAIPVFIQQLISYNFTSFCASCVAAPSQIINHAEKFKNKAILLIH
        DTTSDFIVDENNID+LRAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFE                                    IINHAEKFKNKAILLIH
Subjt:  DTTSDFIVDENNIDVLRAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFEVRSLNIVAPAIPVFIQQLISYNFTSFCASCVAAPSQIINHAEKFKNKAILLIH

Query:  FSARYTTEEIQQAIATLPPPLAGRVSALTEGF
        FSARYTTEEIQQAIAT+PPPLAGRVSAL EGF
Subjt:  FSARYTTEEIQQAIATLPPPLAGRVSALTEGF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3C5G3 nuclear ribonuclease Z1.6e-14380.78Show/hide
Query:  MAAETV--CSRSLDLDPMETRKGMQIEGYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFLFISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKMEPPTIIVP
        MAA T    S++LD +PME  KG+QI GYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQ+FLFISHGHMDHIGGLP YVATRGLYKM PPTI+VP
Subjt:  MAAETV--CSRSLDLDPMETRKGMQIEGYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFLFISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKMEPPTIIVP

Query:  KSIKNDVENLLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYSVKQKLKKEYLGLSGNEIKKLRSSGVEVTNTITEPEVAFT
        KSIKNDVENLLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDL+VRVF+TYHVIDSQGY+LYSVKQKLKK+YLGLSGNEIKKLR SGVE+T TITEPEVAFT
Subjt:  KSIKNDVENLLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYSVKQKLKKEYLGLSGNEIKKLRSSGVEVTNTITEPEVAFT

Query:  GDTTSDFIVDENNIDVLRAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFEVRSLNIVAPAIPVFIQQLISYNFTSFCASCVAAPSQIINHAEKFKNKAILLI
        GDTTSDFIVDENNIDVLRAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFE                                    IINHA+KFKNKAILLI
Subjt:  GDTTSDFIVDENNIDVLRAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFEVRSLNIVAPAIPVFIQQLISYNFTSFCASCVAAPSQIINHAEKFKNKAILLI

Query:  HFSARYTTEEIQQAIATLPPPLAGRVSALTEGF
        HFSARYTTEEIQ+AI+TLPP LAGRVSALTEGF
Subjt:  HFSARYTTEEIQQAIATLPPPLAGRVSALTEGF

A0A5A7V6W7 Nuclear ribonuclease Z1.1e-14481.08Show/hide
Query:  MAAETV--CSRSLDLDPMETRKGMQIEGYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFLFISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKMEPPTIIVP
        MAA T    S++LD +PME  KG+QI GYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQ+FLFISHGHMDHIGGLP YVATRGLYKM PPTI+VP
Subjt:  MAAETV--CSRSLDLDPMETRKGMQIEGYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFLFISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKMEPPTIIVP

Query:  KSIKNDVENLLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYSVKQKLKKEYLGLSGNEIKKLRSSGVEVTNTITEPEVAFT
        KSIKNDVENLLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDL+VRVF+TYHVIDSQGY+LYSVKQKLKK+YLGLSGNEIKKLR SGVE+T TITEPEVAFT
Subjt:  KSIKNDVENLLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYSVKQKLKKEYLGLSGNEIKKLRSSGVEVTNTITEPEVAFT

Query:  GDTTSDFIVDENNIDVLRAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFEVRSLNIVAPAIPVFIQQLISYNFTSFCASCVAAPSQIINHAEKFKNKAILLI
        GDTTSDFIVDENNIDVLRAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFE                                    IINHA+KFKNKAILLI
Subjt:  GDTTSDFIVDENNIDVLRAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFEVRSLNIVAPAIPVFIQQLISYNFTSFCASCVAAPSQIINHAEKFKNKAILLI

Query:  HFSARYTTEEIQQAIATLPPPLAGRVSALTEGF
        HFSARYTTEEIQ+AI+TLPPPLAGRVSALTEGF
Subjt:  HFSARYTTEEIQQAIATLPPPLAGRVSALTEGF

A0A5D3DXQ4 Nuclear ribonuclease Z9.1e-16388.59Show/hide
Query:  MAAETV--CSRSLDLDPMETRKGMQIEGYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFLFISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKMEPPTIIVP
        MAA T    S++LD +PME  KG+QI GYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQ+FLFISHGHMDHIGGLP YVATRGLYKM PPTI+VP
Subjt:  MAAETV--CSRSLDLDPMETRKGMQIEGYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFLFISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKMEPPTIIVP

Query:  KSIKNDVENLLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYSVKQKLKKEYLGLSGNEIKKLRSSGVEVTNTITEPEVAFT
        KSIKNDVENLLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDL+VRVF+TYHVIDSQGY+LYSVKQKLKK+YLGLSGNEIKKLR SGVE+T TITEPEVAFT
Subjt:  KSIKNDVENLLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYSVKQKLKKEYLGLSGNEIKKLRSSGVEVTNTITEPEVAFT

Query:  GDTTSDFIVDENNIDVLRAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFEVRSLNIVAPAIPVFIQQLISYNFTSFCASCVAAPSQIINHAEKFKNKAILLI
        GDTTSDFIVDENNIDVLRAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFEV  LNIV P IPVFIQQLISYNFTS  A  V  P+QIINHA+KFKNKAILLI
Subjt:  GDTTSDFIVDENNIDVLRAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFEVRSLNIVAPAIPVFIQQLISYNFTSFCASCVAAPSQIINHAEKFKNKAILLI

Query:  HFSARYTTEEIQQAIATLPPPLAGRVSALTEGF
        HFSARYTTEEIQ+AI+TLPPPLAGRVSALTEGF
Subjt:  HFSARYTTEEIQQAIATLPPPLAGRVSALTEGF

A0A6J1GGV3 tRNase Z TRZ16.5e-14583.02Show/hide
Query:  SRSLDLDPMETRKGMQIEGYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFLFISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKMEPPTIIVPKSIKNDVEN
        S+SLD D  E  KGMQIEGYPIKGLSIGGHETC+IFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFL ISHGHMDHIGGLP YVATRGLYKMEPPTIIVPKSIKNDVEN
Subjt:  SRSLDLDPMETRKGMQIEGYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFLFISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKMEPPTIIVPKSIKNDVEN

Query:  LLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYSVKQKLKKEYLGLSGNEIKKLRSSGVEVTNTITEPEVAFTGDTTSDFIV
        LLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEE SLRRDL+VR FKTYHVIDSQGY+LYSVKQKLKKEYLGL GNEIKKLR SGVEVT TIT+PEVAFTGDTTSDFIV
Subjt:  LLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYSVKQKLKKEYLGLSGNEIKKLRSSGVEVTNTITEPEVAFTGDTTSDFIV

Query:  DENNIDVLRAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFEVRSLNIVAPAIPVFIQQLISYNFTSFCASCVAAPSQIINHAEKFKNKAILLIHFSARYTTE
        DENNIDVLRAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFE                                    IINHAEKFKNKAIL+IHFSARYTTE
Subjt:  DENNIDVLRAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFEVRSLNIVAPAIPVFIQQLISYNFTSFCASCVAAPSQIINHAEKFKNKAILLIHFSARYTTE

Query:  EIQQAIATLPPPLAGRVSALTEGF
        EIQQA+ATLPPPLAGRVSALTEGF
Subjt:  EIQQAIATLPPPLAGRVSALTEGF

A0A6J1IPL7 tRNase Z TRZ12.5e-14482.72Show/hide
Query:  SRSLDLDPMETRKGMQIEGYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFLFISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKMEPPTIIVPKSIKNDVEN
        S+SLD D  E  KGMQIEGYPIKGLSIGGHETC+IFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFL ISHGHMDHIGGLP YVATRGLYKMEPPTIIVPKSIKNDVEN
Subjt:  SRSLDLDPMETRKGMQIEGYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFLFISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKMEPPTIIVPKSIKNDVEN

Query:  LLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYSVKQKLKKEYLGLSGNEIKKLRSSGVEVTNTITEPEVAFTGDTTSDFIV
        LLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEE SLRRDL+VR FKTYHVIDSQGY+LYSVKQKLKKEYLGL GNEIKKLR SGVEVT TIT+PEVAFTGDTTSDFIV
Subjt:  LLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYSVKQKLKKEYLGLSGNEIKKLRSSGVEVTNTITEPEVAFTGDTTSDFIV

Query:  DENNIDVLRAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFEVRSLNIVAPAIPVFIQQLISYNFTSFCASCVAAPSQIINHAEKFKNKAILLIHFSARYTTE
        DENNIDVLRAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFE                                    IINHAEKFKNKAIL+IHFSARYTTE
Subjt:  DENNIDVLRAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFEVRSLNIVAPAIPVFIQQLISYNFTSFCASCVAAPSQIINHAEKFKNKAILLIHFSARYTTE

Query:  EIQQAIATLPPPLAGRVSALTEGF
        EIQQA+A LPPPLAGRVSALTEGF
Subjt:  EIQQAIATLPPPLAGRVSALTEGF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P60193 Nuclear ribonuclease Z (Fragment)1.8e-7070.59Show/hide
Query:  MQIEGYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFLFISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKMEPPTIIVPKSIKNDVENLLEVHRRLDQSELR
        ++IEGYP++G+SIGGHETCVIFPTL+LAFDIGRCPQ+A++Q+FLFISH H+DHIGGLP YVATRGLY++ PPTI VPK ++  VE L +VHR +DQSEL 
Subjt:  MQIEGYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFLFISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKMEPPTIIVPKSIKNDVENLLEVHRRLDQSELR

Query:  CNLIGLEVGEELSLRRDLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYSVKQKLKKEYLGLSGNEIKKLRSSGVEVTNTIT
          L+ L++GEE  LRRDL+VR FKTYH I SQGYV+YSVKQKLK++YLGL G+EIK+L+ SGVE+TNT+T
Subjt:  CNLIGLEVGEELSLRRDLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYSVKQKLKKEYLGLSGNEIKKLRSSGVEVTNTIT

Q8EQ58 Ribonuclease Z1.4e-0629.33Show/hide
Query:  FDIGRCPQKAISQNFL--------FISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKME--PPTIIVPKSIKNDVENLLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEELSL--RR
        FD G   Q  I    L        FI+H H DHI GLP ++++R     E  P  I  P  IK  VE+ L    RL Q+ L   +   E+ E+ +L    
Subjt:  FDIGRCPQKAISQNFL--------FISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKME--PPTIIVPKSIKNDVENLLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEELSL--RR

Query:  DLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYS-------VKQKLKK-------EYLGLSGNEIKKLRSSGVEVTNTITEPE-----VAFTGDTTSDFIVDENNIDVLR-A
        ++ V   K  H IDS GY +         +  KLK+        Y  +  NEI  L +  +   N +  P      ++  GDT        ++I  ++ +
Subjt:  DLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYS-------VKQKLKK-------EYLGLSGNEIKKLRSSGVEVTNTITEPE-----VAFTGDTTSDFIVDENNIDVLR-A

Query:  KILVMESTFLENRVTVEHAREYGHT
         ILV ESTF +++  +  A EY H+
Subjt:  KILVMESTFLENRVTVEHAREYGHT

Q8L633 tRNase Z TRZ2, chloroplastic7.1e-8851.12Show/hide
Query:  RKGMQIEGYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFLFISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKMEPPTIIVPKSIKNDVENLLEVHRRLDQS
        RKG+++E Y I+G+S+GGHETCVI P L   FDIGRCP +AI Q FLFI+H H+DHIGGLP YVA+RGLY +EPP I VP SIK DVE LLE+HR + Q 
Subjt:  RKGMQIEGYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFLFISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKMEPPTIIVPKSIKNDVENLLEVHRRLDQS

Query:  ELRCNLIGLEVGEELSLRRDLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYSVKQKLKKEYLGLSGNEIKKLRSSGVEVTNTITEPEVAFTGDTTSDFIVDENNIDVLRAK
        EL   LI L VGE   LR D+ VR F T+HVI SQGYV+YSV++KL+K+Y  L G +I+K++ SGVE+T+TI  PE+AFTGDTTS++++D  N D LRAK
Subjt:  ELRCNLIGLEVGEELSLRRDLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYSVKQKLKKEYLGLSGNEIKKLRSSGVEVTNTITEPEVAFTGDTTSDFIVDENNIDVLRAK

Query:  ILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFEVRSLNIVAPAIPVFIQQLISYNFTSFCASCVAAPSQIINHAEKFKNKAILLIHFSARYTTEEIQQAIATLPP
        +L+ E+TFL+   + EHA+  GHTH+                                    SQII +A+  ++K +LL HFS+RY  EEI++A+  L  
Subjt:  ILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFEVRSLNIVAPAIPVFIQQLISYNFTSFCASCVAAPSQIINHAEKFKNKAILLIHFSARYTTEEIQQAIATLPP

Query:  PLAGRVSALTEGF
         ++ +V  LTEGF
Subjt:  PLAGRVSALTEGF

Q8LGU7 tRNase Z TRZ15.0e-11865.51Show/hide
Query:  METRKGMQIEGYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFLFISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKMEPPTIIVPKSIKNDVENLLEVHRRL
        ME +K MQIEGYPI+GLSIGGHETC+IFP+L +AFDIGRCP +AISQ+FLFISH HMDHIGGLP YVATRGLYKM+PPTIIVP SIK  VE+L EVHR+L
Subjt:  METRKGMQIEGYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFLFISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKMEPPTIIVPKSIKNDVENLLEVHRRL

Query:  DQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYSVKQKLKKEYLGLSGNEIKKLRSSGVEVTNTITEPEVAFTGDTTSDFIVDENNIDVL
        D SEL+ NL+GL++GEE  +R+DL+V+ FKT+HVI SQGYV+YS K KLKKEY+GLSGNEIK L+ SGVE+T++I  PEVAFTGDTTSDF+VDE N D L
Subjt:  DQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYSVKQKLKKEYLGLSGNEIKKLRSSGVEVTNTITEPEVAFTGDTTSDFIVDENNIDVL

Query:  RAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFEVRSLNIVAPAIPVFIQQLISYNFTSFCASCVAAPSQIINHAEKFKNKAILLIHFSARYTTEEIQQAIAT
        +AK+LVMESTFL++ V+VEHAR+YGH H+                                    S+I+NHAEKF+NKAILLIHFSARYT +EI+ A++ 
Subjt:  RAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFEVRSLNIVAPAIPVFIQQLISYNFTSFCASCVAAPSQIINHAEKFKNKAILLIHFSARYTTEEIQQAIAT

Query:  LPPPLAGRVSALTEGF
        LPPPL GRV ALT+GF
Subjt:  LPPPLAGRVSALTEGF

Q973F1 Ribonuclease Z1.2e-0726.13Show/hide
Query:  ISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKMEPPTIIV-PKSIKNDVENLLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYSVKQKLK
        I+H H DH+ GLP  + T G+Y  +   +++ PK +K  +E++ +        E++     ++  E+     ++++  F+T H I+SQGY L+  K +LK
Subjt:  ISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKMEPPTIIV-PKSIKNDVENLLEVHRRLDQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYSVKQKLK

Query:  KEYLGLSGNEIKKLR-------SSGVEVTNTITEPE----------VAFTGDTTSDFIVDENNIDVLR-AKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFE
         +   L    IK  R          VE+   +  PE          +A+TGDT       E  I+ ++   +L+ +STF++ +     A +YGH++ ++
Subjt:  KEYLGLSGNEIKKLR-------SSGVEVTNTITEPE----------VAFTGDTTSDFIVDENNIDVLR-AKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G74700.1 tRNAse Z13.6e-11965.51Show/hide
Query:  METRKGMQIEGYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFLFISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKMEPPTIIVPKSIKNDVENLLEVHRRL
        ME +K MQIEGYPI+GLSIGGHETC+IFP+L +AFDIGRCP +AISQ+FLFISH HMDHIGGLP YVATRGLYKM+PPTIIVP SIK  VE+L EVHR+L
Subjt:  METRKGMQIEGYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFLFISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKMEPPTIIVPKSIKNDVENLLEVHRRL

Query:  DQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYSVKQKLKKEYLGLSGNEIKKLRSSGVEVTNTITEPEVAFTGDTTSDFIVDENNIDVL
        D SEL+ NL+GL++GEE  +R+DL+V+ FKT+HVI SQGYV+YS K KLKKEY+GLSGNEIK L+ SGVE+T++I  PEVAFTGDTTSDF+VDE N D L
Subjt:  DQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYSVKQKLKKEYLGLSGNEIKKLRSSGVEVTNTITEPEVAFTGDTTSDFIVDENNIDVL

Query:  RAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFEVRSLNIVAPAIPVFIQQLISYNFTSFCASCVAAPSQIINHAEKFKNKAILLIHFSARYTTEEIQQAIAT
        +AK+LVMESTFL++ V+VEHAR+YGH H+                                    S+I+NHAEKF+NKAILLIHFSARYT +EI+ A++ 
Subjt:  RAKILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFEVRSLNIVAPAIPVFIQQLISYNFTSFCASCVAAPSQIINHAEKFKNKAILLIHFSARYTTEEIQQAIAT

Query:  LPPPLAGRVSALTEGF
        LPPPL GRV ALT+GF
Subjt:  LPPPLAGRVSALTEGF

AT2G04530.1 Metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein5.0e-8951.12Show/hide
Query:  RKGMQIEGYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFLFISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKMEPPTIIVPKSIKNDVENLLEVHRRLDQS
        RKG+++E Y I+G+S+GGHETCVI P L   FDIGRCP +AI Q FLFI+H H+DHIGGLP YVA+RGLY +EPP I VP SIK DVE LLE+HR + Q 
Subjt:  RKGMQIEGYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFLFISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKMEPPTIIVPKSIKNDVENLLEVHRRLDQS

Query:  ELRCNLIGLEVGEELSLRRDLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYSVKQKLKKEYLGLSGNEIKKLRSSGVEVTNTITEPEVAFTGDTTSDFIVDENNIDVLRAK
        EL   LI L VGE   LR D+ VR F T+HVI SQGYV+YSV++KL+K+Y  L G +I+K++ SGVE+T+TI  PE+AFTGDTTS++++D  N D LRAK
Subjt:  ELRCNLIGLEVGEELSLRRDLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYSVKQKLKKEYLGLSGNEIKKLRSSGVEVTNTITEPEVAFTGDTTSDFIVDENNIDVLRAK

Query:  ILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFEVRSLNIVAPAIPVFIQQLISYNFTSFCASCVAAPSQIINHAEKFKNKAILLIHFSARYTTEEIQQAIATLPP
        +L+ E+TFL+   + EHA+  GHTH+                                    SQII +A+  ++K +LL HFS+RY  EEI++A+  L  
Subjt:  ILVMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFEVRSLNIVAPAIPVFIQQLISYNFTSFCASCVAAPSQIINHAEKFKNKAILLIHFSARYTTEEIQQAIATLPP

Query:  PLAGRVSALTEGF
         ++ +V  LTEGF
Subjt:  PLAGRVSALTEGF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAGCCGAAACCGTATGTAGCAGAAGCTTGGACTTGGACCCAATGGAAACGAGGAAGGGAATGCAGATTGAAGGATACCCAATTAAGGGCTTGTCCATTGGAGGTCA
TGAAACTTGCGTCATTTTCCCAACTCTCAATTTGGCCTTCGATATTGGTCGCTGTCCTCAAAAGGCCATAAGCCAGAACTTCCTTTTCATCTCCCATGGTCATATGGATC
ACATTGGGGGACTTCCCTTTTACGTTGCTACCCGTGGATTATACAAAATGGAACCGCCAACAATTATTGTACCAAAATCCATAAAGAATGATGTAGAAAATCTCTTAGAG
GTGCACAGAAGATTGGATCAATCTGAGCTGAGATGTAATTTGATTGGCTTGGAAGTGGGGGAAGAGTTGTCATTGAGAAGGGACCTCAGAGTGAGGGTGTTTAAGACATA
CCATGTCATTGACAGCCAGGGTTATGTACTTTACTCTGTAAAGCAGAAGCTTAAGAAAGAGTACTTGGGACTATCTGGCAACGAGATCAAGAAACTTCGCTCATCTGGTG
TTGAGGTCACTAACACAATTACTGAACCTGAAGTGGCTTTTACTGGAGATACCACGTCTGACTTTATAGTTGATGAAAATAATATTGACGTATTGAGGGCAAAGATCCTG
GTAATGGAGAGCACATTTCTTGAAAATAGAGTTACAGTGGAGCATGCAAGAGAATACGGCCACACTCACCTGTTTGAGGTTCGTTCACTTAACATTGTAGCACCTGCTAT
TCCTGTATTCATTCAGCAACTTATATCTTATAATTTTACATCCTTTTGTGCTTCTTGTGTTGCTGCTCCGTCCCAGATAATAAACCATGCCGAAAAGTTTAAGAACAAAG
CGATACTTCTGATTCACTTTTCAGCTCGCTACACTACAGAGGAAATTCAGCAAGCCATAGCTACTTTACCTCCACCTTTGGCAGGTCGGGTTTCTGCGCTAACGGAAGGT
TTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCAGCCGAAACCGTATGTAGCAGAAGCTTGGACTTGGACCCAATGGAAACGAGGAAGGGAATGCAGATTGAAGGATACCCAATTAAGGGCTTGTCCATTGGAGGTCA
TGAAACTTGCGTCATTTTCCCAACTCTCAATTTGGCCTTCGATATTGGTCGCTGTCCTCAAAAGGCCATAAGCCAGAACTTCCTTTTCATCTCCCATGGTCATATGGATC
ACATTGGGGGACTTCCCTTTTACGTTGCTACCCGTGGATTATACAAAATGGAACCGCCAACAATTATTGTACCAAAATCCATAAAGAATGATGTAGAAAATCTCTTAGAG
GTGCACAGAAGATTGGATCAATCTGAGCTGAGATGTAATTTGATTGGCTTGGAAGTGGGGGAAGAGTTGTCATTGAGAAGGGACCTCAGAGTGAGGGTGTTTAAGACATA
CCATGTCATTGACAGCCAGGGTTATGTACTTTACTCTGTAAAGCAGAAGCTTAAGAAAGAGTACTTGGGACTATCTGGCAACGAGATCAAGAAACTTCGCTCATCTGGTG
TTGAGGTCACTAACACAATTACTGAACCTGAAGTGGCTTTTACTGGAGATACCACGTCTGACTTTATAGTTGATGAAAATAATATTGACGTATTGAGGGCAAAGATCCTG
GTAATGGAGAGCACATTTCTTGAAAATAGAGTTACAGTGGAGCATGCAAGAGAATACGGCCACACTCACCTGTTTGAGGTTCGTTCACTTAACATTGTAGCACCTGCTAT
TCCTGTATTCATTCAGCAACTTATATCTTATAATTTTACATCCTTTTGTGCTTCTTGTGTTGCTGCTCCGTCCCAGATAATAAACCATGCCGAAAAGTTTAAGAACAAAG
CGATACTTCTGATTCACTTTTCAGCTCGCTACACTACAGAGGAAATTCAGCAAGCCATAGCTACTTTACCTCCACCTTTGGCAGGTCGGGTTTCTGCGCTAACGGAAGGT
TTTTAAGGTGGGGTGCAACCGTCGAATACACTTTTATATTCACAGGTTATTTAGAAGTGTTCCGAAAATCATTTTGCTCACCTTTATACATATTTTTTTTTAAAAAAACC
CTTTTTTAGTTCTATTGTAATTTGTCATGATTTGTTTTCTTGAATGCTTTCATTGCGAAAGTGGTGCTTTGAATTGGGTCTCTATGTTTGTGTGGGAAAATGCAAAATCA
AATGCTACATTAGAGGATATTGATTGAATTGGTTCATGCAGTTTAAAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAETVCSRSLDLDPMETRKGMQIEGYPIKGLSIGGHETCVIFPTLNLAFDIGRCPQKAISQNFLFISHGHMDHIGGLPFYVATRGLYKMEPPTIIVPKSIKNDVENLLE
VHRRLDQSELRCNLIGLEVGEELSLRRDLRVRVFKTYHVIDSQGYVLYSVKQKLKKEYLGLSGNEIKKLRSSGVEVTNTITEPEVAFTGDTTSDFIVDENNIDVLRAKIL
VMESTFLENRVTVEHAREYGHTHLFEVRSLNIVAPAIPVFIQQLISYNFTSFCASCVAAPSQIINHAEKFKNKAILLIHFSARYTTEEIQQAIATLPPPLAGRVSALTEG
F