; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CcUC04G074630 (gene) of Watermelon (PI 537277) v1 genome

Gene IDCcUC04G074630
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionRING-type domain-containing protein
Genome locationCicolChr04:30564790..30565356
RNA-Seq ExpressionCcUC04G074630
SyntenyCcUC04G074630
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0025673.1 RING-H2 finger protein ATL72-like [Cucumis melo var. makuwa]1.6e-8183.25Show/hide
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KAG6603909.1 RING-H2 finger protein ATL72, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.3e-7273.3Show/hide
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XP_008440820.1 PREDICTED: RING-H2 finger protein ATL72-like [Cucumis melo]1.6e-8183.25Show/hide
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XP_011658497.1 E3 ubiquitin-protein ligase RHA2B [Cucumis sativus]1.1e-8283.68Show/hide
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XP_038881295.1 RING-H2 finger protein ATL79-like [Benincasa hispida]6.6e-8885.19Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KKP7 RING-type domain-containing protein5.3e-8383.68Show/hide
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A0A1S3B2S4 RING-H2 finger protein ATL72-like7.6e-8283.25Show/hide
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A0A5D3CLV8 RING-H2 finger protein ATL72-like7.6e-8283.25Show/hide
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A0A6J1GEN4 RING-H2 finger protein ATL74-like8.5e-7373.3Show/hide
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A0A6J1IJG4 RING-H2 finger protein ATL74-like1.6e-7172.63Show/hide
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        MNS    GY+YRRLLKDSL + PFG  ER+  ICV SAIAA FV+SLFISLFTCFRRQL S SSKPPSST S QL++MPVYIYGD     S+ YCFT SS
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        FE RNCVICL EFE GDELRVLPNC H FHKGCIDQWLPL+SL CPLCR+ + +EIGT+R PVC+NYW RNPAF+LAF   S+ PLPSQL
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q67YI6 RING-H2 finger protein ATL655.5e-1336.36Show/hide
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        SS  P     S +  +P+++Y   + +   +   TS+   R+C +CL EFE GD +R LP C H FH  CID+WL     +CPLCR   +   G + P+
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Q8GW38 RING-H2 finger protein ATL478.9e-1136.17Show/hide
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        ++RQL        S    + +  +PV++Y ++  +           E  +C +CL EF   D+LR+LPNC H FH  CID WL L +  CPLCR
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Q8H7N9 E3 ubiquitin-protein ligase Os03g01882004.4e-1047.14Show/hide
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        P  +YGD+ +  ++    +   E   C +CLAEF   DELRVLP C HVFH  CID WL   ++ CPLCR
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Q9LY41 E3 ubiquitin-protein ligase ATL45.2e-1140.48Show/hide
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        P +  SS L ++P++ +  ++  S       SS  S +C +CL++FE  D+LR+LP C H FH  CID WL + +  CPLCR P
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Q9XF92 Brassinosteroid-responsive RING protein 12.6e-1036.36Show/hide
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        S FS+ L    +PV  + +L++S              NC +CL EFE   E+R L NC+H+FH+ C+D+W+      CPLCR P + +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G63840.1 RING/U-box superfamily protein3.7e-1247.27Show/hide
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        ES  C +CL +FE+ DE+R L NC+H+FH+GC+D+W +    + CPLCR   I +
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AT3G18930.1 RING/U-box superfamily protein3.9e-1436.36Show/hide
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        SS  P     S +  +P+++Y   + +   +   TS+   R+C +CL EFE GD +R LP C H FH  CID+WL     +CPLCR   +   G + P+
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AT3G18930.2 RING/U-box superfamily protein3.9e-1436.36Show/hide
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        SS  P     S +  +P+++Y   + +   +   TS+   R+C +CL EFE GD +R LP C H FH  CID+WL     +CPLCR   +   G + P+
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AT3G60220.1 TOXICOS EN LEVADURA 43.7e-1240.48Show/hide
Query:  PSSTFSSQLTNMPVYIYGDLSSSSSSSYCFTSSFESRNCVICLAEFEHGDELRVLPNCKHVFHKGCIDQWLPLKSLHCPLCRDP
        P +  SS L ++P++ +  ++  S       SS  S +C +CL++FE  D+LR+LP C H FH  CID WL + +  CPLCR P
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AT5G41400.1 RING/U-box superfamily protein4.8e-1249.02Show/hide
Query:  CVICLAEFEHGDELRVLPNCKHVFHKGCIDQW-LPLKSLHCPLCRDPTIEE
        C +CL EFE+ DE+R L NC+H+FH+ C+D+W +    + CPLCR P I +
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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ACTTCTGCCATTGCAGCCGTGTTTGTAATCTCTTTGTTCATCTCCCTCTTCACCTGCTTTCGGCGTCAACTGAACTCTCCTTCCTCTAAACCTCCCTCATCCACA
TTTAGCAGCCAACTCACTAACATGCCTGTATATATCTATGGCGATTTGTCTTCAAGTTCGTCGTCATCTTATTGTTTTACGTCATCGTTTGAGTCGAGGAACTGT
GTCATATGTTTGGCGGAGTTTGAGCATGGAGATGAGCTTCGTGTTCTGCCTAACTGCAAGCATGTGTTTCATAAAGGCTGCATTGATCAGTGGCTTCCGTTGAAG
TCGTTGCATTGCCCGCTTTGCCGAGACCCTACAATAGAGGAGATTGGGACCATCAGACCTGTTTGTTCGAATTATTGGACCCGAAATCCAGCCTTCATATTGGCC
TTTGGCCTTGGTAGTAGTGTCCCATTGCCCTCTCAACTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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VICLAEFEHGDELRVLPNCKHVFHKGCIDQWLPLKSLHCPLCRDPTIEEIGTIRPVCSNYWTRNPAFILAFGLGSSVPLPSQL