; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CcUC04G078560 (gene) of Watermelon (PI 537277) v1 genome

Gene IDCcUC04G078560
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionDOG1 domain-containing protein
Genome locationCicolChr04:33028269..33034035
RNA-Seq ExpressionCcUC04G078560
SyntenyCcUC04G078560
Gene Ontology termsGO:0006351 - transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0004386 - helicase activity (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR025422 - Transcription factor TGA like domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0052615.1 transcription factor TGA6 [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-11383.59Show/hide
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XP_008439732.1 PREDICTED: transcription factor TGA6 [Cucumis melo]1.9e-11383.21Show/hide
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XP_022926401.1 protein DELAY OF GERMINATION 1-like [Cucurbita moschata]1.1e-9772.45Show/hide
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XP_038883466.1 protein DELAY OF GERMINATION 1-like [Benincasa hispida]4.0e-11181.68Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KNL1 DOG1 domain-containing protein4.1e-11785.5Show/hide
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A0A1S3B031 transcription factor TGA69.4e-11483.21Show/hide
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A0A5D3CMS6 Transcription factor TGA65.5e-11483.59Show/hide
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A0A6J1EET8 protein DELAY OF GERMINATION 1-like5.5e-9872.45Show/hide
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A0A6J1KW35 protein DELAY OF GERMINATION 1-like8.8e-9671.32Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A0SVK0 Protein DELAY OF GERMINATION 11.3e-3535.36Show/hide
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        G SS +   ++  +LEW+ LQ +   EL + L      A       E+ + +L  L  K I  F++Y  +R  LA    S ++AP W S  E +L+W+ G
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        CRPS F RL Y+L G + E RV +FL+     E   G       +LS  Q+ +++ L ++ I EEE++T K++ +QE+ AD  +  +A         N  
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        +++AL+KQ+  M +L+ +AD LR+ +L ++  IL P+Q   FL   KKLHLS+ EWG   DRR
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Q58FV0 Protein DOG1-like 31.2e-3332.71Show/hide
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        C+ EW+ +Q +   +L EAL          + +  + + +L  LV K +  FQ YT++R +L++   S++FAP W S  E  LLW+ GCRPS F+R+ YS
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        L G + ET+++++L       E+       +L+  Q+ +++ L ++ I++E+++T K A +QE +AD   + IA  +      +  +E AL+K +  M  
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        L+ +AD+LR  +L ++ +++ P+QA  FL   K+LH+S+ EWG+ R ++R G V        G AG
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Q9SLV1 Protein ZW21.7e-1126.24Show/hide
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        LV   +  +  Y + +   M +A +D+  FF+P W S+ E  +LWI G +P +  +L        + T V               +L+  Q++QL+S+++
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         T + E  L  + A +Q+ + D  ++ +  R +      EG   E+E A+E    EM+K ++ AD+LR  ++ ++ E+L P Q++  L  + + +L +R+
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Query:  WG
         G
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Q9SN45 Protein DOG1-like 21.1e-2630.12Show/hide
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        M    S       +RC+ EW+ LQ +   +L EAL    N            + +L  LV K +  +  Y  +R +L+    + +FAP W +  E S+LW
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Query:  IAGCRPSLFVRLAYSLTGYELETRVAEFLQGTKPMEEL-----AGELSPRQMEQLDSLQMRTIKEEERLTSKLARMQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGANE
        + GCRPS F+RL Y+L G + ET+++++L       ++       +L+  Q+ +L+ L +  IK+E+++T   A  Q+++AD  +  +         A+ 
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         +E AL+K +  M  L+ +AD+LR  +L ++ +++ PLQAV FL   K+L LS+ + G+
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Q9SN47 Protein DOG1-like 13.1e-2931.25Show/hide
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        E  SS+     + C+ EW+ LQ +   EL EA++             E+ + +L  L+  +I  F DY  +R + ++   S +FAP W +  E +LLW+ 
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Query:  GCRPSLFVRLAYSLTGYELETRVAEFLQGTK---------PMEELAG---------ELSPRQMEQLDSLQMRTIKEEERLTSKLARMQEEMADQTVVGIA
        GCRPS F+RL Y++ G + E R+  F   T           + E  G         +L+  Q+ +++ L ++T++ E +LT   A +QE+ AD  +   A
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Query:  IRSMKEEGANEELEKALEKQDGEMLKLIQQADELRIRSLNELTEILRPLQAVLFLAFSKKLHLSVREWGQRSDRRHGRVGVRKLERNG
                A+  +E+AL+K + +M  L+ +AD+LR+ +L ++ +IL  +QA  FL   KKLHL++ EWG+   R H     R+LE +G
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G58330.1 transcription factor-related1.2e-1226.24Show/hide
Query:  LVDKSIEQFQDYTDRR---MQLAKNDVSAFFAPVWCSTRETSLLWIAGCRPSLFVRLAYSLTGYELETRVAEFLQGTKPMEELAGELSPRQMEQLDSLQM
        LV   +  +  Y + +   M +A +D+  FF+P W S+ E  +LWI G +P +  +L        + T V               +L+  Q++QL+S+++
Subjt:  LVDKSIEQFQDYTDRR---MQLAKNDVSAFFAPVWCSTRETSLLWIAGCRPSLFVRLAYSLTGYELETRVAEFLQGTKPMEELAGELSPRQMEQLDSLQM

Query:  RTIKEEERLTSKLARMQEEMADQTVVGIAIRSM----KEEGANEELEKALEKQDGEMLKLIQQADELRIRSLNELTEILRPLQAVLFLAFSKKLHLSVRE
         T + E  L  + A +Q+ + D  ++ +  R +      EG   E+E A+E    EM+K ++ AD+LR  ++ ++ E+L P Q++  L  + + +L +R+
Subjt:  RTIKEEERLTSKLARMQEEMADQTVVGIAIRSM----KEEGANEELEKALEKQDGEMLKLIQQADELRIRSLNELTEILRPLQAVLFLAFSKKLHLSVRE

Query:  WG
         G
Subjt:  WG

AT3G14880.2 FUNCTIONS IN: molecular_function unknown4.1e-2126.21Show/hide
Query:  ASERCFLEWIKLQEESQRELFEALNAVENRANSNLQNSEETERQLTMLVDKSIEQFQDYTDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSTRETSLLWIAGCRPSLFVR
        + E     + K Q+    +L   LN + +  N +  ++   E +L   VD+ +E F++Y   +      DV    A  W S  E SL W+ G RP+    
Subjt:  ASERCFLEWIKLQEESQRELFEALNAVENRANSNLQNSEETERQLTMLVDKSIEQFQDYTDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSTRETSLLWIAGCRPSLFVR

Query:  LAYSLTGYELETRVAEFLQGTKPMEELAGELSPRQMEQLDSLQMRTIKEEERLTSKLARMQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGANEELEKALEKQDGEMLKL
        L Y+ +    E+R+ + L+G +  +    +LSP Q   +  LQ  T+KEE  +T +L+  Q++ +D  +           G + + ++ + +    + ++
Subjt:  LAYSLTGYELETRVAEFLQGTKPMEELAGELSPRQMEQLDSLQMRTIKEEERLTSKLARMQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGANEELEKALEKQDGEMLKL

Query:  IQQADELRIRSLNELTEILRPLQAVLFLAFSKKLHLSVREWGQRSDRR
        + + D+LR+R++  + E+L PLQ   FL  + +L   V  WG   DRR
Subjt:  IQQADELRIRSLNELTEILRPLQAVLFLAFSKKLHLSVREWGQRSDRR

AT4G18680.1 unknown protein1.4e-2430.84Show/hide
Query:  LQNSEETERQLTMLVDKSIEQFQDYTDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSTRETSLLWIAGCRPSLFVRLAYSLTGYELETRVAEFLQGTKPMEEL-----AG
        L      + +L  LV K +  +  Y  +R +L+    + +FAP W +  E S+LW+ GCRPS F+RL Y+L G + ET+++++L       ++       
Subjt:  LQNSEETERQLTMLVDKSIEQFQDYTDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSTRETSLLWIAGCRPSLFVRLAYSLTGYELETRVAEFLQGTKPMEEL-----AG

Query:  ELSPRQMEQLDSLQMRTIKEEERLTSKLARMQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGANEELEKALEKQDGEMLKLIQQADELRIRSLNELTEILRPLQAVLFLA
        +L+  Q+ +L+ L +  IK+E+++T   A  Q+++AD  +  +         A+  +E AL+K +  M  L+ +AD+LR  +L ++ +++ PLQAV FL 
Subjt:  ELSPRQMEQLDSLQMRTIKEEERLTSKLARMQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGANEELEKALEKQDGEMLKLIQQADELRIRSLNELTEILRPLQAVLFLA

Query:  FSKKLHLSVREWGQ
          K+L LS+ + G+
Subjt:  FSKKLHLSVREWGQ

AT4G18690.1 unknown protein8.6e-3532.71Show/hide
Query:  CFLEWIKLQEESQRELFEALNAVENRANSNLQNSEETERQLTMLVDKSIEQFQDYTDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSTRETSLLWIAGCRPSLFVRLAYS
        C+ EW+ +Q +   +L EAL          + +  + + +L  LV K +  FQ YT++R +L++   S++FAP W S  E  LLW+ GCRPS F+R+ YS
Subjt:  CFLEWIKLQEESQRELFEALNAVENRANSNLQNSEETERQLTMLVDKSIEQFQDYTDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSTRETSLLWIAGCRPSLFVRLAYS

Query:  LTGYELETRVAEFLQGTKPMEEL-----AGELSPRQMEQLDSLQMRTIKEEERLTSKLARMQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGANEELEKALEKQDGEMLK
        L G + ET+++++L       E+       +L+  Q+ +++ L ++ I++E+++T K A +QE +AD   + IA  +      +  +E AL+K +  M  
Subjt:  LTGYELETRVAEFLQGTKPMEEL-----AGELSPRQMEQLDSLQMRTIKEEERLTSKLARMQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGANEELEKALEKQDGEMLK

Query:  LIQQADELRIRSLNELTEILRPLQAVLFLAFSKKLHLSVREWGQ-RSDRRHGRVGVRKLERNGTAG
        L+ +AD+LR  +L ++ +++ P+QA  FL   K+LH+S+ EWG+ R ++R G V        G AG
Subjt:  LIQQADELRIRSLNELTEILRPLQAVLFLAFSKKLHLSVREWGQ-RSDRRHGRVGVRKLERNGTAG

AT5G45830.1 delay of germination 19.2e-3735.36Show/hide
Query:  GGSSSDHAASERCFLEWIKLQEESQRELFEALNAVENRANSNLQNSEETERQLTMLVDKSIEQFQDYTDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSTRETSLLWIAG
        G SS +   ++  +LEW+ LQ +   EL + L      A       E+ + +L  L  K I  F++Y  +R  LA    S ++AP W S  E +L+W+ G
Subjt:  GGSSSDHAASERCFLEWIKLQEESQRELFEALNAVENRANSNLQNSEETERQLTMLVDKSIEQFQDYTDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSTRETSLLWIAG

Query:  CRPSLFVRLAYSLTGYELETRVAEFLQGTKPMEELAG-------ELSPRQMEQLDSLQMRTIKEEERLTSKLARMQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGANEE
        CRPS F RL Y+L G + E RV +FL+     E   G       +LS  Q+ +++ L ++ I EEE++T K++ +QE+ AD  +  +A         N  
Subjt:  CRPSLFVRLAYSLTGYELETRVAEFLQGTKPMEELAG-------ELSPRQMEQLDSLQMRTIKEEERLTSKLARMQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGANEE

Query:  LEKALEKQDGEMLKLIQQADELRIRSLNELTEILRPLQAVLFLAFSKKLHLSVREWGQRSDRR
        +++AL+KQ+  M +L+ +AD LR+ +L ++  IL P+Q   FL   KKLHLS+ EWG   DRR
Subjt:  LEKALEKQDGEMLKLIQQADELRIRSLNELTEILRPLQAVLFLAFSKKLHLSVREWGQRSDRR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGAAGGCGGGAGCAGCAGCGACCATGCTGCATCGGAGCGATGTTTCCTGGAGTGGATAAAGCTTCAAGAGGAAAGTCAGAGGGAGCTTTTTGAAGCCCTTAACGC
TGTCGAAAACAGAGCAAATTCCAACCTCCAAAACTCCGAAGAAACCGAACGCCAACTCACCATGCTTGTAGACAAGAGCATCGAGCAATTCCAAGACTACACTGACCGAC
GAATGCAGCTGGCCAAAAACGACGTGTCGGCATTCTTCGCCCCTGTCTGGTGCAGCACCAGAGAAACCTCTCTCCTCTGGATCGCCGGTTGCCGGCCCTCCCTTTTCGTC
CGCTTAGCCTACTCCCTCACCGGATACGAGCTGGAAACCAGAGTTGCGGAATTCCTGCAGGGGACGAAGCCGATGGAGGAATTAGCGGGAGAGCTGTCGCCGCGGCAAAT
GGAGCAGCTGGACAGTCTGCAGATGAGAACAATAAAGGAAGAGGAGAGACTGACGTCGAAGCTGGCCAGGATGCAGGAGGAGATGGCGGACCAGACGGTGGTGGGGATTG
CGATAAGATCAATGAAAGAAGAAGGGGCGAATGAGGAACTGGAGAAGGCCCTGGAAAAGCAGGATGGGGAAATGCTGAAACTCATCCAACAAGCCGACGAACTGAGGATC
CGTTCGCTGAATGAGCTGACGGAGATTTTGAGACCGTTGCAGGCGGTGTTGTTCTTAGCGTTCAGCAAGAAGCTCCATCTCAGCGTGCGGGAATGGGGACAACGAAGCGA
TCGAAGGCACGGCAGAGTTGGAGTAAGGAAGCTGGAGAGAAACGGAACTGCGGGCCTCTATTACATAAATGTCAGATTTCCCCTTTTAGGAATCCAAATTTCCAAATTTA
GTCGATCAAAGAGTAAAAGCGTAAAAAGAATAAAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGGAAGGCGGGAGCAGCAGCGACCATGCTGCATCGGAGCGATGTTTCCTGGAGTGGATAAAGCTTCAAGAGGAAAGTCAGAGGGAGCTTTTTGAAGCCCTTAACGC
TGTCGAAAACAGAGCAAATTCCAACCTCCAAAACTCCGAAGAAACCGAACGCCAACTCACCATGCTTGTAGACAAGAGCATCGAGCAATTCCAAGACTACACTGACCGAC
GAATGCAGCTGGCCAAAAACGACGTGTCGGCATTCTTCGCCCCTGTCTGGTGCAGCACCAGAGAAACCTCTCTCCTCTGGATCGCCGGTTGCCGGCCCTCCCTTTTCGTC
CGCTTAGCCTACTCCCTCACCGGATACGAGCTGGAAACCAGAGTTGCGGAATTCCTGCAGGGGACGAAGCCGATGGAGGAATTAGCGGGAGAGCTGTCGCCGCGGCAAAT
GGAGCAGCTGGACAGTCTGCAGATGAGAACAATAAAGGAAGAGGAGAGACTGACGTCGAAGCTGGCCAGGATGCAGGAGGAGATGGCGGACCAGACGGTGGTGGGGATTG
CGATAAGATCAATGAAAGAAGAAGGGGCGAATGAGGAACTGGAGAAGGCCCTGGAAAAGCAGGATGGGGAAATGCTGAAACTCATCCAACAAGCCGACGAACTGAGGATC
CGTTCGCTGAATGAGCTGACGGAGATTTTGAGACCGTTGCAGGCGGTGTTGTTCTTAGCGTTCAGCAAGAAGCTCCATCTCAGCGTGCGGGAATGGGGACAACGAAGCGA
TCGAAGGCACGGCAGAGTTGGAGTAAGGAAGCTGGAGAGAAACGGAACTGCGGGCCTCTATTACATAAATGTCAGATTTCCCCTTTTAGGAATCCAAATTTCCAAATTTA
GTCGATCAAAGAGTAAAAGCGTAAAAAGAATAAAGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAEGGSSSDHAASERCFLEWIKLQEESQRELFEALNAVENRANSNLQNSEETERQLTMLVDKSIEQFQDYTDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSTRETSLLWIAGCRPSLFV
RLAYSLTGYELETRVAEFLQGTKPMEELAGELSPRQMEQLDSLQMRTIKEEERLTSKLARMQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGANEELEKALEKQDGEMLKLIQQADELRI
RSLNELTEILRPLQAVLFLAFSKKLHLSVREWGQRSDRRHGRVGVRKLERNGTAGLYYINVRFPLLGIQISKFSRSKSKSVKRIK