; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CcUC05G100360 (gene) of Watermelon (PI 537277) v1 genome

Gene IDCcUC05G100360
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
Descriptionprotein trichome birefringence-like 36
Genome locationCicolChr05:28665918..28669900
RNA-Seq ExpressionCcUC05G100360
SyntenyCcUC05G100360
Gene Ontology termsGO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0016413 - O-acetyltransferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR029962 - Trichome birefringence-like family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6601220.1 Protein trichome birefringence-like 36, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.0e-1388.64Show/hide
Query:  IDLETSIEFPWAPLLVELNKGAENKRVLHLDRIEENAKYWTTVD
        +D ETSIEF WAPLLVELNKGAENKRVLHLD+IEENAKYWT VD
Subjt:  IDLETSIEFPWAPLLVELNKGAENKRVLHLDRIEENAKYWTTVD
KAG7032015.1 Protein trichome birefringence-like 36, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.0e-1388.64Show/hide
Query:  IDLETSIEFPWAPLLVELNKGAENKRVLHLDRIEENAKYWTTVD
        +D ETSIEF WAPLLVELNKGAENKRVLHLD+IEENAKYWT VD
Subjt:  IDLETSIEFPWAPLLVELNKGAENKRVLHLDRIEENAKYWTTVD
XP_022956978.1 protein trichome birefringence-like 36 [Cucurbita moschata]1.8e-1390.91Show/hide
Query:  IDLETSIEFPWAPLLVELNKGAENKRVLHLDRIEENAKYWTTVD
        +D ETSIEF WAPLLVELNKGAENKRVLHLDRIEENAKYWT VD
Subjt:  IDLETSIEFPWAPLLVELNKGAENKRVLHLDRIEENAKYWTTVD
XP_022981662.1 protein trichome birefringence-like 36 [Cucurbita maxima]1.8e-1390.91Show/hide
Query:  IDLETSIEFPWAPLLVELNKGAENKRVLHLDRIEENAKYWTTVD
        +D ETSIEF WAPLLVELNKGAENKRVLHLDRIEENAKYWT VD
Subjt:  IDLETSIEFPWAPLLVELNKGAENKRVLHLDRIEENAKYWTTVD
XP_023539740.1 protein trichome birefringence-like 36 [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.2e-1388.64Show/hide
Query:  IDLETSIEFPWAPLLVELNKGAENKRVLHLDRIEENAKYWTTVD
        +D +TSIEF WAPLLVELNKGAENKRVLHLDRIEENAKYWT VD
Subjt:  IDLETSIEFPWAPLLVELNKGAENKRVLHLDRIEENAKYWTTVD
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KUS5 PMR5N domain-containing protein3.3e-1388.64Show/hide
Query:  IDLETSIEFPWAPLLVELNKGAENKRVLHLDRIEENAKYWTTVD
        +D ETSIEF WAPLLVELNKG ENKRVLHLDRIEENAKYWT VD
Subjt:  IDLETSIEFPWAPLLVELNKGAENKRVLHLDRIEENAKYWTTVD
A0A5A7SXR5 Protein trichome birefringence-like 367.4e-1386.36Show/hide
Query:  IDLETSIEFPWAPLLVELNKGAENKRVLHLDRIEENAKYWTTVD
        +D ETSIEF WAPLLVELNKG ENKRVLHLD+IEENAKYWT VD
Subjt:  IDLETSIEFPWAPLLVELNKGAENKRVLHLDRIEENAKYWTTVD
A0A5D3CB33 Protein trichome birefringence-like 367.4e-1386.36Show/hide
Query:  IDLETSIEFPWAPLLVELNKGAENKRVLHLDRIEENAKYWTTVD
        +D ETSIEF WAPLLVELNKG ENKRVLHLD+IEENAKYWT VD
Subjt:  IDLETSIEFPWAPLLVELNKGAENKRVLHLDRIEENAKYWTTVD
A0A6J1GYV3 protein trichome birefringence-like 368.7e-1490.91Show/hide
Query:  IDLETSIEFPWAPLLVELNKGAENKRVLHLDRIEENAKYWTTVD
        +D ETSIEF WAPLLVELNKGAENKRVLHLDRIEENAKYWT VD
Subjt:  IDLETSIEFPWAPLLVELNKGAENKRVLHLDRIEENAKYWTTVD
A0A6J1IUM0 protein trichome birefringence-like 368.7e-1490.91Show/hide
Query:  IDLETSIEFPWAPLLVELNKGAENKRVLHLDRIEENAKYWTTVD
        +D ETSIEF WAPLLVELNKGAENKRVLHLDRIEENAKYWT VD
Subjt:  IDLETSIEFPWAPLLVELNKGAENKRVLHLDRIEENAKYWTTVD
SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q940H3 Protein trichome birefringence-like 361.3e-1170.45Show/hide
Query:  IDLETSIEFPWAPLLVELNKGAENKRVLHLDRIEENAKYWTTVD
        +D ETSIEF WAPLLVEL +G + KRVLHLD IE+NA+YW  VD
Subjt:  IDLETSIEFPWAPLLVELNKGAENKRVLHLDRIEENAKYWTTVD
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G54260.1 TRICHOME BIREFRINGENCE-LIKE 369.5e-1370.45Show/hide
Query:  IDLETSIEFPWAPLLVELNKGAENKRVLHLDRIEENAKYWTTVD
        +D ETSIEF WAPLLVEL +G + KRVLHLD IE+NA+YW  VD
Subjt:  IDLETSIEFPWAPLLVELNKGAENKRVLHLDRIEENAKYWTTVD

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGAATAGATCTTGAGACTTCAATTGAGTTTCCATGGGCACCACTTCTGGTTGAGCTGAACAAAGGAGCTGAAAACAAGAGAGTATTGCATTTGGATAGGATT
GAAGAGAATGCCAAGTATTGGACAACAGTTGATACTTGTTCCGGGGCAGTTGCTCCTGCTTCAGGGAGTATTGAGAAGGATGAGATTTCCAGTATACCTCCAAGA
CATCACAGCAATGTCGGCACTTCGAAAAGATGGCCACCGCTCCATGTACCGGAACAATTTGAGTCAAGAAGGGAAGCAGCACCAGGAAGTTCAAATATTGCTGGA
ATAGCTCAATATGAAGTGATCAGAATCACTCTTCTGCCAGCAGGGGATATAAATAGTGTCATTGACATGGAGAAGACATCTCCGAGCTTCTTCGACTCGACAGTT
CATTATCGAAATGCCCCATTGACGATTAATTTGTATTATACTTATCTTCGCGAGCTCATCGGGACTCAACCCAAAAGCCTTCTCCAAGAGCTCTACTTTGATCCC
CATATCCAAAAACAACAGCTGGAATTTTCATCGGGCCAGGATTTTGGCTGTCAAAACTTCCTAAATTTTGGATCAAAGCCTCACTCCATGGATATGGAAATTAGT
TGTTCTACAGTCTTTGACACAAAGCTTACATCGGGAAGAAGAAGACCAGCACGATACTCATTAGGGTTGAACTCCGGCCTAAATTTCCCCACCAACTTTAACCAG
TATGTCATTCCACCCAATATGACAAAACTCAACCTGCTCCACCCAGGATGCCATTCCACAACCAATCGCTTTCACATATGCTTCTTTGAGAGACCAGTATCTGCT
TCACAACAGAAAGGAAGAGAAGTTTTTAACAAATTCAATGGTATCCCCATTTTGGGGAGTGGTGTAAGAGACAACGTCCAACCCCACAAGATACAGAGGTTCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGAATAGATCTTGAGACTTCAATTGAGTTTCCATGGGCACCACTTCTGGTTGAGCTGAACAAAGGAGCTGAAAACAAGAGAGTATTGCATTTGGATAGGATT
GAAGAGAATGCCAAGTATTGGACAACAGTTGATACTTGTTCCGGGGCAGTTGCTCCTGCTTCAGGGAGTATTGAGAAGGATGAGATTTCCAGTATACCTCCAAGA
CATCACAGCAATGTCGGCACTTCGAAAAGATGGCCACCGCTCCATGTACCGGAACAATTTGAGTCAAGAAGGGAAGCAGCACCAGGAAGTTCAAATATTGCTGGA
ATAGCTCAATATGAAGTGATCAGAATCACTCTTCTGCCAGCAGGGGATATAAATAGTGTCATTGACATGGAGAAGACATCTCCGAGCTTCTTCGACTCGACAGTT
CATTATCGAAATGCCCCATTGACGATTAATTTGTATTATACTTATCTTCGCGAGCTCATCGGGACTCAACCCAAAAGCCTTCTCCAAGAGCTCTACTTTGATCCC
CATATCCAAAAACAACAGCTGGAATTTTCATCGGGCCAGGATTTTGGCTGTCAAAACTTCCTAAATTTTGGATCAAAGCCTCACTCCATGGATATGGAAATTAGT
TGTTCTACAGTCTTTGACACAAAGCTTACATCGGGAAGAAGAAGACCAGCACGATACTCATTAGGGTTGAACTCCGGCCTAAATTTCCCCACCAACTTTAACCAG
TATGTCATTCCACCCAATATGACAAAACTCAACCTGCTCCACCCAGGATGCCATTCCACAACCAATCGCTTTCACATATGCTTCTTTGAGAGACCAGTATCTGCT
TCACAACAGAAAGGAAGAGAAGTTTTTAACAAATTCAATGGTATCCCCATTTTGGGGAGTGGTGTAAGAGACAACGTCCAACCCCACAAGATACAGAGGTTCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGIDLETSIEFPWAPLLVELNKGAENKRVLHLDRIEENAKYWTTVDTCSGAVAPASGSIEKDEISSIPPRHHSNVGTSKRWPPLHVPEQFESRREAAPGSSNIAG
IAQYEVIRITLLPAGDINSVIDMEKTSPSFFDSTVHYRNAPLTINLYYTYLRELIGTQPKSLLQELYFDPHIQKQQLEFSSGQDFGCQNFLNFGSKPHSMDMEIS
CSTVFDTKLTSGRRRPARYSLGLNSGLNFPTNFNQYVIPPNMTKLNLLHPGCHSTTNRFHICFFERPVSASQQKGREVFNKFNGIPILGSGVRDNVQPHKIQRF