; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CcUC08G148100 (gene) of Watermelon (PI 537277) v1 genome

Gene IDCcUC08G148100
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionPlant transposase
Genome locationCicolChr08:9838057..9848024
RNA-Seq ExpressionCcUC08G148100
SyntenyCcUC08G148100
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0036852.1 Plant transposase [Cucumis melo var. makuwa]2.9e-1338.27Show/hide
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KAA0040964.1 putative TNP1-like transposon protein [Cucumis melo var. makuwa]4.5e-1443.08Show/hide
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KAA0056210.1 integrase [Cucumis melo var. makuwa]2.2e-1342.31Show/hide
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KAA0058414.1 putative TNP1-like transposon protein [Cucumis melo var. makuwa]2.6e-1443.08Show/hide
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TYJ96570.1 Plant transposase [Cucumis melo var. makuwa]5.8e-1443.08Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7T097 Plant transposase1.4e-1338.27Show/hide
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A0A5A7TBX7 Putative TNP1-like transposon protein2.2e-1443.08Show/hide
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A0A5A7UM47 Integrase1.1e-1342.31Show/hide
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A0A5A7UTC4 Putative TNP1-like transposon protein1.3e-1443.08Show/hide
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A0A5D3B9M6 Plant transposase2.8e-1443.08Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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ATGCAGAGGTCTACTAATAGGATAACACTATGATTAAGATTAATAGGCTATGTATAATATTTACAAGTATGCCTAATATATCTCACTATGTTACTCAAAATAAGTATAAT
ATCTACATAGAGTTGGGGTTTCCAAGTTTCCAAGTACAAAATCCTGATTAGGCCCAGACGAGTCTTGATGGTAGGCTAAGCATCCCAAACATGCTTGCTACCTGGAAAAA
ACATCAAAGAAACGAGAATTTATGAGCTATAATGCTCAGTGAGTGACTATCTAAAATATAAACTTAATAAAGCATAACTACAATCACTAGTATAATTTGCTTAGTCACGC
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AGTAATCTTAACACATCAACGTTAAATGCCTTTTATTATGTATATATGATTGTCTGATTTCAGGCTGCTCGTATACCTTCTCATGTCCTTCGGTACTAGGGTCTCAGTGG
ATACTCAATCACCTTCTCTATGTCCTTTGGTGAGAGTTTCATAGAAATACTAGGGCTGCCCACATGCCTTCTCATGTCCTTCAGCATTGGGTCCCAATTCAATCTTTCTA
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AACTTCCTCAGCTCACTCTTCTTTAAATACCGAACGATGTCTAGATTTCTCGTCAACAATCAAGCTTCTGGTTCTGGCTTCAATTTCACCATGAAAATGATCCGAATTCT
ACTTAAATTCAATATAAATACCTTCTTCCACCTCTCCTCATTGTTCGTCTGTGAATGGAATCAATCTGAGTTCGAAAATATGTCTAAAGTGTTTAATTATTCAGTGTACT
CACTCATATATATATATATAGACCACCGACTCACCAGCACTGCCATTACCTTCCTACTTAGGTTGGCCAACGCAAACCTTTCGCGCATGGCTTCAGCAACGCACAGCCTC
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CAGATGTCATCCTAGATGGTCGTCCTATGTCTTTTGGAACTCCAATTACATTACCTGATGATGTACTTGAGAATGCACATCGATATGTCTTATTGAACACAGCAGAGGTG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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