; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CcUC08G162080 (gene) of Watermelon (PI 537277) v1 genome

Gene IDCcUC08G162080
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionOcticosapeptide/Phox/Bem1p family protein
Genome locationCicolChr08:29495172..29496642
RNA-Seq ExpressionCcUC08G162080
SyntenyCcUC08G162080
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000270 - PB1 domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6598239.1 hypothetical protein SDJN03_08017, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.8e-7482.54Show/hide
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XP_004142964.1 uncharacterized protein LOC101207008 [Cucumis sativus]3.7e-7783.6Show/hide
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XP_022961752.1 uncharacterized protein LOC111462427 [Cucurbita moschata]2.9e-7483.6Show/hide
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XP_022996772.1 uncharacterized protein LOC111491906 [Cucurbita maxima]5.5e-7382.54Show/hide
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XP_023545452.1 uncharacterized protein LOC111804876 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.6e-7483.25Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LKJ2 PB1 domain-containing protein1.8e-7783.6Show/hide
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A0A5J5AHC4 PB1 domain-containing protein4.6e-4975Show/hide
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A0A6J1BRT0 uncharacterized protein LOC1110051216.6e-5671.67Show/hide
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A0A6J1HAZ2 uncharacterized protein LOC1114624271.4e-7483.6Show/hide
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A0A6J1K2Y4 uncharacterized protein LOC1114919062.7e-7382.54Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G70640.1 octicosapeptide/Phox/Bem1p (PB1) domain-containing protein8.3e-3554.27Show/hide
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AT3G26510.1 Octicosapeptide/Phox/Bem1p family protein7.3e-3965.25Show/hide
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AT3G26510.4 Octicosapeptide/Phox/Bem1p family protein7.3e-3965.25Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GCGGCTTCCCCTTCCTCATCGTTGAAGATCAGAGCATTCCTTTCCCCTCCCAAATATGCCAAAAGAATCTCCTCTCCTTCTTCAATGGCCTCCTTCTCCTCCTCC
TCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTTGTCGATGTTGGTGGCTCACCGTTGCTTTCGTCGTCGGATGTCACCGCCAAATGCTTCCTACTTGGAGAGATCT
GCATCGGCGGTTCCTTTCAGTGGAATTAAAATTCGAAGTACTCAAAGAGAGGCTAATACCATGAGTTTTGGCATCCACAGATTCTCGCGGACGGACTCCAGATTA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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AASPSSSLKIRAFLSPPKYAKRISSPSSMASFSSSSSSSSSSSSSLSMLVAHRCFRRRMSPPNASYLERSASAVPFSGIKIRSTQREANTMSFGIHRFSRTDSRL
ELWRQMIFSRHCCGCRS