; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CcUC09G166320 (gene) of Watermelon (PI 537277) v1 genome

Gene IDCcUC09G166320
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionRING-type E3 ubiquitin transferase
Genome locationCicolChr09:3114895..3117685
RNA-Seq ExpressionCcUC09G166320
SyntenyCcUC09G166320
Gene Ontology termsGO:0016567 - protein ubiquitination (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0061630 - ubiquitin protein ligase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type
IPR039525 - E3 ubiquitin-protein ligase RNF126-like, zinc-ribbon


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0058670.1 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-15291.05Show/hide
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XP_022991911.1 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like [Cucurbita maxima]3.3e-15489.1Show/hide
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XP_023549060.1 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.1e-15489.13Show/hide
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XP_038899359.1 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like [Benincasa hispida]4.7e-16194.21Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KBK3 RING-type E3 ubiquitin transferase5.3e-15088.85Show/hide
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A0A1S3CE92 RING-type E3 ubiquitin transferase4.3e-15290.73Show/hide
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A0A5D3CET0 RING-type E3 ubiquitin transferase5.1e-15391.05Show/hide
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A0A6J1GMD4 RING-type E3 ubiquitin transferase2.4e-15589.13Show/hide
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        MSSAS    AAAERHTYWCHECDMSVTLVSP     SSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHP SSSSP DSDPSSFV+VDP+P T
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        NS+ DENGFV +DGPINEDAGT
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A0A6J1JS41 RING-type E3 ubiquitin transferase1.6e-15489.1Show/hide
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        MSSAS    AAAERHTYWCHECDMSVTLVSP    SSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHP SSSSP DSDPSSFV+VDP+P TS
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Query:  DDNYLLNSPQFLRLFQQLADSSDSDFVPSVPFNPFTPIKASIMAIPTIKVSSALLEEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSC
        DDNYLL+SPQFLRLFQQLADSSDSDF PSVPFNPFTPIKAS+MAIPTIKVSSA+LEEDP+LICAICKD+FLL+VEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSC
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Query:  PLCRFKLPSDDPSDHVRCRGATTALLRARDLMYQEDSYGLRTTLEHMARRHISIFSEGIQVGLSQSPTQFGVAEMGSGEQTDSVETVSSVATDDGIVIVN
        PLCR+KLPSD+PSDHVRCRGAT ALLRARDLM QEDSYGLRTTLEHMARRH SIFSEG+QV  SQSPTQ GVA MG+GEQTDSVETVSSVATDDGIVIVN
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        S+ DENGFV +DGPINEDAGT
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22197 Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHC1A8.7e-1743.56Show/hide
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        P    LF+QL+  +     P  P       +++I A+PTIK++   L       C +CKD+F L  EAKQ+PC+H+YH DCI+PWL  H+SCP+CR +LP
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Query:  S
        S
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P0CH30 E3 ubiquitin-protein ligase RING17.4e-1632.71Show/hide
Query:  LVSPSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPNSSSSPSDSDPSSFV----------------VVDPIPITSDDNYLLNS-------
        L+ PSSSS+++SSS+S+                 P + S      +    P   DP +F+                V+   P  SD  + L +       
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Query:  -PQFLRLFQQLADSSDSDFVPSVPFNPFTPIKASIMAIPTIKVSSALLEEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKL
         P   +L QQLA+ +D +   + P +     K++I A+P + ++ + L  +    CA+C D F    EAKQ+PC HLYH DC+LPWL  H+SCP+CR +L
Subjt:  -PQFLRLFQQLADSSDSDFVPSVPFNPFTPIKASIMAIPTIKVSSALLEEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKL

Query:  PSDDPSDHVRCRGA
        P+DDP    R RGA
Subjt:  PSDDPSDHVRCRGA

Q8LPN7 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like3.0e-1729.71Show/hide
Query:  SSASAAAERHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPNSSSS----------------------PSDSDP
        S+A+A      ++C++C+ +VT+        S SSS+   CP C   FLE  ++  P  + S++ +PNSS S                      PS  D 
Subjt:  SSASAAAERHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPNSSSS----------------------PSDSDP

Query:  SSFV--VVDPIPITSDDN----------YLLNSPQFLRL----FQQLADSSDSD-------------FVPSV-----------PFNPFTP--IKASIMAI
         S     + P   ++  N          +L N  Q LR     F+ + ++  SD             F P +           P    TP   K++I A+
Subjt:  SSFV--VVDPIPITSDDN----------YLLNSPQFLRL----FQQLADSSDSD-------------FVPSV-----------PFNPFTP--IKASIMAI

Query:  PTIKVSSALLEEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSDDPSDHVRCRGA
        PT+KV+  +L+ + +  CA+C D+F    + KQ+PC H++H DC+LPWL  H+SCP+CRF+LP+DDP    R +G+
Subjt:  PTIKVSSALLEEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSDDPSDHVRCRGA

Q94AK4 E3 ubiquitin-protein ligase RZF13.0e-1744.55Show/hide
Query:  PQFLRLFQQLADSSDSDFVPSVPFNPFTPIKASIMAIPTIKVSSALLEEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLP
        P    L +QL+  +     P  P       K+SI A+PTIK++   L+      C +CKD+F L+ EAKQ+PC H+YH DCI+PWL  H+SCP+CR +LP
Subjt:  PQFLRLFQQLADSSDSDFVPSVPFNPFTPIKASIMAIPTIKVSSALLEEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLP

Query:  S
        S
Subjt:  S

Q9SPL2 E3 ubiquitin-protein ligase CIP81.3e-1549.32Show/hide
Query:  KASIMAIPTIKVSSALLEEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSDD
        K++I A+ T +VSS+  E + V++CA+CKD  ++    K+LPC H YH DCI+PWL   +SCP+CRF+L +DD
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G44330.1 RING/U-box superfamily protein4.3e-1945.19Show/hide
Query:  SDFVPSVPF----NPFTPIKAS-----IMAIPTIKVSSALL----EEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSD
        S F  S PF    NPF   + S     + ++PTIK+SS++L     +D  L CAIC++ F++   A++LPC+HLYH DCI+PWL++H+SCPLCR +LP  
Subjt:  SDFVPSVPF----NPFTPIKAS-----IMAIPTIKVSSALL----EEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSD

Query:  DPSD
           D
Subjt:  DPSD

AT3G19950.1 RING/U-box superfamily protein2.1e-1829.71Show/hide
Query:  SSASAAAERHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPNSSSS----------------------PSDSDP
        S+A+A      ++C++C+ +VT+        S SSS+   CP C   FLE  ++  P  + S++ +PNSS S                      PS  D 
Subjt:  SSASAAAERHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPNSSSS----------------------PSDSDP

Query:  SSFV--VVDPIPITSDDN----------YLLNSPQFLRL----FQQLADSSDSD-------------FVPSV-----------PFNPFTP--IKASIMAI
         S     + P   ++  N          +L N  Q LR     F+ + ++  SD             F P +           P    TP   K++I A+
Subjt:  SSFV--VVDPIPITSDDN----------YLLNSPQFLRL----FQQLADSSDSD-------------FVPSV-----------PFNPFTP--IKASIMAI

Query:  PTIKVSSALLEEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSDDPSDHVRCRGA
        PT+KV+  +L+ + +  CA+C D+F    + KQ+PC H++H DC+LPWL  H+SCP+CRF+LP+DDP    R +G+
Subjt:  PTIKVSSALLEEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSDDPSDHVRCRGA

AT3G56580.1 RING/U-box superfamily protein2.1e-1844.55Show/hide
Query:  PQFLRLFQQLADSSDSDFVPSVPFNPFTPIKASIMAIPTIKVSSALLEEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLP
        P    L +QL+  +     P  P       K+SI A+PTIK++   L+      C +CKD+F L+ EAKQ+PC H+YH DCI+PWL  H+SCP+CR +LP
Subjt:  PQFLRLFQQLADSSDSDFVPSVPFNPFTPIKASIMAIPTIKVSSALLEEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLP

Query:  S
        S
Subjt:  S

AT3G56580.2 RING/U-box superfamily protein2.1e-1844.55Show/hide
Query:  PQFLRLFQQLADSSDSDFVPSVPFNPFTPIKASIMAIPTIKVSSALLEEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLP
        P    L +QL+  +     P  P       K+SI A+PTIK++   L+      C +CKD+F L+ EAKQ+PC H+YH DCI+PWL  H+SCP+CR +LP
Subjt:  PQFLRLFQQLADSSDSDFVPSVPFNPFTPIKASIMAIPTIKVSSALLEEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLP

Query:  S
        S
Subjt:  S

AT3G60080.1 RING/U-box superfamily protein5.9e-4542.52Show/hide
Query:  ERHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISD------HPNSSSSPSDSDPSSFVVVDPIPITSDDNYLLNSPQ
        ER TYWCHECDMS++L+   SSS S S SS LLCP C  DFLE MD    +SSS++ D            +  + D   +  VDP  + SDDN+LL+SP 
Subjt:  ERHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISD------HPNSSSSPSDSDPSSFVVVDPIPITSDDNYLLNSPQ

Query:  FLRLFQQLADSSDSDFVPSVPFNPFTPIKAS-IMAIPTIKVSSALL------EEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLC
          RL + LA  +      S   +  + +K+S I +IPTI++SS+LL      + D VL+CA+CK+ F++   A++LPCSH+YH DCI+PWLS+H+SCPLC
Subjt:  FLRLFQQLADSSDSDFVPSVPFNPFTPIKAS-IMAIPTIKVSSALL------EEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLC

Query:  RFKLPS------DDPSDHVRCRGATTALLRARDLMYQEDSYGLRTTLEHMARRH
        RF+LP+            +R R +  A + A     ++D  G+R  L  +ARRH
Subjt:  RFKLPS------DDPSDHVRCRGATTALLRARDLMYQEDSYGLRTTLEHMARRH


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCCTCCGCCTCTGCCGCCGCCGAACGCCACACCTACTGGTGCCACGAGTGCGATATGAGCGTCACTTTGGTATCCCCTTCTTCTTCTTCTTCGTCTTCGTCTTCTTC
TTCCTCTCTTCTTTGCCCTCACTGCCTCACTGACTTCCTCGAACACATGGATTTCACCATCCCCACTTCCTCTTCTTCAATTTCCGACCACCCCAATTCCTCTTCTTCCC
CTTCAGATTCCGATCCATCGTCCTTCGTCGTCGTCGACCCTATTCCGATCACTTCCGATGACAATTACCTCCTTAACAGCCCTCAATTTCTCCGTCTTTTCCAGCAGCTT
GCAGATTCGTCCGATTCTGATTTTGTCCCCTCTGTGCCCTTCAACCCATTTACTCCGATCAAGGCCTCTATCATGGCGATTCCCACTATTAAAGTCTCCTCCGCCTTGCT
CGAGGAAGACCCAGTTCTAATTTGTGCTATTTGTAAGGATCAGTTCCTTCTTGAGGTTGAAGCCAAACAGCTCCCCTGTTCTCATCTTTATCATCCAGATTGCATTCTTC
CTTGGCTTTCTAATCATGATTCTTGCCCGCTTTGCCGCTTTAAGCTTCCTTCTGATGACCCTTCGGATCATGTGAGATGTAGAGGGGCGACTACGGCTTTGTTGAGGGCT
AGGGATCTGATGTATCAAGAAGATAGTTATGGGTTGAGGACTACTTTGGAACATATGGCTAGAAGGCATATTTCTATTTTTAGTGAGGGAATTCAAGTGGGTTTGTCTCA
ATCGCCTACTCAATTTGGGGTTGCTGAGATGGGGAGTGGGGAACAGACTGATAGTGTTGAGACTGTTTCTAGTGTGGCTACTGATGATGGGATTGTAATTGTCAATAGCA
ATAGTGATGAAAATGGATTTGTGGGAATAGATGGACCTATAAATGAAGATGCCGGCACTACTCCATTTTTCCCCCAATCAAGTAATATAGTAGAATATATGCTTGTTAGA
GGAATCTTAGAAAGCTACCCCAAGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGGCGAGATCGATTGTTTCGCCAAAGTTCATCGCTACCGTCACCTCAGGTGTGGTAATAACCATGTCCTCCGCCTCTGCCGCCGCCGAACGCCACACCTACTGGTGCCAC
GAGTGCGATATGAGCGTCACTTTGGTATCCCCTTCTTCTTCTTCTTCGTCTTCGTCTTCTTCTTCCTCTCTTCTTTGCCCTCACTGCCTCACTGACTTCCTCGAACACAT
GGATTTCACCATCCCCACTTCCTCTTCTTCAATTTCCGACCACCCCAATTCCTCTTCTTCCCCTTCAGATTCCGATCCATCGTCCTTCGTCGTCGTCGACCCTATTCCGA
TCACTTCCGATGACAATTACCTCCTTAACAGCCCTCAATTTCTCCGTCTTTTCCAGCAGCTTGCAGATTCGTCCGATTCTGATTTTGTCCCCTCTGTGCCCTTCAACCCA
TTTACTCCGATCAAGGCCTCTATCATGGCGATTCCCACTATTAAAGTCTCCTCCGCCTTGCTCGAGGAAGACCCAGTTCTAATTTGTGCTATTTGTAAGGATCAGTTCCT
TCTTGAGGTTGAAGCCAAACAGCTCCCCTGTTCTCATCTTTATCATCCAGATTGCATTCTTCCTTGGCTTTCTAATCATGATTCTTGCCCGCTTTGCCGCTTTAAGCTTC
CTTCTGATGACCCTTCGGATCATGTGAGATGTAGAGGGGCGACTACGGCTTTGTTGAGGGCTAGGGATCTGATGTATCAAGAAGATAGTTATGGGTTGAGGACTACTTTG
GAACATATGGCTAGAAGGCATATTTCTATTTTTAGTGAGGGAATTCAAGTGGGTTTGTCTCAATCGCCTACTCAATTTGGGGTTGCTGAGATGGGGAGTGGGGAACAGAC
TGATAGTGTTGAGACTGTTTCTAGTGTGGCTACTGATGATGGGATTGTAATTGTCAATAGCAATAGTGATGAAAATGGATTTGTGGGAATAGATGGACCTATAAATGAAG
ATGCCGGCACTACTCCATTTTTCCCCCAATCAAGTAATATAGTAGAATATATGCTTGTTAGAGGAATCTTAGAAAGCTACCCCAAGTAGATGATTGATTGGAAGTGTAAA
TTGCTACAGAGAAAGACTGTGCTACCTCCTCCTCCTTCTTCTTCCTTATTTTCTTCTCCTTTTCCATCTTTGGTAACCATGTCTCTACATAATAAGAGATGAACCTTATT
TACATTGTTATCTTATCACCTACCAATGTCTCCTTTCCCTTCCTTCTTCCCCGATTATCTCTTTCTGTTGGGTTTGAGATGCTATTTTGGTTATTGTATTTCAAGTAATT
TATCTACTTTCAACAAATTCTAAGCTTGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSASAAAERHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPNSSSSPSDSDPSSFVVVDPIPITSDDNYLLNSPQFLRLFQQL
ADSSDSDFVPSVPFNPFTPIKASIMAIPTIKVSSALLEEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSDDPSDHVRCRGATTALLRA
RDLMYQEDSYGLRTTLEHMARRHISIFSEGIQVGLSQSPTQFGVAEMGSGEQTDSVETVSSVATDDGIVIVNSNSDENGFVGIDGPINEDAGTTPFFPQSSNIVEYMLVR
GILESYPK