; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CcUC09G174860 (gene) of Watermelon (PI 537277) v1 genome

Gene IDCcUC09G174860
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
Descriptionprotein SAMBA-like isoform X1
Genome locationCicolChr09:11714189..11716534
RNA-Seq ExpressionCcUC09G174860
SyntenyCcUC09G174860
Gene Ontology termsGO:0046621 - negative regulation of organ growth (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0010997 - anaphase-promoting complex binding (molecular function)
InterPro domainsIPR037547 - Protein SAMBA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0038559.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold92G00870 [Cucumis melo var. makuwa]9.1e-5379.45Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISTAAVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGQLFNYLTSAFCIL
        MNT SPANSS ST AVAGRC+TNAA+SLDDFRFP+NLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGQLF YLTS F IL
Subjt:  MNTSSPANSSISTAAVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGQLFNYLTSAFCIL

Query:  ILFYASQHVLIAMQFPIRWSFPQKDRREKKIMDQIDINDLHPGEIL
        IL                W FPQKD REKK+MDQID NDLH GEIL
Subjt:  ILFYASQHVLIAMQFPIRWSFPQKDRREKKIMDQIDINDLHPGEIL
XP_004136198.1 protein SAMBA isoform X2 [Cucumis sativus]2.0e-3691.11Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISTAAVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGQLF
        MNT SPANSS+ST AVAGRC+TNAA+SLDDFRFP+NLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQG  F
Subjt:  MNTSSPANSSISTAAVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGQLF
XP_022149249.1 protein SAMBA-like isoform X1 [Momordica charantia]9.8e-4776.09Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISTAAVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGQLFNYLTSAFCIL
        MN+SSPANSSIST AVAGRC+TNAAMS+DDFRFPANLIS+PERKDE M+ALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRS INLMSRQG             
Subjt:  MNTSSPANSSISTAAVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGQLFNYLTSAFCIL

Query:  ILFYASQHVLIAMQFPIRWSFPQKDRREKKIMDQIDIN
                VLIAMQFPIRWSFPQKDRRE+KIM +ID N
Subjt:  ILFYASQHVLIAMQFPIRWSFPQKDRREKKIMDQIDIN
XP_038888367.1 protein SAMBA isoform X1 [Benincasa hispida]5.4e-3796.55Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISTAAVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQG
        MNTSSPANSSIST AVAGRC+TNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMS+QG
Subjt:  MNTSSPANSSISTAAVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQG
XP_038888368.1 protein SAMBA isoform X2 [Benincasa hispida]4.1e-3794.44Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISTAAVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGQLF
        MNTSSPANSSIST AVAGRC+TNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMS+QG  F
Subjt:  MNTSSPANSSISTAAVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGQLF
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LK11 Uncharacterized protein9.9e-3791.11Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISTAAVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGQLF
        MNT SPANSS+ST AVAGRC+TNAA+SLDDFRFP+NLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQG  F
Subjt:  MNTSSPANSSISTAAVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGQLF
A0A1S3CQ76 uncharacterized protein LOC103503566 isoform X22.9e-3691.11Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISTAAVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGQLF
        MNT SPANSS ST AVAGRC+TNAA+SLDDFRFP+NLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQG  F
Subjt:  MNTSSPANSSISTAAVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGQLF
A0A5A7TB46 Uncharacterized protein4.4e-5379.45Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISTAAVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGQLFNYLTSAFCIL
        MNT SPANSS ST AVAGRC+TNAA+SLDDFRFP+NLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGQLF YLTS F IL
Subjt:  MNTSSPANSSISTAAVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGQLFNYLTSAFCIL

Query:  ILFYASQHVLIAMQFPIRWSFPQKDRREKKIMDQIDINDLHPGEIL
        IL                W FPQKD REKK+MDQID NDLH GEIL
Subjt:  ILFYASQHVLIAMQFPIRWSFPQKDRREKKIMDQIDINDLHPGEIL
A0A6J1BST3 protein SAMBA isoform X24.9e-3690Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISTAAVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGQLF
        MN+SSPANSSIST AVAGRC+TNAAMS+DDFRFPANLIS+PERKDEAM+ALKSNIMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRSRINLMSRQG  F
Subjt:  MNTSSPANSSISTAAVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGQLF
A0A6J1D582 protein SAMBA-like isoform X14.7e-4776.09Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISTAAVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGQLFNYLTSAFCIL
        MN+SSPANSSIST AVAGRC+TNAAMS+DDFRFPANLIS+PERKDE M+ALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRS INLMSRQG             
Subjt:  MNTSSPANSSISTAAVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGQLFNYLTSAFCIL

Query:  ILFYASQHVLIAMQFPIRWSFPQKDRREKKIMDQIDIN
                VLIAMQFPIRWSFPQKDRRE+KIM +ID N
Subjt:  ILFYASQHVLIAMQFPIRWSFPQKDRREKKIMDQIDIN
SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9C613 Protein SAMBA7.3e-2160.23Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISTAAVA-GRCTTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQG
        MN +SPA+S +ST AVA G  ++ AA  LDDF FP ++ S+ ERKDEAM  LK+++M  L+KEVKSL++D+WMFEGPRSRI+L+SR+G
Subjt:  MNTSSPANSSISTAAVA-GRCTTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQG
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G32310.1 unknown protein5.2e-2260.23Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISTAAVA-GRCTTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQG
        MN +SPA+S +ST AVA G  ++ AA  LDDF FP ++ S+ ERKDEAM  LK+++M  L+KEVKSL++D+WMFEGPRSRI+L+SR+G
Subjt:  MNTSSPANSSISTAAVA-GRCTTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQG

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAATACCTCGTCCCCAGCCAATTCTTCCATTTCCACCGCCGCGGTTGCCGGAAGGTGTACCACTAACGCCGCAATGTCACTAGATGATTTCCGCTTCCCCGCCAATTT
AATTTCCGTACCCGAGCGCAAGGACGAGGCCATGACTGCTCTTAAGTCCAATATAATGGCTGCTCTGAACAAGGAGGTCAAATCCCTGGATGATGATAACTGGATGTTTG
AAGGTCCTCGCTCCCGTATCAACCTTATGTCACGACAAGGTCAGCTATTCAACTATCTGACTTCTGCATTTTGCATTCTCATTCTTTTTTACGCATCCCAACACGTGCTA
ATTGCCATGCAATTCCCTATCAGGTGGTCCTTTCCTCAAAAAGACAGAAGAGAAAAGAAGATAATGGATCAGATTGATATTAATGATCTTCATCCTGGAGAAATCTTGTG
A
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGAAAATTGAAAACCCTTTATCTTCTCCATTGCTGAATTTTCCTCTCTCTTATTGTATTTGGTTTCTAAACTTCTGTTCTGATTCCTGTACACTTCTAGGGCTTATAGTT
ATTAGTTCATACGAAAATTGGGTAATCGCAATGAATACCTCGTCCCCAGCCAATTCTTCCATTTCCACCGCCGCGGTTGCCGGAAGGTGTACCACTAACGCCGCAATGTC
ACTAGATGATTTCCGCTTCCCCGCCAATTTAATTTCCGTACCCGAGCGCAAGGACGAGGCCATGACTGCTCTTAAGTCCAATATAATGGCTGCTCTGAACAAGGAGGTCA
AATCCCTGGATGATGATAACTGGATGTTTGAAGGTCCTCGCTCCCGTATCAACCTTATGTCACGACAAGGTCAGCTATTCAACTATCTGACTTCTGCATTTTGCATTCTC
ATTCTTTTTTACGCATCCCAACACGTGCTAATTGCCATGCAATTCCCTATCAGGTGGTCCTTTCCTCAAAAAGACAGAAGAGAAAAGAAGATAATGGATCAGATTGATAT
TAATGATCTTCATCCTGGAGAAATCTTGTGATTGTGCTCGCTTTCGACAATACTCGGTTTCATTTATTCAATCAAGTAATCAATTCTTCTTTTCAATTTATAATTATTCT
ATAGATGTAAAGGGTTTTCAAATGCTTGTCCGAATGAAACCTTGCTTATTACCAAAAATATTACTTCCGATATCTTTGGGTCGGTTTGGATTGATTCTTTAAGTGCTTAA
ACAATGTTATTAAGTGAAAAAAATATTTTTAAGCACTTAGAAAGTCAATCCAACTAGACCCTCAGCATTTGAAGATGGAAGGAAGGAACTAGCCAATTCAATCCATC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNTSSPANSSISTAAVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGQLFNYLTSAFCILILFYASQHVL
IAMQFPIRWSFPQKDRREKKIMDQIDINDLHPGEIL