CuGenDBv2

Gene ID	CcUC09G177790
Organism	Citrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
Description	Protein TIC 214
Genome location	CicolChr09:23609673..23610261
RNA-Seq Expression	CcUC09G177790
Synteny	CcUC09G177790
Gene Ontology terms	GO:0015031 - protein transport (biological process) GO:0009706 - chloroplast inner membrane (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR008896 - Protein TIC214

Homology

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QJD26342.1 Ycf1 [Trichosanthes kirilowii]

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YP_009430686.1 photosystem I assembly protein Ycf1 [Gynostemma cardiospermum]

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YP_009440204.1 hypothetical chloroplast RF19-like protein [Gynostemma longipes]

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YP_009738261.1 Ycf1 [Siraitia siamensis]

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YP_009753666.1 Ycf1 protein [Trichosanthes wallichiana]

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A0A1S4EU51 Protein TIC 214

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A0A1S4EU70 Protein TIC 214

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A0A249RZD8 Protein TIC 214

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A0A6M3RWE9 Protein TIC 214

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A0A6M3S424 Protein TIC 214

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A0A393 Protein TIC 214

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A6MM95 Protein TIC 214

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Q2MIC9 Protein TIC 214

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Q33BW4 Protein TIC 214

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Q3C1P6 Protein TIC 214

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Arabidopsis top hits

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AT2G07739.1 Ycf1 protein

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ATCG00170.1 DNA-directed RNA polymerase family protein

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ATCG01000.1 Ycf1 protein

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ATCG01130.1 Ycf1 protein

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ATMG00370.1 Ycf1 protein

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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

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ATGAAGATAATCAATTCGGTCGTTGTGGTCGGACTCTATTATGGATTTCTGACCACATTCTCCATAGGGCCCTCTTATCTCTTCCTTCTCCGAGCTCGGGTTATG
GAAGAAGGAACCGAGAAGAAAGTATCAGCAACAACAGGTTTTATTACGGGACAGCTCATGATGTTCATATCGATCTATTATGCGCCTCTGCATCTAGCATTGGGT
AGACCTCATACAATAACTGTCCTAGCTCTACCCCGAGTAGGCGGATTGGTCCGAGTGGAGAAAAAAAAAAAAAGGATTGAACTCAAAATATTTTCTGGAGATATA
CATTTTCCTCGAGAGATGGATAAGATATCCCGACACAATGGCATCTTGATACCACCTGAAAGAGTAAAAAAAAATTCTAAGAAATCAAAAAAATTGAAAAATTGG
ATTTATGTCCAGTGGATCACACATTTAAACAAACTG

mRNA sequence

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TTCTCCGAGCTCGGGTTATGGAAGAAGGAACCGAGAAGAAAGTATCAGCAACAACAGGTTTTATTACGGGACAGCTCATGATGTTCATATCGATCTATTATGCGC
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Protein sequence

Show/hide protein sequence

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CcUC09G177790 (gene) of Watermelon (PI 537277) v1 genome