; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CcUC09G182060 (gene) of Watermelon (PI 537277) v1 genome

Gene IDCcUC09G182060
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
Descriptionglutaredoxin
Genome locationCicolChr09:33573208..33574661
RNA-Seq ExpressionCcUC09G182060
SyntenyCcUC09G182060
Gene Ontology termsGO:0034599 - cellular response to oxidative stress (biological process)
GO:0098869 - cellular oxidant detoxification (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0004362 - glutathione-disulfide reductase activity (molecular function)
GO:0097573 - glutathione oxidoreductase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002109 - Glutaredoxin
IPR011767 - Glutaredoxin active site
IPR011899 - Glutaredoxin, eukaryotic/virial
IPR014025 - Glutaredoxin subgroup
IPR036249 - Thioredoxin-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6578661.1 Isocitrate dehydrogenase [NADP], chloroplastic/mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.5e-4488.79Show/hide
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KAG7016200.1 hypothetical protein SDJN02_21305 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.5e-4488.79Show/hide
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XP_022938379.1 glutaredoxin [Cucurbita moschata]2.2e-4387.85Show/hide
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XP_022993774.1 glutaredoxin isoform X1 [Cucurbita maxima]9.8e-4488.79Show/hide
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XP_038889541.1 glutaredoxin-like [Benincasa hispida]2.1e-4692.52Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3C8S5 glutaredoxin-C61.8e-4386.92Show/hide
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A0A5A7T277 Glutaredoxin-C61.8e-4386.92Show/hide
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A0A6J1BY96 glutaredoxin6.8e-4384.11Show/hide
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A0A6J1FDX0 glutaredoxin1.1e-4387.85Show/hide
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A0A6J1K114 glutaredoxin isoform X14.7e-4488.79Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P55142 Glutaredoxin-C63.5e-3671.84Show/hide
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P55143 Glutaredoxin1.4e-3772.55Show/hide
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Q6K953 Glutaredoxin-C4, chloroplastic7.8e-3671.7Show/hide
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Q9FNE2 Glutaredoxin-C25.4e-3771.96Show/hide
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Q9ZR41 Glutaredoxin1.5e-3975Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G20270.1 Thioredoxin superfamily protein1.6e-2054.64Show/hide
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        E  K  V  NPV V+SKT+C Y  QVK L   L      VELD   S+GS++Q  L + TGQ TVPNVFIGGKHIGGC  T+ L+ KG L  +LAEA
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AT4G28730.1 Glutaredoxin family protein6.2e-2050.52Show/hide
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AT5G40370.1 Glutaredoxin family protein3.8e-3871.96Show/hide
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AT5G40370.2 Glutaredoxin family protein7.0e-3272.53Show/hide
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AT5G63030.1 Thioredoxin superfamily protein3.1e-3262.62Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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SAA