; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CcUC10G192520 (gene) of Watermelon (PI 537277) v1 genome

Gene IDCcUC10G192520
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionRas-related protein Rab-1A
Genome locationCicolChr10:9621636..9624424
RNA-Seq ExpressionCcUC10G192520
SyntenyCcUC10G192520
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0012505 - endomembrane system (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L6Q4 Uncharacterized protein4.1e-9774.35Show/hide
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A0A1S3BTF1 ras-related protein RABD1 isoform X14.1e-9773.98Show/hide
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A0A6J1JCC5 ras-related protein RABD1-like1.0e-9572.86Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P16976 GTP-binding protein YPTM19.2e-7860.36Show/hide
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P40392 Ras-related protein RIC14.1e-7859.26Show/hide
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Q05737 GTP-binding protein YPTM29.2e-7859.63Show/hide
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Q9SEH3 Ras-related protein RABD2c7.1e-7858.74Show/hide
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Q9ZRE2 Ras-related protein RABD11.1e-8363.7Show/hide
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                                                             IVYD TEMESFNNVKQWL+EIDRYAN+SVCKLL+GNK D+VE+KVV 
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Query:  TQTAKAFADELGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSKSS--GNVQMKGQPIQQKSSCC
        T+T +A ADELGIPFLETSAKDSINVEQAFLT+A EIKKKMGSQ  ++K+S  G VQMKGQPIQQ +  C
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02130.1 RAS 51.4e-7657.78Show/hide
Query:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIRTCSFMALDWKIFF
        M+ EYDYLFKLLLIGDS VGKSCLLLRF+DDSYV+SYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII               
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Query:  ECILLLALSALKLISVCISCVVEKALEPISSSLVDFYVKALHRYYYILFELQQIVYDVTEMESFNNVKQWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVENKVVD
                                                             IVYDVT+ ESFNNVKQWL+EIDRYA+D+V KLLVGNK DL EN+ + 
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Query:  TQTAKAFADELGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSKS-SGNVQMKGQPIQQKSSCCS
         +TAKAFADE+GIPF+ETSAKD+ NVEQAF+ M+A IK++M SQP  + +    VQ++GQP+ QK+ CCS
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AT3G09900.1 RAB GTPase homolog E1E1.6e-5344Show/hide
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        ++YDYL KLLLIGDS VGKSCLLLRF+DD++  S+I+TIG+DFKIRTVELDGK IKLQIWDTAGQERFRTIT++YYRGA GI+                 
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Query:  ILLLALSALKLISVCISCVVEKALEPISSSLVDFYVKALHRYYYILFELQQIVYDVTEMESFNNVKQWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVENK-VVDT
                                                           +VYDVT+  SFNN++ W+  I+++A+DSV K+LVGNK D+ E+K  V T
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Query:  QTAKAFADELGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSKSSGNVQMK-------GQPIQQKSSCCS
           +A ADE GI F ETSAK + NVEQ FL++A +IK+++    T ++  G    K            +KS+CCS
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AT3G11730.1 Ras-related small GTP-binding family protein8.0e-8563.7Show/hide
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        MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADD+Y+DSYISTIGVDFKIRT+E DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII               
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Query:  ECILLLALSALKLISVCISCVVEKALEPISSSLVDFYVKALHRYYYILFELQQIVYDVTEMESFNNVKQWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVENKVVD
                                                             IVYD TEMESFNNVKQWL+EIDRYAN+SVCKLL+GNK D+VE+KVV 
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Query:  TQTAKAFADELGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSKSS--GNVQMKGQPIQQKSSCC
        T+T +A ADELGIPFLETSAKDSINVEQAFLT+A EIKKKMGSQ  ++K+S  G VQMKGQPIQQ +  C
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AT4G17530.1 RAB GTPase homolog 1C5.0e-7958.74Show/hide
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        M+ EYDYLFKLLLIGDS VGKSCLLLRFADDSY+DSYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII               
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Query:  ECILLLALSALKLISVCISCVVEKALEPISSSLVDFYVKALHRYYYILFELQQIVYDVTEMESFNNVKQWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVENKVVD
                                                             + YDVT++ESFNNVKQWLNEIDRYA+++V KLLVGNKCDL   KVV 
Subjt:  ECILLLALSALKLISVCISCVVEKALEPISSSLVDFYVKALHRYYYILFELQQIVYDVTEMESFNNVKQWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVENKVVD

Query:  TQTAKAFADELGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSKSSGNVQMKGQPIQQKSSCCS
        T+TAKAFADELGIPFLETSAK++ NVE+AF+ M A IK +M SQP        VQ++GQP+ Q+S CCS
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AT5G47200.1 RAB GTPase homolog 1A1.6e-7758.36Show/hide
Query:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIRTCSFMALDWKIFF
        M+ EYDYLFKLLLIGDS VGKSCLLLRFADDSY+DSYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII               
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Query:  ECILLLALSALKLISVCISCVVEKALEPISSSLVDFYVKALHRYYYILFELQQIVYDVTEMESFNNVKQWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVENKVVD
                                                             + YDVT++ESFNNVKQWLNEIDRYA+++V KLLVGNK DL   KVV 
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Query:  TQTAKAFADELGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSKSSGNVQMKGQPIQQKSSCCS
        T+TAKAFADELGIPFLETSAK++ NVE+AF+ M A IK +M SQP        VQ++GQP+ Q+S CCS
Subjt:  TQTAKAFADELGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSKSSGNVQMKGQPIQQKSSCCS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGCAACGAATATGATTATTTGTTCAAGCTCTTGCTAATCGGCGACTCTTCCGTTGGAAAATCATGCCTTCTTCTCAGATTTGCGGATGATTCCTATGTGGATAGCTA
TATAAGTACAATTGGAGTTGATTTTAAAATCAGAACGGTGGAACTGGATGGGAAGACCATTAAGCTCCAGATTTGGGACACTGCTGGTCAGGAGAGATTCAGGACTATAA
CGAGCAGCTATTACAGAGGTGCACATGGAATAATTATTAGAACATGTAGTTTCATGGCTCTTGATTGGAAGATTTTTTTTGAATGCATATTGTTATTAGCACTATCAGCC
CTAAAGCTAATATCAGTTTGTATTAGTTGTGTTGTGGAAAAAGCCCTTGAGCCAATATCTAGTTCATTAGTTGACTTTTACGTCAAAGCATTGCATCGTTATTACTATAT
TTTGTTTGAATTGCAACAGATTGTTTATGATGTCACTGAGATGGAGAGCTTTAACAACGTCAAGCAATGGTTGAATGAGATTGATAGATATGCTAATGATAGTGTATGCA
AGCTTTTAGTAGGAAATAAGTGCGATTTAGTTGAGAACAAGGTTGTCGACACACAGACAGCAAAGGCATTTGCAGATGAGCTCGGAATCCCTTTTCTAGAGACGAGTGCC
AAAGACTCTATCAACGTAGAACAAGCTTTCTTAACTATGGCTGCTGAAATAAAGAAAAAGATGGGGAGCCAGCCAACTTCGTCCAAGTCTTCAGGAAATGTGCAAATGAA
GGGACAGCCAATTCAGCAAAAGAGCAGCTGTTGCAGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGCAACGAATATGATTATTTGTTCAAGCTCTTGCTAATCGGCGACTCTTCCGTTGGAAAATCATGCCTTCTTCTCAGATTTGCGGATGATTCCTATGTGGATAGCTA
TATAAGTACAATTGGAGTTGATTTTAAAATCAGAACGGTGGAACTGGATGGGAAGACCATTAAGCTCCAGATTTGGGACACTGCTGGTCAGGAGAGATTCAGGACTATAA
CGAGCAGCTATTACAGAGGTGCACATGGAATAATTATTAGAACATGTAGTTTCATGGCTCTTGATTGGAAGATTTTTTTTGAATGCATATTGTTATTAGCACTATCAGCC
CTAAAGCTAATATCAGTTTGTATTAGTTGTGTTGTGGAAAAAGCCCTTGAGCCAATATCTAGTTCATTAGTTGACTTTTACGTCAAAGCATTGCATCGTTATTACTATAT
TTTGTTTGAATTGCAACAGATTGTTTATGATGTCACTGAGATGGAGAGCTTTAACAACGTCAAGCAATGGTTGAATGAGATTGATAGATATGCTAATGATAGTGTATGCA
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AAAGACTCTATCAACGTAGAACAAGCTTTCTTAACTATGGCTGCTGAAATAAAGAAAAAGATGGGGAGCCAGCCAACTTCGTCCAAGTCTTCAGGAAATGTGCAAATGAA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIRTCSFMALDWKIFFECILLLALSA
LKLISVCISCVVEKALEPISSSLVDFYVKALHRYYYILFELQQIVYDVTEMESFNNVKQWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVENKVVDTQTAKAFADELGIPFLETSA
KDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSKSSGNVQMKGQPIQQKSSCCS