CuGenDBv2

Gene ID	CcUC10G193500
Organism	Citrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
Description	Protein TIC 214
Genome location	CicolChr10:12606005..12690865
RNA-Seq Expression	CcUC10G193500
Synteny	CcUC10G193500
Gene Ontology terms	GO:0015031 - protein transport (biological process) GO:0009706 - chloroplast inner membrane (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR008896 - Protein TIC214

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

APW82691.1 Ycf1 [Citrullus lanatus subsp. vulgaris]

3.9e-29

Show/hide

Query:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRLTGR
        +GRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIR+ G+
Subjt:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRLTGR

QZL38729.1 Ycf1 protein [Citrullus ecirrhosus]

3.9e-29

Show/hide

Query:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRLTGR
        +GRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIR+ G+
Subjt:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRLTGR

QZL38742.1 Ycf1 protein [Citrullus ecirrhosus]

3.9e-29

Show/hide

Query:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRLTGR
        +GRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIR+ G+
Subjt:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRLTGR

YP_009326048.1 Ycf1 [Citrullus lanatus]

3.9e-29

Show/hide

Query:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRLTGR
        +GRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIR+ G+
Subjt:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRLTGR

YP_009431615.1 Ycf1 [Citrullus amarus]

3.9e-29

Show/hide

Query:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRLTGR
        +GRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIR+ G+
Subjt:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRLTGR

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1P8LE53 Ycf1

1.9e-29

Show/hide

Query:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRLTGR
        +GRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIR+ G+
Subjt:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRLTGR

A0A1P8LFC3 Ycf1

1.9e-29

Show/hide

Query:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRLTGR
        +GRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIR+ G+
Subjt:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRLTGR

A0A249RX64 Protein TIC 214

1.9e-29

Show/hide

Query:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRLTGR
        +GRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIR+ G+
Subjt:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRLTGR

A0A249RXF8 Protein TIC 214

1.9e-29

Show/hide

Query:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRLTGR
        +GRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIR+ G+
Subjt:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRLTGR

A0A343A8H0 Protein TIC 214

1.9e-29

Show/hide

Query:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRLTGR
        +GRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIR+ G+
Subjt:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRLTGR

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

A6MM95 Protein TIC 214

1.1e-26

Show/hide

Query:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRLTGR
        +GR+P+PIVTKKLKETS+TEERGESEEE DVEIETTSETKGTKQEQE  TEED SPSL SEEKEDPDKIDETEEIR+ G+
Subjt:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRLTGR

A6MMG9 Protein TIC 214

1.2e-25

Show/hide

Query:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRLTGR
        +GRIPSPIVTKKLKETSETEE GESEEETDVEIETTSET+GT++EQEG TEED  PSL SEEKEDPDKIDETEEIR+ G+
Subjt:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRLTGR

Q06GT8 Protein TIC 214

4.9e-27

87.5

Show/hide

Query:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRLTGR
        +GRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEG TEED  PS  SEEKEDPDK+DETEEIR+ G+
Subjt:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRLTGR

Q0ZIW0 Protein TIC 214

3.4e-28

87.5

Show/hide

Query:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRLTGR
        +GRIPSPI+TKK+KETSETEERGESEEETDVEIE TSETKGTKQEQE  TEED SPSLFSEEKEDPDKIDETEEIR+ G+
Subjt:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRLTGR

Q49KU0 Protein TIC 214

6.0e-25

87.01

Show/hide

Query:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRL
        +GRIPSPIVTKK KETSETEERGE EEETDVEIETT ETKGT+QEQEG TEED  PSLFSEEKEDPDKIDE EEIR+
Subjt:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRL

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

ATCG01000.1 Ycf1 protein

8.6e-11

Show/hide

Query:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRLTGR
        +GRIPSPI TKKLK                     TSET GTKQ+QE  TEE   PSLFSEE ED DKIDE EEIR+ G+
Subjt:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRLTGR

ATCG01130.1 Ycf1 protein

8.6e-11

Show/hide

Query:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRLTGR
        +GRIPSPI TKKLK                     TSET GTKQ+QE  TEE   PSLFSEE ED DKIDE EEIR+ G+
Subjt:  MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRLTGR

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGGCAGAATACCGTCACCCATTGTTACTAAGAAACTGAAAGAAACCTCAGAAACGGAGGAAAGGGGGGAAAGCGAGGAAGAAACAGATGTAGAAATAGAAACCACTTC
CGAAACGAAGGGGACTAAACAGGAACAAGAGGGATTCACCGAAGAAGATACTTCTCCTTCCCTTTTTTCGGAAGAAAAGGAGGATCCGGACAAAATCGATGAAACGGAAG
AGATCCGATTGACTGGAAGATAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRLTGR

CcUC10G193500 (gene) of Watermelon (PI 537277) v1 genome