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CcUC10G194530 (gene) of Watermelon (PI 537277) v1 genome

Gene IDCcUC10G194530
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionNAD(P)H-quinone oxidoreductase chain 4, chloroplastic
Genome locationCicolChr10:18165284..18165853
RNA-Seq ExpressionCcUC10G194530
SyntenyCcUC10G194530
Gene Ontology termsGO:0042773 - ATP synthesis coupled electron transport (biological process)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0008137 - NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity (molecular function)
GO:0048038 - quinone binding (molecular function)
InterPro domainsIPR003918 - NADH:ubiquinone oxidoreductase
IPR017896 - 4Fe-4S ferredoxin-type, iron-sulphur binding domain
IPR017900 - 4Fe-4S ferredoxin, iron-sulphur binding, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
APW82683.1 NADH dehydrogenase subunit 4 [Citrullus lanatus subsp. vulgaris]2.7e-5898.23Show/hide
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YP_004841835.1 NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit 4 [Cucumis melo subsp. melo]3.0e-5797.35Show/hide
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YP_009326040.1 NADH dehydrogenase subunit 4 [Citrullus lanatus]2.7e-5898.23Show/hide
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A0A1P8LDX3 NADH dehydrogenase subunit 41.3e-5898.23Show/hide
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A0A1P8LE40 NAD(P)H-quinone oxidoreductase chain 41.3e-5898.23Show/hide
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A0A1P8LEU5 NAD(P)H-quinone oxidoreductase chain 41.3e-5898.23Show/hide
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A0A2Z2CH55 NAD(P)H-quinone oxidoreductase chain 4, chloroplastic1.5e-5996.55Show/hide
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A0A343A8G2 NAD(P)H-quinone oxidoreductase chain 4, chloroplastic1.3e-5898.23Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2A7B8 NAD(P)H-quinone oxidoreductase chain 4, chloroplastic1.2e-5084.91Show/hide
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Q2VED0 NAD(P)H-quinone oxidoreductase chain 4, chloroplastic1.2e-5084.91Show/hide
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Q33BX2 NAD(P)H-quinone oxidoreductase chain 4, chloroplastic1.2e-5085.85Show/hide
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Q4VZL8 NAD(P)H-quinone oxidoreductase chain 4, chloroplastic5.2e-5798.11Show/hide
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Q8S8U7 NAD(P)H-quinone oxidoreductase chain 4, chloroplastic1.9e-5186.79Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
ATCG01050.1 NADH-Ubiquinone/plastoquinone (complex I) protein3.2e-4980.53Show/hide
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ATCG01060.1 iron-sulfur cluster binding;electron carriers;4 iron, 4 sulfur cluster binding1.5e-1995.24Show/hide
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ATMG00580.1 NADH dehydrogenase subunit 41.1e-0423.23Show/hide
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        L+ +++ P+   + L F P+   + +R   +C  ++  L +       F+      Q +E  +W+P+ + ++ LGIDG+S+  ++LT F+  +     W
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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