; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CcUC10G194820 (gene) of Watermelon (PI 537277) v1 genome

Gene IDCcUC10G194820
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionMADS-box protein SVP-like
Genome locationCicolChr10:19407769..19414051
RNA-Seq ExpressionCcUC10G194820
SyntenyCcUC10G194820
Gene Ontology termsGO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000978 - RNA polymerase II proximal promoter sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002100 - Transcription factor, MADS-box
IPR002487 - Transcription factor, K-box
IPR033896 - MADS MEF2-like
IPR036879 - Transcription factor, MADS-box superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7027510.1 MADS-box protein SVP [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.2e-8776.45Show/hide
Query:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPELSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEEF
        MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSM ELLRRHNM+PE+++F Q P   SQ+EK  +AKL+EEF
Subjt:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPELSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEEF

Query:  AAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNRDQQEEQAVVVIG
        AAKT+EL+HM+GE+LQ LGIEELK+LEKLLEIGLNRV+ETKD+KFLKEIG  KEKEALLM+ENQRL N              + TLN  +QE+    VIG
Subjt:  AAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNRDQQEEQAVVVIG

Query:  GNSLGSKSNTTNSSSSPNPNSQDYDDISLKLGLVVFLHIHYI
        G+SLGSKSNTTNSSSSPNPNS D+DDISLKLGLV+FLH+ YI
Subjt:  GNSLGSKSNTTNSSSSPNPNSQDYDDISLKLGLVVFLHIHYI

XP_008454463.1 PREDICTED: MADS-box protein JOINTLESS-like isoform X1 [Cucumis melo]4.5e-8982.28Show/hide
Query:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPELSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEEF
        MTRQKI+IKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSML+LLRRHNMLPEL+N SQ P   SQLEKS HAKLTEEF
Subjt:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPELSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEEF

Query:  AAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETL-NRD-QQEEQAVVV
        AAKT+ELRHMKGEELQ LGIEELK+LEKLLE GLNRV+ETKDEKFLKEIGTVKEKE LLM+ENQRL NK+            +ETL +RD Q+EE+AVVV
Subjt:  AAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETL-NRD-QQEEQAVVV

Query:  IGGNSLG--SKSNTTNSSSSPNPNSQDYDDISLKLGL
        IGGNS+G  SKSNT+NSSSS NPNSQDYDD+SLKLGL
Subjt:  IGGNSLG--SKSNTTNSSSSPNPNSQDYDDISLKLGL

XP_011653451.1 MADS-box protein JOINTLESS [Cucumis sativus]2.9e-8881.51Show/hide
Query:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPELSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEEF
        MTRQKI+IKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSML+LLRRHNMLPEL++ SQPP   SQLEKS HAKLTEEF
Subjt:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPELSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEEF

Query:  AAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETL-NRD--QQEEQAVV
        AAKT+ELRHMKGEELQ LGIEELK+LEKLLE GLNRV+ETKDEKFLKEI TVKEKE+LLM+ENQRL NK+            +ETL NRD  Q+EE+AVV
Subjt:  AAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETL-NRD--QQEEQAVV

Query:  VIGGNSLG--SKSNTTNSSSSPNPNSQDYDDISLKLGL
        +I GNS+G  SKSNT+NSSSS NPNSQDYDDISLKLGL
Subjt:  VIGGNSLG--SKSNTTNSSSSPNPNSQDYDDISLKLGL

XP_038905492.1 MADS-box protein SVP-like isoform X1 [Benincasa hispida]7.7e-9786.27Show/hide
Query:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPELSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEEF
        MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPEL+NFSQPP   SQLEKS + KLTEEF
Subjt:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPELSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEEF

Query:  AAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNRDQQEEQAVVVIG
        AAKT+ELRHMKGEELQGLGIEELK+LEKLLEIGLNRV+ETKDEKFLKEIG VKEKEALLMEENQRL NK             +ETLN DQQE+QAV V+G
Subjt:  AAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNRDQQEEQAVVVIG

Query:  GNSLGSKSNTTNSSSSPNPNSQDYDDISLKLGL
        GNSLGSKSNT+NSSSS NPNSQDYDDISLKLGL
Subjt:  GNSLGSKSNTTNSSSSPNPNSQDYDDISLKLGL

XP_038905494.1 MADS-box protein SVP-like isoform X2 [Benincasa hispida]2.9e-8880.69Show/hide
Query:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPELSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEEF
        MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPEL+NFSQPP   SQLEKS + KLTEEF
Subjt:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPELSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEEF

Query:  AAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNRDQQEEQAVVVIG
        AAKT+ELRHMKGEELQGLGIEELK+LEKLLEIGLNRV+ETKDEKFLKEIG VKEK                           +ETLN DQQE+QAV V+G
Subjt:  AAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNRDQQEEQAVVVIG

Query:  GNSLGSKSNTTNSSSSPNPNSQDYDDISLKLGL
        GNSLGSKSNT+NSSSS NPNSQDYDDISLKLGL
Subjt:  GNSLGSKSNTTNSSSSPNPNSQDYDDISLKLGL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BYS5 MADS-box protein JOINTLESS-like isoform X12.2e-8982.28Show/hide
Query:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPELSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEEF
        MTRQKI+IKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSML+LLRRHNMLPEL+N SQ P   SQLEKS HAKLTEEF
Subjt:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPELSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEEF

Query:  AAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETL-NRD-QQEEQAVVV
        AAKT+ELRHMKGEELQ LGIEELK+LEKLLE GLNRV+ETKDEKFLKEIGTVKEKE LLM+ENQRL NK+            +ETL +RD Q+EE+AVVV
Subjt:  AAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETL-NRD-QQEEQAVVV

Query:  IGGNSLG--SKSNTTNSSSSPNPNSQDYDDISLKLGL
        IGGNS+G  SKSNT+NSSSS NPNSQDYDD+SLKLGL
Subjt:  IGGNSLG--SKSNTTNSSSSPNPNSQDYDDISLKLGL

A0A6J1E3I4 MADS-box protein SVP-like isoform X11.0e-8379.83Show/hide
Query:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPELSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEEF
        MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSM ELL RHN LPE++NF QP  Q  Q+EKSV A L EEF
Subjt:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPELSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEEF

Query:  AAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNRDQQEEQAVVVIG
        AAKT+ELRHMKGEEL+ LGIEELK+LEKLLEIGLNRV+ETKDEKFLKEI  VKEKEALL +ENQRL N+VRA             LNRD+QE+QAV V G
Subjt:  AAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNRDQQEEQAVVVIG

Query:  GNSLGSKSNTTNSSSSPNPNSQDYDDISLKLGL
        G+SLGSKS T+NSSSSPNP+SQD DDISLKLGL
Subjt:  GNSLGSKSNTTNSSSSPNPNSQDYDDISLKLGL

A0A6J1EDZ0 MADS-box protein SVP-like1.8e-8376.82Show/hide
Query:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPELSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEEF
        MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSM ELLRRHNM+PE+++F Q P   SQ+EK  +AKL+EEF
Subjt:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPELSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEEF

Query:  AAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNRDQQEEQAVVVIG
        AAKT+EL+HM+GE+LQ LGIEELK+LEKLLEIGLNRV+ETKD+KFLKEIG  KEKEALLM+ENQRL N              + TLN  +QE+    VIG
Subjt:  AAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNRDQQEEQAVVVIG

Query:  GNSLGSKSNTTNSSSSPNPNSQDYDDISLKLGL
        G+SLGSKSNTTNSSSSPNPNS D+DDISLKLGL
Subjt:  GNSLGSKSNTTNSSSSPNPNSQDYDDISLKLGL

A0A6J1J9W9 MADS-box protein SVP-like isoform X25.6e-8581.12Show/hide
Query:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPELSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEEF
        MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSM ELL RHN LPE++NF QP     Q+EKSV A L EEF
Subjt:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPELSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEEF

Query:  AAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNRDQQEEQAVVVIG
        AAKT+ELRHMKGEELQ LGIEELKKLEKLLEIGLNRV+ETKDEKFLKEI  VKEKEALLM+ENQRL N+VRA             LNRDQQE+QAV V G
Subjt:  AAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNRDQQEEQAVVVIG

Query:  GNSLGSKSNTTNSSSSPNPNSQDYDDISLKLGL
        G+SLGSKS T+NSSSSPNP+SQD DDISLKLGL
Subjt:  GNSLGSKSNTTNSSSSPNPNSQDYDDISLKLGL

A0A6J1J9Z1 MADS-box protein SVP-like isoform X18.6e-8681.55Show/hide
Query:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPELSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEEF
        MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSM ELL RHN LPE++NF QP  Q  Q+EKSV A L EEF
Subjt:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPELSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEEF

Query:  AAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNRDQQEEQAVVVIG
        AAKT+ELRHMKGEELQ LGIEELKKLEKLLEIGLNRV+ETKDEKFLKEI  VKEKEALLM+ENQRL N+VRA             LNRDQQE+QAV V G
Subjt:  AAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNRDQQEEQAVVVIG

Query:  GNSLGSKSNTTNSSSSPNPNSQDYDDISLKLGL
        G+SLGSKS T+NSSSSPNP+SQD DDISLKLGL
Subjt:  GNSLGSKSNTTNSSSSPNPNSQDYDDISLKLGL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O82794 MADS-box protein AGL243.6e-4146.38Show/hide
Query:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNM-LPELSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEE
        M R+KI+IKKIDNI ARQVTFSKRRRG+FKKA EL+ LCDAD+ALI+FSA+GKLF++SSS M ++L R+++    ++    PPS   +LE    ++L++E
Subjt:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNM-LPELSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEE

Query:  FAAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNRDQQEEQAVVVI
           KT++LR ++GE+L GL +EEL++LEKLLE GL+RV E K E  + +I +++++ + L++EN+RL +K             +ETL      E+A +  
Subjt:  FAAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNRDQQEEQAVVVI

Query:  GGNSLGSKSNTTNSSSSPNPNS-QDYDDISLKLGL
           +L ++S TTN SS  +    +D  D SLKLGL
Subjt:  GGNSLGSKSNTTNSSSSPNPNS-QDYDDISLKLGL

Q5K4R0 MADS-box transcription factor 472.7e-3643.83Show/hide
Query:  RQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPELSNFSQPPSQGSQLE-KSVHAKLTEEFA
        R++I I++IDN+AARQVTFSKRRRGLFKKA EL+ LCDA++ L+VFSA+GKLF ++S+SM +++ R+N   +    ++P     Q E  S  A+L EE A
Subjt:  RQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPELSNFSQPPSQGSQLE-KSVHAKLTEEFA

Query:  AKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNRDQQEEQAVVVIGG
          +  LR M+GEEL  L +E+L++LEK LE GL  V++TK +K L EI  ++ K   L+EEN RL  +++      S +  +E +      E  +V   G
Subjt:  AKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNRDQQEEQAVVVIGG

Query:  NSLGSKSNTTNSSSSPNPNSQDYDDISLKLGLVVF
         S  S+S T  S   P P++    D SL+LGL +F
Subjt:  NSLGSKSNTTNSSSSPNPNSQDYDDISLKLGLVVF

Q9FUY6 MADS-box protein JOINTLESS9.9e-4746Show/hide
Query:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNM-LPELSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEE
        M R+KIQIKKIDN  ARQVTFSKRRRGLFKKA EL+ LCDAD+ALI+FS++GKLFDYSSSSM ++L R ++    L    QP  +   +E S +++L++E
Subjt:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNM-LPELSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEE

Query:  FAAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNRDQQEEQAVVVI
         + K+  LR M+GEELQGL IEEL++LE+ LE GL+RV+E K +K ++EI  +++K   LMEEN++L  +V      N+        N   +E   V+  
Subjt:  FAAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNRDQQEEQAVVVI

Query:  GGNSLGSKSNTTNSSS----------SPNPNSQDYDDISLKLGLVVFLHI
          N   + +N    SS           P P   D  D SLKLGL   L +
Subjt:  GGNSLGSKSNTTNSSS----------SPNPNSQDYDDISLKLGLVVFLHI

Q9FVC1 MADS-box protein SVP9.9e-4748.95Show/hide
Query:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPE-LSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEE
        M R+KIQI+KIDN  ARQVTFSKRRRGLFKKA EL+ LCDAD+ALI+FS++GKLF++ SSSM E+L RHN+  + L    QP  +   +E S HA++++E
Subjt:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPE-LSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEE

Query:  FAAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNR-----DQQEEQ
         A K+  LR M+GEELQGL IEEL++LEK LE GL RV+ETK +K + EI  +++K   LM+EN+RL  +       N   L ++  N        + E 
Subjt:  FAAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNR-----DQQEEQ

Query:  AVVVIGGNSLGSKSNTTNSSSSPNPNSQDYDDISLKLGL
        A V   G S  S +N  NS+ +  P   +  D SL+LGL
Subjt:  AVVVIGGNSLGSKSNTTNSSSSPNPNSQDYDDISLKLGL

Q9XJ66 MADS-box transcription factor 224.3e-4244.21Show/hide
Query:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPELSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEEF
        M R++ +IK+I++ AARQVTFSKRRRGLFKKA EL+ LCDAD+ALIVFS++GKL  ++SSSM E++ ++N        ++ PS    LE S +A L E+ 
Subjt:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPELSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEEF

Query:  AAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNRDQQEEQAVVVIG
        A  +  LR M+GEEL+GL I+EL++LEK LE GL+RV+ TKD++F+++I  ++ K + L EEN +L N+V     A   ++  E    + Q  ++V+   
Subjt:  AAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNRDQQEEQAVVVIG

Query:  GNSLGSKSNTTNSSSSPNPNSQDYDDISLKLGL
                   +S SS + ++ D  D+SLKLGL
Subjt:  GNSLGSKSNTTNSSSSPNPNSQDYDDISLKLGL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G22540.1 K-box region and MADS-box transcription factor family protein7.0e-4848.95Show/hide
Query:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPE-LSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEE
        M R+KIQI+KIDN  ARQVTFSKRRRGLFKKA EL+ LCDAD+ALI+FS++GKLF++ SSSM E+L RHN+  + L    QP  +   +E S HA++++E
Subjt:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPE-LSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEE

Query:  FAAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNR-----DQQEEQ
         A K+  LR M+GEELQGL IEEL++LEK LE GL RV+ETK +K + EI  +++K   LM+EN+RL  +       N   L ++  N        + E 
Subjt:  FAAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNR-----DQQEEQ

Query:  AVVVIGGNSLGSKSNTTNSSSSPNPNSQDYDDISLKLGL
        A V   G S  S +N  NS+ +  P   +  D SL+LGL
Subjt:  AVVVIGGNSLGSKSNTTNSSSSPNPNSQDYDDISLKLGL

AT2G22540.2 K-box region and MADS-box transcription factor family protein5.6e-4548.12Show/hide
Query:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPE-LSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEE
        M R+KIQI+KIDN  ARQVTFSKRRRGLFKKA EL+ LCDAD+ALI+FS++GKLFD     M E+L RHN+  + L    QP  +   +E S HA++++E
Subjt:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPE-LSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEE

Query:  FAAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNR-----DQQEEQ
         A K+  LR M+GEELQGL IEEL++LEK LE GL RV+ETK +K + EI  +++K   LM+EN+RL  +       N   L ++  N        + E 
Subjt:  FAAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNR-----DQQEEQ

Query:  AVVVIGGNSLGSKSNTTNSSSSPNPNSQDYDDISLKLGL
        A V   G S  S +N  NS+ +  P   +  D SL+LGL
Subjt:  AVVVIGGNSLGSKSNTTNSSSSPNPNSQDYDDISLKLGL

AT3G57230.1 AGAMOUS-like 162.3e-2738.73Show/hide
Query:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPELSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEEF
        M R KI IK+I+N  +RQVTFSKRR GL KKA ELA LCDA++ +I+FS++G+L+D+SSSSM  ++ R++     ++    P+   Q  +   A L  + 
Subjt:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPELSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEEF

Query:  AAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNRDQQEEQAVVVIG
            E  R M GEEL GL +E L+ LE  LE+ L  V   KD+  ++EI  +  +  L+ +EN  L  KV      N        L+    E + V +  
Subjt:  AAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNRDQQEEQAVVVIG

Query:  GNSL
         NSL
Subjt:  GNSL

AT3G57230.2 AGAMOUS-like 168.9e-2740.38Show/hide
Query:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRH-NMLPELSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEE
        M R KI IK+I+N  +RQVTFSKRR GL KKA ELA LCDA++ +I+FS++G+L+D+SSSSM  ++ R+ +   E S+ + P S+  ++       +T E
Subjt:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRH-NMLPELSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEE

Query:  FAAKTEEL---RHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNRDQQEEQAV
          A +EEL   R M GEEL GL +E L+ LE  LE+ L  V   KD+  ++EI  +  +  L+ +EN  L  KV      N        L+    E + V
Subjt:  FAAKTEEL---RHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNRDQQEEQAV

Query:  VVIGGNSL
         +   NSL
Subjt:  VVIGGNSL

AT4G24540.1 AGAMOUS-like 242.6e-4246.38Show/hide
Query:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNM-LPELSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEE
        M R+KI+IKKIDNI ARQVTFSKRRRG+FKKA EL+ LCDAD+ALI+FSA+GKLF++SSS M ++L R+++    ++    PPS   +LE    ++L++E
Subjt:  MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNM-LPELSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEE

Query:  FAAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNRDQQEEQAVVVI
           KT++LR ++GE+L GL +EEL++LEKLLE GL+RV E K E  + +I +++++ + L++EN+RL +K             +ETL      E+A +  
Subjt:  FAAKTEELRHMKGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNRDQQEEQAVVVI

Query:  GGNSLGSKSNTTNSSSSPNPNS-QDYDDISLKLGL
           +L ++S TTN SS  +    +D  D SLKLGL
Subjt:  GGNSLGSKSNTTNSSSSPNPNS-QDYDDISLKLGL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACAAGACAAAAAATCCAGATAAAGAAAATAGACAACATAGCAGCAAGGCAAGTGACATTTTCAAAGAGGAGAAGAGGACTATTCAAAAAAGCTCATGAACTTGCAAC
TCTCTGTGATGCTGATATTGCTCTCATTGTTTTTTCTGCTTCTGGAAAGCTTTTTGATTATTCCAGCTCAAGCATGCTGGAGTTATTGAGAAGACATAATATGCTACCAG
AGTTGAGTAACTTTAGTCAACCTCCATCTCAGGGTTCACAGTTGGAAAAGAGTGTCCATGCTAAATTGACTGAGGAATTTGCAGCCAAGACCGAAGAACTTAGGCATATG
AAGGGAGAAGAGCTTCAAGGGCTTGGAATAGAAGAATTAAAGAAATTGGAGAAATTGCTTGAGATTGGTTTGAATCGTGTAGTAGAGACCAAGGATGAAAAGTTTCTTAA
AGAGATTGGTACTGTGAAGGAGAAGGAAGCTTTGCTAATGGAAGAGAATCAGAGACTGATGAATAAAGTGAGAGCTTTCTTCTTAGCTAATTCTCTAATTCTCTTTGTGG
AAACTTTGAATAGAGATCAGCAAGAAGAACAGGCAGTGGTTGTTATTGGTGGAAATTCTTTGGGGTCAAAGTCAAACACCACCAACAGCAGCTCCTCACCAAACCCTAAT
TCTCAAGATTATGATGACATTTCTCTTAAATTGGGGTTAGTAGTTTTCTTACATATACACTATATATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGAAAATTTGCCTTAAAACCATTCCATTCCTTTTCCTTTGTCCAGAAAAGGAAACACTTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAAAAATCCATTGCTGCTGCTAAATTG
AGTTTCATACTTTGCAGCACCTACTTTTTTTATTTTTCTTTTTTAAATTCCTACAGCAAAAACCCAGAAGGACAACATAGAAATACACGAGGTGGAAAATAAATTTTGGG
AGGAAAAAAGGGGAAAAAAAATGACAAGACAAAAAATCCAGATAAAGAAAATAGACAACATAGCAGCAAGGCAAGTGACATTTTCAAAGAGGAGAAGAGGACTATTCAAA
AAAGCTCATGAACTTGCAACTCTCTGTGATGCTGATATTGCTCTCATTGTTTTTTCTGCTTCTGGAAAGCTTTTTGATTATTCCAGCTCAAGCATGCTGGAGTTATTGAG
AAGACATAATATGCTACCAGAGTTGAGTAACTTTAGTCAACCTCCATCTCAGGGTTCACAGTTGGAAAAGAGTGTCCATGCTAAATTGACTGAGGAATTTGCAGCCAAGA
CCGAAGAACTTAGGCATATGAAGGGAGAAGAGCTTCAAGGGCTTGGAATAGAAGAATTAAAGAAATTGGAGAAATTGCTTGAGATTGGTTTGAATCGTGTAGTAGAGACC
AAGGATGAAAAGTTTCTTAAAGAGATTGGTACTGTGAAGGAGAAGGAAGCTTTGCTAATGGAAGAGAATCAGAGACTGATGAATAAAGTGAGAGCTTTCTTCTTAGCTAA
TTCTCTAATTCTCTTTGTGGAAACTTTGAATAGAGATCAGCAAGAAGAACAGGCAGTGGTTGTTATTGGTGGAAATTCTTTGGGGTCAAAGTCAAACACCACCAACAGCA
GCTCCTCACCAAACCCTAATTCTCAAGATTATGATGACATTTCTCTTAAATTGGGGTTAGTAGTTTTCTTACATATACACTATATATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTRQKIQIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLELLRRHNMLPELSNFSQPPSQGSQLEKSVHAKLTEEFAAKTEELRHM
KGEELQGLGIEELKKLEKLLEIGLNRVVETKDEKFLKEIGTVKEKEALLMEENQRLMNKVRAFFLANSLILFVETLNRDQQEEQAVVVIGGNSLGSKSNTTNSSSSPNPN
SQDYDDISLKLGLVVFLHIHYI