; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CcUC10G195820 (gene) of Watermelon (PI 537277) v1 genome

Gene IDCcUC10G195820
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionProtein RALF-like 33
Genome locationCicolChr10:21497208..21497588
RNA-Seq ExpressionCcUC10G195820
SyntenyCcUC10G195820
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044366.1 protein RALF-like 33 [Cucumis melo var. makuwa]1.5e-5189.17Show/hide
Query:  MGNSSSPPTLCTLIFTIAFFVSSSSITVTAMSSDHSLSWLSTETRCHGRSISECMMNIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYNCQ
        MGNSSSPP    LIFTIA FVSSSS+ VTAMSSD SL+WLSTE RCHGRSISECMM IEFEMDSEINRRILATSSYISYKSL+ANNIPCSRRG+SYYNCQ
Subjt:  MGNSSSPPTLCTLIFTIAFFVSSSSITVTAMSSDHSLSWLSTETRCHGRSISECMMNIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYNCQ

Query:  PGAEANPYQRGCTAITRCRS
        PGAEANPYQRGCTAITRCRS
Subjt:  PGAEANPYQRGCTAITRCRS

KGN52797.1 hypothetical protein Csa_014956 [Cucumis sativus]9.6e-5188.52Show/hide
Query:  MGNSSSPPTLCTLIFTIAFFV--SSSSITVTAMSSDHSLSWLSTETRCHGRSISECMMNIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYN
        MG+SSSPP L  LIFTIAFFV  SSSS+ VT MSSD SL+WLSTE RCHGRSISECMM+IEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRG+SYYN
Subjt:  MGNSSSPPTLCTLIFTIAFFV--SSSSITVTAMSSDHSLSWLSTETRCHGRSISECMMNIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYN

Query:  CQPGAEANPYQRGCTAITRCRS
        CQPGAEANPYQRGCTAITRCRS
Subjt:  CQPGAEANPYQRGCTAITRCRS

XP_022934551.1 protein RALF-like 1 [Cucurbita moschata]1.4e-4985.95Show/hide
Query:  MGNSSSPPTLCT-LIFTIAFFVSSSSITVTAMSSDHSLSWLSTETRCHGRSISECMMNIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYNC
        MGNSSSPP   + LIFTIAFFVSSSS+ V AMS D SLSWLSTE RCHGRS+SECMM++EFEMDSEINRRILATSSYISYKSL+ANNIPCSRRG+SYYNC
Subjt:  MGNSSSPPTLCT-LIFTIAFFVSSSSITVTAMSSDHSLSWLSTETRCHGRSISECMMNIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAEANPYQRGCTAITRCRS
        QPGAEANPYQRGCT ITRCRS
Subjt:  QPGAEANPYQRGCTAITRCRS

XP_022983404.1 protein RALF-like 1 [Cucurbita maxima]2.4e-4985.95Show/hide
Query:  MGNSSSPPTLCT-LIFTIAFFVSSSSITVTAMSSDHSLSWLSTETRCHGRSISECMMNIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYNC
        MGNSSSPP   + LIFTIAFFVSSSS+ V AMS D SLSWLSTE RCHGR +SECMMN+EFEMDSEINRRILATSSYISYKSL+ANNIPCSRRG+SYYNC
Subjt:  MGNSSSPPTLCT-LIFTIAFFVSSSSITVTAMSSDHSLSWLSTETRCHGRSISECMMNIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAEANPYQRGCTAITRCRS
        QPGAEANPYQRGCT ITRCRS
Subjt:  QPGAEANPYQRGCTAITRCRS

XP_023529110.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.8e-5086.78Show/hide
Query:  MGNSSSPPTLCT-LIFTIAFFVSSSSITVTAMSSDHSLSWLSTETRCHGRSISECMMNIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYNC
        MGNSSSPP   + LIFTIAFFV SSS+ V AMS DHSLSWLSTE RCHGRS+SECMMN+EFEMDSEINRRILATSSYISYKSL+ANNIPCSRRG+SYYNC
Subjt:  MGNSSSPPTLCT-LIFTIAFFVSSSSITVTAMSSDHSLSWLSTETRCHGRSISECMMNIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAEANPYQRGCTAITRCRS
        QPGAEANPYQRGCT ITRCRS
Subjt:  QPGAEANPYQRGCTAITRCRS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KWI2 Uncharacterized protein4.7e-5188.52Show/hide
Query:  MGNSSSPPTLCTLIFTIAFFV--SSSSITVTAMSSDHSLSWLSTETRCHGRSISECMMNIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYN
        MG+SSSPP L  LIFTIAFFV  SSSS+ VT MSSD SL+WLSTE RCHGRSISECMM+IEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRG+SYYN
Subjt:  MGNSSSPPTLCTLIFTIAFFV--SSSSITVTAMSSDHSLSWLSTETRCHGRSISECMMNIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYN

Query:  CQPGAEANPYQRGCTAITRCRS
        CQPGAEANPYQRGCTAITRCRS
Subjt:  CQPGAEANPYQRGCTAITRCRS

A0A5A7TQI0 Protein RALF-like 337.2e-5289.17Show/hide
Query:  MGNSSSPPTLCTLIFTIAFFVSSSSITVTAMSSDHSLSWLSTETRCHGRSISECMMNIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYNCQ
        MGNSSSPP    LIFTIA FVSSSS+ VTAMSSD SL+WLSTE RCHGRSISECMM IEFEMDSEINRRILATSSYISYKSL+ANNIPCSRRG+SYYNCQ
Subjt:  MGNSSSPPTLCTLIFTIAFFVSSSSITVTAMSSDHSLSWLSTETRCHGRSISECMMNIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYNCQ

Query:  PGAEANPYQRGCTAITRCRS
        PGAEANPYQRGCTAITRCRS
Subjt:  PGAEANPYQRGCTAITRCRS

A0A6J1F244 protein RALF-like 16.7e-5085.95Show/hide
Query:  MGNSSSPPTLCT-LIFTIAFFVSSSSITVTAMSSDHSLSWLSTETRCHGRSISECMMNIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYNC
        MGNSSSPP   + LIFTIAFFVSSSS+ V AMS D SLSWLSTE RCHGRS+SECMM++EFEMDSEINRRILATSSYISYKSL+ANNIPCSRRG+SYYNC
Subjt:  MGNSSSPPTLCT-LIFTIAFFVSSSSITVTAMSSDHSLSWLSTETRCHGRSISECMMNIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAEANPYQRGCTAITRCRS
        QPGAEANPYQRGCT ITRCRS
Subjt:  QPGAEANPYQRGCTAITRCRS

A0A6J1J798 protein RALF-like 11.1e-4985.95Show/hide
Query:  MGNSSSPPTLCT-LIFTIAFFVSSSSITVTAMSSDHSLSWLSTETRCHGRSISECMMNIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYNC
        MGNSSSPP   + LIFTIAFFVSSSS+ V AMS D SLSWLSTE RCHGR +SECMMN+EFEMDSEINRRILATSSYISYKSL+ANNIPCSRRG+SYYNC
Subjt:  MGNSSSPPTLCT-LIFTIAFFVSSSSITVTAMSSDHSLSWLSTETRCHGRSISECMMNIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAEANPYQRGCTAITRCRS
        QPGAEANPYQRGCT ITRCRS
Subjt:  QPGAEANPYQRGCTAITRCRS

A0A6J5XM33 Uncharacterized protein1.3e-2958.06Show/hide
Query:  MGNSSSPPTLCTLIFTIAFFVSSSSITVTAMS----SDHSLSWLSTETRCHGRSISECMMNIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASY
        M NSSS       IF  AF++ ++++ ++  +     DH LSW+ + TRC G SI+ECM + EF+MDSEINRRILATS YISY +L+ N +PCSRRGASY
Subjt:  MGNSSSPPTLCTLIFTIAFFVSSSSITVTAMS----SDHSLSWLSTETRCHGRSISECMMNIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASY

Query:  YNCQPGAEANPYQRGCTAITRCRS
        YNC+PGAE+NPY RGC+AI RCRS
Subjt:  YNCQPGAEANPYQRGCTAITRCRS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 338.5e-2652.89Show/hide
Query:  GNSSSPPTLCTLIFTIAFFVSSSSITVTAMSSDHSLSWLSTETRCHGRSISECMMNI---EFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYN
        G S+ P  +   I T+ F  +       A++S  S  ++  E++C+G +I+EC ++    EFEMDSEINRRILAT+ YISY +LR N +PCSRRGASYYN
Subjt:  GNSSSPPTLCTLIFTIAFFVSSSSITVTAMSSDHSLSWLSTETRCHGRSISECMMNI---EFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYN

Query:  CQPGAEANPYQRGCTAITRCR
        C+ GA+ANPY RGC+AITRCR
Subjt:  CQPGAEANPYQRGCTAITRCR

Q945T0 Rapid alkalinization factor2.3e-2355.65Show/hide
Query:  LCTLIFTIAFFVSSSSITVTAMSSDHSLSWLSTETR---CHGRSISECMM-NIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYNCQPGAEA
        LC LI   AFF+S     + A     +  W+        C G SI EC+    EFE+DSE NRRILAT  YISY +L+ N++PCSRRGASYYNC+PGA+A
Subjt:  LCTLIFTIAFFVSSSSITVTAMSSDHSLSWLSTETR---CHGRSISECMM-NIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYNCQPGAEA

Query:  NPYQRGCTAITRCRS
        NPY RGC+AITRCRS
Subjt:  NPYQRGCTAITRCRS

Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 236.8e-2347.06Show/hide
Query:  MGNSSSPPTLCTLIFTIAFFVSSSSITVTAMSSDHSLSWLSTETRCHGRSISECM-----------------MNIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLR
        +  +S    +  ++  +A  V + S+ V++ S++ +  +   ET C G +I+EC                  M  EFEMDSEINRRILAT  YISY +LR
Subjt:  MGNSSSPPTLCTLIFTIAFFVSSSSITVTAMSSDHSLSWLSTETRCHGRSISECM-----------------MNIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLR

Query:  ANNIPCSRRGASYYNCQPGAEANPYQRGCTAITRCR
         N IPCSRRGASYYNC+ GA+ANPY RGC+AITRCR
Subjt:  ANNIPCSRRGASYYNCQPGAEANPYQRGCTAITRCR

Q9MA62 Protein RALF-like 221.4e-2065.33Show/hide
Query:  CHGRSISECMM-NIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYNCQPGAEANPYQRGCTAITRCR
        C G SI+EC+    E E DS+I+RRILA   YISY ++R N++PCSRRGASYYNCQ GA+ANPY RGC+ ITRCR
Subjt:  CHGRSISECMM-NIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYNCQPGAEANPYQRGCTAITRCR

Q9SRY3 Protein RALF-like 11.9e-2555.36Show/hide
Query:  TLIFTIAFFVSSSSITVTAMSSDHSLSWLST---ETRCHGRSISECMMNIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYNCQPGAEANPY
        TL   + F +SS  +     +    ++W +T    + CHG SI+EC+   E EMDSEINRRILAT+ YISY+SL+ N++PCSRRGASYYNCQ GA+ANPY
Subjt:  TLIFTIAFFVSSSSITVTAMSSDHSLSWLST---ETRCHGRSISECMMNIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYNCQPGAEANPY

Query:  QRGCTAITRCRS
         RGC+ I RCRS
Subjt:  QRGCTAITRCRS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 11.4e-2655.36Show/hide
Query:  TLIFTIAFFVSSSSITVTAMSSDHSLSWLST---ETRCHGRSISECMMNIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYNCQPGAEANPY
        TL   + F +SS  +     +    ++W +T    + CHG SI+EC+   E EMDSEINRRILAT+ YISY+SL+ N++PCSRRGASYYNCQ GA+ANPY
Subjt:  TLIFTIAFFVSSSSITVTAMSSDHSLSWLST---ETRCHGRSISECMMNIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYNCQPGAEANPY

Query:  QRGCTAITRCRS
         RGC+ I RCRS
Subjt:  QRGCTAITRCRS

AT2G33775.1 ralf-like 191.7e-1644.68Show/hide
Query:  ITVTAMSSDHSLSWLSTETRCHGRSISECMMNIEFEMDSEINRRILAT-SSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYNCQPGAEANPYQRGCTAITRC
        +T+  ++   + +W  T++  +G+        +++ MDSE NRR LA   SYISY +LR NN+PCSRRG SYY+C+    ANPY+RGC+ IT C
Subjt:  ITVTAMSSDHSLSWLSTETRCHGRSISECMMNIEFEMDSEINRRILAT-SSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYNCQPGAEANPYQRGCTAITRC

AT3G05490.1 ralf-like 221.0e-2165.33Show/hide
Query:  CHGRSISECMM-NIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYNCQPGAEANPYQRGCTAITRCR
        C G SI+EC+    E E DS+I+RRILA   YISY ++R N++PCSRRGASYYNCQ GA+ANPY RGC+ ITRCR
Subjt:  CHGRSISECMM-NIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYNCQPGAEANPYQRGCTAITRCR

AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 234.8e-2447.06Show/hide
Query:  MGNSSSPPTLCTLIFTIAFFVSSSSITVTAMSSDHSLSWLSTETRCHGRSISECM-----------------MNIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLR
        +  +S    +  ++  +A  V + S+ V++ S++ +  +   ET C G +I+EC                  M  EFEMDSEINRRILAT  YISY +LR
Subjt:  MGNSSSPPTLCTLIFTIAFFVSSSSITVTAMSSDHSLSWLSTETRCHGRSISECM-----------------MNIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLR

Query:  ANNIPCSRRGASYYNCQPGAEANPYQRGCTAITRCR
         N IPCSRRGASYYNC+ GA+ANPY RGC+AITRCR
Subjt:  ANNIPCSRRGASYYNCQPGAEANPYQRGCTAITRCR

AT4G15800.1 ralf-like 336.1e-2752.89Show/hide
Query:  GNSSSPPTLCTLIFTIAFFVSSSSITVTAMSSDHSLSWLSTETRCHGRSISECMMNI---EFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYN
        G S+ P  +   I T+ F  +       A++S  S  ++  E++C+G +I+EC ++    EFEMDSEINRRILAT+ YISY +LR N +PCSRRGASYYN
Subjt:  GNSSSPPTLCTLIFTIAFFVSSSSITVTAMSSDHSLSWLSTETRCHGRSISECMMNI---EFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYN

Query:  CQPGAEANPYQRGCTAITRCR
        C+ GA+ANPY RGC+AITRCR
Subjt:  CQPGAEANPYQRGCTAITRCR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGCTAAAGGCAACTATGGGTAACTCTTCTTCTCCACCTACCTTATGTACGCTCATTTTCACCATTGCTTTCTTCGTCTCTTCGTCCTCTATAACGGTCACGGCAAT
GAGTAGCGACCATAGTCTTAGTTGGCTCTCGACCGAAACTCGATGCCATGGACGTTCAATAAGTGAATGCATGATGAACATTGAGTTTGAAATGGATTCTGAGATCAATC
GTCGCATCTTAGCCACTTCAAGTTACATAAGTTACAAGTCGTTGAGGGCCAACAACATTCCATGCTCTCGGAGAGGTGCGTCCTACTACAATTGTCAACCTGGGGCCGAA
GCTAACCCGTATCAGCGAGGTTGTACTGCCATTACTCGTTGTAGAAGCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAGCTAAAGGCAACTATGGGTAACTCTTCTTCTCCACCTACCTTATGTACGCTCATTTTCACCATTGCTTTCTTCGTCTCTTCGTCCTCTATAACGGTCACGGCAAT
GAGTAGCGACCATAGTCTTAGTTGGCTCTCGACCGAAACTCGATGCCATGGACGTTCAATAAGTGAATGCATGATGAACATTGAGTTTGAAATGGATTCTGAGATCAATC
GTCGCATCTTAGCCACTTCAAGTTACATAAGTTACAAGTCGTTGAGGGCCAACAACATTCCATGCTCTCGGAGAGGTGCGTCCTACTACAATTGTCAACCTGGGGCCGAA
GCTAACCCGTATCAGCGAGGTTGTACTGCCATTACTCGTTGTAGAAGCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKLKATMGNSSSPPTLCTLIFTIAFFVSSSSITVTAMSSDHSLSWLSTETRCHGRSISECMMNIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGASYYNCQPGAE
ANPYQRGCTAITRCRS