; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CcUC10G196130 (gene) of Watermelon (PI 537277) v1 genome

Gene IDCcUC10G196130
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
Descriptionprotein SENESCENCE-ASSOCIATED GENE 21, mitochondrial-like
Genome locationCicolChr10:21995618..22003611
RNA-Seq ExpressionCcUC10G196130
SyntenyCcUC10G196130
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR004926 - Late embryogenesis abundant protein, LEA_3 subgroup


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044385.1 protein SENESCENCE-ASSOCIATED protein 21 [Cucumis melo var. makuwa]6.6e-1777.46Show/hide
Query:  RRGY-TAAPEGVAARI-GVMMKKEESVR-STEK--VSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLNPTAK
        RRGY TA+ EGVAARI  +M KKEES+R   EK  VSWVPDPVTGYYRPENC AE+DAADLRAMLLNPT K
Subjt:  RRGY-TAAPEGVAARI-GVMMKKEESVR-STEK--VSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLNPTAK

XP_008454329.1 PREDICTED: protein SENESCENCE-ASSOCIATED GENE 21, mitochondrial-like [Cucumis melo]2.5e-1676.06Show/hide
Query:  RRGY-TAAPEGVAARI-GVMMKKEESVR-STEK--VSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLNPTAK
        RRGY TA+ EGVAARI  +M KKEES+R   EK  VSWVPDPVTGYYRPENC AE+DAADLRAMLLNP  K
Subjt:  RRGY-TAAPEGVAARI-GVMMKKEESVR-STEK--VSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLNPTAK

XP_011652940.1 late embryogenesis abundant protein Lea5-A [Cucumis sativus]1.3e-1772.86Show/hide
Query:  RRGYTAAPEGVAARI-GVMMKKEESV---RSTEKVSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLNPTAK
        RRGY  APEGVAAR+ G+M KKEES+   R  + VSWVPDPVTGYYRPENC AE+DAADLRAMLLN   K
Subjt:  RRGYTAAPEGVAARI-GVMMKKEESV---RSTEKVSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLNPTAK

XP_022949199.1 protein SENESCENCE-ASSOCIATED GENE 21, mitochondrial-like [Cucurbita moschata]1.2e-1573.13Show/hide
Query:  RRGY-TAAPEGVAARIGVMMKKEESVRSTEKVSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLNPTAK
        RRGY  AAP+ VAARIG      ++V+STEK SWVPDPVTGYYRPENC AEIDAADLRAMLL  T K
Subjt:  RRGY-TAAPEGVAARIGVMMKKEESVRSTEKVSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLNPTAK

XP_023525742.1 protein SENESCENCE-ASSOCIATED GENE 21, mitochondrial-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.4e-1467.12Show/hide
Query:  RRGYT-------AAPEGVAARIGVMMKKEESVRSTEKVSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLNPTAK
        RRGY        AA +GVAARIG      ++V+STEK SWVPDPVTGYYRPENC AEIDAADLRAMLL  T K
Subjt:  RRGYT-------AAPEGVAARIGVMMKKEESVRSTEKVSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLNPTAK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KTB8 Uncharacterized protein6.4e-1872.86Show/hide
Query:  RRGYTAAPEGVAARI-GVMMKKEESV---RSTEKVSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLNPTAK
        RRGY  APEGVAAR+ G+M KKEES+   R  + VSWVPDPVTGYYRPENC AE+DAADLRAMLLN   K
Subjt:  RRGYTAAPEGVAARI-GVMMKKEESV---RSTEKVSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLNPTAK

A0A1S3BZK3 protein SENESCENCE-ASSOCIATED GENE 21, mitochondrial-like1.2e-1676.06Show/hide
Query:  RRGY-TAAPEGVAARI-GVMMKKEESVR-STEK--VSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLNPTAK
        RRGY TA+ EGVAARI  +M KKEES+R   EK  VSWVPDPVTGYYRPENC AE+DAADLRAMLLNP  K
Subjt:  RRGY-TAAPEGVAARI-GVMMKKEESVR-STEK--VSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLNPTAK

A0A5A7TSN1 Protein SENESCENCE-ASSOCIATED protein 213.2e-1777.46Show/hide
Query:  RRGY-TAAPEGVAARI-GVMMKKEESVR-STEK--VSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLNPTAK
        RRGY TA+ EGVAARI  +M KKEES+R   EK  VSWVPDPVTGYYRPENC AE+DAADLRAMLLNPT K
Subjt:  RRGY-TAAPEGVAARI-GVMMKKEESVR-STEK--VSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLNPTAK

A0A5D3E0D0 SENESCENCE-ASSOCIATED GENE 21 protein1.2e-1676.06Show/hide
Query:  RRGY-TAAPEGVAARI-GVMMKKEESVR-STEK--VSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLNPTAK
        RRGY TA+ EGVAARI  +M KKEES+R   EK  VSWVPDPVTGYYRPENC AE+DAADLRAMLLNP  K
Subjt:  RRGY-TAAPEGVAARI-GVMMKKEESVR-STEK--VSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLNPTAK

A0A6J1GC45 protein SENESCENCE-ASSOCIATED GENE 21, mitochondrial-like6.0e-1673.13Show/hide
Query:  RRGY-TAAPEGVAARIGVMMKKEESVRSTEKVSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLNPTAK
        RRGY  AAP+ VAARIG      ++V+STEK SWVPDPVTGYYRPENC AEIDAADLRAMLL  T K
Subjt:  RRGY-TAAPEGVAARIGVMMKKEESVRSTEKVSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLNPTAK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P32292 Indole-3-acetic acid-induced protein ARG24.7e-1063.79Show/hide
Query:  AAPEGVAARIGVMMKK--EESVRSTEKVSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLL
        +A  G A+  G M+ K  EE VR  EKVSWVPDPVTGYYRPEN T EID AD+RA +L
Subjt:  AAPEGVAARIGVMMKK--EESVRSTEKVSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLL

P46521 Late embryogenesis abundant protein Lea5-A2.5e-1154.67Show/hide
Query:  RRGYTAAPEGVA----ARIGVMMK-------KEESVRSTEKVS--WVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLN
        RRGY+ AP         R G M K       KE S   T   S  W PDPVTGYYRPENC AEIDAADLR M+LN
Subjt:  RRGYTAAPEGVA----ARIGVMMK-------KEESVRSTEKVS--WVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLN

P46522 Late embryogenesis abundant protein Lea5-D4.3e-1154.67Show/hide
Query:  RRGYTAAPEGVA----ARIGVMMK-------KEESVRSTEKVS--WVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLN
        RRGY+ AP         R G M K       KE S   T   S  W PDPVTGYYRPENC AEIDAA+LR MLLN
Subjt:  RRGYTAAPEGVA----ARIGVMMK-------KEESVRSTEKVS--WVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLN

Q39644 Late embryogenesis abundant protein Lea51.6e-1055.22Show/hide
Query:  RRGY-TAAPEGVAARIGVMMKKE--ESVRSTEKVS--WVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLN
        RRGY  AAP G  +R G+M K +   +VR     S  W PDP+TGYYRPEN   EID A+LR MLLN
Subjt:  RRGY-TAAPEGVAARIGVMMKKE--ESVRSTEKVS--WVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLN

Q93WF6 Protein SENESCENCE-ASSOCIATED GENE 21, mitochondrial9.6e-1155.71Show/hide
Query:  RRGY--TAAPEGVA------ARIGVMMKKEESVRSTEKVSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLN
        RRGY  TAA   V+      A    +MKK+    ST+K+SWVPDP TGYYRPE  + EIDAA+LRA LLN
Subjt:  RRGY--TAAPEGVA------ARIGVMMKKEESVRSTEKVSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLN

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02820.1 Late embryogenesis abundant 3 (LEA3) family protein2.2e-1051.56Show/hide
Query:  RRGYTAAPEGV--AARIGVMMKKEESVRSTEKVSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLN
        RRG+ AA +     +     MKK     S+EK  WVPDP TGYYRPE  + EID A+LRA+LLN
Subjt:  RRGYTAAPEGV--AARIGVMMKKEESVRSTEKVSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLN

AT3G53770.1 late embryogenesis abundant 3 (LEA3) family protein1.9e-0638.1Show/hide
Query:  PEGVAARIGVMMKKEESVRST----EKVSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLNPTAK
        PE  A  +   + K   V+      E++ W+PDP TGYYRP+N   E+DA +LR++  N   K
Subjt:  PEGVAARIGVMMKKEESVRST----EKVSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLNPTAK

AT4G02380.1 senescence-associated gene 216.8e-1255.71Show/hide
Query:  RRGY--TAAPEGVA------ARIGVMMKKEESVRSTEKVSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLN
        RRGY  TAA   V+      A    +MKK+    ST+K+SWVPDP TGYYRPE  + EIDAA+LRA LLN
Subjt:  RRGY--TAAPEGVA------ARIGVMMKKEESVRSTEKVSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLN

AT4G02380.2 senescence-associated gene 211.5e-1154.29Show/hide
Query:  RRGY--TAAPEGVA------ARIGVMMKKEESVRSTEKVSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLN
        +RGY  TAA   V+      A    +MKK+    ST+K+SWVPDP TGYYRPE  + EIDAA+LRA LLN
Subjt:  RRGY--TAAPEGVA------ARIGVMMKKEESVRSTEKVSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLN

AT4G15910.1 drought-induced 211.2e-0840.79Show/hide
Query:  MRRGYTAAPEGVAA---------RIGVMMKKEESVRSTEKVSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLNPTAK
        +RR Y A  + V A         R+ V   ++  +    + +W PDPVTGYYRP N  AEID A+LR +LL   AK
Subjt:  MRRGYTAAPEGVAA---------RIGVMMKKEESVRSTEKVSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLNPTAK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGGCGTGGATACACGGCGGCGCCAGAAGGAGTTGCGGCCAGAATTGGCGTTATGATGAAGAAGGAAGAATCCGTAAGAAGTACAGAGAAGGTGTCGTGGGTTCCAGA
CCCCGTCACCGGTTATTACCGACCGGAGAACTGCACCGCCGAGATCGATGCTGCCGATCTCCGGGCAATGCTACTGAACCCAACAGCAAAGGGTATCTTGAATCTTGAAT
GTGTTGTTCGACCACCAGACATAATTGCAGCAGCTACACCTGATGTTGCTGTGGCTAAAGCTATCATATCTCTTGACCTTACAGTCGCTAGAAGCACACGATATAAAAAA
GTTTTACCTGTTCCACCAGGCCATCAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGGCGTGGATACACGGCGGCGCCAGAAGGAGTTGCGGCCAGAATTGGCGTTATGATGAAGAAGGAAGAATCCGTAAGAAGTACAGAGAAGGTGTCGTGGGTTCCAGA
CCCCGTCACCGGTTATTACCGACCGGAGAACTGCACCGCCGAGATCGATGCTGCCGATCTCCGGGCAATGCTACTGAACCCAACAGCAAAGGGTATCTTGAATCTTGAAT
GTGTTGTTCGACCACCAGACATAATTGCAGCAGCTACACCTGATGTTGCTGTGGCTAAAGCTATCATATCTCTTGACCTTACAGTCGCTAGAAGCACACGATATAAAAAA
GTTTTACCTGTTCCACCAGGCCATCAATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRRGYTAAPEGVAARIGVMMKKEESVRSTEKVSWVPDPVTGYYRPENCTAEIDAADLRAMLLNPTAKGILNLECVVRPPDIIAAATPDVAVAKAIISLDLTVARSTRYKK
VLPVPPGHQ