; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CcUC11G212560 (gene) of Watermelon (PI 537277) v1 genome

Gene IDCcUC11G212560
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionRING-type domain-containing protein
Genome locationCicolChr11:4460417..4466772
RNA-Seq ExpressionCcUC11G212560
SyntenyCcUC11G212560
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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AT4G39140.1 RING/U-box superfamily protein2.9e-10050Show/hide
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AT4G39140.2 RING/U-box superfamily protein2.9e-10050Show/hide
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AT4G39140.3 RING/U-box superfamily protein2.9e-10050Show/hide
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AT4G39140.4 RING/U-box superfamily protein2.9e-10050Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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AGGAATATATCGACAGATGTGAGTATAGAACAGGTGAAGGAGGCTATAGAATCTCCCACAGCTTCATATAAGTCTCCTGCAAAATTGTCACTTTCATTGCCTTCAACTTC
ATCTTTGTCAACATCTCCTTTGTCATCTCAGAGTTATCTGCCTCCAACCAATTCATCCCTAACAAGATGTTCCCACCGATCTCCAGGACATCAGTTGTTGCGTCAAGTGT
CTGACAGCCGAATCCGAGGATTAAAATCACCAAGTAGCTATTTAGCTTTGGAAGATAGACCAAGACTTCCCTCTTGGAGCAATGAATCGGTCCGGGACTCACATGGAGGG
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ACAATGAACTTTCCGTTGCTGCTGTACTAACCTGTGGACATGTTTATCATGCCGATTGTTTGGAGAGTATGACACCTGAGATTTACAAGTACGACCCCGCTTGCCCTGTT
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TTTCGATGTCGATTTTGCTGCAAACGACCCTTTCAAAAATAATGCGCGTCTTGAAAGGGGATCGAAAATGTCTGCCAGTTCTAGCATGAGAAGCTCCTCAGGGAAGCCTT
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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ACAAAATACAGTTTGACGTTTCCTTGAGAGGCATGGTGCTGGGGTTATTCTCAGAGTTCTAATTTTGAAGAGCTTCAGCAACTCTTGTGGCAAAGTTAATAAAACCATAA
TCTTGGTCCTTCTCCAGCATGGGATCTGCGTGTTGTGTTGCTGCTAGGGACAAGACTATAGTAAGTGGATCTGGAAGTGAAACCTTATGTAGGAATATAAGGTATTCGCC
TAGTTGGAGCTTTCGATGGGATAATCGTGGACGGGTAGCTGGCGAAGAGACTTCCATAAATTGGTTTTCTGATGGTGTTAGCCGCAATGATAGAGTGGAACTGAAGTTTG
AGTCGGCATATGCATCAGAGGATGGAAGTCCACTTGAACATCTCCGTAGACGTGCATGGCAAAAGTCCCCACCACCAGAAGGCACAACTAATAATTTGAGGACTCCTAGT
TCAGGTCAATCAAATTCAAGGAATATATCGACAGATGTGAGTATAGAACAGGTGAAGGAGGCTATAGAATCTCCCACAGCTTCATATAAGTCTCCTGCAAAATTGTCACT
TTCATTGCCTTCAACTTCATCTTTGTCAACATCTCCTTTGTCATCTCAGAGTTATCTGCCTCCAACCAATTCATCCCTAACAAGATGTTCCCACCGATCTCCAGGACATC
AGTTGTTGCGTCAAGTGTCTGACAGCCGAATCCGAGGATTAAAATCACCAAGTAGCTATTTAGCTTTGGAAGATAGACCAAGACTTCCCTCTTGGAGCAATGAATCGGTC
CGGGACTCACATGGAGGGTCTTCAGATTGTTGGTCTGTGCATGCTTTCTCTGAACTCATGGCCACTTCTCATAGAGAAAGGTGGTCTTTCGATAGCGACTCGTTTGGCTT
TAATGGTGAGAAAATTGCCAGATCTAGTAGTCAGATTTCAACTTCCTCAGTTGACTTGCAAACTTGCGGAGTTTGCTCGAAGCTGTTGACCGAGAAATCCTCATGGAGTA
GCCAAAGGATTATTGCTAACAATGAACTTTCCGTTGCTGCTGTACTAACCTGTGGACATGTTTATCATGCCGATTGTTTGGAGAGTATGACACCTGAGATTTACAAGTAC
GACCCCGCTTGCCCTGTTTGTACCTTTGGGGAGAAGCATACTCAAAAGTTGTCTGAAAAGGCGCTTAAAGCTGAAATGGACTGGAAGAATCTATATAAGAGACCCAAAAA
CTGTATTGCAGATAGTGATTTCGATGTCGATTTTGCTGCAAACGACCCTTTCAAAAATAATGCGCGTCTTGAAAGGGGATCGAAAATGTCTGCCAGTTCTAGCATGAGAA
GCTCCTCAGGGAAGCCTTTCTTGAAACGGCACTTCTCCTTCGGCTCAAAGGGATCTTCTAGAGTGATGTCTGATAATCACTCCACAAGAAGGAAAGGATTCTTCTGGGCA
AAGTCTAGCAAAGTATGATAGATTCTAACGGCCCCTTCACGTTGCTTCGGGAAGTTGTGTTTCGTGAAACAAGGGAACCATCGACTTCTGTGCCTCGTCAATGGAAACAT
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CTTGTTTATACACAGTCGCATTTGTGTAAAACAGATTCCAATACTAATCTTCCTATCATCTGTTCCCTTTTATTTTTCTGGTCTCAAGCATGTTAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGSACCVAARDKTIVSGSGSETLCRNIRYSPSWSFRWDNRGRVAGEETSINWFSDGVSRNDRVELKFESAYASEDGSPLEHLRRRAWQKSPPPEGTTNNLRTPSSGQSNS
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