; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CcUC11G218410 (gene) of Watermelon (PI 537277) v1 genome

Gene IDCcUC11G218410
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionPSI subunit V
Genome locationCicolChr11:19728821..19730455
RNA-Seq ExpressionCcUC11G218410
SyntenyCcUC11G218410
Gene Ontology termsGO:0015979 - photosynthesis (biological process)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0009538 - photosystem I reaction center (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR003757 - Photosystem I PsaL, reaction centre subunit XI
IPR022980 - Photosystem I, reaction centre subunit XI
IPR036592 - Photosystem I PsaL, reaction centre subunit XI superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
NP_001267647.1 photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic [Cucumis sativus]2.4e-11398.62Show/hide
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A0A0A0LHJ8 PSI subunit V1.1e-11398.62Show/hide
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A0A1S3B555 PSI subunit V3.0e-11499.54Show/hide
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A0A6J1D7U0 PSI subunit V3.3e-11398.16Show/hide
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A0A6J1FBZ4 PSI subunit V8.2e-11296.77Show/hide
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A0A6J1HKH3 PSI subunit V1.3e-11297.24Show/hide
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O78469 Photosystem I reaction center subunit XI1.5e-3348Show/hide
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P23993 Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic1.4e-7970.18Show/hide
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Q39654 Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic1.2e-11598.16Show/hide
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Q41385 Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic1.5e-9177.63Show/hide
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Q9SUI4 Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic6.3e-9378.54Show/hide
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AT4G12800.1 photosystem I subunit l4.4e-9478.54Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CATCCCTACAAGAACACACTCCTTCACCATCAGAGCCATCCAAGCTGATAAGCCAACATACCAAGTGATCCAGCCAATCAATGGAGACCCATTCATTGGAAGCCTCGAGA
CTCCAGTCACCTCAAGCCCACTGATAGCATGGTACCTATCAAACCTCCCAGCCTACAGAACAGCAGTTAGCCCATTGCTGAGGGGAATTGAAGTGGGCCTGGCCCACGGT
TTTTTTCTGGTTGGCCCATTTGTCAAAGCTGGCCCTCTAAGGAACACAGCCTACGCCGGAGGAGCCGGCTCACTGGCCGCTGGCGGTCTCATTGTCATTTTGAGCATCTG
CTTGACAATGTATGGTGTTGCATCCTTCAATGAAGGAGAACCATCTACCGCACCATCGTTGACCTTGACTGGCCGAAAGAAGACCCCTGATCAGCTACAAACAGCCGACG
GGTGGGCAAAATTCTCCGGTGGGTTCTTCTTCGGCGGGATCTCTGGTGTGATCTGGGCATACTTCCTCCTCTATGTCTTGGACCTCCCATACTACGTCAAGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAAAGCCAAATCCAAATCTCTGATTTCCTCATGAGAGAAAGAAATGGATAAGGGATAAGGTTATGTGGCAAGTTCCATCCAATGAGAAGAGGGAGGTTTGATCAACCACA
GCCTCCCACAAATTTCCATGGCCAATGACCACCAACAACAAAAACTTAAACTAACCCCCAAAACCAAATCTAAAAATCTCACCTCATTCTTCTTCTCTGCCACTGATCCT
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ATCTCTCCCAAAGGCCTCTCCGCTTCGCCACTCCGACGCATCCCTACAAGAACACACTCCTTCACCATCAGAGCCATCCAAGCTGATAAGCCAACATACCAAGTGATCCA
GCCAATCAATGGAGACCCATTCATTGGAAGCCTCGAGACTCCAGTCACCTCAAGCCCACTGATAGCATGGTACCTATCAAACCTCCCAGCCTACAGAACAGCAGTTAGCC
CATTGCTGAGGGGAATTGAAGTGGGCCTGGCCCACGGTTTTTTTCTGGTTGGCCCATTTGTCAAAGCTGGCCCTCTAAGGAACACAGCCTACGCCGGAGGAGCCGGCTCA
CTGGCCGCTGGCGGTCTCATTGTCATTTTGAGCATCTGCTTGACAATGTATGGTGTTGCATCCTTCAATGAAGGAGAACCATCTACCGCACCATCGTTGACCTTGACTGG
CCGAAAGAAGACCCCTGATCAGCTACAAACAGCCGACGGGTGGGCAAAATTCTCCGGTGGGTTCTTCTTCGGCGGGATCTCTGGTGTGATCTGGGCATACTTCCTCCTCT
ATGTCTTGGACCTCCCATACTACGTCAAGTAGATTTTGTATCATTTTCTGTTTCTGCAATGCAACTTCCATGTCTGTGTTAAGGAAATATAAAATTGTATATTTTCTGCC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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