; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Chy11G190220 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChy11G190220
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionProtein of unknown function (DUF1645)
Genome locationchrH11:4334559..4336103
RNA-Seq ExpressionChy11G190220
SyntenyChy11G190220
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR012442 - Protein of unknown function DUF1645, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004153625.1 uncharacterized protein LOC101210068 [Cucumis sativus]4.11e-23495.11Show/hide
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XP_022944215.1 uncharacterized protein LOC111448731 [Cucurbita moschata]1.93e-16072.8Show/hide
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XP_023513132.1 uncharacterized protein LOC111777661 [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.82e-16273.37Show/hide
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XP_038900517.1 uncharacterized protein LOC120087714 [Benincasa hispida]7.22e-19582.96Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LII3 Uncharacterized protein5.4e-18295.11Show/hide
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A0A1S3CA74 uncharacterized protein LOC1034984035.8e-17692.2Show/hide
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A0A5A7SPX1 Uncharacterized protein1.4e-10593.61Show/hide
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A0A6J1FYJ1 uncharacterized protein LOC1114487317.2e-12672.8Show/hide
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A0A6J1JGW7 uncharacterized protein LOC1114842681.6e-12572.8Show/hide
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        MEV V   P G D+FNFGSPCSSHYLSA STPFSSLSAPTSPSS   NFFR  +D DVPIGSPS+VPF WEEKPGIPKSP+C   S + DFEF  SR S 
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G15760.1 Protein of unknown function (DUF1645)9.8e-2733.51Show/hide
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        ME+ V A    A++ NF S  SS Y          ++AP+SP+  G NFF           + S++PF W+++P  PK    +    + DFEF+ S    
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         + RK +RS+SP R+S            + +   +    KSS FLSAI F  +  +KW+L+D LLFRSAS+GR     + L + Y ++++K  ++V+ SS
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Query:  FRSEDS----------------GGPRMRFTAANRAVSEELKKKSFLPNKPSFLGRCLRFNRSGMQEISRGIGSLTR
         RS +S                    M +T  NRAVSEELK+K+FLP K  +LG CL FN   + EI+R +GSL+R
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AT2G26530.1 Protein of unknown function (DUF1645)9.5e-2232.16Show/hide
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        ++ +  +P S   LS        LSAPTSP      +   +           +VPF WEE PG P+     T+  D D +F           SL A+ELF
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          GKIKPLKPPP        Q  + S RSP +             SPRK   N+       DPFE A+ K             + N     RGR  +   
Subjt:  HAGKIKPLKPPP------GFQSNVSSSRSPHN----------LRLSPRKTKSNIDTKNINDDPFEAALVKETHRHRSNYELIDSNNNNEIIRGRTDKISY

Query:  ISSNFARKQTRSLSPFRLSS-----------ESTLHGDSARKSKSSSFLSAISF------SKTNRKWRLRD-LLFRSASEGRATEKADKLRSTYVVMSEK
           N  R+  RSLSPFR+S+           +        RK   SS  S  S       S +++KWRL+D LLFRSASEGRA    D ++ T+  +  K
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Query:  LDDDVKISSFRSEDSGGPRMR--FTAANRAVSEELKKKSFLP
          +D K SS R   S           + +A +++LKKK+FLP
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AT2G26530.2 Protein of unknown function (DUF1645)1.1e-1731.9Show/hide
Query:  DIFNFGSPCSSHYLSAHSTPFSSLSAPTSPSSLGFNFFRLDNDVDVPIGSPSSVPFGWEEKPGIPKSPDCATSSTDHDFEFHCSRHSFFSKPSLSADELF
        ++ +  +P S   LS        LSAPTSP      +   +           +VPF WEE PG P+     T+  D D +F           SL A+ELF
Subjt:  DIFNFGSPCSSHYLSAHSTPFSSLSAPTSPSSLGFNFFRLDNDVDVPIGSPSSVPFGWEEKPGIPKSPDCATSSTDHDFEFHCSRHSFFSKPSLSADELF

Query:  HAGKIKPLKPPPGFQSNVSSSRSPHNLRLSPRKTKSNIDTKNINDDPFEAALVKETHRHRSNYELIDSNNNNEIIRGRTDKISYISSNFARKQTRSLSPF
          GKIKPLKPPP  Q  +     P    LSPR  +S I                    H  N          E  RGR         N  R+  RSLSPF
Subjt:  HAGKIKPLKPPPGFQSNVSSSRSPHNLRLSPRKTKSNIDTKNINDDPFEAALVKETHRHRSNYELIDSNNNNEIIRGRTDKISYISSNFARKQTRSLSPF

Query:  RLSS-----------ESTLHGDSARKSKSSSFLSAISF------SKTNRKWRLRD-LLFRSASEGRATEKADKLRSTYVVMSEKLDDDVKISSFRSEDSG
        R+S+           +        RK   SS  S  S       S +++KWRL+D LLFRSASEGRA    D ++ T+  +  K  +D K SS R   S 
Subjt:  RLSS-----------ESTLHGDSARKSKSSSFLSAISF------SKTNRKWRLRD-LLFRSASEGRATEKADKLRSTYVVMSEKLDDDVKISSFRSEDSG

Query:  GPRMR--FTAANRAVSEELKKKSFLP
                  + +A +++LKKK+FLP
Subjt:  GPRMR--FTAANRAVSEELKKKSFLP

AT3G27880.1 Protein of unknown function (DUF1645)1.4e-0430.47Show/hide
Query:  SPFRLSSESTLHGDSARKSKSSSFLSAISFSKTNRKWRLRDLLFRSASEGRATEKADKLRSTYVVMSEKLDDDVKISSFRSED---SGGPRMRFTAANRA
        +P R +++ +  G   RKSKS+   S  ++S   ++WRLRD L RS S+G+ + K       ++  + + DDD    S +      +     +F   N+A
Subjt:  SPFRLSSESTLHGDSARKSKSSSFLSAISFSKTNRKWRLRDLLFRSASEGRATEKADKLRSTYVVMSEKLDDDVKISSFRSED---SGGPRMRFTAANRA

Query:  VSEELKKKSFLPNKPSFLGRCLRFNRSG
        + EE K+KS+LP K   +G     +R G
Subjt:  VSEELKKKSFLPNKPSFLGRCLRFNRSG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGTTGTTGTTCGAGCCCCTCCCACCGGTGCCGACATCTTCAACTTTGGTAGCCCTTGCTCCTCCCATTATCTTTCTGCTCATTCTACTCCCTTCTCCTCCCTTAG
TGCTCCCACAAGCCCCTCTTCTCTTGGCTTCAACTTCTTCCGCCTCGACAACGATGTCGACGTTCCAATCGGCTCTCCCTCTTCTGTTCCCTTCGGCTGGGAGGAGAAGC
CTGGCATCCCCAAGTCCCCCGATTGCGCCACCAGTAGTACTGATCATGATTTTGAATTTCATTGTTCCCGCCACTCCTTCTTCTCTAAGCCTTCCCTCTCCGCCGATGAG
CTCTTCCATGCCGGCAAGATCAAGCCGCTCAAACCGCCGCCCGGATTTCAGTCGAACGTGTCGTCGTCGAGATCGCCGCACAATCTGAGGCTATCGCCTCGGAAAACCAA
AAGCAACATCGACACGAAGAACATCAACGACGACCCATTTGAAGCAGCACTAGTCAAAGAAACTCATCGCCATAGAAGCAATTACGAGCTCATTGATTCAAATAACAACA
ACGAAATTATTAGAGGAAGAACGGACAAAATTTCATACATTTCCTCTAATTTTGCTCGCAAACAAACTCGATCTCTTTCCCCTTTCAGACTCTCCTCTGAATCCACACTC
CATGGAGATAGCGCCAGAAAATCAAAATCGTCGTCTTTTTTGTCGGCAATTTCATTTTCAAAGACCAATAGGAAATGGAGGCTTAGAGACCTGTTGTTTCGCAGTGCGTC
GGAAGGTCGGGCAACGGAGAAAGCCGATAAGCTGAGGTCTACATACGTTGTAATGTCAGAAAAATTGGATGACGATGTGAAGATTTCAAGTTTCCGGTCAGAGGACAGTG
GCGGTCCCAGAATGCGTTTTACGGCGGCGAACCGGGCAGTTTCTGAGGAGTTGAAGAAGAAAAGTTTTTTGCCTAATAAACCGAGCTTCTTGGGCCGTTGCTTGCGGTTT
AACCGGTCCGGTATGCAGGAGATTTCTAGAGGAATTGGGTCATTGACACGTGGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAGTTGTTGTTCGAGCCCCTCCCACCGGTGCCGACATCTTCAACTTTGGTAGCCCTTGCTCCTCCCATTATCTTTCTGCTCATTCTACTCCCTTCTCCTCCCTTAG
TGCTCCCACAAGCCCCTCTTCTCTTGGCTTCAACTTCTTCCGCCTCGACAACGATGTCGACGTTCCAATCGGCTCTCCCTCTTCTGTTCCCTTCGGCTGGGAGGAGAAGC
CTGGCATCCCCAAGTCCCCCGATTGCGCCACCAGTAGTACTGATCATGATTTTGAATTTCATTGTTCCCGCCACTCCTTCTTCTCTAAGCCTTCCCTCTCCGCCGATGAG
CTCTTCCATGCCGGCAAGATCAAGCCGCTCAAACCGCCGCCCGGATTTCAGTCGAACGTGTCGTCGTCGAGATCGCCGCACAATCTGAGGCTATCGCCTCGGAAAACCAA
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AACCGGTCCGGTATGCAGGAGATTTCTAGAGGAATTGGGTCATTGACACGTGGATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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LFHAGKIKPLKPPPGFQSNVSSSRSPHNLRLSPRKTKSNIDTKNINDDPFEAALVKETHRHRSNYELIDSNNNNEIIRGRTDKISYISSNFARKQTRSLSPFRLSSESTL
HGDSARKSKSSSFLSAISFSKTNRKWRLRDLLFRSASEGRATEKADKLRSTYVVMSEKLDDDVKISSFRSEDSGGPRMRFTAANRAVSEELKKKSFLPNKPSFLGRCLRF
NRSGMQEISRGIGSLTRG