; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Chy11G193280 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChy11G193280
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionRING-H2 finger protein ATL18-like
Genome locationchrH11:10279521..10279897
RNA-Seq ExpressionChy11G193280
SyntenyChy11G193280
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0047798.1 RING-H2 finger protein ATL18-like [Cucumis melo var. makuwa]7.34e-3684.81Show/hide
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TYK01060.1 RING-H2 finger protein ATL18-like [Cucumis melo var. makuwa]5.99e-3583.54Show/hide
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XP_022944066.1 RING-H2 finger protein ATL18-like [Cucurbita moschata]1.74e-1156Show/hide
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XP_023512248.1 RING-H2 finger protein ATL18-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.45e-1156Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KFW5 RING-type domain-containing protein2.4e-3193.59Show/hide
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A0A5A7TXY0 RING-H2 finger protein ATL18-like1.0e-2684.81Show/hide
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A0A5D3BPT9 RING-H2 finger protein ATL18-like5.1e-2683.54Show/hide
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        MRFPILFF+TFLWIPLFR+ QAILGVVATVFG P SSP+HGTD++VVRSYDED GGSSEEICSICLTEFGRS DS+  L
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A0A6J1FTE6 RING-H2 finger protein ATL18-like6.3e-0854.05Show/hide
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        I+FFNTF+WIPLFR+ +AILG VA+VF    LP      G   L+VR Y+E     D    EE+CSICLTEF R
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A0A6J1G855 E3 ubiquitin-protein ligase ATL41-like5.9e-0650.62Show/hide
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        I FFNT++WIPL R+  AI+G V +VF L   P S    G   L+VR Y+E    D  + EEICSICL EF R GDS+ +L
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCGATTCCCCATCCTTTTCTTCAACACTTTCCTGTGGATTCCGCTTTTTCGTATCAATCAAGCCATTCTGGGCGTGGTGGCTACTGTTTTTGGCCTGCCCTCCTCCTC
CCCAGAACATGGAACCGACGTTCTGGTGGTGAGGTCATACGATGAGGATGGAGGATCCTCAGAGGAGATTTGCTCCATCTGTTTGACAGAGTTTGGTAGATCAGGAGATT
CGATGCTTCTTCTTCTTCGAAGACAACCACAAGTTGGACACCAAGTGGAGCTTCCTCGTCCCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCGATTCCCCATCCTTTTCTTCAACACTTTCCTGTGGATTCCGCTTTTTCGTATCAATCAAGCCATTCTGGGCGTGGTGGCTACTGTTTTTGGCCTGCCCTCCTCCTC
CCCAGAACATGGAACCGACGTTCTGGTGGTGAGGTCATACGATGAGGATGGAGGATCCTCAGAGGAGATTTGCTCCATCTGTTTGACAGAGTTTGGTAGATCAGGAGATT
CGATGCTTCTTCTTCTTCGAAGACAACCACAAGTTGGACACCAAGTGGAGCTTCCTCGTCCCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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