; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Chy11G194580 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChy11G194580
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationchrH11:12206529..12207205
RNA-Seq ExpressionChy11G194580
SyntenyChy11G194580
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR040358 - Uncharacterized protein At4g22758-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6606010.1 hypothetical protein SDJN03_03327, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.06e-11088.24Show/hide
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XP_004145782.1 uncharacterized protein At4g22758 [Cucumis sativus]6.98e-12397.86Show/hide
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XP_008458628.1 PREDICTED: uncharacterized protein At4g22758 [Cucumis melo]4.01e-12096.81Show/hide
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XP_022958439.1 uncharacterized protein At4g22758 [Cucurbita moschata]2.06e-11088.24Show/hide
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XP_038902782.1 uncharacterized protein At4g22758 [Benincasa hispida]3.59e-11392.51Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KES9 Uncharacterized protein2.5e-9397.86Show/hide
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A0A1S3C8V7 uncharacterized protein At4g227583.1e-9196.81Show/hide
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A0A5A7SQA1 Uncharacterized protein3.1e-9196.81Show/hide
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A0A6J1H539 uncharacterized protein At4g227588.1e-8488.24Show/hide
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A0A6J1K3Z9 uncharacterized protein At4g22758-like1.8e-8388.24Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q56XJ7 Uncharacterized protein At4g227581.3e-0930.92Show/hide
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           V +Y KEGR P L     SAF+LH S FS++ L K E +  LGSR+F++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G27830.1 unknown protein3.3e-4557.07Show/hide
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        +SHR+ KL+EK+ SFHG   +P      LRRPKT PEL S    G S + P ++   PR+TKLLLNVT+QGSLG VQ+++SPE TV+DL+ A VRQY+KE
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         RRP LP ++PS FDLHYSQFSLES+ ++EKLI+LGSRNFFLC RK +    +    SS SCSKEA++ AK  + F W KF+ F
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AT4G22758.1 unknown protein9.1e-1130.92Show/hide
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        P+   HR G+     + S   G   E  TK    L R +++     P LL+  +   S+            K++++V ++GS GPV+ ++     V + +
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Query:  SATVRQYLKEGRRPILPTADPSAFDLHYSQFSLESLNKEEKLIALGSRNFFL
           V +Y KEGR P L     SAF+LH S FS++ L K E +  LGSR+F++
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AT5G37730.1 unknown protein1.8e-0628.24Show/hide
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        KLL++V + GS+GP++ L + +  V+  ++ T++ Y ++GR P+L   D   F  +       +L+ +EK+ ++   NF +C ++
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GTCAGACGATAACAACGATTTAATCGCTTCTTCTTCATCTTCTTCGTGCTCGAAAGAAGCTAAAGAAAGCGCGAAGAGTTCCAGCAGTTTCAGTTGGTTCAAATTCATCG
ATTTCCGGATTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCCGAACCCTAGGTCTCACAGGAAGGGGAAGCTTGCGGAGAAGTCGTCTTCGTTCCATGGAGAGAGTCCGACTAAGACGGCAGCGATGCTTCGGAGGCCGAAGACGGA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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