; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Chy11G194930 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChy11G194930
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionE3 ubiquitin-protein ligase RHF1A
Genome locationchrH11:12515349..12517851
RNA-Seq ExpressionChy11G194930
SyntenyChy11G194930
Gene Ontology termsGO:0009561 - megagametogenesis (biological process)
GO:0010498 - proteasomal protein catabolic process (biological process)
GO:0016567 - protein ubiquitination (biological process)
GO:0051726 - regulation of cell cycle (biological process)
GO:0055046 - microgametogenesis (biological process)
GO:0004842 - ubiquitin-protein transferase activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0033417.1 E3 ubiquitin-protein ligase RHF1A [Cucumis melo var. makuwa]6.82e-19396.66Show/hide
Query:  SQRSDECPICCQLLVLKDPVGQQLLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHSEDSDFDDLIMQHLAAAASRARYVQRRERQRHFGVGPSQ
        SQRSDECPICCQLL LKDPVGQ+LLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHS+DSDFDDLIMQHLAAAASRARYV RRERQRHFGVGPSQ
Subjt:  SQRSDECPICCQLLVLKDPVGQQLLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHSEDSDFDDLIMQHLAAAASRARYVQRRERQRHFGVGPSQ

Query:  VSSACPEVPMSPRFQDATLTSPNSDSPSPSSPMPSVGRTGINKISPSVILLPDTPSGSQQKTNQSEGLSFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQGIKEKL
        V+SACPEVPMSPRFQDATLTSPNSDSPSP SPMPSVG+TGINKISPSVILLPDTPSGSQQKTNQSEGLSFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQGIKEKL
Subjt:  VSSACPEVPMSPRFQDATLTSPNSDSPSPSSPMPSVGRTGINKISPSVILLPDTPSGSQQKTNQSEGLSFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQGIKEKL

Query:  LARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDLTSKRNTGSVSFFSCSGGTSNSLKGKNVVQESAVTDGSVKINRICTGSPSQVSPTVPGSVKVSLAQ
        LARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDLTSKRNTGSVSFFSC GGTSNSLKGKNVVQESA TDGSVKINRICTGSPSQVSPTVPGSV+VSLAQ
Subjt:  LARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDLTSKRNTGSVSFFSCSGGTSNSLKGKNVVQESAVTDGSVKINRICTGSPSQVSPTVPGSVKVSLAQ

XP_004149264.1 E3 ubiquitin-protein ligase RHF1A [Cucumis sativus]6.72e-19798.33Show/hide
Query:  SQRSDECPICCQLLVLKDPVGQQLLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHSEDSDFDDLIMQHLAAAASRARYVQRRERQRHFGVGPSQ
        SQRSDECPICCQLLVLKDPVGQ+LLAAMASERLLKSR LSSAASTSL FHENFDFDHDSVHS+DSDFDDLIMQHLAAAASRARYVQRRERQRHFGVGPSQ
Subjt:  SQRSDECPICCQLLVLKDPVGQQLLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHSEDSDFDDLIMQHLAAAASRARYVQRRERQRHFGVGPSQ

Query:  VSSACPEVPMSPRFQDATLTSPNSDSPSPSSPMPSVGRTGINKISPSVILLPDTPSGSQQKTNQSEGLSFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQGIKEKL
        VSSACPEVPMSPRFQDATLTSPNSDSPSPSSPMPSVGRTGINKISPSVILLPDTPSGSQQKTNQSEGLSFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQGIKEKL
Subjt:  VSSACPEVPMSPRFQDATLTSPNSDSPSPSSPMPSVGRTGINKISPSVILLPDTPSGSQQKTNQSEGLSFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQGIKEKL

Query:  LARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDLTSKRNTGSVSFFSCSGGTSNSLKGKNVVQESAVTDGSVKINRICTGSPSQVSPTVPGSVKVSLAQ
        LARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDLTSKRNTGSVSFFSCSGGTSNSLKGKNVVQESAVTDGSVKINRICTGSPSQVSPTVP SVKVSLAQ
Subjt:  LARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDLTSKRNTGSVSFFSCSGGTSNSLKGKNVVQESAVTDGSVKINRICTGSPSQVSPTVPGSVKVSLAQ

XP_008458566.1 PREDICTED: E3 ubiquitin-protein ligase RHF1A [Cucumis melo]4.23e-19296.66Show/hide
Query:  SQRSDECPICCQLLVLKDPVGQQLLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHSEDSDFDDLIMQHLAAAASRARYVQRRERQRHFGVGPSQ
        SQRSDECPICCQLL LKDPVGQ+LLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHS+DSDFDDLIMQHLAAAASRARYV RRERQRHFGVGPSQ
Subjt:  SQRSDECPICCQLLVLKDPVGQQLLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHSEDSDFDDLIMQHLAAAASRARYVQRRERQRHFGVGPSQ

Query:  VSSACPEVPMSPRFQDATLTSPNSDSPSPSSPMPSVGRTGINKISPSVILLPDTPSGSQQKTNQSEGLSFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQGIKEKL
        V+SACPEVPMSPRFQDATLTSPNSDSPSP SPMPSVG+TGINKISPSVILLPDTPSGSQQKTNQSEGLSFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQGIKEKL
Subjt:  VSSACPEVPMSPRFQDATLTSPNSDSPSPSSPMPSVGRTGINKISPSVILLPDTPSGSQQKTNQSEGLSFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQGIKEKL

Query:  LARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDLTSKRNTGSVSFFSCSGGTSNSLKGKNVVQESAVTDGSVKINRICTGSPSQVSPTVPGSVKVSLAQ
        LARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDLTSKRNTGSVSFFSC GGTSNSLKGKNVVQESA TDGSVKINRICTGSPSQVSPTVPGSV+VSLAQ
Subjt:  LARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDLTSKRNTGSVSFFSCSGGTSNSLKGKNVVQESAVTDGSVKINRICTGSPSQVSPTVPGSVKVSLAQ

XP_023006440.1 E3 ubiquitin-protein ligase RHF1A isoform X1 [Cucurbita maxima]1.33e-16384.64Show/hide
Query:  SQRSDECPICCQLLVLKDPVGQQLLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHSEDSDFDDLIMQHLAAAASRARYVQRRERQRHFGVGPSQ
        SQRS+ECPICCQLLVL+DPVGQ+LLAA+ASE+LLKSRSLSS ASTSLRFHENFD DHDS HS+DSDFDDLIMQHLAAAASRARYV RRERQRHFG+GPSQ
Subjt:  SQRSDECPICCQLLVLKDPVGQQLLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHSEDSDFDDLIMQHLAAAASRARYVQRRERQRHFGVGPSQ

Query:  VSSACPE------VPMSPRFQDATLTSPNSDSPSPSSPMPSVGRTGINKISPSVILLPDTPSGSQQKTNQSEGLSFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQ
          SACPE       P+SPRFQDATL+SPNSDSPSP SP+ S GRTGI+KISP V LL +T SGSQQKTNQ EGLSF DSIKSKWSATSAKYKESI RSTQ
Subjt:  VSSACPE------VPMSPRFQDATLTSPNSDSPSPSSPMPSVGRTGINKISPSVILLPDTPSGSQQKTNQSEGLSFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQ

Query:  GIKEKLLARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDLTSKRNTGSVSFFSCSGGTSNSLKGKNVV-QESAVTDGSVKINRICTGSPSQVSPTVPGSV
        GIKEKLLARNSSVKELS+GVKREVSAGIAGVARMIDRLDL+SKRN  SVSFFSCSGGTSNS+KGKNVV QES VTDGSVK +RICTGSPS VSPTVPGSV
Subjt:  GIKEKLLARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDLTSKRNTGSVSFFSCSGGTSNSLKGKNVV-QESAVTDGSVKINRICTGSPSQVSPTVPGSV

Query:  KVSLAQ
          SLAQ
Subjt:  KVSLAQ

XP_038906575.1 E3 ubiquitin-protein ligase RHF1A [Benincasa hispida]1.69e-17590.67Show/hide
Query:  SQRSDECPICCQLLVLKDPVGQQLLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHSEDSDFDDLIMQHLAAAASRARYVQRRERQRHFGVGPSQ
        SQRS+ECPICCQLLVLKDPVGQ+LLAA+ASERLLK RSLSSAASTSLRFHENFD DHDS HS+DSDFDDLIMQHLAAAASRARYV RRERQRHFG+GPSQ
Subjt:  SQRSDECPICCQLLVLKDPVGQQLLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHSEDSDFDDLIMQHLAAAASRARYVQRRERQRHFGVGPSQ

Query:  VSSACPE-VPMSPRFQDATLTSPNSDSPSPSSPMPSVGRTGINKISPSVILLPDTPSGSQQKTNQSEGLSFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQGIKEK
        V SACPE VPMSPRFQDATL SPNSDSPSP SP+ SVG+TG +KIS SVILLP  PSGS QKTNQSEGLSF DSIKSKWSATSAKYKESILRSTQGIKEK
Subjt:  VSSACPE-VPMSPRFQDATLTSPNSDSPSPSSPMPSVGRTGINKISPSVILLPDTPSGSQQKTNQSEGLSFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQGIKEK

Query:  LLARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDLTSKRNTGSVSFFSCSGGTSNSLKGKNVVQESAVTDGSVKINRICTGSPSQVSPTVPGSVKVSLAQ
        LLARNSS+KELS+GVKREVSAGIAGVARMIDRLDLTSKRNTGSVSFFS SGGTSNSLKGKNVVQESAVTDGSVKI+RICTGSPSQVSPTVPGSV+VSLAQ
Subjt:  LLARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDLTSKRNTGSVSFFSCSGGTSNSLKGKNVVQESAVTDGSVKINRICTGSPSQVSPTVPGSVKVSLAQ

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KDQ6 RING-type domain-containing protein1.3e-15398.33Show/hide
Query:  SQRSDECPICCQLLVLKDPVGQQLLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHSEDSDFDDLIMQHLAAAASRARYVQRRERQRHFGVGPSQ
        SQRSDECPICCQLLVLKDPVGQ+LLAAMASERLLKSR LSSAASTSL FHENFDFDHDSVHS+DSDFDDLIMQHLAAAASRARYVQRRERQRHFGVGPSQ
Subjt:  SQRSDECPICCQLLVLKDPVGQQLLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHSEDSDFDDLIMQHLAAAASRARYVQRRERQRHFGVGPSQ

Query:  VSSACPEVPMSPRFQDATLTSPNSDSPSPSSPMPSVGRTGINKISPSVILLPDTPSGSQQKTNQSEGLSFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQGIKEKL
        VSSACPEVPMSPRFQDATLTSPNSDSPSPSSPMPSVGRTGINKISPSVILLPDTPSGSQQKTNQSEGLSFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQGIKEKL
Subjt:  VSSACPEVPMSPRFQDATLTSPNSDSPSPSSPMPSVGRTGINKISPSVILLPDTPSGSQQKTNQSEGLSFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQGIKEKL

Query:  LARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDLTSKRNTGSVSFFSCSGGTSNSLKGKNVVQESAVTDGSVKINRICTGSPSQVSPTVPGSVKVSLAQ
        LARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDLTSKRNTGSVSFFSCSGGTSNSLKGKNVVQESAVTDGSVKINRICTGSPSQVSPTVP SVKVSLAQ
Subjt:  LARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDLTSKRNTGSVSFFSCSGGTSNSLKGKNVVQESAVTDGSVKINRICTGSPSQVSPTVPGSVKVSLAQ

A0A1S3C9D8 E3 ubiquitin-protein ligase RHF1A5.1e-15096.66Show/hide
Query:  SQRSDECPICCQLLVLKDPVGQQLLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHSEDSDFDDLIMQHLAAAASRARYVQRRERQRHFGVGPSQ
        SQRSDECPICCQLL LKDPVGQ+LLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHS+DSDFDDLIMQHLAAAASRARYV RRERQRHFGVGPSQ
Subjt:  SQRSDECPICCQLLVLKDPVGQQLLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHSEDSDFDDLIMQHLAAAASRARYVQRRERQRHFGVGPSQ

Query:  VSSACPEVPMSPRFQDATLTSPNSDSPSPSSPMPSVGRTGINKISPSVILLPDTPSGSQQKTNQSEGLSFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQGIKEKL
        V+SACPEVPMSPRFQDATLTSPNSDSPSP SPMPSVG+TGINKISPSVILLPDTPSGSQQKTNQSEGLSFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQGIKEKL
Subjt:  VSSACPEVPMSPRFQDATLTSPNSDSPSPSSPMPSVGRTGINKISPSVILLPDTPSGSQQKTNQSEGLSFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQGIKEKL

Query:  LARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDLTSKRNTGSVSFFSCSGGTSNSLKGKNVVQESAVTDGSVKINRICTGSPSQVSPTVPGSVKVSLAQ
        LARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDLTSKRNTGSVSFFSC GGTSNSLKGKNVVQESA TDGSVKINRICTGSPSQVSPTVPGSV+VSLAQ
Subjt:  LARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDLTSKRNTGSVSFFSCSGGTSNSLKGKNVVQESAVTDGSVKINRICTGSPSQVSPTVPGSVKVSLAQ

A0A5A7SVT0 E3 ubiquitin-protein ligase RHF1A5.1e-15096.66Show/hide
Query:  SQRSDECPICCQLLVLKDPVGQQLLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHSEDSDFDDLIMQHLAAAASRARYVQRRERQRHFGVGPSQ
        SQRSDECPICCQLL LKDPVGQ+LLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHS+DSDFDDLIMQHLAAAASRARYV RRERQRHFGVGPSQ
Subjt:  SQRSDECPICCQLLVLKDPVGQQLLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHSEDSDFDDLIMQHLAAAASRARYVQRRERQRHFGVGPSQ

Query:  VSSACPEVPMSPRFQDATLTSPNSDSPSPSSPMPSVGRTGINKISPSVILLPDTPSGSQQKTNQSEGLSFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQGIKEKL
        V+SACPEVPMSPRFQDATLTSPNSDSPSP SPMPSVG+TGINKISPSVILLPDTPSGSQQKTNQSEGLSFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQGIKEKL
Subjt:  VSSACPEVPMSPRFQDATLTSPNSDSPSPSSPMPSVGRTGINKISPSVILLPDTPSGSQQKTNQSEGLSFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQGIKEKL

Query:  LARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDLTSKRNTGSVSFFSCSGGTSNSLKGKNVVQESAVTDGSVKINRICTGSPSQVSPTVPGSVKVSLAQ
        LARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDLTSKRNTGSVSFFSC GGTSNSLKGKNVVQESA TDGSVKINRICTGSPSQVSPTVPGSV+VSLAQ
Subjt:  LARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDLTSKRNTGSVSFFSCSGGTSNSLKGKNVVQESAVTDGSVKINRICTGSPSQVSPTVPGSVKVSLAQ

A0A6J1H5S5 E3 ubiquitin-protein ligase RHF1A isoform X11.4e-12683.66Show/hide
Query:  SQRSDECPICCQLLVLKDPVGQQLLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHSEDSDFDDLIMQHLAAAASRARYVQRRERQRHFGVGPSQ
        SQRS+ECPICCQLLVL+DPVGQ+LLAA+A+E+LLKSRSLSS ASTSLRFHENFD DHDS  S+DSDFDDLIMQHLAAAASRARYV RRERQR FG+GPSQ
Subjt:  SQRSDECPICCQLLVLKDPVGQQLLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHSEDSDFDDLIMQHLAAAASRARYVQRRERQRHFGVGPSQ

Query:  VSSACPE------VPMSPRFQDATLTSPNSDSPSPSSPMPSVGRTGINKISPSVILLPDTPSGSQQKTNQSEGLSFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQ
         +SACPE       P+SPRFQDA+L+SPNSDSPSP SP+ S GRTGI+KISP V LL +T SGSQQKTNQSEGLSF DSIKSKWSATSAKYKESI RSTQ
Subjt:  VSSACPE------VPMSPRFQDATLTSPNSDSPSPSSPMPSVGRTGINKISPSVILLPDTPSGSQQKTNQSEGLSFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQ

Query:  GIKEKLLARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDLTSKRNTGSVSFFSCSGGTSNSLKGKNVV-QESAVTDGSVKINRICTGSPSQVSPTVPGSV
        GIKEKLLARNSSVKELS+GVKREVSAGIAGVARMIDRLDL+SKRN  SVSFFSCSGGTSNS+KGKNVV QES VTDGSVK +RICTGSPS VSPTVPGSV
Subjt:  GIKEKLLARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDLTSKRNTGSVSFFSCSGGTSNSLKGKNVV-QESAVTDGSVKINRICTGSPSQVSPTVPGSV

Query:  KVSLAQ
          SLAQ
Subjt:  KVSLAQ

A0A6J1L048 E3 ubiquitin-protein ligase RHF1A isoform X13.2e-12884.64Show/hide
Query:  SQRSDECPICCQLLVLKDPVGQQLLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHSEDSDFDDLIMQHLAAAASRARYVQRRERQRHFGVGPSQ
        SQRS+ECPICCQLLVL+DPVGQ+LLAA+ASE+LLKSRSLSS ASTSLRFHENFD DHDS HS+DSDFDDLIMQHLAAAASRARYV RRERQRHFG+GPSQ
Subjt:  SQRSDECPICCQLLVLKDPVGQQLLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHSEDSDFDDLIMQHLAAAASRARYVQRRERQRHFGVGPSQ

Query:  VSSACPE------VPMSPRFQDATLTSPNSDSPSPSSPMPSVGRTGINKISPSVILLPDTPSGSQQKTNQSEGLSFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQ
          SACPE       P+SPRFQDATL+SPNSDSPSP SP+ S GRTGI+KISP V LL +T SGSQQKTNQ EGLSF DSIKSKWSATSAKYKESI RSTQ
Subjt:  VSSACPE------VPMSPRFQDATLTSPNSDSPSPSSPMPSVGRTGINKISPSVILLPDTPSGSQQKTNQSEGLSFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQ

Query:  GIKEKLLARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDLTSKRNTGSVSFFSCSGGTSNSLKGKNVV-QESAVTDGSVKINRICTGSPSQVSPTVPGSV
        GIKEKLLARNSSVKELS+GVKREVSAGIAGVARMIDRLDL+SKRN  SVSFFSCSGGTSNS+KGKNVV QES VTDGSVK +RICTGSPS VSPTVPGSV
Subjt:  GIKEKLLARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDLTSKRNTGSVSFFSCSGGTSNSLKGKNVV-QESAVTDGSVKINRICTGSPSQVSPTVPGSV

Query:  KVSLAQ
          SLAQ
Subjt:  KVSLAQ

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q4TU14 E3 ubiquitin-protein ligase RHF1A1.7e-4143.86Show/hide
Query:  SQRSDECPICCQLLVLKDPVGQQLLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHSEDSDFDDLIMQHLAAAASRARYVQRRERQRHFGVGPSQ
        SQRS ECPIC QL VL+DP  Q+LLAA+  ERLLK+R++SS++  S+  H + DF  +   S+ S FD+  ++HL  AA R   ++RR+ Q    +  S 
Subjt:  SQRSDECPICCQLLVLKDPVGQQLLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHSEDSDFDDLIMQHLAAAASRARYVQRRERQRHFGVGPSQ

Query:  VSSACP------EVPMSPRFQDATLTSPNSDSPSPS----SPMPSVGRTGI-------NKISPSVILLPDTPSGSQQKTNQSEGLSFQDSIKSKWSATSA
        VSS+ P      ++    R    +     + +P PS    +P P  G + I       ++ISP       +PS S Q     E  S  ++IKSK +A SA
Subjt:  VSSACP------EVPMSPRFQDATLTSPNSDSPSPS----SPMPSVGRTGI-------NKISPSVILLPDTPSGSQQKTNQSEGLSFQDSIKSKWSATSA

Query:  KYKESILRSTQGIKEKLLARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDLTSKRNTGSV---SFFSCSGGTSNSLKGKNVVQES
        KYKESI +S QG+KEKLLARN+SVKELSKGV+RE++AGIAGVARMI+R+D +SKR  GS    +  + + G + S KGK V   S
Subjt:  KYKESILRSTQGIKEKLLARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDLTSKRNTGSV---SFFSCSGGTSNSLKGKNVVQES

Q9ZT42 E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A3.5e-2334.48Show/hide
Query:  QRSDECPICCQLLVLKDPVGQQLLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHSEDSDFDDLIMQHLAAAAS--RARYVQRRERQR-------
        QRS +CP+C Q + LKDP  Q+LL A+  ER  +     +A         +F+  H  V  ++++ ++ I+QHLAAAA+  RAR+  RRE  R       
Subjt:  QRSDECPICCQLLVLKDPVGQQLLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHSEDSDFDDLIMQHLAAAAS--RARYVQRRERQR-------

Query:  --HFGVGPSQVSSAC----PEVPMSPRFQDATLTSPN------------SDSPSPSSPMPSVGRTGINKISPSVI------LLPDTPSGSQQKTNQSEGL
           F V  SQ +++     P +P SP  +D + T  N            S++  P+S  P        ++SPS        L   +PS  Q +   SE  
Subjt:  --HFGVGPSQVSSAC----PEVPMSPRFQDATLTSPN------------SDSPSPSSPMPSVGRTGINKISPSVI------LLPDTPSGSQQKTNQSEGL

Query:  SFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQGIKEKLLARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDL--TSKRNTGSVSFFS--CSGGTSNSLKGKNVVQE
        SF +S+KS+ +A S +YKESI ++T+  K++L +RN+S+ +L   VKREVSAGIA V+RM++RL+    S+ +T SVS  S   +  T+N         E
Subjt:  SFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQGIKEKLLARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDL--TSKRNTGSVSFFS--CSGGTSNSLKGKNVVQE

Query:  SAVTDGSVKINRICTGSPS
         +V +  VK     TGS S
Subjt:  SAVTDGSVKINRICTGSPS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G14220.1 RING-H2 group F1A1.2e-4243.86Show/hide
Query:  SQRSDECPICCQLLVLKDPVGQQLLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHSEDSDFDDLIMQHLAAAASRARYVQRRERQRHFGVGPSQ
        SQRS ECPIC QL VL+DP  Q+LLAA+  ERLLK+R++SS++  S+  H + DF  +   S+ S FD+  ++HL  AA R   ++RR+ Q    +  S 
Subjt:  SQRSDECPICCQLLVLKDPVGQQLLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHSEDSDFDDLIMQHLAAAASRARYVQRRERQRHFGVGPSQ

Query:  VSSACP------EVPMSPRFQDATLTSPNSDSPSPS----SPMPSVGRTGI-------NKISPSVILLPDTPSGSQQKTNQSEGLSFQDSIKSKWSATSA
        VSS+ P      ++    R    +     + +P PS    +P P  G + I       ++ISP       +PS S Q     E  S  ++IKSK +A SA
Subjt:  VSSACP------EVPMSPRFQDATLTSPNSDSPSPS----SPMPSVGRTGI-------NKISPSVILLPDTPSGSQQKTNQSEGLSFQDSIKSKWSATSA

Query:  KYKESILRSTQGIKEKLLARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDLTSKRNTGSV---SFFSCSGGTSNSLKGKNVVQES
        KYKESI +S QG+KEKLLARN+SVKELSKGV+RE++AGIAGVARMI+R+D +SKR  GS    +  + + G + S KGK V   S
Subjt:  KYKESILRSTQGIKEKLLARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDLTSKRNTGSV---SFFSCSGGTSNSLKGKNVVQES

AT5G22000.1 RING-H2 group F2A2.5e-2434.48Show/hide
Query:  QRSDECPICCQLLVLKDPVGQQLLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHSEDSDFDDLIMQHLAAAAS--RARYVQRRERQR-------
        QRS +CP+C Q + LKDP  Q+LL A+  ER  +     +A         +F+  H  V  ++++ ++ I+QHLAAAA+  RAR+  RRE  R       
Subjt:  QRSDECPICCQLLVLKDPVGQQLLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHSEDSDFDDLIMQHLAAAAS--RARYVQRRERQR-------

Query:  --HFGVGPSQVSSAC----PEVPMSPRFQDATLTSPN------------SDSPSPSSPMPSVGRTGINKISPSVI------LLPDTPSGSQQKTNQSEGL
           F V  SQ +++     P +P SP  +D + T  N            S++  P+S  P        ++SPS        L   +PS  Q +   SE  
Subjt:  --HFGVGPSQVSSAC----PEVPMSPRFQDATLTSPN------------SDSPSPSSPMPSVGRTGINKISPSVI------LLPDTPSGSQQKTNQSEGL

Query:  SFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQGIKEKLLARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDL--TSKRNTGSVSFFS--CSGGTSNSLKGKNVVQE
        SF +S+KS+ +A S +YKESI ++T+  K++L +RN+S+ +L   VKREVSAGIA V+RM++RL+    S+ +T SVS  S   +  T+N         E
Subjt:  SFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQGIKEKLLARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDL--TSKRNTGSVSFFS--CSGGTSNSLKGKNVVQE

Query:  SAVTDGSVKINRICTGSPS
         +V +  VK     TGS S
Subjt:  SAVTDGSVKINRICTGSPS

AT5G22000.2 RING-H2 group F2A2.5e-2434.48Show/hide
Query:  QRSDECPICCQLLVLKDPVGQQLLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHSEDSDFDDLIMQHLAAAAS--RARYVQRRERQR-------
        QRS +CP+C Q + LKDP  Q+LL A+  ER  +     +A         +F+  H  V  ++++ ++ I+QHLAAAA+  RAR+  RRE  R       
Subjt:  QRSDECPICCQLLVLKDPVGQQLLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHSEDSDFDDLIMQHLAAAAS--RARYVQRRERQR-------

Query:  --HFGVGPSQVSSAC----PEVPMSPRFQDATLTSPN------------SDSPSPSSPMPSVGRTGINKISPSVI------LLPDTPSGSQQKTNQSEGL
           F V  SQ +++     P +P SP  +D + T  N            S++  P+S  P        ++SPS        L   +PS  Q +   SE  
Subjt:  --HFGVGPSQVSSAC----PEVPMSPRFQDATLTSPN------------SDSPSPSSPMPSVGRTGINKISPSVI------LLPDTPSGSQQKTNQSEGL

Query:  SFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQGIKEKLLARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDL--TSKRNTGSVSFFS--CSGGTSNSLKGKNVVQE
        SF +S+KS+ +A S +YKESI ++T+  K++L +RN+S+ +L   VKREVSAGIA V+RM++RL+    S+ +T SVS  S   +  T+N         E
Subjt:  SFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQGIKEKLLARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDL--TSKRNTGSVSFFS--CSGGTSNSLKGKNVVQE

Query:  SAVTDGSVKINRICTGSPS
         +V +  VK     TGS S
Subjt:  SAVTDGSVKINRICTGSPS

AT5G22000.3 RING-H2 group F2A2.5e-2434.48Show/hide
Query:  QRSDECPICCQLLVLKDPVGQQLLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHSEDSDFDDLIMQHLAAAAS--RARYVQRRERQR-------
        QRS +CP+C Q + LKDP  Q+LL A+  ER  +     +A         +F+  H  V  ++++ ++ I+QHLAAAA+  RAR+  RRE  R       
Subjt:  QRSDECPICCQLLVLKDPVGQQLLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHSEDSDFDDLIMQHLAAAAS--RARYVQRRERQR-------

Query:  --HFGVGPSQVSSAC----PEVPMSPRFQDATLTSPN------------SDSPSPSSPMPSVGRTGINKISPSVI------LLPDTPSGSQQKTNQSEGL
           F V  SQ +++     P +P SP  +D + T  N            S++  P+S  P        ++SPS        L   +PS  Q +   SE  
Subjt:  --HFGVGPSQVSSAC----PEVPMSPRFQDATLTSPN------------SDSPSPSSPMPSVGRTGINKISPSVI------LLPDTPSGSQQKTNQSEGL

Query:  SFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQGIKEKLLARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDL--TSKRNTGSVSFFS--CSGGTSNSLKGKNVVQE
        SF +S+KS+ +A S +YKESI ++T+  K++L +RN+S+ +L   VKREVSAGIA V+RM++RL+    S+ +T SVS  S   +  T+N         E
Subjt:  SFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQGIKEKLLARNSSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDL--TSKRNTGSVSFFS--CSGGTSNSLKGKNVVQE

Query:  SAVTDGSVKINRICTGSPS
         +V +  VK     TGS S
Subjt:  SAVTDGSVKINRICTGSPS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTCTTGATTTTATTTGCTTGATCTTATTTGAATTCCTCATTGAGTCTCAAAGAAGCGATGAGTGCCCAATCTGTTGCCAGTTGCTAGTGTTGAAGGATCCTGTTGG
TCAGCAGCTTCTAGCAGCTATGGCTAGTGAAAGGCTTTTGAAGTCGAGAAGCTTGTCTTCTGCTGCATCTACTTCTTTGCGTTTCCACGAAAACTTCGATTTTGATCATG
ACTCTGTGCACTCGGAGGACTCCGACTTTGATGACCTGATTATGCAGCATCTTGCTGCTGCAGCTAGCAGAGCTCGGTATGTTCAGAGAAGGGAGAGGCAAAGACATTTT
GGAGTTGGGCCTTCACAAGTTTCCTCTGCATGTCCAGAGGTTCCAATGTCACCACGATTTCAAGATGCAACTCTAACTTCACCTAATAGTGATTCACCATCTCCCAGTTC
TCCAATGCCATCGGTTGGCCGAACTGGAATTAATAAAATCTCCCCTAGTGTAATTTTACTACCCGATACACCGTCAGGTAGTCAACAGAAAACAAACCAGTCTGAGGGGC
TCTCTTTCCAAGATTCCATCAAATCCAAATGGTCTGCTACTTCTGCAAAGTACAAGGAGTCAATCTTGCGAAGCACTCAAGGTATTAAGGAGAAACTGCTTGCTCGTAAC
AGCTCAGTCAAGGAGCTAAGCAAGGGAGTAAAGCGTGAAGTTAGTGCTGGGATTGCTGGCGTTGCTCGAATGATCGATCGCCTAGATTTGACTTCGAAAAGGAATACTGG
TTCCGTTTCCTTCTTCAGCTGCAGTGGGGGTACATCAAATTCCTTGAAAGGAAAGAACGTAGTGCAAGAGAGTGCTGTCACTGACGGTTCAGTTAAAATTAATAGAATAT
GTACTGGTTCACCTTCACAAGTTTCCCCAACCGTTCCAGGCTCCGTCAAAGTTTCTTTAGCTCAGAATGCACAATGCGGCAAGCGACGTGTTACAACTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGTCTTGATTTTATTTGCTTGATCTTATTTGAATTCCTCATTGAGTCTCAAAGAAGCGATGAGTGCCCAATCTGTTGCCAGTTGCTAGTGTTGAAGGATCCTGTTGG
TCAGCAGCTTCTAGCAGCTATGGCTAGTGAAAGGCTTTTGAAGTCGAGAAGCTTGTCTTCTGCTGCATCTACTTCTTTGCGTTTCCACGAAAACTTCGATTTTGATCATG
ACTCTGTGCACTCGGAGGACTCCGACTTTGATGACCTGATTATGCAGCATCTTGCTGCTGCAGCTAGCAGAGCTCGGTATGTTCAGAGAAGGGAGAGGCAAAGACATTTT
GGAGTTGGGCCTTCACAAGTTTCCTCTGCATGTCCAGAGGTTCCAATGTCACCACGATTTCAAGATGCAACTCTAACTTCACCTAATAGTGATTCACCATCTCCCAGTTC
TCCAATGCCATCGGTTGGCCGAACTGGAATTAATAAAATCTCCCCTAGTGTAATTTTACTACCCGATACACCGTCAGGTAGTCAACAGAAAACAAACCAGTCTGAGGGGC
TCTCTTTCCAAGATTCCATCAAATCCAAATGGTCTGCTACTTCTGCAAAGTACAAGGAGTCAATCTTGCGAAGCACTCAAGGTATTAAGGAGAAACTGCTTGCTCGTAAC
AGCTCAGTCAAGGAGCTAAGCAAGGGAGTAAAGCGTGAAGTTAGTGCTGGGATTGCTGGCGTTGCTCGAATGATCGATCGCCTAGATTTGACTTCGAAAAGGAATACTGG
TTCCGTTTCCTTCTTCAGCTGCAGTGGGGGTACATCAAATTCCTTGAAAGGAAAGAACGTAGTGCAAGAGAGTGCTGTCACTGACGGTTCAGTTAAAATTAATAGAATAT
GTACTGGTTCACCTTCACAAGTTTCCCCAACCGTTCCAGGCTCCGTCAAAGTTTCTTTAGCTCAGAATGCACAATGCGGCAAGCGACGTGTTACAACTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGLDFICLILFEFLIESQRSDECPICCQLLVLKDPVGQQLLAAMASERLLKSRSLSSAASTSLRFHENFDFDHDSVHSEDSDFDDLIMQHLAAAASRARYVQRRERQRHF
GVGPSQVSSACPEVPMSPRFQDATLTSPNSDSPSPSSPMPSVGRTGINKISPSVILLPDTPSGSQQKTNQSEGLSFQDSIKSKWSATSAKYKESILRSTQGIKEKLLARN
SSVKELSKGVKREVSAGIAGVARMIDRLDLTSKRNTGSVSFFSCSGGTSNSLKGKNVVQESAVTDGSVKINRICTGSPSQVSPTVPGSVKVSLAQNAQCGKRRVTT