; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Chy11G195880 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChy11G195880
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionX8 domain-containing protein
Genome locationchrH11:14239849..14241419
RNA-Seq ExpressionChy11G195880
SyntenyChy11G195880
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
GO:0009506 - plasmodesma (cellular component)
GO:0004553 - hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds (molecular function)
InterPro domainsIPR012946 - X8 domain
IPR044788 - Carbohydrate-binding X8 domain-containing protein, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_038900831.1 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 3-like isoform X1 [Benincasa hispida]3.25e-8086.59Show/hide
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XP_038900832.1 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 3-like isoform X2 [Benincasa hispida]1.44e-8086.59Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S4E1R5 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 5-like5.5e-7393.67Show/hide
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A0A6J1D8X8 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 3-like2.6e-5477.99Show/hide
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A0A6J1FWZ7 major pollen allergen Ole e 10-like4.2e-5779.75Show/hide
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A0A6J1JFA6 major pollen allergen Ole e 10-like1.0e-5881.65Show/hide
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A0A6P3ZWZ3 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 35.3e-5280.43Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O65399 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 13.5e-1644.64Show/hide
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P52409 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase3.1e-1745.1Show/hide
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Query:  PS
         S
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Q84V39 Major pollen allergen Ole e 104.1e-1745.63Show/hide
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        T+ S  P     G   WC+    A+ A LQ  +DY C   G DC  IQ  G C+NPN+VR HASYA NS+YQ K      C+F GT  ITS++PS+G+C 
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Query:  YPS
        + S
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Q9M2K6 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 56.3e-1848.39Show/hide
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        WC+A  +A  ++LQ A+++ACG GGADC  IQ GG C +P  V+  AS+ FN+YY KN     +CNF   A +TS NPS GTC+YPS+  +++
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Q9ZU91 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 37.0e-1743.97Show/hide
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Query:  N----SSGSTVFGAVP
        +    S+ ST  G +P
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09460.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein8.5e-2651.64Show/hide
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        +  P    ++    G SWC+A   ASQ +LQ ALDYACGI  ADCS +Q GG CY+P S++ HAS+AFNSYYQKNP P SC+FGG A + +TNPS+G+C 
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Query:  YPSTSTSSSVL--NTTNSSGST
        Y + S++S+ +   TT  + ST
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AT1G29380.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein5.9e-2750.77Show/hide
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        G   WCIA  +AS  +LQ+ALDYACG GGADC  IQ G  CY PN++RDHAS+AFNSYYQK+P  +SCNFGG A +TST+PS G+C + S+S + S    
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        +  S         S P SS+    +  P+T
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AT2G30933.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein6.7e-3955.92Show/hide
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        +T PS        G  SWC+A ++ ++ ALQ ALDYACGIGGADCS IQ GG CYNPNS+R HAS+AFNSYYQKNP+P+SCNF GTA+  S +PS G+C 
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Query:  YPSTSTSSSVLNTTNSSGSTVFGAVPSGPS---SSSSSSALNFPSTQYFSLF
        +PSTSTS S+LN T+  G  +FG +PS P+    +S+SS+    S  YF  F
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AT2G30933.2 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein2.2e-2963.16Show/hide
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        +T PS        G  SWC+A ++ ++ ALQ ALDYACGIGGADCS IQ GG CYNPNS+R HAS+AFNSYYQKNP+P+SCNF GTA+  S +PS
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AT5G55180.1 O-Glycosyl hydrolases family 17 protein3.3e-2255.56Show/hide
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        G +WC+A+   ++  LQ  LDYACG GGADC  IQ G  CYNP S+  HASYAFNSYYQKN     +CNFGG A + S  P  G CE+P+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CTTATTTACAAATTTTCTTCTTTTTATTGCTTTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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