; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Chy11G200030 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChy11G200030
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionDUF4283 domain-containing protein
Genome locationchrH11:20917786..20918385
RNA-Seq ExpressionChy11G200030
SyntenyChy11G200030
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0047412.1 putative non-LTR retroelement reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa]1.28e-5253.43Show/hide
Query:  MELRTDAGLAVVASAIGKPLSLDLATKERRTLSYARVCVELNIDSPMPVDIT------------------------------------SVEHKALSKEDV
        MEL T+AGLAVVAS +GKPL+LDLATKERR LSYARVCVEL++DS MP +IT                                    SVE K L +E V
Subjt:  MELRTDAGLAVVASAIGKPLSLDLATKERRTLSYARVCVELNIDSPMPVDIT------------------------------------SVEHKALSKEDV

Query:  SN----KKEDLTSVAYGDVVMESFKQLEEGEINSSPMRTIK--EKVIENQNDFTLVARRKKELVSVRNKGKSVEVTMPNSFGSLMELGEGDKWALSIVDG
        S     K+++L S   G VV+ESFKQLE+GEI SSP R     EK ++ +++FTLV R+K+ELVS+R++GKS+EVTMPNSFGSL ++G+ DKWAL+IV+G
Subjt:  SN----KKEDLTSVAYGDVVMESFKQLEEGEINSSPMRTIK--EKVIENQNDFTLVARRKKELVSVRNKGKSVEVTMPNSFGSLMELGEGDKWALSIVDG

Query:  SPPP
        SPPP
Subjt:  SPPP

KAA0049770.1 hypothetical protein E6C27_scaffold76G001230 [Cucumis melo var. makuwa]4.06e-5051.24Show/hide
Query:  MELRTDAGLAVVASAIGKPLSLDLATKERRTLSYARVCVELNIDSPMPVDIT------------------------------------SVEHKALSKEDV
        M+L T+AGLAVVAS +GKP+SLDLA K+R  LSYARVC+EL   S MP +IT                                    SVE K + +E+V
Subjt:  MELRTDAGLAVVASAIGKPLSLDLATKERRTLSYARVCVELNIDSPMPVDIT------------------------------------SVEHKALSKEDV

Query:  SNKKEDLTSVAYGDVVMESFKQLEEGEINSSPMR--TIKEKVIENQNDFTLVARRKKELVSVRNKGKSVEVTMPNSFGSLMELGEGDKWALSIVDGSPPP
         +K + L S   G+VV+ESFKQLEEG+I SSP R  +  EK +   +DFTLV R+K ELVSVR++GKS+EV MPNSFGSL+E+G+ DKW LSI++GSPPP
Subjt:  SNKKEDLTSVAYGDVVMESFKQLEEGEINSSPMR--TIKEKVIENQNDFTLVARRKKELVSVRNKGKSVEVTMPNSFGSLMELGEGDKWALSIVDGSPPP

Query:  L
        L
Subjt:  L

TYK23423.1 DUF4283 domain-containing protein [Cucumis melo var. makuwa]5.98e-5863.37Show/hide
Query:  MELRTDAGLAVVASAIGKPLSLDLATKERRTLSYARVCVELNIDSPMPVDIT---SVEHKALSKEDVSN----KKEDLTSVAYGDVVMESFKQLEEGEIN
        MEL T+AGLAVVASA+GKP++LDLA KERR LSYAR+CVEL++DS MP  IT   SVE K L +E VS     K + L S   G+VV+ESFKQLEEGEI 
Subjt:  MELRTDAGLAVVASAIGKPLSLDLATKERRTLSYARVCVELNIDSPMPVDIT---SVEHKALSKEDVSN----KKEDLTSVAYGDVVMESFKQLEEGEIN

Query:  SSPMRTIK--EKVIENQNDFTLVARRKKELVSVRNKGKSVEVTMPNSFGSLMELGEGDKWALSIVDGSPPPL
        SSP R     EK +   ++FTLV R+K+ELVSVR++GKS+EVTMPNSFGSL+E+G+ +KWAL+I++GSPPPL
Subjt:  SSPMRTIK--EKVIENQNDFTLVARRKKELVSVRNKGKSVEVTMPNSFGSLMELGEGDKWALSIVDGSPPPL

TYK26642.1 uncharacterized protein E5676_scaffold313G002880 [Cucumis melo var. makuwa]5.14e-5057.8Show/hide
Query:  MELRTDAGLAVVASAIGKPLSLDLATKERRTLSYARVCVELNIDSPMPVDIT--------SVEHKALSKEDVSNKKEDLTSVAYGDVVMESFKQLEEGEI
        MEL  +AGLAVVASA+GKP+SLDLATKE R LSYARVCVEL   S MP +IT        +V  + + K  V  K + L S   G+VV+ESFKQLEEGEI
Subjt:  MELRTDAGLAVVASAIGKPLSLDLATKERRTLSYARVCVELNIDSPMPVDIT--------SVEHKALSKEDVSNKKEDLTSVAYGDVVMESFKQLEEGEI

Query:  NSSPMRTIKE--KVIENQNDFTLVARRKKELVSVRNKGKSVEVTMPNSFGSLMELGEGDKWALSIVDGSPPPL
         SSP R   +  K +   ++FTLV R+K +LVSV+++GK  EV MPNSFGSL+E+G+ DKWAL+I++GSPPPL
Subjt:  NSSPMRTIKE--KVIENQNDFTLVARRKKELVSVRNKGKSVEVTMPNSFGSLMELGEGDKWALSIVDGSPPPL

XP_008466769.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103504100 [Cucumis melo]7.80e-4852.2Show/hide
Query:  MELRTDAGLAVVASAIGKPLSLDLATKERRTLSYARVCVELNIDSPMPVDIT------------------------------------SVEHKALSKEDV
        MEL T+AGLAVVASA+GKP+SLDL TKERR LSYARVCVEL   S MP  IT                                    SVE K + +E V
Subjt:  MELRTDAGLAVVASAIGKPLSLDLATKERRTLSYARVCVELNIDSPMPVDIT------------------------------------SVEHKALSKEDV

Query:  SN----KKEDLTSVAYGDVVMESFKQLEEGEINSSPMR--TIKEKVIENQNDFTLVARRKKELVSVRNKGKSVEVTMPNSFGSLMELGEGDKWALSIVDG
              K++ L S   G+VV+ESFKQLEE EI SSP R  +  E+     ++FTLV R+K ELVSVR++GKS+EV MPNSFGSL+E+G+ DKWALSI++G
Subjt:  SN----KKEDLTSVAYGDVVMESFKQLEEGEINSSPMR--TIKEKVIENQNDFTLVARRKKELVSVRNKGKSVEVTMPNSFGSLMELGEGDKWALSIVDG

Query:  SPPPL
        SPPPL
Subjt:  SPPPL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CRZ6 uncharacterized protein LOC1035041003.7e-4052.2Show/hide
Query:  MELRTDAGLAVVASAIGKPLSLDLATKERRTLSYARVCVELNIDSPMPVDIT------------------------------------SVEHKALSKEDV
        MEL T+AGLAVVASA+GKP+SLDL TKERR LSYARVCVEL   S MP  IT                                    SVE K + +E V
Subjt:  MELRTDAGLAVVASAIGKPLSLDLATKERRTLSYARVCVELNIDSPMPVDIT------------------------------------SVEHKALSKEDV

Query:  ----SNKKEDLTSVAYGDVVMESFKQLEEGEINSSPMR--TIKEKVIENQNDFTLVARRKKELVSVRNKGKSVEVTMPNSFGSLMELGEGDKWALSIVDG
              K++ L S   G+VV+ESFKQLEE EI SSP R  +  E+     ++FTLV R+K ELVSVR++GKS+EV MPNSFGSL+E+G+ DKWALSI++G
Subjt:  ----SNKKEDLTSVAYGDVVMESFKQLEEGEINSSPMR--TIKEKVIENQNDFTLVARRKKELVSVRNKGKSVEVTMPNSFGSLMELGEGDKWALSIVDG

Query:  SPPPL
        SPPPL
Subjt:  SPPPL

A0A5A7TVB8 Putative non-LTR retroelement reverse transcriptase1.4e-4453.43Show/hide
Query:  MELRTDAGLAVVASAIGKPLSLDLATKERRTLSYARVCVELNIDSPMPVDIT------------------------------------SVEHKALSKEDV
        MEL T+AGLAVVAS +GKPL+LDLATKERR LSYARVCVEL++DS MP +IT                                    SVE K L +E V
Subjt:  MELRTDAGLAVVASAIGKPLSLDLATKERRTLSYARVCVELNIDSPMPVDIT------------------------------------SVEHKALSKEDV

Query:  S----NKKEDLTSVAYGDVVMESFKQLEEGEINSSPMRTIK--EKVIENQNDFTLVARRKKELVSVRNKGKSVEVTMPNSFGSLMELGEGDKWALSIVDG
        S     K+++L S   G VV+ESFKQLE+GEI SSP R     EK ++ +++FTLV R+K+ELVS+R++GKS+EVTMPNSFGSL ++G+ DKWAL+IV+G
Subjt:  S----NKKEDLTSVAYGDVVMESFKQLEEGEINSSPMRTIK--EKVIENQNDFTLVARRKKELVSVRNKGKSVEVTMPNSFGSLMELGEGDKWALSIVDG

Query:  SPPP
        SPPP
Subjt:  SPPP

A0A5A7U3C2 Exo_endo_phos domain-containing protein/DUF4283 domain-containing protein2.2e-4051.24Show/hide
Query:  MELRTDAGLAVVASAIGKPLSLDLATKERRTLSYARVCVELNIDSPMPVDIT------------------------------------SVEHKALSKEDV
        M+L T+AGLAVVAS +GKP+SLDLA K+R  LSYARVC+EL   S MP +IT                                    SVE K + +E+V
Subjt:  MELRTDAGLAVVASAIGKPLSLDLATKERRTLSYARVCVELNIDSPMPVDIT------------------------------------SVEHKALSKEDV

Query:  SNKKEDLTSVAYGDVVMESFKQLEEGEINSSPMR--TIKEKVIENQNDFTLVARRKKELVSVRNKGKSVEVTMPNSFGSLMELGEGDKWALSIVDGSPPP
         +K + L S   G+VV+ESFKQLEEG+I SSP R  +  EK +   +DFTLV R+K ELVSVR++GKS+EV MPNSFGSL+E+G+ DKW LSI++GSPPP
Subjt:  SNKKEDLTSVAYGDVVMESFKQLEEGEINSSPMR--TIKEKVIENQNDFTLVARRKKELVSVRNKGKSVEVTMPNSFGSLMELGEGDKWALSIVDGSPPP

Query:  L
        L
Subjt:  L

A0A5D3DIK9 DUF4283 domain-containing protein6.9e-4763.37Show/hide
Query:  MELRTDAGLAVVASAIGKPLSLDLATKERRTLSYARVCVELNIDSPMPVDIT---SVEHKALSKEDVS----NKKEDLTSVAYGDVVMESFKQLEEGEIN
        MEL T+AGLAVVASA+GKP++LDLA KERR LSYAR+CVEL++DS MP  IT   SVE K L +E VS     K + L S   G+VV+ESFKQLEEGEI 
Subjt:  MELRTDAGLAVVASAIGKPLSLDLATKERRTLSYARVCVELNIDSPMPVDIT---SVEHKALSKEDVS----NKKEDLTSVAYGDVVMESFKQLEEGEIN

Query:  SSPMR--TIKEKVIENQNDFTLVARRKKELVSVRNKGKSVEVTMPNSFGSLMELGEGDKWALSIVDGSPPPL
        SSP R  +  EK +   ++FTLV R+K+ELVSVR++GKS+EVTMPNSFGSL+E+G+ +KWAL+I++GSPPPL
Subjt:  SSPMR--TIKEKVIENQNDFTLVARRKKELVSVRNKGKSVEVTMPNSFGSLMELGEGDKWALSIVDGSPPPL

A0A5D3DT40 DUF4283 domain-containing protein5.7e-4157.8Show/hide
Query:  MELRTDAGLAVVASAIGKPLSLDLATKERRTLSYARVCVELNIDSPMPVDIT--------SVEHKALSKEDVSNKKEDLTSVAYGDVVMESFKQLEEGEI
        MEL  +AGLAVVASA+GKP+SLDLATKE R LSYARVCVEL   S MP +IT        +V  + + K  V  K + L S   G+VV+ESFKQLEEGEI
Subjt:  MELRTDAGLAVVASAIGKPLSLDLATKERRTLSYARVCVELNIDSPMPVDIT--------SVEHKALSKEDVSNKKEDLTSVAYGDVVMESFKQLEEGEI

Query:  NSSPMRTIKE--KVIENQNDFTLVARRKKELVSVRNKGKSVEVTMPNSFGSLMELGEGDKWALSIVDGSPPPL
         SSP R   +  K +   ++FTLV R+K +LVSV+++GK  EV MPNSFGSL+E+G+ DKWAL+I++GSPPPL
Subjt:  NSSPMRTIKE--KVIENQNDFTLVARRKKELVSVRNKGKSVEVTMPNSFGSLMELGEGDKWALSIVDGSPPPL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGTTGCGGACAGATGCCGGATTGGCTGTTGTTGCTAGTGCTATAGGCAAACCCCTATCCTTAGATCTTGCTACTAAGGAAAGACGCACACTGTCATATGCTCGTGT
TTGTGTTGAACTAAATATAGACAGCCCTATGCCTGTTGATATTACAAGTGTAGAACACAAAGCCCTAAGTAAGGAAGATGTAAGTAATAAAAAGGAAGATCTGACAAGTG
TGGCTTATGGAGATGTGGTGATGGAGTCCTTCAAACAGTTGGAAGAAGGTGAGATTAATAGTTCCCCCATGAGGACTATTAAGGAAAAGGTAATAGAAAATCAGAATGAC
TTTACTCTTGTTGCTAGGAGGAAAAAGGAGCTGGTTTCGGTCCGAAATAAGGGCAAAAGTGTGGAGGTGACTATGCCTAACTCCTTTGGTAGCCTTATGGAGTTGGGTGA
AGGAGACAAGTGGGCATTATCTATAGTGGATGGCTCTCCTCCACCCCTATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGTTGCGGACAGATGCCGGATTGGCTGTTGTTGCTAGTGCTATAGGCAAACCCCTATCCTTAGATCTTGCTACTAAGGAAAGACGCACACTGTCATATGCTCGTGT
TTGTGTTGAACTAAATATAGACAGCCCTATGCCTGTTGATATTACAAGTGTAGAACACAAAGCCCTAAGTAAGGAAGATGTAAGTAATAAAAAGGAAGATCTGACAAGTG
TGGCTTATGGAGATGTGGTGATGGAGTCCTTCAAACAGTTGGAAGAAGGTGAGATTAATAGTTCCCCCATGAGGACTATTAAGGAAAAGGTAATAGAAAATCAGAATGAC
TTTACTCTTGTTGCTAGGAGGAAAAAGGAGCTGGTTTCGGTCCGAAATAAGGGCAAAAGTGTGGAGGTGACTATGCCTAACTCCTTTGGTAGCCTTATGGAGTTGGGTGA
AGGAGACAAGTGGGCATTATCTATAGTGGATGGCTCTCCTCCACCCCTATAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MELRTDAGLAVVASAIGKPLSLDLATKERRTLSYARVCVELNIDSPMPVDITSVEHKALSKEDVSNKKEDLTSVAYGDVVMESFKQLEEGEINSSPMRTIKEKVIENQND
FTLVARRKKELVSVRNKGKSVEVTMPNSFGSLMELGEGDKWALSIVDGSPPPL