; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Chy12G215260 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChy12G215260
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionVQ motif containing protein
Genome locationchrH12:14640887..14642634
RNA-Seq ExpressionChy12G215260
SyntenyChy12G215260
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039611 - VQ motif-containing protein 4/11/13/19/31/33
IPR039827 - VQ motif-containing protein 4/13


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0056997.1 VQ motif-containing protein 4 isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa]8.91e-17199.18Show/hide
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XP_038876999.1 VQ motif-containing protein 4 [Benincasa hispida]1.37e-15990.94Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LV54 VQ domain-containing protein4.2e-13299.18Show/hide
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A0A1S3B685 VQ motif-containing protein 4 isoform X11.2e-13199.18Show/hide
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A0A1S3B6X5 VQ motif-containing protein 4 isoform X27.2e-13297.58Show/hide
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A0A5A7UQT0 VQ motif-containing protein 4 isoform X21.9e-13299.18Show/hide
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A0A6J1KRE6 VQ motif-containing protein 4-like1.3e-10985.32Show/hide
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        ME+SSI Q+NP P     SSLLPSPS+R+++STT+S+STS GL    P  +HLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASV 
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         A    NSDS SKTHIPPIKSLP+RQQSGFKLYERRNS+NKLKINPVFPVFGS  HSGFSPRK EILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSY
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        LKNGN KLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFP+TSPRVPG
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23660 VQ motif-containing protein 135.3e-3147.94Show/hide
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        TR    + Y TTF++ D SSFKQVVQ+LTG P   K  + +  P  P   S     IPPIK++  ++Q S F+L ERRNS+ + L INP         HS
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        G      EIL+P+IL+FPAL LSP TPL+ DPF R G  + S   + +     + +E++IKEKGFYL PSP+TTPRD+EPRLL LFP+T    P
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Q5M750 VQ motif-containing protein 41.2e-5958.75Show/hide
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        ++L+PSP    SN++   +S+S    P      +    TRSES NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  +S+K  P     D   + S   IP
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        PIK++P ++Q     SGF+LYERRNS+  LKINP+ PVF +  +S FSPRK EILSPSILDFP+L LSPVTPLIPDPFDRSG +N S         +  A
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        EEKA+KE+GFYLHPSP TTP D EPRLLPLFP+TSPRV G
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Q9FHZ3 VQ motif-containing protein 331.1e-3142.8Show/hide
Query:  LPSPSARVSNSTTTSTSTSNGLHPQFNHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKSAPG-VPNSDSHSKTHIPPIKSLP
        + +P   +S+        S   H Q  HL            NPYPTTFVQADTS+FKQVVQMLTGS           AP  V N++  S   IPPIK   
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Query:  RRQQSGFKLYERRNS-----------LNKLKINPVFPVFGSGAHSG------FSPR-----KHEILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFDRSGLANC
          + + FKLYERR +           +N L++     +  +G +S       FSPR     ++ +LSPS+LDFP L L SPVTPL    DPF++S     
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Query:  SYLKNGNGKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPLTSP
        S L  GN    +  E+KAI +KGFYLHPSP +TPRDS+P LLPLFP+ SP
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Q9FNP0 VQ motif-containing protein 311.2e-1134.24Show/hide
Query:  TTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKSAPGVPNSDSHSKTHIPPIKSLPRRQQSGFKLYERRNSLN-KLKINPVFPVFGSGAHSGFSPRKHEILS
        TTFVQ DT++F+++VQ LTG  E    A+   A  +       KT I        +++   KL+ERR  +  KL+I      F     +  S   +  L 
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Query:  PSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNGKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPLTSPRVPG
         S +  P+   S ++ +  +P       +C+         + E EEKAIKE+ FYLHPSP + P  +EP LL LFPLTSP   G
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Q9LDZ1 VQ motif-containing protein 193.0e-3445.34Show/hide
Query:  SPPSSLLPSPSARVSNSTTTSTSTSNGLHPQFNHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKSAPGVPNSDSHSKTHIPP
        +PPSS         S+S+ +S+  +  LH   +H+     ITRS+    YPTTFVQAD+SSFKQVVQMLTGS       S +  P  P+   +    IPP
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Query:  IKSLPRRQQSGFKLYERR-------NSLNKLKINPVFPVFGSGAHSGFSPRKHEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKN
        IK+   ++ SG KLYERR       N  N L IN +    G      FSPR  EILSPS LDFP LAL SPVTPL         DPFD+           
Subjt:  IKSLPRRQQSGFKLYERR-------NSLNKLKINPVFPVFGSGAHSGFSPRKHEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKN

Query:  GNGKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPLTSPRV
                 EE+ I +KG+YLH SP +TPRDSEP+LLPLFP+TSPR+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28280.1 VQ motif-containing protein8.6e-6158.75Show/hide
Query:  SSLLPSPSARVSNSTTTSTSTSNGLHPQFNHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQ-ASVKSAPGVPNSD---SHSKTHIP
        ++L+PSP    SN++   +S+S    P      +    TRSES NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  +S+K  P     D   + S   IP
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        PIK++P ++Q     SGF+LYERRNS+  LKINP+ PVF +  +S FSPRK EILSPSILDFP+L LSPVTPLIPDPFDRSG +N S         +  A
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        EEKA+KE+GFYLHPSP TTP D EPRLLPLFP+TSPRV G
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AT1G28280.2 VQ motif-containing protein3.3e-6058.82Show/hide
Query:  SSLLPSPSARVSNSTTTSTSTSNGLHPQFNHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQ-ASVKSAPGVPNSD---SHSKTHIP
        ++L+PSP    SN++   +S+S    P      +    TRSES NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  +S+K  P     D   + S   IP
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Query:  PIKSLPRRQQ-----SGFKLYERRNSLNKLKINPVFPVFGSGAHSGFSPRKHEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNGKLDAEA
        PIK++P ++Q     SGF+LYERRNS+  LKINP+ PVF +  +S FSPRK EILSPSILDFP+L LSPVTPLIPDPFDRSG +N S         +  A
Subjt:  PIKSLPRRQQ-----SGFKLYERRNSLNKLKINPVFPVFGSGAHSGFSPRKHEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNGKLDAEA

Query:  EEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPLTSPRV
        EEKA+KE+GFYLHPSP TTP D EPRLLPLFP+TSPRV
Subjt:  EEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPLTSPRV

AT2G33780.1 VQ motif-containing protein3.8e-3247.94Show/hide
Query:  TRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKSAPGVPNSDSHSKTHIPPIKSLP-RRQQSGFKLYERRNSL-NKLKINPVFPVFGSGAHS
        TR    + Y TTF++ D SSFKQVVQ+LTG P   K  + +  P  P   S     IPPIK++  ++Q S F+L ERRNS+ + L INP         HS
Subjt:  TRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKSAPGVPNSDSHSKTHIPPIKSLP-RRQQSGFKLYERRNSL-NKLKINPVFPVFGSGAHS

Query:  GFSPRKHEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNGKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPLTSPRVP
        G      EIL+P+IL+FPAL LSP TPL+ DPF R G  + S   + +     + +E++IKEKGFYL PSP+TTPRD+EPRLL LFP+T    P
Subjt:  GFSPRKHEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNGKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPLTSPRVP

AT3G15300.1 VQ motif-containing protein2.1e-3545.34Show/hide
Query:  SPPSSLLPSPSARVSNSTTTSTSTSNGLHPQFNHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKSAPGVPNSDSHSKTHIPP
        +PPSS         S+S+ +S+  +  LH   +H+     ITRS+    YPTTFVQAD+SSFKQVVQMLTGS       S +  P  P+   +    IPP
Subjt:  SPPSSLLPSPSARVSNSTTTSTSTSNGLHPQFNHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKSAPGVPNSDSHSKTHIPP

Query:  IKSLPRRQQSGFKLYERR-------NSLNKLKINPVFPVFGSGAHSGFSPRKHEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKN
        IK+   ++ SG KLYERR       N  N L IN +    G      FSPR  EILSPS LDFP LAL SPVTPL         DPFD+           
Subjt:  IKSLPRRQQSGFKLYERR-------NSLNKLKINPVFPVFGSGAHSGFSPRKHEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKN

Query:  GNGKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPLTSPRV
                 EE+ I +KG+YLH SP +TPRDSEP+LLPLFP+TSPR+
Subjt:  GNGKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPLTSPRV

AT5G53830.1 VQ motif-containing protein7.6e-3342.8Show/hide
Query:  LPSPSARVSNSTTTSTSTSNGLHPQFNHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKSAPG-VPNSDSHSKTHIPPIKSLP
        + +P   +S+        S   H Q  HL            NPYPTTFVQADTS+FKQVVQMLTGS           AP  V N++  S   IPPIK   
Subjt:  LPSPSARVSNSTTTSTSTSNGLHPQFNHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKSAPG-VPNSDSHSKTHIPPIKSLP

Query:  RRQQSGFKLYERRNS-----------LNKLKINPVFPVFGSGAHSG------FSPR-----KHEILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFDRSGLANC
          + + FKLYERR +           +N L++     +  +G +S       FSPR     ++ +LSPS+LDFP L L SPVTPL    DPF++S     
Subjt:  RRQQSGFKLYERRNS-----------LNKLKINPVFPVFGSGAHSG------FSPR-----KHEILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFDRSGLANC

Query:  SYLKNGNGKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPLTSP
        S L  GN    +  E+KAI +KGFYLHPSP +TPRDS+P LLPLFP+ SP
Subjt:  SYLKNGNGKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPLTSP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAACCTCTTCAATTCACCAAGATAACCCATCTCCTCCTTCTTCTCTTCTTCCTTCTCCATCCGCTCGCGTCTCCAACAGCACTACCACCAGTACCAGCACCAGCAA
TGGCCTCCACCCTCAATTCAACCACTTACATTCTCCCAAACCCATCACTCGATCCGAATCTGTCAATCCTTACCCCACTACCTTCGTTCAAGCTGATACTTCCTCTTTTA
AACAAGTTGTTCAAATGCTCACTGGATCCCCTGAAACTGCTAAGCAAGCCTCCGTCAAGTCTGCTCCCGGTGTTCCTAACTCTGATTCTCACTCCAAGACGCATATTCCT
CCCATTAAATCTTTGCCCAGAAGGCAGCAATCTGGATTCAAGCTCTATGAGCGTAGGAACTCTTTGAATAAACTTAAAATTAACCCCGTGTTTCCTGTTTTTGGTTCTGG
TGCTCATTCTGGGTTTTCTCCGAGGAAACATGAAATTCTTTCTCCTAGTATTTTGGATTTTCCGGCGCTTGCTCTCAGTCCGGTCACGCCGCTGATTCCTGACCCGTTTG
ATCGATCTGGGTTGGCGAACTGTAGCTATTTGAAGAATGGGAATGGTAAGTTAGATGCCGAGGCGGAAGAGAAAGCGATTAAAGAAAAGGGGTTTTACTTGCATCCATCG
CCGACCACCACTCCTCGGGACTCTGAGCCTCGGTTGTTACCTCTGTTCCCATTGACATCTCCTAGAGTACCAGGATTAGAAAAATTCACCATTGGACATCTGAGACGAGA
TGTGACCCCATCTGAAATTGATTCTGGAAACAGATTTGTACCAGTCAACAAACTTAGGTTAGATGGAAGTGAATCTGGTCAACATCTTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAACCTCTTCAATTCACCAAGATAACCCATCTCCTCCTTCTTCTCTTCTTCCTTCTCCATCCGCTCGCGTCTCCAACAGCACTACCACCAGTACCAGCACCAGCAA
TGGCCTCCACCCTCAATTCAACCACTTACATTCTCCCAAACCCATCACTCGATCCGAATCTGTCAATCCTTACCCCACTACCTTCGTTCAAGCTGATACTTCCTCTTTTA
AACAAGTTGTTCAAATGCTCACTGGATCCCCTGAAACTGCTAAGCAAGCCTCCGTCAAGTCTGCTCCCGGTGTTCCTAACTCTGATTCTCACTCCAAGACGCATATTCCT
CCCATTAAATCTTTGCCCAGAAGGCAGCAATCTGGATTCAAGCTCTATGAGCGTAGGAACTCTTTGAATAAACTTAAAATTAACCCCGTGTTTCCTGTTTTTGGTTCTGG
TGCTCATTCTGGGTTTTCTCCGAGGAAACATGAAATTCTTTCTCCTAGTATTTTGGATTTTCCGGCGCTTGCTCTCAGTCCGGTCACGCCGCTGATTCCTGACCCGTTTG
ATCGATCTGGGTTGGCGAACTGTAGCTATTTGAAGAATGGGAATGGTAAGTTAGATGCCGAGGCGGAAGAGAAAGCGATTAAAGAAAAGGGGTTTTACTTGCATCCATCG
CCGACCACCACTCCTCGGGACTCTGAGCCTCGGTTGTTACCTCTGTTCCCATTGACATCTCCTAGAGTACCAGGATTAGAAAAATTCACCATTGGACATCTGAGACGAGA
TGTGACCCCATCTGAAATTGATTCTGGAAACAGATTTGTACCAGTCAACAAACTTAGGTTAGATGGAAGTGAATCTGGTCAACATCTTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
METSSIHQDNPSPPSSLLPSPSARVSNSTTTSTSTSNGLHPQFNHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKSAPGVPNSDSHSKTHIP
PIKSLPRRQQSGFKLYERRNSLNKLKINPVFPVFGSGAHSGFSPRKHEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNGKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPS
PTTTPRDSEPRLLPLFPLTSPRVPGLEKFTIGHLRRDVTPSEIDSGNRFVPVNKLRLDGSESGQHL