CuGenDBv2

Gene ID	Chy12G220940
Organism	Cucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
Description	Protein of unknown function (DUF1118)
Genome location	chrH12:18799278..18799945
RNA-Seq Expression	Chy12G220940
Synteny	Chy12G220940
Gene Ontology terms	GO:0010027 - thylakoid membrane organization (biological process) GO:0010196 - nonphotochemical quenching (biological process) GO:0045893 - positive regulation of transcription, DNA-templated (biological process) GO:0090391 - granum assembly (biological process) GO:0009515 - granal stacked thylakoid (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR009500 - Protein of unknown function DUF1118

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_004137438.1 uncharacterized protein LOC101204037 [Cucumis sativus]

1.00e-120

98.98

Show/hide

Query:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
        MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMA EKP PSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
Subjt:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL

Query:  SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
        SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
Subjt:  SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN

XP_008451074.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103492437 [Cucumis melo]

2.12e-122

99.49

Show/hide

Query:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
        MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMAAEKPPPSA+KTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
Subjt:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL

Query:  SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
        SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
Subjt:  SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN

XP_022137623.1 uncharacterized protein LOC111009021 [Momordica charantia]

3.85e-103

88.61

Show/hide

Query:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRP-----LHLHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAE
        MEVTSFCSSS R  SF+YSYP  T SR   P     L + SMAAEKP PSAAKTVGSKKIN+TVFPLGEKGPRSSISLSTSP IKLLTRVEQLKLLSKAE
Subjt:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRP-----LHLHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAE

Query:  KAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQR
        KAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQ AVALVS+VGGSAAFAASNLVSNLQR
Subjt:  KAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQR

Query:  SN
        SN
Subjt:  SN

XP_023520287.1 uncharacterized protein LOC111783600 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

7.95e-104

89.39

Show/hide

Query:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMAAEKPPPSAAKTVGS-KKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGL
        MEVTSFC SS RAASF+YSYPS T SR K+ L L SMA +KPPPSAAKTV S KK+N+TVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGL
Subjt:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMAAEKPPPSAAKTVGS-KKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGL

Query:  LSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
        LSAAEKAGLSLSSIEKLG LSKAEELG+LSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPE+SVWEI LQ AVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
Subjt:  LSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN

XP_038893804.1 uncharacterized protein LOC120082623 [Benincasa hispida]

1.07e-110

92.39

Show/hide

Query:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
        MEV+SFCSSS RAASF++SYPS T SR KR LHLHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKIN+TVFPLGEKGPR+SISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
Subjt:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL

Query:  SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
        SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG+LSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVW+I LQV+VALVS+VGGSAAFAASNLVSNLQRSN
Subjt:  SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LQ98 Uncharacterized protein

7.7e-93

98.98

Show/hide

Query:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
        MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMA EKP PSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
Subjt:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL

Query:  SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
        SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
Subjt:  SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN

A0A1S3BQ40 uncharacterized protein LOC103492437

4.1e-94

99.49

Show/hide

Query:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
        MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMAAEKPPPSA+KTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
Subjt:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL

Query:  SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
        SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
Subjt:  SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN

A0A5D3BGQ3 Uncharacterized protein

4.1e-94

99.49

Show/hide

Query:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
        MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMAAEKPPPSA+KTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
Subjt:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL

Query:  SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
        SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
Subjt:  SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN

A0A6J1CAU4 uncharacterized protein LOC111009021

2.2e-79

88.61

Show/hide

Query:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSR-----RKRPLHLHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAE
        MEVTSFCSSS R  SF+YSYP  T SR        PL + SMAAEKP PSAAKTVGSKKIN+TVFPLGEKGPRSSISLSTSP IKLLTRVEQLKLLSKAE
Subjt:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSR-----RKRPLHLHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAE

Query:  KAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQR
        KAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQ AVALVS+VGGSAAFAASNLVSNLQR
Subjt:  KAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQR

Query:  SN
        SN
Subjt:  SN

A0A6J1K230 uncharacterized protein LOC111490350

3.7e-79

85.64

Show/hide

Query:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKR-----PLHLHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAE
        MEV S  +SS RAASFIYSYP  T S+ +      PLH+H+MAAEKPP SA KT+GSKKIN+TVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAE
Subjt:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKR-----PLHLHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAE

Query:  KAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQR
        KAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG+LSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPED+VWEIVLQ A ALVS++GGSAAFAASNLVSNLQR
Subjt:  KAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQR

Query:  SN
        SN
Subjt:  SN

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G74730.1 Protein of unknown function (DUF1118)

3.6e-10

38.84

Show/hide

Query:  IKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATD-PGT-PGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVS
        + +  ++E+ K+LS  EK+GLLS AE  GL+LSS+EKL + SKAE+LG+LS   +  GT P  L S +L  L      V L+P+DS   +V Q  +A   
Subjt:  IKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATD-PGT-PGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVS

Query:  IVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
         + G      S ++  LQ ++
Subjt:  IVGGSAAFAASNLVSNLQRSN

AT5G08050.1 Protein of unknown function (DUF1118)

1.3e-44

63.47

Show/hide

Query:  LHLHSMAAEKPPPSAA-KTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSA
        L +HSMA +KP PSAA +T+ SKK   T                  P +KLLTRVEQLKLL+KAEKAGLLS AEK+G SLS+IE+LGLL+KAEE GVLSA
Subjt:  LHLHSMAAEKPPPSAA-KTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSA

Query:  ATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
        AT+P TPG L +LSLGLLLLGP   Y+VPED  WE+V+QV VAL+S++GGSAAFAAS  VSNLQ+S+
Subjt:  ATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGAGGTCACTTCTTTCTGTAGCAGCAGCACCAGAGCAGCTTCCTTCATCTACTCATATCCTTCCACAACCACTTCAAGAAGAAAACGCCCTCTTCATCTTCAT
TCCATGGCTGCCGAGAAACCTCCCCCTTCCGCCGCTAAAACCGTCGGCTCCAAGAAGATCAACACCACGGTGTTCCCTCTCGGCGAGAAAGGCCCAAGGAGTAGC
ATCTCGCTCTCGACTTCACCGCCGATTAAGCTACTGACGAGGGTGGAGCAATTGAAGTTACTAAGCAAGGCGGAGAAGGCAGGCTTGCTATCTGCGGCGGAGAAG
GCCGGGCTGTCTTTGTCTTCGATTGAGAAATTAGGACTTCTGTCGAAGGCTGAGGAATTGGGGGTTTTATCGGCAGCGACAGATCCAGGAACTCCCGGTGCGTTG
CTGAGTTTAAGCTTAGGGCTGTTGTTGTTAGGGCCTTCATGTGTGTATTTGGTGCCGGAAGATAGTGTTTGGGAAATCGTGTTGCAGGTGGCAGTGGCTCTCGTC
TCCATCGTCGGCGGTTCCGCAGCTTTTGCCGCGTCGAATTTGGTCTCGAATTTGCAGAGATCGAATTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLLSAAEK
AGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN

Chy12G220940 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome