; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Chy1G010160 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChy1G010160
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionSufE domain-containing protein
Genome locationchrH01:10724888..10725916
RNA-Seq ExpressionChy1G010160
SyntenyChy1G010160
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR002634 - BolA protein
IPR003808 - Fe-S metabolism associated domain, SufE-like
IPR036065 - BolA-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8646035.1 hypothetical protein Csa_016708 [Cucumis sativus]6.23e-19897.66Show/hide
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TYJ98710.1 sufE-like protein 1 [Cucumis melo var. makuwa]2.48e-21994.49Show/hide
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XP_004139770.1 sufE-like protein 1, chloroplastic/mitochondrial [Cucumis sativus]1.37e-22997.95Show/hide
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XP_008447788.1 PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: sufE-like protein 1, chloroplastic/mitochondrial [Cucumis melo]1.43e-21894.2Show/hide
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XP_038897655.1 sufE-like protein 1, chloroplastic/mitochondrial [Benincasa hispida]1.63e-20790.94Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K8K1 SufE domain-containing protein1.7e-18097.95Show/hide
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A0A1S3BJ54 LOW QUALITY PROTEIN: sufE-like protein 1, chloroplastic/mitochondrial3.8e-17294.2Show/hide
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A0A5D3BG00 SufE-like protein 11.0e-17294.49Show/hide
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A0A6J1FMC1 sufE-like protein 1, chloroplastic/mitochondrial1.9e-14781.98Show/hide
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A0A6J1J2B6 sufE-like protein 1, chloroplastic/mitochondrial8.6e-14882.85Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P74523 Uncharacterized SufE-like protein slr14197.5e-3250.35Show/hide
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Q12238 UV-induced protein uvi311.1e-1448.35Show/hide
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Q3E793 BolA-like protein 11.4e-1458.21Show/hide
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Q682I1 Protein BOLA1, chloroplastic5.0e-2856.03Show/hide
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        K      +SV  S + +K    S  + +R  R++E L++EL PVEL +ED+SYQHAGHAG++G  D ETHFN+K+VSK FEG +LVKRHRLVY+LL++EL
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         +GLHALSI +KTP E
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Q84W65 SufE-like protein 1, chloroplastic/mitochondrial7.3e-10461.1Show/hide
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        SSC     RL+  + ++ S  H P KT  + P      P  R   I+FQ+  +      S S+S +S   LQPIE+LPPKLQ+IVKLFQSVQ+ +AKYEQ
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        KLMQKKAL L V+ E+ + S  SS  +  S+ + K E+N  +  ++SK      LG    D     SNV  LGSRG RI+E LE+EL+PVEL VED+SYQ
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Query:  HAGHAGVR---GNDGETHFNLKVVSKEFEGKSLVKRHRLVYNLLQDELQSGLHALSISAKTPDEI
        HAGHA VR   G+DGETHFNL++VS  F+GKSLVKRHRL+Y+LLQDEL+SGLHALSI AKTP E+
Subjt:  HAGHAGVR---GNDGETHFNLKVVSKEFEGKSLVKRHRLVYNLLQDELQSGLHALSISAKTPDEI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G55805.1 BolA-like family protein3.6e-2956.03Show/hide
Query:  KPESNTEKSVVDSKLGDKGNQSSNVLGSRGKRIKEILERELNPVELYVEDISYQHAGHAGVRG-NDGETHFNLKVVSKEFEGKSLVKRHRLVYNLLQDEL
        K      +SV  S + +K    S  + +R  R++E L++EL PVEL +ED+SYQHAGHAG++G  D ETHFN+K+VSK FEG +LVKRHRLVY+LL++EL
Subjt:  KPESNTEKSVVDSKLGDKGNQSSNVLGSRGKRIKEILERELNPVELYVEDISYQHAGHAGVRG-NDGETHFNLKVVSKEFEGKSLVKRHRLVYNLLQDEL

Query:  QSGLHALSISAKTPDE
         +GLHALSI +KTP E
Subjt:  QSGLHALSISAKTPDE

AT1G67810.1 sulfur E21.4e-0927.24Show/hide
Query:  SSCGFRLLTTESSIVSHSPKTFFIP---FNSHHFP-----FLRSISFQRFPSKSPSSLSVSASAASSKPLQPIEQLPPKLQDIVKLFQSVQDSRAKYEQL
        +S  F+ L +   I +  P T   P   F S   P        S++    P K+PS  S+ A+ +   PL    +   KL+ +V  F+S+ +   + ++L
Subjt:  SSCGFRLLTTESSIVSHSPKTFFIP---FNSHHFP-----FLRSISFQRFPSKSPSSLSVSASAASSKPLQPIEQLPPKLQDIVKLFQSVQDSRAKYEQL

Query:  MFYGKNLKPLHPQFKNNSNKVEGCVSQVWVRAYLDSDKNVVYEADSDSVLTKGLAALLVQGLSNRPVDEILRV-SPDFVVLLGLQQSLTPSRNNGFLNML
        + Y   L PL    + + N+V GC +QVW+   +D    + ++ADSDS ++KG  + L+  L     +E++ V S D   +         SR N + N+L
Subjt:  MFYGKNLKPLHPQFKNNSNKVEGCVSQVWVRAYLDSDKNVVYEADSDSVLTKGLAALLVQGLSNRPVDEILRV-SPDFVVLLGLQQSLTPSRNNGFLNML

Query:  KLMQKKALALL---VESEKG--------------NGSAVSSSQTDD
          MQK+ + L+   V  ++G              NGS + SS+  D
Subjt:  KLMQKKALALL---VESEKG--------------NGSAVSSSQTDD

AT4G26500.1 chloroplast sulfur E5.2e-10561.1Show/hide
Query:  SSC---GFRLLTTESSIVS--HSP-KTFFI-PFNSHHFPFLRS--ISFQRFPSKSPSSLSVSASAASSKPLQPIEQLPPKLQDIVKLFQSVQDSRAKYEQ
        SSC     RL+  + ++ S  H P KT  + P      P  R   I+FQ+  +      S S+S +S   LQPIE+LPPKLQ+IVKLFQSVQ+ +AKYEQ
Subjt:  SSC---GFRLLTTESSIVS--HSP-KTFFI-PFNSHHFPFLRS--ISFQRFPSKSPSSLSVSASAASSKPLQPIEQLPPKLQDIVKLFQSVQDSRAKYEQ

Query:  LMFYGKNLKPLHPQFKNNSNKVEGCVSQVWVRAYLDSDKNVVYEADSDSVLTKGLAALLVQGLSNRPVDEILRVSPDFVVLLGLQQSLTPSRNNGFLNML
        LMFYGKNL PL  QFK   NKVEGCVSQVWVRA+ D ++NVVYEADSDSVLTKGLAALLV+GLS RPV EILR++PDF VLLGLQQSL+PSRNNG LNML
Subjt:  LMFYGKNLKPLHPQFKNNSNKVEGCVSQVWVRAYLDSDKNVVYEADSDSVLTKGLAALLVQGLSNRPVDEILRVSPDFVVLLGLQQSLTPSRNNGFLNML

Query:  KLMQKKALALLVESEKGNGSAVSSSQTDDSVEKVKPESNTEKSVVDSK------LG----DKGNQSSNV--LGSRGKRIKEILERELNPVELYVEDISYQ
        KLMQKKAL L V+ E+ + S  SS  +  S+ + K E+N  +  ++SK      LG    D     SNV  LGSRG RI+E LE+EL+PVEL VED+SYQ
Subjt:  KLMQKKALALLVESEKGNGSAVSSSQTDDSVEKVKPESNTEKSVVDSK------LG----DKGNQSSNV--LGSRGKRIKEILERELNPVELYVEDISYQ

Query:  HAGHAGVR---GNDGETHFNLKVVSKEFEGKSLVKRHRLVYNLLQDELQSGLHALSISAKTPDEI
        HAGHA VR   G+DGETHFNL++VS  F+GKSLVKRHRL+Y+LLQDEL+SGLHALSI AKTP E+
Subjt:  HAGHAGVR---GNDGETHFNLKVVSKEFEGKSLVKRHRLVYNLLQDELQSGLHALSISAKTPDEI

AT5G17560.1 BolA-like family protein6.5e-0733.94Show/hide
Query:  SVVDSKLGDKGNQSSNVLGSRGKRIKEILERELNPVELYVEDISYQHAGHAGVRGNDGETHFNLKVVSKEFEGKSLVKRHRLVYNLLQDELQSGLHAL-S
        S   S++ D G+    ++ S   +IKE    +LN   + V D+S            DG  H  + VVS  FEG+S V R R+VY  + +ELQ+ +HA+  
Subjt:  SVVDSKLGDKGNQSSNVLGSRGKRIKEILERELNPVELYVEDISYQHAGHAGVRGNDGETHFNLKVVSKEFEGKSLVKRHRLVYNLLQDELQSGLHAL-S

Query:  ISAKTPDEI
        ++ KTP E+
Subjt:  ISAKTPDEI

AT5G50210.1 quinolinate synthase2.2e-1532.39Show/hide
Query:  SSIVSHSP------KTFFIPFNSHH-----FPFLRSISFQRFPSK--SPSSLSVSASAASSKPLQPIEQLPPKLQDIVKLFQSVQDSRAKYEQLMFYGKN
        SS++S +P      +T  + F S        P LRS    +  S+  + S  S+SA A+SS   Q  E +P KLQ +VK F+S+ +   + + ++ Y   
Subjt:  SSIVSHSP------KTFFIPFNSHH-----FPFLRSISFQRFPSK--SPSSLSVSASAASSKPLQPIEQLPPKLQDIVKLFQSVQDSRAKYEQLMFYGKN

Query:  LKPLHPQFKNNSNKVEGCVSQVWVRAYLDSDKNVVYEADSDSVLTKGLAALLVQGLSNRPVDEILRVSPD-----FVVLLGLQQSLTPSRNNGFLNMLKL
        L  +    K  SN+V GC ++VW+ A L  D  + + ADSDS ++KG+ + L+Q L      E++ +  +      V LLG ++    SR N + N+L  
Subjt:  LKPLHPQFKNNSNKVEGCVSQVWVRAYLDSDKNVVYEADSDSVLTKGLAALLVQGLSNRPVDEILRVSPD-----FVVLLGLQQSLTPSRNNGFLNMLKL

Query:  MQKKALALLVESE
        MQKK   L+ E E
Subjt:  MQKKALALLVESE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCATCTTGTGGCTTCCGATTGCTCACTACAGAATCCTCAATTGTTTCTCATTCTCCCAAAACTTTCTTCATCCCCTTTAATTCCCACCATTTCCCTTTTCTT
CGATCCATTTCTTTCCAAAGATTTCCCTCCAAATCCCCGTCTTCACTCTCCGTGTCTGCTTCCGCCGCCTCCTCCAAGCCTCTGCAACCCATTGAACAACTCCCT
CCCAAGCTTCAAGATATCGTCAAGCTCTTTCAATCGGTTCAGGATTCCAGGGCCAAGTACGAGCAGCTCATGTTCTATGGCAAAAACCTCAAACCCCTTCACCCC
CAATTCAAAAACAACTCCAACAAGGTTGAGGGTTGCGTTTCTCAGGTCTGGGTCAGAGCTTATTTGGATTCCGATAAGAACGTTGTTTACGAGGCCGATTCCGAC
TCTGTTCTAACCAAGGGTCTTGCCGCTCTGCTCGTTCAAGGCCTTTCCAATCGTCCTGTGGATGAGATTCTTAGGGTTTCTCCTGATTTCGTTGTTCTTCTTGGC
CTTCAACAGAGCCTTACGCCTTCTAGGAATAATGGGTTTTTGAATATGTTGAAGTTGATGCAGAAGAAGGCGCTTGCGTTGCTTGTGGAATCTGAAAAAGGTAAT
GGCAGTGCGGTTTCATCGTCACAAACAGATGATTCTGTTGAGAAAGTTAAACCAGAATCTAATACTGAGAAATCTGTTGTGGATTCGAAGTTGGGGGATAAAGGA
AATCAAAGTTCTAATGTATTAGGAAGTAGAGGGAAGAGAATAAAGGAGATATTGGAGAGAGAGCTAAATCCGGTGGAATTGTATGTTGAAGACATCTCTTATCAA
CATGCAGGGCATGCTGGGGTAAGGGGTAATGATGGAGAAACTCACTTTAATTTGAAGGTTGTGTCAAAGGAGTTTGAAGGAAAAAGTTTAGTGAAGAGGCACAGG
CTCGTTTATAATCTGTTGCAAGATGAGTTGCAGAGTGGACTCCACGCCTTATCCATCTCAGCAAAGACACCTGATGAAATCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCATCTTGTGGCTTCCGATTGCTCACTACAGAATCCTCAATTGTTTCTCATTCTCCCAAAACTTTCTTCATCCCCTTTAATTCCCACCATTTCCCTTTTCTT
CGATCCATTTCTTTCCAAAGATTTCCCTCCAAATCCCCGTCTTCACTCTCCGTGTCTGCTTCCGCCGCCTCCTCCAAGCCTCTGCAACCCATTGAACAACTCCCT
CCCAAGCTTCAAGATATCGTCAAGCTCTTTCAATCGGTTCAGGATTCCAGGGCCAAGTACGAGCAGCTCATGTTCTATGGCAAAAACCTCAAACCCCTTCACCCC
CAATTCAAAAACAACTCCAACAAGGTTGAGGGTTGCGTTTCTCAGGTCTGGGTCAGAGCTTATTTGGATTCCGATAAGAACGTTGTTTACGAGGCCGATTCCGAC
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CTCGTTTATAATCTGTTGCAAGATGAGTTGCAGAGTGGACTCCACGCCTTATCCATCTCAGCAAAGACACCTGATGAAATCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSCGFRLLTTESSIVSHSPKTFFIPFNSHHFPFLRSISFQRFPSKSPSSLSVSASAASSKPLQPIEQLPPKLQDIVKLFQSVQDSRAKYEQLMFYGKNLKPLHP
QFKNNSNKVEGCVSQVWVRAYLDSDKNVVYEADSDSVLTKGLAALLVQGLSNRPVDEILRVSPDFVVLLGLQQSLTPSRNNGFLNMLKLMQKKALALLVESEKGN
GSAVSSSQTDDSVEKVKPESNTEKSVVDSKLGDKGNQSSNVLGSRGKRIKEILERELNPVELYVEDISYQHAGHAGVRGNDGETHFNLKVVSKEFEGKSLVKRHR
LVYNLLQDELQSGLHALSISAKTPDEI