; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Chy2G024150 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChy2G024150
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationchrH02:1078884..1079354
RNA-Seq ExpressionChy2G024150
SyntenyChy2G024150
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0052545.1 hypothetical protein E6C27_scaffold120G001480 [Cucumis melo var. makuwa]3.14e-8486.96Show/hide
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        KK VV PGGFKSSNN  KNDKGSAFS MLPKGFVPPSGSSPCHNENPQSSSLAFYCHLDRP
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KAG6581427.1 hypothetical protein SDJN03_21429, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.00e-3755.06Show/hide
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        MGFKI S         FFQIS+SLILFFLL S++SS K LP+     + RHRTT+  G+P T      +REVD      +Y++NKL+M I+ NK SKK K
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        KK        +  +N N N+KG+AFS MLPKGFVPPSGSSPCHN++PQSSS AFYCHL
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KAG6594469.1 hypothetical protein SDJN03_11022, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.23e-2847.44Show/hide
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        MGFKI  S  SPNYL +  ISLSLILFFLL S +S+ +PLP    N   + RHRTT+  G+P TT             + + KL+ME             
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                  +N + K +K +AFSAMLPKGFVPPSGSSPCHNENP+   +AFYCHL
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KAG7026467.1 hypothetical protein SDJN02_10467, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.52e-2947.44Show/hide
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        MGFKI  S  SPNYL +  ISLSLILFFLL S++S+ +PLP    N   + RHRTT+  G+P TT             + + KL+ME             
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Query:  VVVLPGGFKSSNNRNKNDKGSAFSAMLPKGFVPPSGSSPCHNENPQSSSLAFYCHL
                  +N + K +K +AFSAMLPKGFVPPSGSSPCHNENP+   +AFYCHL
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KGN49393.1 hypothetical protein Csa_004373 [Cucumis sativus]1.72e-9792.41Show/hide
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        MGFKIPSSFSSPNYLCFFQISLSLILFFLLT TTSSFKPLP HE +NVRHRTTVVHGS ITTLRREVDH HHHHHEYRSNKLEMEI+INKISKK IK+KV
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        VVLPGGFKSSN++NKNDKGSAFSAMLPKGFVPPSGSSPCHNE+PQSSSLAFYCHLDRP
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KIK1 Uncharacterized protein4.9e-7492.41Show/hide
Query:  MGFKIPSSFSSPNYLCFFQISLSLILFFLLTSTTSSFKPLPAHESNNVRHRTTVVHGSPITTLRREVDH-HHHHHEYRSNKLEMEIQINKISKK-IKKKV
        MGFKIPSSFSSPNYLCFFQISLSLILFFLLT TTSSFKPLP HE +NVRHRTTVVHGS ITTLRREVDH HHHHHEYRSNKLEMEI+INKISKK IK+KV
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Query:  VVLPGGFKSSNNRNKNDKGSAFSAMLPKGFVPPSGSSPCHNENPQSSSLAFYCHLDRP
        VVLPGGFKSSN++NKNDKGSAFSAMLPKGFVPPSGSSPCHNE+PQSSSLAFYCHLDRP
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A0A444WWS8 Uncharacterized protein7.2e-0935.25Show/hide
Query:  LILFFLLTSTTSSFKPLPAHESNNVRHRTTVVHGSPITTLRREVDHHHHHHEYRSNKLEME-IQINKISKKIKKKVVVLPGGFKSSNNRNKN--------
        +IL  L +S++SSF       +NN     +    SPI +    +  +H     ++NK + +   I K  + +K+   ++      +NN+NKN        
Subjt:  LILFFLLTSTTSSFKPLPAHESNNVRHRTTVVHGSPITTLRREVDHHHHHHEYRSNKLEME-IQINKISKKIKKKVVVLPGGFKSSNNRNKN--------

Query:  DKGSAFSAMLPKGFVPPSGSSPCHNENPQSSSLAFYCHL
            AFS MLPKGFVPPSGSSPCHN+ P S+  +F+CHL
Subjt:  DKGSAFSAMLPKGFVPPSGSSPCHNENPQSSSLAFYCHL

A0A445I8K3 Uncharacterized protein2.1e-0833.8Show/hide
Query:  SLSLILFFLLTSTTSSFKPLPAHESNNVRHRTTVVHGSPITTLRREVDHHHHHHEY--------RSNKLEMEIQINKISKKIKKKVVVLPGGFKSSNN-R
        +++L + FLL+ T SS        S++  H +T    +P ++      H+H H  +          +K E   +  +I +   K ++++    K   N +
Subjt:  SLSLILFFLLTSTTSSFKPLPAHESNNVRHRTTVVHGSPITTLRREVDHHHHHHEY--------RSNKLEMEIQINKISKKIKKKVVVLPGGFKSSNN-R

Query:  NKNDKGSAFSAMLPKGFVPPSGSSPCHNENPQSSSLAFYCHL
           D   AFS MLPKGFVPPSGSSPCHN+ P S S +F+CHL
Subjt:  NKNDKGSAFSAMLPKGFVPPSGSSPCHNENPQSSSLAFYCHL

A0A5A7UFQ9 Uncharacterized protein7.8e-6486.96Show/hide
Query:  MGFKIPSSF---SSPNYLCFFQISLSLILFFLLTSTTSSFKPLPAHESNNVRHR-TTVVHGSP-ITTLRREVDHHHHHHEYRSNKLEMEIQINKISKKIK
        MGFKIPSSF   SSPNYLCFFQISLSLILFFL+TSTTSSFKPLP HESNNV HR T VVHGS  ITTL REVD HHHH EYRS KLEMEI+INKISKK+K
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Query:  KKVVVLPGGFKSSNNRNKNDKGSAFSAMLPKGFVPPSGSSPCHNENPQSSSLAFYCHLDRP
        KK VV PGGFKSSNN  KNDKGSAFS MLPKGFVPPSGSSPCHNENPQSSSLAFYCHLDRP
Subjt:  KKVVVLPGGFKSSNNRNKNDKGSAFSAMLPKGFVPPSGSSPCHNENPQSSSLAFYCHLDRP

A0A7J6ER19 Uncharacterized protein4.2e-0936.08Show/hide
Query:  LILFFLLTSTTS-SFKPLPAHESNNVRHRTTVVHGSPITTLRREV------------DHHHHHHEY-------RSNKLEME--------IQINKISKKIK
        LILFF++ S++S + KPL     N +   ++ +  SP TT   EV            D ++    Y        +NK+ M         I   K  KK  
Subjt:  LILFFLLTSTTS-SFKPLPAHESNNVRHRTTVVHGSPITTLRREV------------DHHHHHHEY-------RSNKLEME--------IQINKISKKIK

Query:  KKVVVLPGGFKSSNNRNKNDKGSAFSAMLPKGFVPPSGSSPCHNENPQSSSLAFYCHL
        KK   +    K  NN++      +FS MLPKGFVPPSGSSPCHNENP  +S+ F+C L
Subjt:  KKVVVLPGGFKSSNNRNKNDKGSAFSAMLPKGFVPPSGSSPCHNENPQSSSLAFYCHL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G18335.1 unknown protein1.1e-0630.67Show/hide
Query:  FQISLSLILFFLLTSTTSSFKPLPAHESNNVRHRTTVVHGSP------------ITTLRREVDHH------HHHHEYRSNKLEMEIQINKISKKIKKKVV
        F +SL L L FL++ ++SS        S          + SP            I   R + D+H      H ++ Y  + L     ++  +   K    
Subjt:  FQISLSLILFFLLTSTTSSFKPLPAHESNNVRHRTTVVHGSP------------ITTLRREVDHH------HHHHEYRSNKLEMEIQINKISKKIKKKVV

Query:  VLPGGFKSSNNRNKNDKGSAFSAMLPKGFVPPSGSSPCHNENPQSSSLAF
              K +N  N+  +   FS MLPKGFVPPSGSSPCHN+NP S++  F
Subjt:  VLPGGFKSSNNRNKNDKGSAFSAMLPKGFVPPSGSSPCHNENPQSSSLAF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTTTCAAGATTCCCTCTTCATTCTCATCACCAAATTACCTTTGTTTCTTTCAAATCTCTCTCTCTCTCATTCTCTTCTTCCTCCTAACTTCCACCACCTCTTCCTT
TAAACCCCTTCCCGCCCATGAATCAAACAACGTCCGCCACCGTACCACCGTTGTCCATGGCAGCCCAATCACCACACTACGGCGAGAAGTAGATCATCATCATCATCATC
ATGAATACAGAAGCAACAAATTAGAAATGGAGATCCAAATTAACAAGATAAGCAAGAAGATCAAAAAGAAGGTTGTAGTACTTCCGGGCGGGTTTAAAAGCAGTAATAAT
AGAAATAAAAATGATAAAGGAAGTGCTTTCTCTGCAATGCTTCCAAAGGGATTTGTTCCTCCTTCTGGTTCTTCGCCTTGTCATAACGAAAACCCTCAATCTTCATCTCT
TGCTTTTTACTGCCATCTTGATCGCCCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGTTTCAAGATTCCCTCTTCATTCTCATCACCAAATTACCTTTGTTTCTTTCAAATCTCTCTCTCTCTCATTCTCTTCTTCCTCCTAACTTCCACCACCTCTTCCTT
TAAACCCCTTCCCGCCCATGAATCAAACAACGTCCGCCACCGTACCACCGTTGTCCATGGCAGCCCAATCACCACACTACGGCGAGAAGTAGATCATCATCATCATCATC
ATGAATACAGAAGCAACAAATTAGAAATGGAGATCCAAATTAACAAGATAAGCAAGAAGATCAAAAAGAAGGTTGTAGTACTTCCGGGCGGGTTTAAAAGCAGTAATAAT
AGAAATAAAAATGATAAAGGAAGTGCTTTCTCTGCAATGCTTCCAAAGGGATTTGTTCCTCCTTCTGGTTCTTCGCCTTGTCATAACGAAAACCCTCAATCTTCATCTCT
TGCTTTTTACTGCCATCTTGATCGCCCTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGFKIPSSFSSPNYLCFFQISLSLILFFLLTSTTSSFKPLPAHESNNVRHRTTVVHGSPITTLRREVDHHHHHHEYRSNKLEMEIQINKISKKIKKKVVVLPGGFKSSNN
RNKNDKGSAFSAMLPKGFVPPSGSSPCHNENPQSSSLAFYCHLDRP