; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Chy2G024340 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChy2G024340
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionChlorophyll a-b binding protein, chloroplastic
Genome locationchrH02:1173807..1175516
RNA-Seq ExpressionChy2G024340
SyntenyChy2G024340
Gene Ontology termsGO:0009416 - response to light stimulus (biological process)
GO:0009768 - photosynthesis, light harvesting in photosystem I (biological process)
GO:0018298 - protein-chromophore linkage (biological process)
GO:0009522 - photosystem I (cellular component)
GO:0009523 - photosystem II (cellular component)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0016168 - chlorophyll binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001344 - Chlorophyll A-B binding protein, plant and chromista
IPR022796 - Chlorophyll A-B binding protein
IPR023329 - Chlorophyll a/b binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P07370 Chlorophyll a-b binding protein 1B, chloroplastic8.2e-11389.45Show/hide
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P09756 Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic8.2e-11391.24Show/hide
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P27493 Chlorophyll a-b binding protein 21, chloroplastic1.7e-11388.99Show/hide
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P27495 Chlorophyll a-b binding protein 40, chloroplastic1.3e-11390.45Show/hide
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        LA DPEAFAELKVKELKNGR
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AT2G34420.1 photosystem II light harvesting complex gene B1B21.2e-10384.55Show/hide
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        LA DPEAFAELKVKELKNGR
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AT2G34430.1 light-harvesting chlorophyll-protein complex II subunit B19.0e-10785.84Show/hide
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        HSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFS+GGLDYLGNPSLVHAQSILAIWA QV+LMGAVEGYR+AG GPLGE  D +YPGGSFDPLGL
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        A DPEAFAELKVKELKNGR
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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