; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Chy2G025590 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChy2G025590
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionVQ motif-containing protein 4-like
Genome locationchrH02:1906953..1908506
RNA-Seq ExpressionChy2G025590
SyntenyChy2G025590
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039611 - VQ motif-containing protein 4/11/13/19/31/33
IPR039827 - VQ motif-containing protein 4/13


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004134700.1 VQ motif-containing protein 4 [Cucumis sativus]4.90e-14596.38Show/hide
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XP_023543221.1 VQ motif-containing protein 4-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.98e-10384.46Show/hide
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XP_038882910.1 VQ motif-containing protein 4-like [Benincasa hispida]2.75e-12888.69Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KI33 VQ domain-containing protein2.9e-11296.38Show/hide
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A0A1S3B0C2 VQ motif-containing protein 4-like5.1e-10995.05Show/hide
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A0A5D3CP65 VQ motif-containing protein 4-like5.1e-10995.05Show/hide
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A0A6J1EIU9 VQ motif-containing protein 4-like1.1e-7975.68Show/hide
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A0A6J1IR60 VQ motif-containing protein 4-like4.3e-7681.87Show/hide
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        I SPSMLDFPSLV+SPVTPLIPDPFGRSQPLNSEP+NNV SSN GLD EAEAKAIREKGFYLHPSPATTPRESE +LLPLFPITSPPRPG  P
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23660 VQ motif-containing protein 133.5e-3045.11Show/hide
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        P+L LSP TPL+ DPF R    +  P    S S    D++ E ++I+EKGFYL PSP+TTPR++E  LL LFP+T    P   P
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Q5M750 VQ motif-containing protein 43.4e-4651.72Show/hide
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        N+S   S+S+ +      P   +  RS+S NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  S+         PDP   PS   IPPIK++P ++ S+  
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Q9FHZ3 VQ motif-containing protein 333.2e-2841.47Show/hide
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        ++S+ ++  +  Q PPP I +                   +NPYPTTFVQADTS+FKQVVQMLTGS     T K    P P       S   IPPIK   
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          + ++FKLYERR   +N+   N +    ++TLR  N             H  P             +LSPSMLDFP L L SPVTPL    DPF +S P
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        L        S  NS      E KAI +KGFYLHPSP +TPR+S+  LLPLFP+ SP R
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Q9FNP0 VQ motif-containing protein 312.1e-1134.81Show/hide
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        TTFVQ DT++F+++VQ LTG  E     +TP+           +I KR  S  KL+ERR  +   L+++ P   F  + +T    + N   + SP  +  
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        PS + S ++ +  +P           T N+         E E KAI+E+ FYLHPSP + P  +E ELL LFP+TSP   G
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Q9LDZ1 VQ motif-containing protein 193.5e-3044.49Show/hide
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        M+IS +P SS +SS S++  +        I+ RSD    YPTTFVQAD+SSFKQVVQMLTG     SP++ +  +TP       IPPIK+   ++HS  K
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        LYERR      N L N  MIN +        + R +  N  EILSPS LDFP L L SPVTPL         DPF +  PL+                  
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        E + I +KG+YLH SP +TPR+SE +LLPLFP+TSP
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28280.1 VQ motif-containing protein2.4e-4751.72Show/hide
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        N+S   S+S+ +      P   +  RS+S NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  S+         PDP   PS   IPPIK++P ++ S+  
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           F+LYERRN++ NL++  +NPVF    S     +   PEILSPS+LDFPSLVLSPVTPLIPDPF RS   N  P           +  AE KA++E+G
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        FYLHPSPATTP + E  LLPLFP+TSP   G+
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AT1G28280.2 VQ motif-containing protein1.9e-4752.42Show/hide
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        N+S   S+S+ +      P   +  RS+S NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  S+         PDP   PS   IPPIK++P ++ S+  
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        FYLHPSPATTP + E  LLPLFP+TSP
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AT2G33780.1 VQ motif-containing protein2.5e-3145.11Show/hide
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        Y TTF++ D SSFKQVVQ+LTG P+       P  P    IPPIK++  K+Q S+F+L ERRN++ +   INP  +             PEIL+P++L+F
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        P+L LSP TPL+ DPF R    +  P    S S    D++ E ++I+EKGFYL PSP+TTPR++E  LL LFP+T    P   P
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AT3G15300.1 VQ motif-containing protein2.5e-3144.49Show/hide
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Query:  LYERR------NALHNLQMINPVF--ASSVSTLRHNNHNLPEILSPSMLDFPSLVL-SPVTPLIP-------DPFGRSQPLNSEPTNNVSSSNSGLDEEA
        LYERR      N L N  MIN +        + R +  N  EILSPS LDFP L L SPVTPL         DPF +  PL+                  
Subjt:  LYERR------NALHNLQMINPVF--ASSVSTLRHNNHNLPEILSPSMLDFPSLVL-SPVTPLIP-------DPFGRSQPLNSEPTNNVSSSNSGLDEEA

Query:  EAKAIREKGFYLHPSPATTPRESELELLPLFPITSP
        E + I +KG+YLH SP +TPR+SE +LLPLFP+TSP
Subjt:  EAKAIREKGFYLHPSPATTPRESELELLPLFPITSP

AT5G53830.1 VQ motif-containing protein2.3e-2941.47Show/hide
Query:  TSSTSTTTADAFQLPPPKILN---------------RSDSTNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS---PETAKQISTPDP------PSKSPIPPIKSIP
        ++S+ ++  +  Q PPP I +                   +NPYPTTFVQADTS+FKQVVQMLTGS     T K    P P       S   IPPIK   
Subjt:  TSSTSTTTADAFQLPPPKILN---------------RSDSTNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS---PETAKQISTPDP------PSKSPIPPIKSIP

Query:  KRQHSNFKLYERRNALHNLQMINPVFASSVSTLRHNN-------------HNLPE------------ILSPSMLDFPSLVL-SPVTPL--IPDPFGRSQP
          + ++FKLYERR   +N+   N +    ++TLR  N             H  P             +LSPSMLDFP L L SPVTPL    DPF +S P
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Query:  LNSEPTNNVSSSNSGLDEEAEAKAIREKGFYLHPSPATTPRESELELLPLFPITSPPR
        L        S  NS      E KAI +KGFYLHPSP +TPR+S+  LLPLFP+ SP R
Subjt:  LNSEPTNNVSSSNSGLDEEAEAKAIREKGFYLHPSPATTPRESELELLPLFPITSPPR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAAATTTCTCATCCAAATTCCTCCTTCACTTCTTCCACTTCAACCACCACTGCCGATGCCTTTCAACTGCCACCCCCAAAAATCCTTAACAGATCCGATTCC
ACTAATCCATACCCCACCACTTTCGTTCAAGCCGATACCTCTTCCTTTAAACAAGTTGTTCAAATGCTCACCGGCTCCCCGGAAACCGCCAAGCAAATTTCTACA
CCAGACCCTCCTTCTAAATCCCCCATCCCTCCCATTAAATCAATTCCCAAACGCCAACACTCCAATTTCAAGCTCTATGAGCGAAGAAATGCCCTCCATAACCTC
CAAATGATCAACCCTGTTTTTGCCTCCTCTGTTTCTACTCTCAGACATAATAACCATAACCTCCCTGAAATTCTCTCTCCCAGTATGCTGGATTTCCCCTCACTC
GTCCTCAGCCCCGTCACGCCCCTCATTCCCGACCCATTCGGCCGATCACAGCCGTTGAATTCTGAACCGACGAACAATGTCAGTTCTAGTAATTCGGGTTTGGAT
GAAGAAGCAGAGGCTAAAGCCATTAGAGAAAAAGGATTTTATTTGCACCCTTCACCGGCCACCACTCCCAGAGAATCGGAGCTGGAGCTTTTGCCACTATTTCCG
ATCACTTCCCCTCCGCGACCAGGGACTCAGCCATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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ITSPPRPGTQP