; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Chy2G030480 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChy2G030480
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
Descriptiontranscription factor bHLH93
Genome locationchrH02:4839171..4840507
RNA-Seq ExpressionChy2G030480
SyntenyChy2G030480
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_011657932.1 transcription factor bHLH93 isoform X1 [Cucumis sativus]1.74e-23497.95Show/hide
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XP_038882570.1 transcription factor bHLH93-like isoform X2 [Benincasa hispida]3.30e-22393.27Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KG39 BHLH domain-containing protein2.1e-18398.24Show/hide
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A0A1S3B0U8 transcription factor bHLH93 isoform X21.7e-18097.07Show/hide
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A0A1S3B204 transcription factor bHLH93 isoform X14.2e-17996.78Show/hide
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A0A6J1GDE8 transcription factor bHLH93-like isoform X22.1e-16287.39Show/hide
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A0A6J1IPK2 transcription factor bHLH93-like isoform X23.9e-16187.1Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q10S44 Transcription factor BHLH32.1e-5542.86Show/hide
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        MEL +  FL+EL++     S PW +  Y  G           +D    G +  S +    M +S F         P      +F+F       N     G
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          +   +++S T+   TP     V++EE S           ++  L      ++P+     M   G  E +  + G+  +G    +   K+ G PSKNLM
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Query:  AERRRRKRLNDRLSMLRAIVPKISKMDRTSILGDTIDYVKELLERINNLKEEEETGLDSNHVGFLNGI--SKEGKSNEVQVRNSPKFDVE-RKEKETRID
        AERRRRKRLNDRLSMLR+IVPKISKMDRTSILGDTIDYVKEL ERI  L  EEE G+    +  LN +  S  G +NE+ VRNS KFDVE R    TRI+
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Query:  ICCATRPGLLLSTVNTLEALGLEIQQCVISCFNDFSMQASCAEGSAQKAVASSDDIKEALFRNAGYGGKCL
        ICC   PG+LLSTV+ LE LGLEI+QCV+SCF+DF MQASC +   ++ V S+D+IK+ LFR+AGYGG+CL
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Q336V8 Basic helix-loop-helix protein 0042.0e-4556.38Show/hide
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        G PSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLR++VP+ISKMDRTSILGDTI YVKEL++RI NL+ E  TG  S+       +  LN +     S+  +    +RNS
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Query:  PKFDVERKEK-ETRIDICCATRPGLLLSTVNTLEALGLEIQQCVISCFNDFSMQASCAEGSAQKAVA-SSDDIKEALFRNAGYGGKCL
         +F+VER+E   TRI++ CA  P LL ST+  LEALG+EI+QCVISCF+DF+MQASC +   ++ +   +++IK+ LFR+AGYG  CL
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Q9LPW3 Transcription factor SCREAM25.1e-3341.3Show/hide
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        SE   S  + E++      I++S +        ++N   K +G P+KNLMAERRRRK+LNDRL MLR++VPKISKMDR SILGD IDY+KELL+RIN+L 
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Query:  EEEETGLDSNHVGFLNGISKEGKSNEVQVR--------------NSPKFDVERKE-KETRIDICCATRPGLLLSTVNTLEALGLEIQQCVISCFNDFSMQ
         E E+   S+    L+ ++   ++   +V+                P+ +V  +E K   I + C  RPGLLLST+  L+ LGL++QQ VISCFN F++ 
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Query:  ASCAEGSAQKAVASSDDIKEALFRNAGYGG
           AE   +      + IK  L   AGY G
Subjt:  ASCAEGSAQKAVASSDDIKEALFRNAGYGG

Q9LSL1 Transcription factor bHLH931.2e-6647.12Show/hide
Query:  MELS-QHGFLEELLASTPWTS--------SYSNGF----NDFFQNGWNF-------ASFDENPQMGSSTFSNFPTIQTANDFSFADQQLYSNFLEGFAMP
        MELS Q    EELL  T   +        S++ GF    + FF NG+N           DEN  +  S+F +  + Q           L          P
Subjt:  MELS-QHGFLEELLASTPWTS--------SYSNGF----NDFFQNGWNF-------ASFDENPQMGSSTFSNFPTIQTANDFSFADQQLYSNFLEGFAMP

Query:  ELDSSSYTKNNETPPFV-SQEEMSNKNNGYPPVAMEE-EELGFIESETAPSVCKVEMEQMGVREINVSIMGVAELGKRSSNKAKKIEGQPSKNLMAERRR
         L SS+        PF+ + +E+ + ++  PP+ ++  +E  F    + PS     ME    +  +V   G    G+ +  K+KK+EGQPSKNLMAERRR
Subjt:  ELDSSSYTKNNETPPFV-SQEEMSNKNNGYPPVAMEE-EELGFIESETAPSVCKVEMEQMGVREINVSIMGVAELGKRSSNKAKKIEGQPSKNLMAERRR

Query:  RKRLNDRLSMLRAIVPKISKMDRTSILGDTIDYVKELLERINNLKEEEETGLDSN--HVGFLNGISKEGKSNEVQVRNSPKFDVERKEKETRIDICCATR
        RKRLNDRLSMLR+IVPKISKMDRTSILGD IDY+KELL++IN L++EE+   +SN  H   L G  K+  +NE  VRNSPKF+++R++++TR+DICC+ +
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Query:  PGLLLSTVNTLEALGLEIQQCVISCFNDFSMQASCAEGSAQKAVASSDDIKEALFRNAGYGGKCL
        PGLLLSTVNTLE LGLEI+QCVISCF+DFS+QASC+EG+ Q+   +S+DIK+ALFRNAGYGG CL
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Q9LXA9 Transcription factor bHLH612.1e-5847.62Show/hide
Query:  NDFSFADQQLYSNFLEGFAMPELDSSSYTKN--NETPPFVSQEEMSNKNNGYPPVAMEEEELGFIES------ETAPSVCKVEMEQMG----VREINVSI
        ND++F D   ++N L+     +  SSS   N  ++ PP + Q    +      P      +  F+E          P +     E       + E + S 
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Query:  MGVAELGKRSSNKAKKIEGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRAIVPKISKMDRTSILGDTIDYVKELLERINNLKEEEETGLDSNHVGFLNGISKEGKS
        + + E  K+ SN  KK+EGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLS+LR+IVPKI+KMDRTSILGD IDY+KELL++IN L+E+E+    ++H+  L        +
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Query:  NEVQVRNSPKFDVERKEKETRIDICCATRPGLLLSTVNTLEALGLEIQQCVISCFNDFSMQASCAEGSAQKAVASSDDIKEALFRNAGYGGKCL
        NE  VRNS KF+V+++E  T IDICC T+PGL++STV+TLE LGLEI+QCVISCF+DFS+QASC E   Q+ + +S+  K+AL RNAGYGG+CL
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G12860.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein3.7e-3441.3Show/hide
Query:  SETAPSVCKVEMEQMGVREINVSIMGVAELGKRSSNKAKKIEGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRAIVPKISKMDRTSILGDTIDYVKELLERINNLK
        SE   S  + E++      I++S +        ++N   K +G P+KNLMAERRRRK+LNDRL MLR++VPKISKMDR SILGD IDY+KELL+RIN+L 
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Query:  EEEETGLDSNHVGFLNGISKEGKSNEVQVR--------------NSPKFDVERKE-KETRIDICCATRPGLLLSTVNTLEALGLEIQQCVISCFNDFSMQ
         E E+   S+    L+ ++   ++   +V+                P+ +V  +E K   I + C  RPGLLLST+  L+ LGL++QQ VISCFN F++ 
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Query:  ASCAEGSAQKAVASSDDIKEALFRNAGYGG
           AE   +      + IK  L   AGY G
Subjt:  ASCAEGSAQKAVASSDDIKEALFRNAGYGG

AT3G26744.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein5.3e-3345.12Show/hide
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        EIN S      +      K KK +G P+KNLMAERRRRK+LNDRL MLR++VPKISKMDR SILGD IDY+KELL+RIN+L  E E+     L      F
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Query:  LNGISKEGKSNEVQVRN--------SPKFDVERKEKETR------IDICCATRPGLLLSTVNTLEALGLEIQQCVISCFNDFSMQASCAEGSAQKAVASS
         + ++   ++   +V+         SPK    R E   R      I + C  RPGLLL+T+  L+ LGL++QQ VISCFN F++    AE   +      
Subjt:  LNGISKEGKSNEVQVRN--------SPKFDVERKEKETR------IDICCATRPGLLLSTVNTLEALGLEIQQCVISCFNDFSMQASCAEGSAQKAVASS

Query:  DDIKEALFRNAGYGG
        D IK  LF  AGY G
Subjt:  DDIKEALFRNAGYGG

AT3G26744.2 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein5.3e-3345.12Show/hide
Query:  EINVSIMGVAELGKRSSNKAKKIEGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRAIVPKISKMDRTSILGDTIDYVKELLERINNLKEEEET----GLDSNHVGF
        EIN S      +      K KK +G P+KNLMAERRRRK+LNDRL MLR++VPKISKMDR SILGD IDY+KELL+RIN+L  E E+     L      F
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Query:  LNGISKEGKSNEVQVRN--------SPKFDVERKEKETR------IDICCATRPGLLLSTVNTLEALGLEIQQCVISCFNDFSMQASCAEGSAQKAVASS
         + ++   ++   +V+         SPK    R E   R      I + C  RPGLLL+T+  L+ LGL++QQ VISCFN F++    AE   +      
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Query:  DDIKEALFRNAGYGG
        D IK  LF  AGY G
Subjt:  DDIKEALFRNAGYGG

AT5G10570.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.5e-5947.62Show/hide
Query:  NDFSFADQQLYSNFLEGFAMPELDSSSYTKN--NETPPFVSQEEMSNKNNGYPPVAMEEEELGFIES------ETAPSVCKVEMEQMG----VREINVSI
        ND++F D   ++N L+     +  SSS   N  ++ PP + Q    +      P      +  F+E          P +     E       + E + S 
Subjt:  NDFSFADQQLYSNFLEGFAMPELDSSSYTKN--NETPPFVSQEEMSNKNNGYPPVAMEEEELGFIES------ETAPSVCKVEMEQMG----VREINVSI

Query:  MGVAELGKRSSNKAKKIEGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRAIVPKISKMDRTSILGDTIDYVKELLERINNLKEEEETGLDSNHVGFLNGISKEGKS
        + + E  K+ SN  KK+EGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLS+LR+IVPKI+KMDRTSILGD IDY+KELL++IN L+E+E+    ++H+  L        +
Subjt:  MGVAELGKRSSNKAKKIEGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRAIVPKISKMDRTSILGDTIDYVKELLERINNLKEEEETGLDSNHVGFLNGISKEGKS

Query:  NEVQVRNSPKFDVERKEKETRIDICCATRPGLLLSTVNTLEALGLEIQQCVISCFNDFSMQASCAEGSAQKAVASSDDIKEALFRNAGYGGKCL
        NE  VRNS KF+V+++E  T IDICC T+PGL++STV+TLE LGLEI+QCVISCF+DFS+QASC E   Q+ + +S+  K+AL RNAGYGG+CL
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AT5G65640.1 beta HLH protein 938.6e-6847.12Show/hide
Query:  MELS-QHGFLEELLASTPWTS--------SYSNGF----NDFFQNGWNF-------ASFDENPQMGSSTFSNFPTIQTANDFSFADQQLYSNFLEGFAMP
        MELS Q    EELL  T   +        S++ GF    + FF NG+N           DEN  +  S+F +  + Q           L          P
Subjt:  MELS-QHGFLEELLASTPWTS--------SYSNGF----NDFFQNGWNF-------ASFDENPQMGSSTFSNFPTIQTANDFSFADQQLYSNFLEGFAMP

Query:  ELDSSSYTKNNETPPFV-SQEEMSNKNNGYPPVAMEE-EELGFIESETAPSVCKVEMEQMGVREINVSIMGVAELGKRSSNKAKKIEGQPSKNLMAERRR
         L SS+        PF+ + +E+ + ++  PP+ ++  +E  F    + PS     ME    +  +V   G    G+ +  K+KK+EGQPSKNLMAERRR
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Query:  RKRLNDRLSMLRAIVPKISKMDRTSILGDTIDYVKELLERINNLKEEEETGLDSN--HVGFLNGISKEGKSNEVQVRNSPKFDVERKEKETRIDICCATR
        RKRLNDRLSMLR+IVPKISKMDRTSILGD IDY+KELL++IN L++EE+   +SN  H   L G  K+  +NE  VRNSPKF+++R++++TR+DICC+ +
Subjt:  RKRLNDRLSMLRAIVPKISKMDRTSILGDTIDYVKELLERINNLKEEEETGLDSN--HVGFLNGISKEGKSNEVQVRNSPKFDVERKEKETRIDICCATR

Query:  PGLLLSTVNTLEALGLEIQQCVISCFNDFSMQASCAEGSAQKAVASSDDIKEALFRNAGYGGKCL
        PGLLLSTVNTLE LGLEI+QCVISCF+DFS+QASC+EG+ Q+   +S+DIK+ALFRNAGYGG CL
Subjt:  PGLLLSTVNTLEALGLEIQQCVISCFNDFSMQASCAEGSAQKAVASSDDIKEALFRNAGYGGKCL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGCTCAGTCAACATGGTTTCTTAGAGGAGTTATTAGCTTCAACACCTTGGACTTCTTCATACTCAAATGGGTTCAATGATTTTTTTCAAAATGGCTGGAATTTCGC
TTCTTTTGATGAAAATCCCCAAATGGGTTCTTCCACTTTCTCCAATTTTCCCACTATCCAAACAGCTAATGATTTTTCTTTCGCCGATCAACAACTCTACAGCAATTTTC
TCGAAGGGTTTGCGATGCCGGAGCTCGATTCCTCATCCTACACTAAGAACAACGAAACCCCACCATTTGTTTCGCAAGAAGAAATGAGTAATAAGAACAATGGTTACCCT
CCGGTAGCGATGGAGGAGGAAGAACTTGGTTTTATCGAGAGTGAAACAGCTCCAAGTGTTTGTAAAGTGGAAATGGAGCAAATGGGTGTTCGTGAAATTAATGTTTCTAT
AATGGGTGTCGCAGAATTGGGAAAAAGAAGCAGCAACAAAGCTAAGAAGATTGAAGGACAGCCTTCAAAGAATTTAATGGCGGAAAGAAGAAGAAGGAAGCGGTTGAATG
ATCGGCTTTCAATGCTCAGAGCCATAGTCCCTAAAATAAGCAAGATGGATAGAACGTCTATACTTGGAGACACAATCGATTATGTGAAAGAGCTGCTAGAAAGAATCAAT
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GTTCGATGTTGAAAGGAAGGAGAAGGAGACTCGAATCGACATTTGCTGTGCAACAAGGCCAGGATTATTGCTGTCTACAGTCAACACATTAGAAGCATTGGGTCTTGAGA
TTCAGCAGTGTGTTATTAGCTGCTTCAATGATTTTTCAATGCAAGCTTCTTGTGCAGAGGGAAGTGCTCAGAAAGCTGTGGCAAGTTCTGATGATATAAAGGAAGCACTG
TTCAGAAATGCAGGATATGGAGGAAAGTGCTTGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGCTCAGTCAACATGGTTTCTTAGAGGAGTTATTAGCTTCAACACCTTGGACTTCTTCATACTCAAATGGGTTCAATGATTTTTTTCAAAATGGCTGGAATTTCGC
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CCGGTAGCGATGGAGGAGGAAGAACTTGGTTTTATCGAGAGTGAAACAGCTCCAAGTGTTTGTAAAGTGGAAATGGAGCAAATGGGTGTTCGTGAAATTAATGTTTCTAT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MELSQHGFLEELLASTPWTSSYSNGFNDFFQNGWNFASFDENPQMGSSTFSNFPTIQTANDFSFADQQLYSNFLEGFAMPELDSSSYTKNNETPPFVSQEEMSNKNNGYP
PVAMEEEELGFIESETAPSVCKVEMEQMGVREINVSIMGVAELGKRSSNKAKKIEGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRAIVPKISKMDRTSILGDTIDYVKELLERIN
NLKEEEETGLDSNHVGFLNGISKEGKSNEVQVRNSPKFDVERKEKETRIDICCATRPGLLLSTVNTLEALGLEIQQCVISCFNDFSMQASCAEGSAQKAVASSDDIKEAL
FRNAGYGGKCL